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Submitted by: danr April 27, 2023

Table of tables

All tables contain Species, Phylum, Gram stain and Coloniser headings. This allows for relevant comparisons between tables and bacterial clusters.

Table Name General
 Physiology
 Metabolism Tolerances Health
Alt Name Class Family Motility Morph.
 Spore
 DNA G/C
 Substrate O/F
 Substrate Use
 Metabolites
 Enzymes
 Bioch. Tests
 Digest /hydrol O2 Temp Salt
pH
Net Effect BAuA Risk Risk Notes Symbiosis Pathog. Source Studies Antibiotics
1 Health                                                  
2 Physiology                                                  
3 Hydrolysis / Digestion                                                  
4 Biochemical Tests                     Catalase, Oxidase                            
5 Metabolites Produced                   SCFA, gases, other                              
6 Substrate Use - Monosaccharides and polyols                 Monosacch, polyols                                
7 Substrate Use - Oligosaccharides and polysaccharides                

Oligosacch, Polysacch

                                
8 Substrate Use - Miscellaneous related carbohydrates                

Other

                                
9 Substrate Use - Short and medium chain fatty acids                 SCFA, MCFA                                
10 Substrate Use - Polyacidic compounds                 Di-, tri-, hydroxy-, acids
                                
11 Substrate Use - Miscellaneous related acids                 Other                                
12 Substrate Use - The 20 typical amino acids                 21 AA                                
13 Substrate Use - Unusual amino acids                 Other AA                                
14 Substrate Use - Nitrogen-containing compounds                 N-sources                                
15 Oxid/Fermentation - Monosaccharides and polyols               Monosacch, polyols                                  
16 Oxid/Fermentation - Oligosaccharides and polysaccharides               Oligosacch, polysacch, glucose
                                  
17 Oxid/Fermentation - Miscellaneous related carbohydrates              

Other, glucose

                                  
18 Bacterial Enzymes - General enzymes                     Oxidase, Catalase, Urease, etc.                            
19 Bacterial Enzymes - Carbohydrate cleaving                     b-Gal, a-Gal, b-Glc, a-Glc, etc., Oxidase, Catalase, Urease                            
20 Bacterial Enzymes - Esterases                     Lipases, Phosphatases, Oxidase, Catalase, Urease                            
21 Bacterial Enzymes - Proteases                     Trypsin, Chymotrypsin, Oxidase, Catalase, Urease
                            
22 Bacterial Enzymes - Amidases                     Arylamidases, Oxidase, Catalase, Urease                            
23 Antibiotic Responses - All Antibiotics                           O2                     All
24 Antibiotic Responses - Penicillins and Penems                           O2                     Penecillins, Penems
25 Antibiotic Responses - Cephems (Cephalosporins)                            O2                     Cephems
26 Antibiotic Responses - Aminoglycosides and Macrolides                           O2                     Aminoglycosides, Macrolides
27 Antibiotic Responses - Glycopeptides (Vancomycins) and Polyketides                           O2                     Glycopeptides, Polyketides
28 Antibiotic Responses - Quinolones and Tetracyclines                           O2                     Quinolines, Tetracyclines
29 Antibiotic Responses - Heterocycles, Vancomycins & Miscellaneous                           O2                     Heterocycles, Vancomycins, etc.

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