Substrate digestion, hydrolysis or degradation, and other Biochemical Tests
FILTERS
Total 2651
Current 2651
Bacteria Phylum Coloniser Gram Cata Oxid EggY Haem MRed NO3R 2NO2 NO2R ONPG Sred SO4R CO2 VP Aesc Urea Gela Star Case Tyro Arg Cell Dext DNA Meat Milk Chit Algn Agar Pect Hipp Mucn Xnth Tw'n
Abiotrophia defectiva Firmicutes Minor + neg neg alpha neg neg neg neg neg neg
Absiella argi Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg
Absiella innocuum Firmicutes Moderate
Absiella tortuosum Firmicutes Rare + neg d neg + neg neg neg curdle neg
Acetanaerobacterium elongatum Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg + + curdle
Acetatifactor muris Firmicutes Rare + neg
Acetitomaculum ruminis Firmicutes Rare + neg neg + d(+)
Acetivibrio cellulolyticus Firmicutes Rare neg neg neg neg neg + neg neg + neg neg
Acetivibrio clariflavus Firmicutes Unlikely vr neg neg + neg neg neg neg + neg neg
Acetivibrio ethanolgignens Firmicutes Minor neg + neg neg + neg neg
Acetivibrio saccincola Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg
Acetivibrio thermocellus Firmicutes Unlikely neg +
Acetoanaerobium sticklandii Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Acetobacter pasteurianus Proteobacteria Unlikely neg d(w) neg + neg neg
Acetobacterium woodii Firmicutes Rare + neg +
Acetomicrobium hydrogeniformans Synergistetes Unlikely neg neg neg neg
Achromobacter denitrificans Proteobacteria Unlikely neg + + neg + + + + + neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Achromobacter insuavis Proteobacteria Unlikely neg + + + neg
Achromobacter spanius Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg d neg neg neg 80(neg)
Achromobacter xylosoxidans Proteobacteria Rare neg + + neg neg + + + neg + neg neg neg + neg neg neg neg neg 80(neg)
Acidaminococcus fermentans Firmicutes Widespread neg neg neg neg neg neg d(neg)
Acidaminococcus intestini Firmicutes Moderate neg neg neg neg neg neg neg
Acidaminococcus massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Acidaminococcus provencensis Firmicutes Rare neg neg neg
Acidaminococcus timonensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Acidipropionibacterium acidipropionici Actinobacteria Rare + neg neg
Acidipropionibacterium jensenii Actinobacteria Rare + vr vr
Acidisarcina polymorpha Acidobacteria Rare neg neg + + d d neg
Acidovorax facilis Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg neg + neg 80(vr)
Acidovorax sp. strain KKS102 Proteobacteria Rare neg + + +
Acidovorax temperans Proteobacteria Rare neg d(+) + neg + + neg d neg neg neg 80(+)
Acidovorax wautersii Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg + neg
Acinetobacter baumannii Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Acinetobacter bereziniae Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg neg neg neg neg neg
Acinetobacter calcoaceticus Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg neg neg + neg neg neg neg
Acinetobacter guillouiae Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg neg neg neg neg
Acinetobacter haemolyticus Proteobacteria Unlikely neg + neg + neg neg neg neg neg neg + neg
Acinetobacter idrijaensis Proteobacteria Rare
Acinetobacter johnsonii Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Acinetobacter junii Proteobacteria Rare neg neg d neg neg neg neg neg neg neg neg
Acinetobacter lwoffii Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg + neg neg
Acinetobacter parvus Proteobacteria Unlikely neg neg neg neg
Acinetobacter pittii Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Acinetobacter radioresistens Proteobacteria Rare neg + neg neg neg + neg neg neg neg neg neg 80(+)
Acinetobacter schindleri Proteobacteria Unlikely neg neg neg neg
Acinetobacter septicus Proteobacteria Unlikely neg + neg + neg neg + neg
Acinetobacter towneri Proteobacteria Unlikely neg neg neg neg 40(+) 80(+)
Acinetobacter ursingii Proteobacteria Unlikely neg neg neg neg
Acinetobacter variabilis Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg
Actinobacillus capsulatus Proteobacteria Rare neg d(+) d(+) neg neg + neg + neg 20(neg) 80(neg)
Actinobacillus minor Proteobacteria Unlikely neg neg neg
Actinobacillus pleuropneumoniae Proteobacteria Rare neg d d + + + neg neg + neg
Actinobacillus succinogenes Proteobacteria Rare neg + + + neg neg
Actinobacillus ureae Proteobacteria Non neg + + + neg +
Actinobaculum massiliense Actinobacteria Minor + neg neg neg neg neg neg neg neg +
Actinomyces bouchesdurhonensis Actinobacteria Unlikely + neg neg + neg
Actinomyces canis Actinobacteria Non + + neg neg neg neg neg neg neg
Actinomyces dentalis Actinobacteria Non + neg neg neg + neg neg neg neg
Actinomyces georgiae Actinobacteria Non + neg gamma > alpha d(neg) d(+) vr d(neg) neg curdle
Actinomyces gerencseriae Actinobacteria Unlikely + neg gamma d(neg) + neg neg curdles
Actinomyces graevenitzii Actinobacteria Minor + neg neg neg neg neg vr vr
Actinomyces ihuae Actinobacteria Rare + neg neg neg neg
Actinomyces israelii Actinobacteria Non + neg + + neg
Actinomyces johnsonii Actinobacteria Rare + d + neg d
Actinomyces marseillensis Actinobacteria Rare + neg neg + +
Actinomyces massiliensis Actinobacteria Rare + neg neg +
Actinomyces mediterranea Actinobacteria Rare + neg neg
Actinomyces minihominis Actinobacteria Rare + neg neg
Actinomyces naeslundii Actinobacteria Minor + neg + neg d(+) neg neg neg
Actinomyces oris Actinobacteria Rare + vr + neg d(neg) neg neg neg
Actinomyces pacaensis Actinobacteria Rare + + neg
Actinomyces polynesiensis Actinobacteria Rare + + neg
Actinomyces provencensis Actinobacteria Rare + + neg neg
Actinomyces sp. ph3 Actinobacteria Rare +
Actinomyces timonensis Actinobacteria Rare + neg neg neg
Actinomyces urogenitalis Actinobacteria Rare + neg + + + neg neg neg
Actinomyces viscosus Actinobacteria Minor + + + neg + neg neg neg
Actinosynnema mirum Actinobacteria Non + + neg + + + + + neg
Actinotignum schaalii Actinobacteria Rare + neg neg neg neg neg neg neg +
Acutalibacter muris Firmicutes Rare + +
Acutalibacter timonensis Firmicutes Minor
Adhaeribacter aquaticus Bacteroidetes Unlikely neg + + neg neg w
Adlercreutzia caecimuris Actinobacteria Rare + neg
Adlercreutzia equolifaciens Actinobacteria Moderate + neg
Adlercreutzia equolifaciens subsp. celatus Actinobacteria Rare + neg neg
Adlercreutzia hattorii Actinobacteria Rare + neg neg neg +
Adlercreutzia mucosicola Actinobacteria Rare + neg neg +
Adlercreutzia rubneri Actinobacteria Rare + neg neg neg neg
Aeribacillus pallidus Firmicutes Unlikely + + + neg + neg neg neg w neg
Aerococcus vaginalis Firmicutes Non + alpha neg neg neg neg neg +
Aerococcus viridans Firmicutes Rare + neg neg alpha neg neg + neg neg neg +
Aeromicrobium massiliense Actinobacteria Rare + + neg + + +
Aeromicrobium tamlense Actinobacteria Rare + + neg neg w + + neg neg neg
Aeromonas allosaccharophila Proteobacteria Rare neg + + + beta(vr) + + neg d neg + + + + 80(+)
Aeromonas bestiarum Proteobacteria Rare neg + + + + + + + neg + d
Aeromonas caviae Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg + neg + curdle
Aeromonas dhakensis Proteobacteria Rare neg + + beta + + + + + + +
Aeromonas encheleia Proteobacteria Unlikely neg + + + + + + d(neg) + neg d d(+) + + + neg 80(+)
Aeromonas enteropelogenes Proteobacteria Rare neg + neg neg +
Aeromonas eucrenophila Proteobacteria Non neg + + + + neg + neg + + +
Aeromonas hydrophila Proteobacteria Unlikely neg + + beta + + + + neg +
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila Proteobacteria Unlikely neg + + + + + neg
Aeromonas jandaei Proteobacteria Rare neg + + + neg neg + + neg neg 80(d)
Aeromonas media Proteobacteria Rare neg + + + + neg d neg vr + d neg d d neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Aeromonas popoffii Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg + + + + neg 80(+)
Aeromonas salmonicida Proteobacteria Unlikely neg + + beta neg + + d + neg + +
Aeromonas schubertii Proteobacteria Non neg + beta(w) + + + vr neg neg w w +
Aeromonas sobria Proteobacteria Rare neg + + d neg neg + + neg
Aeromonas taiwanensis Proteobacteria Non neg + + neg + + neg + neg + + +
Aeromonas tecta Proteobacteria Rare neg + + beta + neg vr neg + +
Aeromonas trota Proteobacteria Rare neg + d + + + neg neg +
Aeromonas veronii Proteobacteria Rare neg + + + d(+) vr + neg +
Aestuariimicrobium kwangyangense Actinobacteria Rare + + neg + + neg + neg neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Afipia birgiae Proteobacteria Unlikely neg w + neg + neg + neg
Afipia broomeae Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg + neg
Afipia lausannensis Proteobacteria Unlikely neg neg + neg + neg neg +
Africanella massiliensis Firmicutes Rare + + +
Agathobacter ruminis Firmicutes Rare + neg + +
Agathobaculum butyriciproducens Firmicutes Moderate + neg neg neg neg +
Agathobaculum desmolans Firmicutes Minor + neg neg neg neg + neg neg neg neg
Aggregatibacter actinomycetemcomitans Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg
Aggregatibacter aphrophilus Proteobacteria Minor neg neg d(neg) neg + + + vr neg neg neg
Aggregatibacter segnis Proteobacteria Minor neg w neg neg + d d neg
Agrilactobacillus composti Firmicutes Unlikely + neg neg
Agrobacterium radiobacter Proteobacteria Unlikely neg + +
Agrobacterium rhizogenes Proteobacteria Unlikely neg +
Agrobacterium tumefaciens Proteobacteria Unlikely neg + + + +
Agrococcus casei Actinobacteria Rare + neg + 20(neg) 80(+)
Agrococcus jejuensis Actinobacteria Rare + + neg neg + neg +
Agrococcus jenensis Actinobacteria Rare + + neg neg neg + neg neg + d neg neg neg 20(+) 80(neg)
Agrococcus terreus Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + neg + neg neg neg 80(neg)
Akkermansia glycaniphila Verrucomicrobia Rare neg + + neg + +
Akkermansia muciniphila Verrucomicrobia Widespread neg neg neg neg neg neg +
Alcaligenes faecalis Proteobacteria Rare neg + + neg neg + + neg neg neg neg 80(neg)
Alcaligenes faecalis subsp. faecalis Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg + + neg neg neg neg 80(neg)
Aliagarivorans marinus Proteobacteria Rare neg + neg neg + neg neg neg + neg neg neg neg neg + + 80(neg)
Aliarcobacter butzleri Proteobacteria Rare neg d(neg) + + neg neg neg neg neg neg
Aliarcobacter cryaerophilus Proteobacteria Rare neg + + neg + + neg neg neg neg neg neg neg neg
Aliarcobacter skirrowii Proteobacteria Rare neg + + alpha + neg neg neg neg neg neg + neg
Alicyclobacillus acidocaldarius Firmicutes Rare + + neg neg neg + + neg
Aliiruegeria sabulilitoris Proteobacteria Unlikely neg + + + + + neg neg neg neg + 80(neg)
Alistipes communis Bacteroidetes Rare neg neg + neg
Alistipes dispar Bacteroidetes Rare neg neg neg w
Alistipes finegoldii Bacteroidetes Moderate neg neg beta(w) neg neg vr neg + neg
Alistipes ihumii Bacteroidetes Moderate neg neg + beta neg
Alistipes indistinctus Bacteroidetes Moderate neg + neg neg neg neg neg
Alistipes inops Bacteroidetes Rare neg neg neg w neg neg +
Alistipes marseilloanorexicus Bacteroidetes Rare neg neg
Alistipes massiliensis Bacteroidetes Rare neg
Alistipes megaguti Bacteroidetes Rare neg neg neg neg
Alistipes montrealensis Bacteroidetes Rare neg + neg neg + neg
Alistipes obesi Bacteroidetes Moderate neg + neg neg
Alistipes onderdonkii Bacteroidetes Moderate neg neg beta(w) neg neg vr neg + neg
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris Bacteroidetes Rare neg vr neg vr
Alistipes provencensis Bacteroidetes Rare neg + neg
Alistipes putredinis Bacteroidetes Widespread neg + neg neg neg neg + neg vr
Alistipes senegalensis Bacteroidetes Moderate neg + neg neg neg
Alistipes shahii Bacteroidetes Widespread neg neg beta(w) neg neg + neg + neg
Alistipes timonensis Bacteroidetes Moderate neg + neg
Alkalibacillus halophilus Firmicutes Unlikely + + neg neg w neg neg 20(neg) 80(neg)
Alkalihalobacillus alcalophilus Firmicutes Unlikely + + + neg d(neg) + + + + 20(neg) 40(+) 60(+) 80(neg)
Alkalihalobacillus gibsonii Firmicutes Rare + d + neg + neg 20(neg) 40(d) 60(d) 80(neg)
Alkalihalobacillus halodurans Firmicutes Rare + neg d + + neg + + + 20(neg) 40(+) 60(+) 80(neg)
Alkalihalobacillus oshimensis Firmicutes Unlikely + + + neg neg neg + + + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Alkaliphilus metalliredigens Firmicutes Rare + neg neg
Alkaliphilus oremlandii Firmicutes Non +
Alkaliphilus transvaalensis Firmicutes Non + +
Alkanindiges illinoisensis Proteobacteria Non vr + neg 40(+) 80(+)
Allisonella histaminiformans Firmicutes Minor neg neg neg
Allobaculum fili Firmicutes Rare + +
Allobaculum mucilyticum Firmicutes Rare + + +
Alloprevotella rava Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg + neg
Alloprevotella tannerae Bacteroidetes Minor neg neg + neg neg + + neg neg curdle
Alloscardovia omnicolens Actinobacteria Minor + neg neg neg neg + neg
Alteracholeplasma palmae Tenericutes Rare unk neg neg
Alterileibacterium massiliense Firmicutes Rare neg neg neg
Amaricoccus kaplicensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg
Amedibacillus dolichus Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg neg neg
Amedibacterium intestinale Firmicutes Rare + neg neg +
Aminipila butyrica Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg
Aminipila terrae Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Aminomonas paucivorans Synergistetes Rare neg neg neg neg neg
Ammonifex degensii Firmicutes Non neg + + +
Amycolatopsis alba Actinobacteria Rare + + neg + + + + + + + +
Amycolatopsis mediterranei Actinobacteria Rare + + neg + + + neg + + neg
Amycolatopsis thailandensis Actinobacteria Rare + + + + + + + + +
Amycolatopsis vancoresmycina Actinobacteria Unlikely + neg + +
Anaerobiospirillum succiniciproducens Proteobacteria Rare neg neg neg beta(w) neg neg neg neg vr neg curdle(vr) neg
Anaerobiospirillum thomasii Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg neg neg neg
Anaerobutyricum hallii Firmicutes Widespread + neg neg neg neg neg neg neg w neg
Anaerobutyricum soehngenii Firmicutes Rare + neg neg neg
Anaerococcus hydrogenalis Firmicutes Rare + d(neg) neg neg neg neg +
Anaerococcus jeddahensis Firmicutes Rare + neg +
Anaerococcus lactolyticus Firmicutes Rare +
Anaerococcus marasmi Firmicutes Rare + + neg
Anaerococcus mediterraneensis Firmicutes Rare + + neg
Anaerococcus murdochii Firmicutes Rare + neg neg
Anaerococcus obesiensis Firmicutes Rare +
Anaerococcus octavius Firmicutes Rare + vr neg neg neg neg neg neg neg
Anaerococcus prevotii Firmicutes Minor + + + +
Anaerococcus provencensis Firmicutes Rare +
Anaerococcus rubeinfantis Firmicutes Rare + + neg neg neg
Anaerococcus senegalensis Firmicutes Rare + + neg neg neg
Anaerococcus tetradius Firmicutes Rare +
Anaerococcus vaginalis Firmicutes Minor + w neg neg
Anaerocolumna aminovalerica Firmicutes Rare + w neg + + +
Anaerocolumna cellulosilytica Firmicutes Rare + neg neg + neg + neg curdle
Anaerocolumna chitinilytica Firmicutes Rare + + +
Anaerocolumna sedimenticola Firmicutes Rare + neg neg neg + neg neg
Anaerocolumna xylanovorans Firmicutes Rare + neg
Anaerofilum pentosovorans Firmicutes Rare + neg neg
Anaerofustis stercorihominis Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg
Anaeroglobus geminatus Firmicutes Minor neg neg neg neg neg neg
Anaeromassilibacillus senegalensis Firmicutes Rare neg neg neg
Anaerorhabdus furcosa Firmicutes Rare neg neg d d(neg) neg neg
Anaerosalibacter bizertensis Firmicutes Rare + neg neg neg +
Anaerosalibacter massiliensis Firmicutes Rare + neg neg +
Anaerosphaera massiliensis Firmicutes Rare + neg neg
Anaerospora hongkongensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Anaerostipes butyraticus Firmicutes Rare + neg + neg neg
Anaerostipes caccae Firmicutes Moderate + neg neg neg w + neg neg
Anaerostipes coli Firmicutes Rare + neg
Anaerostipes hadrus Firmicutes Moderate + neg w neg + d neg neg neg neg curdle
Anaerostipes hominis Firmicutes Rare vr
Anaerostipes rhamnosivorans Firmicutes Rare vr neg neg neg neg neg neg neg
Anaerostipes rhamnosus Firmicutes Rare +
Anaerotignum faecicola Firmicutes Rare + neg neg neg
Anaerotignum lactatifermentans Firmicutes Moderate neg neg neg neg + neg
Anaerotignum neopropionicum Firmicutes Rare neg neg
Anaerotignum propionicum Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Anaerotruncus colihominis Firmicutes Moderate + neg neg neg neg neg neg
Anaerotruncus massiliensis Firmicutes Rare neg + neg neg + + neg +
Anaerotruncus rubiinfantis Firmicutes Moderate +
Anaerovorax odorimutans Firmicutes Rare vr neg
Ancylobacter polymorphus Proteobacteria Rare neg + + + neg + + neg
Aneurinibacillus aneurinilyticus Firmicutes Rare + w + neg + + neg neg neg neg + neg + neg
Aneurinibacillus migulanus Firmicutes Rare + + + + + + + neg neg
Angelakisella massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg
Anoxybacillus flavithermus Firmicutes Non + + + + neg + neg + +
Anoxybacillus gonensis Firmicutes Unlikely + w + + neg neg d +
Anoxynatronum sibiricum Firmicutes Rare + + neg neg neg neg + neg
Anseongella ginsenosidimutans Bacteroidetes Unlikely neg neg + neg neg neg neg neg 80(neg)
Aquabacterium citratiphilum Proteobacteria Rare neg neg + + neg neg neg + neg neg neg neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Aquabacterium commune Proteobacteria Rare neg neg + + neg neg neg neg neg + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Aquabacterium parvum Proteobacteria Rare neg neg + + neg neg neg + neg neg neg neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Aquamicrobium lusatiense Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Aquincola tertiaricarbonis Proteobacteria Non neg w + neg neg neg
Arabia massiliensis Actinobacteria Rare neg + neg neg
Arachnia propionica Actinobacteria Rare +
Arcanobacterium haemolyticum Actinobacteria Rare + neg beta neg neg neg neg neg neg neg
Arthrobacter agilis Actinobacteria Non + + + neg neg neg neg + neg + + neg d 80(d)
Arthrobacter castelli Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg
Arthrobacter citreus Actinobacteria Unlikely vr + + w neg neg
Arthrobacter gandavensis Actinobacteria Unlikely + + + + d
Arthrobacter globiformis Actinobacteria Unlikely + neg neg +
Arthrobacter koreensis Actinobacteria Unlikely + + + + neg 40(+) 80(+)
Arthrobacter luteolus Actinobacteria Unlikely + + + neg neg + + + neg
Arthrobacter parietis Actinobacteria Non + + neg + + d +
Arthrobacter pigmenti Actinobacteria Non + + neg d d neg +
Arthrobacter russicus Actinobacteria Unlikely + neg neg neg 40(+) 80(+)
Asaccharospora irregularis Firmicutes Rare + neg neg + neg neg neg
Asticcacaulis biprosthecium Proteobacteria Unlikely neg neg
Asticcacaulis excentricus Proteobacteria Unlikely neg +
Atlantibacter hermannii Proteobacteria Rare neg neg + + + neg w neg neg
Atopobium minutum Actinobacteria Minor + neg d(neg) neg neg neg neg curdle neg
Atopostipes suicloacalis Firmicutes Unlikely + neg neg
Aureimonas altamirensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg neg + neg
Aureimonas ureilytica Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg + neg + neg neg neg + neg neg 80(+)
Averyella dalhousiensis Proteobacteria Rare neg neg + + + neg neg d(+) neg neg
Azoarcus pumilus Proteobacteria Rare neg neg + neg neg + + 20(+) 40(neg) 60(neg) 80(neg)
Azospirillum lipoferum Proteobacteria Rare neg d + neg alpha + + + neg neg neg 80(+)
Azotobacter vinelandii Proteobacteria Non neg +
Bacilliculturomica massiliensis Firmicutes Rare + neg neg neg
Bacillus altitudinis Firmicutes Rare + + + neg neg + + + neg +
Bacillus amyloliquefaciens Firmicutes Rare + neg neg + d(+) + + neg + + + neg neg d(neg) neg neg 20(+), 40(+), 60(+)
Bacillus andreraoultii Firmicutes Rare + + neg + + neg
Bacillus aneurinolyticus Firmicutes Rare + w + + + + neg neg neg neg neg + neg neg neg
Bacillus anthracis Firmicutes Non + + + neg + + + neg + + + neg
Bacillus atrophaeus Firmicutes Rare + + neg neg + + + neg + + + neg 80(neg)
Bacillus badius DSM 23T Firmicutes Rare + + + neg neg neg neg + + + + neg
Bacillus badius DSM 5610 Firmicutes Rare + + + neg neg neg neg + neg + + neg
Bacillus baekryungensis Firmicutes Non + + neg + + + + 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Bacillus benzoevorans Firmicutes Rare + d neg + neg neg + neg neg neg
Bacillus caccae Firmicutes Rare +
Bacillus cereus Firmicutes Minor + + neg + + vr + d + + + + +
Bacillus circulans Firmicutes Rare + + neg neg neg neg neg + neg d w w 80(d(+))
Bacillus clausii Firmicutes Rare + neg + neg + neg + + + neg neg
Bacillus cytotoxicus Firmicutes Rare + + + neg w neg + neg
Bacillus dakarensis Firmicutes Rare + + +
Bacillus endophyticus Firmicutes Unlikely + + + neg neg + neg neg neg neg neg
Bacillus firmus Firmicutes Rare + vr neg neg neg + neg neg + neg d(+) + + + neg neg d(+) 20(+) 80(+)
Bacillus fordii Firmicutes Rare neg + + neg neg neg neg neg neg
Bacillus halotolerans Firmicutes Rare + + neg + + + + + neg + + + neg + 20(+) 80(+)
Bacillus idriensis Firmicutes Rare + + neg vr + neg neg
Bacillus infantis Firmicutes Rare + + neg
Bacillus kwashiorkori Firmicutes Rare + + + neg
Bacillus licheniformis Firmicutes Minor + + d neg + + d + + vr + + + neg + + + neg 20(+) 80(d(+))
Bacillus marasmi Firmicutes Rare + neg neg
Bacillus massilioanorexius Firmicutes Rare + + + + +
Bacillus massiliogabonensis Firmicutes Unlikely neg + neg
Bacillus massilionigeriensis Firmicutes Rare + + neg neg neg
Bacillus mediterraneensis Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg +
Bacillus methanolicus Firmicutes Non + + + neg d neg
Bacillus mojavensis Firmicutes Rare + + + neg + + neg + + + neg neg 80(neg)
Bacillus mycoides Firmicutes Rare + + + + d + + d + + + neg
Bacillus niameyensis Firmicutes Rare + + neg +
Bacillus pakistanensis Firmicutes Rare + + neg neg neg + neg +
Bacillus phocaeensis Firmicutes Rare + + neg neg neg neg +
Bacillus pseudofirmus Firmicutes Rare + neg + + + neg neg 20(neg) 40(+) 60(+) 80(neg)
Bacillus pseudomycoides Firmicutes Unlikely + + neg + + + + + + +
Bacillus pumilus Firmicutes Rare + + vr neg neg + + neg + neg + neg
Bacillus rubiinfantis Firmicutes Rare + + neg neg +
Bacillus sinesaloumensis Firmicutes Unlikely + + +
Bacillus siralis Firmicutes Rare + + + + + neg + neg + neg + neg
Bacillus smithii Firmicutes Rare + + neg neg neg d(neg) vr neg neg w(d) neg neg + neg neg +
Bacillus sonorensis Firmicutes Rare + + neg + + + + + neg
Bacillus subtilis Firmicutes Minor + + vr neg + + + + + neg + + + neg + 80(w)
Bacillus testis Firmicutes Rare + + neg
Bacillus thuringiensis Firmicutes Rare + + neg + + + + neg + + +
Bacillus timonensis Firmicutes Rare neg neg +
Bacillus tuaregi Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Bacillus vallismortis Firmicutes Rare + + + neg + + + + neg + + + neg 80(w)
Bacillus velezensis Variant polyfermenticus Firmicutes Rare + + + + + + + + + neg neg 20(neg) 80(neg)
Bacillus wiedmannii Firmicutes Rare + + + d + + +
Bacteroides acidifaciens Bacteroidetes Moderate neg d + d(neg) d
Bacteroides bouchesdurhonensis Bacteroidetes Moderate neg + neg + + + +
Bacteroides caccae Bacteroidetes Widespread neg neg neg w neg neg + neg w neg neg neg
Bacteroides caecimuris Bacteroidetes Rare neg neg + neg +
Bacteroides cellulosilyticus Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg + neg neg + + +
Bacteroides clarus Bacteroidetes Moderate neg neg + neg neg
Bacteroides congonensis Bacteroidetes Moderate neg + neg neg neg
Bacteroides coprosuis Bacteroidetes Rare neg neg neg neg + + neg +
Bacteroides cutis Bacteroidetes Moderate neg neg neg
Bacteroides eggerthii Bacteroidetes Widespread neg neg neg neg neg neg vr + neg curdle neg
Bacteroides faecalis Bacteroidetes Rare neg neg neg neg + neg +
Bacteroides faecichinchillae Bacteroidetes Rare neg neg neg + neg
Bacteroides faecis Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg + neg neg
Bacteroides finegoldii Bacteroidetes Widespread neg neg + neg neg
Bacteroides fluxus Bacteroidetes Moderate neg neg neg + neg neg
Bacteroides fragilis Bacteroidetes Widespread neg + neg neg neg + neg w neg +
Bacteroides galacturonicus Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg neg +
Bacteroides gallinarum Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg + neg
Bacteroides graminisolvens Bacteroidetes Rare neg neg neg neg + neg neg + neg
Bacteroides helcogenes Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg neg neg
Bacteroides heparinolyticus Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg + neg +
Bacteroides ihuae Bacteroidetes Rare neg neg neg neg
Bacteroides ilei Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg
Bacteroides intestinalis Bacteroidetes Widespread neg neg + neg neg +
Bacteroides luhongzhouii Bacteroidetes Rare neg
Bacteroides luti Bacteroidetes Rare neg neg neg neg
Bacteroides mediterraneensis Bacteroidetes Moderate neg + neg
Bacteroides ndongoniae Bacteroidetes Minor neg + neg neg
Bacteroides neonati Bacteroidetes Minor neg + neg w
Bacteroides nordii Bacteroidetes Moderate neg neg neg + neg +
Bacteroides oleiciplenus Bacteroidetes Moderate neg + neg + neg +
Bacteroides ovatus Bacteroidetes Widespread neg neg neg neg neg + neg w + curdle
Bacteroides pectinophilus Bacteroidetes Moderate neg neg neg + +
Bacteroides propionicifaciens Bacteroidetes Rare neg vr neg neg + neg neg
Bacteroides pyogenes Bacteroidetes Minor neg neg neg neg d neg neg d neg d
Bacteroides reticulotermitis Bacteroidetes Rare neg neg + neg neg +
Bacteroides salyersiae Bacteroidetes Moderate neg neg neg + neg +
Bacteroides sp. Strain D8 Bacteroidetes Rare neg neg neg neg
Bacteroides stercorirosoris Bacteroidetes Moderate neg neg neg + neg neg
Bacteroides stercoris Bacteroidetes Widespread neg neg neg neg + neg neg neg neg neg
Bacteroides thetaiotaomicron Bacteroidetes Widespread neg neg neg neg curdle +
Bacteroides timonensis Bacteroidetes Rare neg + neg +
Bacteroides togonis Bacteroidetes Minor neg neg neg
Bacteroides uniformis Bacteroidetes Widespread neg neg neg + neg d(neg) curdle
Bacteroides xylanisolvens Bacteroidetes Widespread neg neg neg + neg neg neg neg
Bacteroides zhangwenhongi Bacteroidetes Rare neg
Bacteroides zoogleoformans Bacteroidetes Rare neg neg neg neg + neg + + neg neg curdle
Bariatricus massiliensis Firmicutes Minor + neg neg
Barnesiella intestinihominis Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg + neg neg
Barnesiella viscericola Bacteroidetes Rare neg neg neg + neg +
Bartonella vinsonii Proteobacteria Non neg neg neg neg neg
Bavariicoccus seileri Firmicutes Rare + neg neg
Bdellovibrio bacteriovorus Bdellovibrionota Moderate neg + + neg +
Beduinella massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg
Beduini massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Beduinibacterium massiliense Firmicutes Rare + neg neg neg
Belnapia soli Proteobacteria Rare neg + neg neg neg
Berryella intestinalis Actinobacteria Rare +
Bhargavaea beijingensis Firmicutes Rare + + + beta neg + + neg + + + neg + 40(+) 80(neg)
Bhargavaea cecembensis Firmicutes Non + + + + neg neg + neg neg neg 60(+) 80(neg)
Bifidobacterium adolescentis Actinobacteria Widespread + neg neg neg neg + neg neg neg
Bifidobacterium aerophilum Actinobacteria Rare + neg neg neg neg
Bifidobacterium angulatum Actinobacteria Moderate + neg neg neg neg + neg neg neg curdle neg
Bifidobacterium animalis Actinobacteria Moderate + neg neg neg neg + neg neg neg + neg
Bifidobacterium animalis subsp. lactis Actinobacteria Rare + neg neg
Bifidobacterium asteroides Actinobacteria Rare + + neg + d neg
Bifidobacterium avesanii Actinobacteria Rare + neg neg neg neg neg
Bifidobacterium biavatii Actinobacteria Rare + neg neg
Bifidobacterium bifidum Actinobacteria Widespread + neg neg neg neg vr neg neg neg +
Bifidobacterium boum Actinobacteria Rare + neg neg neg + + neg neg neg curdle
Bifidobacterium breve Actinobacteria Widespread + neg neg neg neg + neg neg neg +
Bifidobacterium callitrichidarum Actinobacteria Rare + neg neg neg neg +
Bifidobacterium catenulatum Actinobacteria Moderate + neg neg neg neg + neg neg curdle neg
Bifidobacterium catenulatum subsp. kashiwanohense Actinobacteria Rare + neg neg neg
Bifidobacterium choerinum Actinobacteria Rare + neg d neg
Bifidobacterium coryneforme Actinobacteria Rare + neg + neg neg
Bifidobacterium cuniculi Actinobacteria Rare + neg neg + neg neg neg
Bifidobacterium dentium Actinobacteria Moderate + neg neg neg neg + neg neg neg
Bifidobacterium eulemuris Actinobacteria Rare + neg neg neg neg + +
Bifidobacterium faecale Actinobacteria Rare + neg neg + neg
Bifidobacterium gallicum Actinobacteria Rare + neg neg neg + neg neg neg
Bifidobacterium imperatoris Actinobacteria Rare +
Bifidobacterium indicum Actinobacteria Rare + neg neg
Bifidobacterium lemurum Actinobacteria Rare + neg neg neg + +
Bifidobacterium longum subsp. infantis Actinobacteria Moderate + neg neg neg neg + neg neg neg +
Bifidobacterium longum subsp. longum Actinobacteria Widespread + neg neg neg neg + neg neg neg +
Bifidobacterium longum subsp. suis Actinobacteria Rare + d(+) neg
Bifidobacterium merycicum Actinobacteria Rare + neg neg
Bifidobacterium minimum Actinobacteria Rare + neg neg + neg
Bifidobacterium mongoliense Actinobacteria Unlikely + neg neg + neg
Bifidobacterium moukalabense Actinobacteria Rare + + neg neg
Bifidobacterium myosotis Actinobacteria Rare + neg neg neg neg + +
Bifidobacterium pseudocatenulatum Actinobacteria Widespread + neg neg neg + + neg neg neg curdle neg
Bifidobacterium pseudolongum Actinobacteria Minor + neg neg + neg neg neg
Bifidobacterium pseudolongum subsp. globosum Actinobacteria Rare + neg neg neg d neg + neg neg
Bifidobacterium pullorum subsp. gallinarum Actinobacteria Rare + neg neg neg neg d neg
Bifidobacterium pullorum subsp. saeculare Actinobacteria Rare + neg neg neg
Bifidobacterium ramosum Actinobacteria Rare + neg neg neg neg + neg
Bifidobacterium reuteri Actinobacteria Rare + neg
Bifidobacterium ruminantium Actinobacteria Minor + neg neg neg neg neg neg
Bifidobacterium saguini Actinobacteria Rare +
Bifidobacterium scardovii Actinobacteria Minor + neg neg neg neg neg + vr neg neg
Bifidobacterium stellenboschense Actinobacteria Rare + neg
Bifidobacterium subtile Actinobacteria Rare + neg + d(+) neg neg
Bifidobacterium thermacidophilum Actinobacteria Rare + neg neg neg neg
Bifidobacterium thermophilum Actinobacteria Rare + neg + neg
Bifissio spartinae Bacteroidetes Rare neg
Bilophila wadsworthia Desulfobacterota Widespread neg + + + neg d(+) neg neg neg
Bittarella massiliensis Firmicutes Moderate neg neg neg
Blastococcus massiliensis Actinobacteria Rare + + neg
Blastomonas natatoria Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg + neg w neg neg w neg 80(+)
Blautia brookingsii Firmicutes Rare +
Blautia caecimuris Firmicutes Rare + neg +
Blautia coccoides Firmicutes Minor + neg neg neg + neg neg neg neg curdle
Blautia faecicola Firmicutes Rare + neg neg
Blautia faecis Firmicutes Rare + neg neg neg
Blautia glucerasea Firmicutes Rare + neg neg
Blautia hansenii Firmicutes Moderate + neg neg neg vr neg neg curdle neg
Blautia hominis Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Blautia hydrogenotrophica Firmicutes Moderate + neg neg neg + + +
Blautia intestinalis Firmicutes Rare +
Blautia liquoris Firmicutes Rare +
Blautia luti Firmicutes Minor + neg neg neg + neg
Blautia marasmi Firmicutes Rare +
Blautia massiliensis Firmicutes Moderate neg neg neg neg neg neg
Blautia obeum Firmicutes Widespread + neg neg neg neg neg curdle
Blautia phocaeensis Firmicutes Rare + neg neg neg
Blautia producta Firmicutes Widespread + neg neg + neg + neg neg neg
Blautia provencensis Firmicutes Rare +
Blautia pseudococcoides Firmicutes Rare + neg neg + neg neg neg neg curdles
Blautia schinkii Firmicutes Rare + neg neg neg
Blautia stercoris Firmicutes Minor + neg neg neg
Blautia wexlerae Firmicutes Moderate + neg neg + + neg
Bordetella bronchiseptica Proteobacteria Non neg + + d +
Bordetella hinzii Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg
Bordetella trematum Proteobacteria Non neg + neg d neg neg neg neg
Bosea massiliensis Proteobacteria Rare neg + + alpha d neg + neg
Brachybacterium conglomeratum Actinobacteria Rare + + neg + d + + d(neg) + 20(neg) 40(neg) 60(d) 80(d)
Brachybacterium faecium Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + d neg + d neg d neg neg d neg
Brachybacterium ginsengisoli Actinobacteria Unlikely + + neg + + neg + + + + + 20(neg) 80(neg)
Brachybacterium massiliense Actinobacteria Rare + + neg neg 80(+)
Brachybacterium muris Actinobacteria Rare + + neg neg + neg + + neg neg 20(+) 80(d)
Brachybacterium paraconglomeratum Actinobacteria Rare + + neg + + neg + + + + neg
Brachymonas chironomi Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg
Brachyspira aalborgi Spirochaetes Rare neg neg neg w
Brachyspira hyodysenteriae Spirochaetes Rare neg + beta neg + neg
Brachyspira pilosicoli Spirochaetes Unlikely neg w neg + neg neg + neg
Bradyrhizobium denitrificans Proteobacteria Rare neg + + + neg + + neg
Bradyrhizobium elkanii Proteobacteria Rare neg + neg neg neg vr neg
Bradyrhizobium ganzhouense Proteobacteria Unlikely neg + + neg 80(+)
Bradyrhizobium icense Proteobacteria Unlikely neg +
Bradyrhizobium japonicum Proteobacteria Rare neg + + + neg + neg neg neg
Bradyrhizobium neotropicale Proteobacteria Rare neg + + neg + + neg
Brassicibacter mesophilus Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg neg
Brenneria populi Li et al. 2015 Proteobacteria Rare neg + neg neg + neg neg
Brevibacillus agri Firmicutes Unlikely + + neg neg beta neg neg neg neg neg vr neg + + + neg + 60(+) 80(+)
Brevibacillus borstelensis Firmicutes Rare + + neg neg + + neg vr neg neg + neg + + +
Brevibacillus brevis Firmicutes Rare vr + + neg + + + neg + neg + neg + + neg
Brevibacillus centrosporus Firmicutes Unlikely + + neg neg vr d neg neg neg neg vr neg neg neg
Brevibacillus choshinensis Firmicutes Rare + + + neg neg neg neg neg neg d 60(neg) 80(neg)
Brevibacillus formosus Firmicutes Unlikely + + neg neg + + neg neg neg + neg + neg +
Brevibacillus laterosporus Firmicutes Rare vr + + neg neg neg + neg +
Brevibacillus massiliensis Firmicutes Rare + + + neg neg neg neg
Brevibacillus parabrevis Firmicutes Unlikely vr + + + + neg neg + neg + + 60(+) 80(+)
Brevibacillus thermoruber Firmicutes Non + neg neg neg neg + + + neg curdle
Brevibacterium aurantiacum Actinobacteria Unlikely + + + + neg neg d neg +
Brevibacterium casei Actinobacteria Rare + + neg vr + vr neg + + + +
Brevibacterium celere Actinobacteria Rare + + + neg neg + neg neg + 40(+) 80(+)
Brevibacterium epidermidis Actinobacteria Rare + + neg neg + neg neg + + + +
Brevibacterium ihuae Actinobacteria Rare + + neg
Brevibacterium iodinum Actinobacteria Unlikely vr + + neg neg neg neg + w + neg
Brevibacterium linens Actinobacteria Unlikely + + w vr neg neg + + + +
Brevibacterium luteolum Actinobacteria Rare + + neg neg neg + + neg neg
Brevibacterium mcbrellneri Actinobacteria Unlikely + + neg beta neg + + neg neg + + d 80(neg)
Brevibacterium otitidis Actinobacteria Non + + neg neg + +
Brevibacterium paucivorans Actinobacteria Rare + + neg neg neg w neg neg neg
Brevibacterium pityocampae Actinobacteria Rare + + neg + + neg + neg neg
Brevibacterium ravenspurgense Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg 40(+) 80(+)
Brevibacterium samyangense Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg + neg 40(+) 80(+)
Brevibacterium sanguinis Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg + + + +
Brevibacterium senegalense Actinobacteria Rare + + neg + w
Brevundimonas aurantiaca Proteobacteria Rare neg + neg +
Brevundimonas bacteroides Proteobacteria Rare neg + d w
Brevundimonas bullata Proteobacteria Rare neg vr + + vr + neg + neg neg 40(neg) 80(neg)
Brevundimonas diminuta Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg neg 80(neg)
Brevundimonas intermedia Proteobacteria Rare neg + neg +
Brevundimonas nasdae Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg + neg neg neg neg neg 80(neg)
Brevundimonas terrae Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg neg neg + neg neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Brevundimonas vesicularis Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg + neg neg neg 80(neg)
Brochothrix thermosphacta Firmicutes Unlikely + + neg neg neg + + neg neg vr neg neg neg curdle neg 20(neg) 40(neg) 60(vr) 80(neg)
Brucella anthropi Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg neg neg
Brucella cytisi Proteobacteria Rare neg + + + + + neg neg
Brucella melitensis Proteobacteria Non neg + + neg neg
Brucella tritici Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg + neg 40(+) 80(+)
Buchnera aphidicola Proteobacteria Non neg
Bulleidia extructa Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg +
Burkholderia arboris Proteobacteria Rare neg + beta(d) d neg neg +
Burkholderia cepacia Proteobacteria Rare neg + w vr neg vr neg vr neg 80(+)
Burkholderia gladioli Proteobacteria Unlikely neg + + d neg neg d(+) + neg + + neg 20(+) 80(+)
Burkholderia mallei Proteobacteria Unlikely neg + + + + d +
Burkholderia multivorans Proteobacteria Rare neg + + + neg neg + neg neg neg neg neg 20(+) 80(+)
Burkholderia pseudomallei Proteobacteria Unlikely neg
Burkholderia pyrrocinia Proteobacteria Unlikely neg + neg neg d neg neg neg
Burkholderia vietnamiensis Proteobacteria Rare neg + + d(+) + neg neg
Buttiauxella agrestis Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg + neg neg neg 80(neg)
Butyribacter intestini Firmicutes Rare + neg +
Butyricicoccus faecihominis Firmicutes Rare + neg neg neg
Butyricicoccus porcorum Firmicutes Rare + neg neg + neg neg neg
Butyricicoccus pullicaecorum Firmicutes Minor + + neg
Butyricimonas faecalis Bacteroidetes Rare neg + neg neg neg neg
Butyricimonas faecihominis Bacteroidetes Rare neg + neg neg neg neg
Butyricimonas paravirosa Bacteroidetes Rare neg + neg neg neg neg
Butyricimonas phoceensis Bacteroidetes Rare neg + neg
Butyricimonas synergistica Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg +
Butyricimonas virosa Bacteroidetes Moderate neg + neg + neg neg
Butyrivibrio crossotus Firmicutes Widespread neg neg neg neg neg vr neg + neg curdle
Butyrivibrio fibrisolvens Firmicutes Minor neg neg neg neg d neg vr neg neg
Butyrivibrio hungatei Firmicutes Unlikely neg neg neg neg neg neg d(neg) neg
Butyrivibrio proteoclasticus Firmicutes Rare + neg neg neg + curdle
Caballeronia novacaledonica Proteobacteria Rare neg + neg neg neg d
Caecibacter massiliensis Firmicutes Rare
Caldibacillus thermoamylovorans Firmicutes Unlikely + + neg neg neg + neg neg neg +
Caldicellulosiruptor diazotrophicus Firmicutes Non +
Caldicoprobacter faecalis Firmicutes Unlikely neg
Caloranaerobacter azorensis Firmicutes Non neg neg neg + neg
Campylobacter avium Proteobacteria Non neg w + alpha(neg) + neg +
Campylobacter coli Proteobacteria Unlikely neg + + d(neg) + neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter concisus Proteobacteria Minor neg neg d neg + d(neg) neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter curvus Proteobacteria Rare neg neg + neg + + neg neg neg neg neg neg neg neg d(neg)
Campylobacter faecalis Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter fetus subsp. fetus Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter gracilis Proteobacteria Minor neg d(neg) neg neg d(+) + neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter hominis Proteobacteria Minor neg neg + neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter hyointestinalis subsp. hyointestinalis Proteobacteria Unlikely neg + + alpha(d) + + neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter jejuni subsp. doylei Proteobacteria Rare neg d(+) + neg neg neg neg neg neg neg neg neg +
Campylobacter jejuni subsp. jejuni Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter lanienae Proteobacteria Rare neg + + + + neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter lari subsp. concheus Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter lari subsp. lari Proteobacteria Rare neg + + alpha + neg neg vr neg neg neg neg neg
Campylobacter mucosalis Proteobacteria Rare neg neg + + + neg neg
Campylobacter peloridis Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg
Campylobacter rectus Proteobacteria Rare neg neg neg + + neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter showae Proteobacteria Rare neg + vr + + + neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter sputorum Proteobacteria Non neg neg + alpha + neg neg
Campylobacter troglodytis Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg
Campylobacter upsaliensis Proteobacteria Rare neg neg + + neg neg neg neg neg neg neg neg
Campylobacter ureolyticus Proteobacteria Minor neg d + alpha(d) + neg + neg d(neg) neg neg neg
Candidatus Babela massiliensis Candidatus Dependentiae Unlikely neg
Candidatus Dorea massiliensis Firmicutes Rare +
Candidatus Stoquefichus massiliensis Firmicutes Rare + + +
Capnocytophaga canimorsus Bacteroidetes Unlikely neg + + neg neg d d neg neg
Capnocytophaga gingivalis Bacteroidetes Non neg neg neg neg neg neg + neg neg
Capnocytophaga granulosa Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg neg neg
Capnocytophaga leadbetteri Bacteroidetes Rare neg neg neg beta(neg) + neg neg neg d
Capnocytophaga ochracea Bacteroidetes Rare neg neg neg w d(neg) d + + neg d vr neg + neg neg
Capnocytophaga sputigena Bacteroidetes Rare neg neg neg neg + + + neg d(+) neg + + neg
Capnocytophaga stomatis Bacteroidetes Unlikely neg + + beta + + +
Caproicibacter fermentans Firmicutes Rare neg
Cardiobacterium hominis Proteobacteria Rare neg neg + neg neg neg neg neg
Cardiobacterium valvarum Proteobacteria Rare neg neg + neg neg neg
Carnobacterium divergens Firmicutes Non + neg neg neg + w neg neg +
Carnobacterium inhibens Firmicutes Rare + pseudo(+) neg alpha neg neg neg neg +
Carnobacterium maltaromaticum Firmicutes Unlikely + neg neg neg + + +
Carnobacterium mobile Firmicutes Non + neg neg neg + neg
Casaltella massiliensis Firmicutes Rare neg
Catenibacillus scindens Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg
Catenibacterium mitsuokai Firmicutes Moderate + neg neg neg +
Catenulispora acidiphila Actinobacteria Unlikely + + neg + + +
Catonella morbi Firmicutes Rare neg neg neg neg + d(neg) d(+) neg curdles
Caulobacter vibrioides Proteobacteria Unlikely neg + neg
Cedecea davisae Proteobacteria Rare neg + neg + + + vr + neg neg neg neg neg neg 40(+) 60(+) 80(+)
Cedecea lapagei Proteobacteria Rare neg + neg + + + + + neg neg neg neg neg 40(+) 60(+) 80(+)
Cedecea neteri Proteobacteria Rare neg neg + + + + + neg neg neg neg neg neg
Cellulomonas carbonis Actinobacteria Unlikely + + neg neg + neg + neg + + neg neg neg 80(neg)
Cellulomonas composti Actinobacteria Rare + neg + + neg w + neg + +
Cellulomonas denverensis Actinobacteria Rare + + + + + neg neg neg
Cellulomonas fimi Actinobacteria Rare + + + + + + neg
Cellulomonas flavigena Actinobacteria Rare + + + + neg + + neg
Cellulomonas hominis Actinobacteria Rare + + + + neg + neg +
Cellulomonas massiliensis Actinobacteria Rare + + + neg + neg
Cellulomonas parahominis Actinobacteria Rare +
Cellulomonas timonensis Actinobacteria Rare + + neg + +
Cellulosilyticum lentocellum Firmicutes Rare neg neg neg neg +
Cellulosilyticum ruminicola Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg neg
Cellulosimicrobium cellulans Actinobacteria Rare + + + neg + neg w + + +
Centipeda periodontii Firmicutes Rare neg neg neg neg + d(+) neg neg neg
Cerasibacillus quisquiliarum Firmicutes Non + + + neg neg neg neg + neg
Cetobacterium somerae Fusobacteria Rare neg neg + + d d neg
Chelatococcus asaccharovorans Proteobacteria Unlikely neg neg +
Chitinophaga agri Bacteroidetes Unlikely neg + neg + + neg + + + neg 80(+)
Chlamydia trachomatis Chlamydiae Non neg
Chloracidobacterium thermophilum Acidobacteria Non neg neg + HCO3-
Christensenella hongkongensis Firmicutes Minor + + neg neg neg neg neg
Christensenella massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg
Christensenella minuta Firmicutes Minor neg neg neg neg neg neg neg
Christensenella timonensis Firmicutes Minor neg neg neg
Chromobacterium violaceum Proteobacteria Unlikely neg neg + + + d(+) neg + neg + + + 80(+)
Chromohalobacter japonicus Proteobacteria Unlikely neg + neg + neg neg neg neg + neg neg neg 40(neg) 80(neg)
Chromohalobacter salexigens Proteobacteria Unlikely neg + neg + + neg neg neg neg neg + neg 80(neg)
Chryseobacterium gallinarum Bacteroidetes Unlikely neg + + neg neg + + + + + + +
Chryseobacterium gleum Bacteroidetes Unlikely neg + + neg d d d(+) + d + d(+) + d + neg 20(+) 80(+)
Chryseobacterium hominis Bacteroidetes Rare neg + d(+) neg + neg vr + d d(+) 80(neg)
Chryseobacterium indologenes Bacteroidetes Rare neg + + + d(+) + neg + + + +
Chryseobacterium oranimense Bacteroidetes Rare neg + + neg neg + neg + + + +
Chryseobacterium taklimakanense Bacteroidetes Rare neg + + neg neg + + neg + + + neg neg neg 20(neg) 80(neg)
Chryseobacterium viscerum Bacteroidetes Non neg + + + + neg neg + + + + + + neg neg neg 80(+)
Chryseomicrobium amylolyticum Firmicutes Rare + + neg neg neg neg neg + neg
Citrobacter amalonaticus Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg + neg d(+) neg neg
Citrobacter braakii Proteobacteria Rare neg + neg + + d(+) neg neg neg d neg
Citrobacter europaeus Proteobacteria Rare neg + neg + neg neg
Citrobacter farmeri Proteobacteria Minor neg + neg + + + + neg neg neg + neg
Citrobacter freundii Proteobacteria Minor neg + neg + + + vr neg neg d neg
Citrobacter gillenii Proteobacteria Rare neg + neg + + neg neg neg neg neg
Citrobacter intermedius Proteobacteria Unlikely neg + neg +
Citrobacter koseri Proteobacteria Minor neg + neg + + + neg d neg + neg
Citrobacter murliniae Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg neg neg d neg
Citrobacter pasteurii Proteobacteria Rare neg neg neg + neg + neg
Citrobacter portucalensis Proteobacteria Rare neg neg neg + + neg neg neg
Citrobacter rodentium Proteobacteria Rare neg + + + neg + + neg neg
Citrobacter sedlakii Proteobacteria Rare neg + neg + + + + neg + neg + neg
Citrobacter werkmanii Proteobacteria Rare neg + neg + + + + neg neg + neg
Citrobacter youngae Proteobacteria Rare neg d(+) neg + + + neg neg d neg d neg
Citroniella saccharovorans Firmicutes Rare + neg neg
Cloacibacillus evryensis Synergistetes Minor neg neg neg
Cloacibacillus porcorum Synergistetes Rare neg neg +
Cloacibacterium normanense Bacteroidetes Rare neg + + neg neg + neg + + + neg w neg neg neg neg neg
Clostridioides difficile Firmicutes Widespread + neg neg d + neg + neg neg +
Clostridioides mangenotii Firmicutes Rare + neg neg neg + d
Clostridium acetobutylicum Firmicutes Rare + neg neg neg + + + + curdle
Clostridium amazonense Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium amazonitimonense Firmicutes Rare + neg neg
Clostridium aminobutyricum Firmicutes Rare + neg neg + + + + curdles
Clostridium aminophilum Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium amylolyticum Firmicutes Rare + neg neg neg + neg + neg
Clostridium anorexicamassiliense Firmicutes Rare + + neg
Clostridium argentinense Firmicutes Rare + neg beta neg + neg + neg +
Clostridium aurantibutyricum Firmicutes Rare + + + neg neg +
Clostridium autoethanogenum Firmicutes Rare + neg +
Clostridium baratii Firmicutes Minor + neg + beta(d(+)) vr d + neg d neg neg acid
Clostridium beijerinckii Firmicutes Minor + neg d d neg + d(neg) +
Clostridium boliviensis Firmicutes Rare + +
Clostridium bornimense Firmicutes Rare vr + w
Clostridium botulinum Gp I Firmicutes Unlikely + d beta neg neg neg + neg d curdle
Clostridium botulinum Gp II Firmicutes Unlikely + neg beta neg + d neg neg
Clostridium botulinum Gp III Firmicutes Unlikely + neg beta + + neg + curdle
Clostridium botulinum Gp IV Firmicutes Unlikely + beta neg + neg + d d
Clostridium budayi Firmicutes Rare + neg + + neg d neg neg
Clostridium butyricum Firmicutes Widespread + neg neg + neg neg neg neg +
Clostridium cadaveris Firmicutes Rare + vr d(neg)
Clostridium cagae Firmicutes Rare + + neg neg
Clostridium carboxidivorans Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg +
Clostridium carnis Firmicutes Rare + beta(w) neg + neg neg neg
Clostridium celatum Firmicutes Minor + alpha(vr) vr curdle(w)
Clostridium cellulosi Firmicutes Unlikely neg neg neg + neg + c
Clostridium cellulovorans Firmicutes Rare neg +
Clostridium chartatabidum Firmicutes Rare + neg neg + +
Clostridium chauvoei Firmicutes Rare + + beta neg neg neg neg
Clostridium cochlearium Firmicutes Minor + vr neg + w neg neg neg d
Clostridium cocleatum Firmicutes Rare + neg neg d + neg neg + neg + + 80(neg)
Clostridium colicanis Firmicutes Rare neg neg neg + + + neg
Clostridium colinum Firmicutes Rare + neg neg + neg neg d(neg) neg neg
Clostridium combesii Firmicutes Rare + beta neg d(+) + neg d(neg) curdle
Clostridium culturomicium Firmicutes Rare + neg neg
Clostridium dakarense Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium diolis Firmicutes Rare + neg + neg curdle +
Clostridium disporicum Firmicutes Minor + neg alpha neg + neg + neg neg + +
Clostridium drakei Firmicutes Unlikely + + neg + neg neg
Clostridium estertheticum Firmicutes Unlikely + beta(neg) + neg w neg
Clostridium fallax Firmicutes Rare + + + neg + d
Clostridium felsineum Firmicutes Rare + beta(w) d(+) +
Clostridium fessum Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Clostridium gasigenes Firmicutes Unlikely + beta + + + curdle
Clostridium haemolyticum Firmicutes Rare +
Clostridium herbivorans Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg d
Clostridium hylemonae Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg neg
Clostridium ihumii Firmicutes Rare + neg + neg + +
Clostridium innocuum Firmicutes Widespread + neg neg neg neg neg neg neg neg
Clostridium intestinale Firmicutes Rare + neg beta neg + neg
Clostridium isatidis Firmicutes Unlikely + neg neg + neg neg neg neg
Clostridium jeddahense Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium jeddahitimonense Firmicutes Rare + neg neg
Clostridium kluyveri Firmicutes Unlikely vr neg + neg + neg neg neg
Clostridium leptum Firmicutes Widespread + neg neg neg neg + d
Clostridium magnum Firmicutes Rare neg neg neg neg neg
Clostridium malenominatum Firmicutes Rare + vr d(neg) neg neg neg
Clostridium manihotivorum Firmicutes Rare + neg + + curdle +
Clostridium massiliamazoniense Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium massiliodielmoense Firmicutes Rare + neg neg
Clostridium mediterraneense Firmicutes Rare + neg neg
Clostridium merdae Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium metallolevans Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium methoxybenzovorans Firmicutes Rare + neg neg +
Clostridium methylpentosum Firmicutes Moderate + neg neg + + neg + +
Clostridium minihomine Firmicutes Rare + neg neg
Clostridium moniliforme Firmicutes Rare + neg d neg + neg neg + neg neg neg
Clostridium neonatale Firmicutes Minor + neg neg neg neg + neg + neg d
Clostridium niameyense Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Clostridium nigeriense Firmicutes Rare + neg +
Clostridium nitritogenes Firmicutes Rare + neg + neg neg neg neg neg
Clostridium novyi A Firmicutes Rare + + beta + neg d(+) vr(w) curdle
Clostridium oceanicum Firmicutes Rare + + neg neg + + d + + + d neg
Clostridium paraputrificum Firmicutes Moderate + vr d + neg + + neg
Clostridium pasteurianum Firmicutes Rare + neg + neg + neg neg
Clostridium perfringens Firmicutes Widespread + + + d neg + d vr d
Clostridium phoceensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Clostridium polyendosporum Firmicutes Rare + neg neg + neg neg +
Clostridium polynesiense Firmicutes Rare + neg neg +
Clostridium polysaccharolyticum Firmicutes Rare neg neg neg w neg + + + w
Clostridium populeti Firmicutes Rare neg neg neg w neg neg +
Clostridium punense Firmicutes Rare + neg neg alpha neg neg
Clostridium putrefaciens Firmicutes Minor + beta neg neg neg + neg
Clostridium rectalis Firmicutes Rare + + neg neg
Clostridium roseum Firmicutes Rare + neg neg + + neg curdles
Clostridium saccharobutylicum Firmicutes Unlikely + neg + neg + curdle
Clostridium saccharoperbutylacetonicum Firmicutes Rare + neg neg neg + + + neg neg curdle
Clostridium sardiniense Firmicutes Rare + + + + w +
Clostridium sartagoforme Firmicutes Minor + neg d + d neg neg d(neg)
Clostridium saudiense Firmicutes Minor + neg neg neg
Clostridium scatologenes Firmicutes Rare + neg neg + vr neg neg neg d
Clostridium schirmacherense Firmicutes Unlikely + neg neg beta(neg) neg neg + + +
Clostridium scindens Firmicutes Moderate + neg neg neg neg neg neg neg neg
Clostridium senegalense Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium septicum Firmicutes Rare + beta d neg + neg neg neg d + neg +
Clostridium sporogenes Firmicutes Minor + neg beta(d(+)) neg + neg + neg + d +
Clostridium sporosphaeroides Firmicutes Minor + neg neg neg +
Clostridium subterminale Firmicutes Rare + d(neg) beta(d(+)) neg neg neg + + vr d
Clostridium sulfidigenes Firmicutes Rare + neg neg +
Clostridium symbiosum Firmicutes Widespread neg neg neg vr neg neg neg neg neg curdle(d)
Clostridium taeniosporum Firmicutes Unlikely +
Clostridium tertium Firmicutes Moderate + neg neg vr d neg + neg neg d neg + + neg
Clostridium tetani Firmicutes Unlikely + beta neg neg neg + d(neg) vr neg
Clostridium thermarum Firmicutes Unlikely + + d + +
Clostridium thermobutyricum Firmicutes Rare vr neg neg neg neg w neg neg neg neg
Clostridium thiosulfatireducens Firmicutes Rare + neg neg neg +
Clostridium transplantifaecale Firmicutes Rare + + neg
Clostridium tyrobutyricum Firmicutes Rare + beta(d(+)) d neg neg neg neg neg neg
Clostridium vincentii Firmicutes Rare + neg neg neg
Clostridium viride Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg
Colibacter massiliensis Firmicutes Rare + neg neg + +
Colidextribacter massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg
Collinsella aerofaciens Actinobacteria Widespread + neg neg neg neg neg
Collinsella bouchesdurhonensis Actinobacteria Minor + neg neg +
Collinsella ihumii Actinobacteria Rare + neg neg neg
Collinsella intestinalis Actinobacteria Moderate + neg neg
Collinsella massiliensis Actinobacteria Rare + neg neg neg
Collinsella phocaeensis Actinobacteria Rare neg neg neg neg
Collinsella provencensis Actinobacteria Rare + neg neg
Collinsella stercoris Actinobacteria Minor + neg neg
Collinsella tanakaei Actinobacteria Minor + neg neg neg + neg neg
Collinsella vaginalis Actinobacteria Rare + neg neg
Comamonas aquatica Proteobacteria Non neg + + + neg neg neg neg
Comamonas denitrificans Proteobacteria Rare neg + + + + +
Comamonas kerstersii Proteobacteria Rare neg + + + neg neg neg neg +
Comamonas koreensis Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg neg 80(+)
Comamonas terrigena Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg neg neg + neg 80(neg)
Comamonas testosteroni Proteobacteria Rare neg + + vr neg neg neg neg neg neg 80(d)
Comamonas thiooxydans Proteobacteria Rare neg + + neg + neg + neg +
Companilactobacillus alimentarius Firmicutes Rare + neg neg + + neg neg +
Companilactobacillus farciminis Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg +
Companilactobacillus mindensis Firmicutes Unlikely + neg neg neg
Companilactobacillus versmoldensis Firmicutes Unlikely + neg neg
Conexibacter woesei Actinobacteria Rare + + + + + neg + 40(neg) 80(neg)
Congobacterium massiliense Firmicutes Rare +
Coprobacillus cateniformis Firmicutes Moderate + neg d neg d
Coprobacter fastidiosus Bacteroidetes Moderate neg + neg neg neg +
Coprobacter secundus Bacteroidetes Moderate neg + + +
Coprobacter secundus subsp. similis Bacteroidetes Rare neg + w neg + neg neg
Coprococcus catus Firmicutes Widespread + alpha(w) neg neg neg neg
Coprococcus comes Firmicutes Widespread + alpha(w) vr neg neg neg
Coprococcus eutactus Firmicutes Widespread + neg + + vr curdle neg
Coprococcus phoceensis Firmicutes Rare vr neg neg
Coraliomargarita akajimensis Verrucomicrobia Non neg neg + neg + neg + neg neg neg w neg
Coriobacterium glomerans Actinobacteria Unlikely +
Corynebacterium accolens Actinobacteria Rare + + neg neg neg + neg neg d(neg) neg neg neg neg
Corynebacterium afermentans Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg neg neg neg vr
Corynebacterium ammoniagenes Actinobacteria Rare + + + + + neg + neg neg neg + neg neg + neg
Corynebacterium amycolatum Actinobacteria Rare + + neg + d + neg neg neg + neg neg d neg
Corynebacterium appendicis Actinobacteria Rare + + neg neg + neg + neg neg neg
Corynebacterium argentoratense Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg d neg neg d
Corynebacterium aurimucosum Actinobacteria Rare + + d(neg) neg + d d(neg) d(neg) neg +
Corynebacterium bouchesdurhonense Actinobacteria Rare + + +
Corynebacterium bovis Actinobacteria Rare + + d neg neg neg neg neg +
Corynebacterium callunae Actinobacteria Unlikely + + neg + neg neg + neg neg +
Corynebacterium casei Actinobacteria Rare + + neg + neg neg neg neg neg
Corynebacterium coyleae Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg neg neg
Corynebacterium cystitidis Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg + neg + neg neg neg neg + neg 80(+)
Corynebacterium diphtheriae Actinobacteria Non vr + d(+)
Corynebacterium doosanense Actinobacteria Rare + + + + neg neg neg +
Corynebacterium durum Actinobacteria Minor + + + + w w neg neg
Corynebacterium efficiens Actinobacteria Rare + + + vr vr neg
Corynebacterium falsenii Actinobacteria Rare + + neg neg + neg neg neg
Corynebacterium flavescens Actinobacteria Rare vr + + neg + neg neg neg neg neg 80(neg)
Corynebacterium freneyi Actinobacteria Rare + + d(+) + neg neg neg neg
Corynebacterium genitalium Actinobacteria Rare + + neg neg neg 80(d)
Corynebacterium glaucum Actinobacteria Rare + + neg + neg neg neg neg +
Corynebacterium glucuronolyticum Actinobacteria Rare + + neg d vr vr neg
Corynebacterium glutamicum Actinobacteria Rare + + + neg neg neg +
Corynebacterium ihumii Actinobacteria Rare + + neg neg neg
Corynebacterium jeddahense Actinobacteria Rare + + neg
Corynebacterium jeikeium Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg 20(+) 40(neg) 60(neg) 80(+)
Corynebacterium kroppenstedtii Actinobacteria Minor + + neg neg neg + + neg neg neg
Corynebacterium lipophiloflavum Actinobacteria Rare + + neg neg w
Corynebacterium lujinxingii Actinobacteria Rare + + neg
Corynebacterium matruchotii Actinobacteria Unlikely + + + + + neg + +
Corynebacterium minutissimum Actinobacteria Rare + + neg neg + neg neg neg neg + neg
Corynebacterium mucifaciens Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg +
Corynebacterium neomassiliense Actinobacteria Rare + + neg neg
Corynebacterium otitidis Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg
Corynebacterium pacaense Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg
Corynebacterium propinquum Actinobacteria Rare + + neg neg neg + + neg neg vr neg neg + vr
Corynebacterium provencense Actinobacteria Rare + + + neg
Corynebacterium pseudodiphtheriticum Actinobacteria Rare + + neg + + +
Corynebacterium pseudogenitalium Actinobacteria Rare + + + neg + neg d(neg) neg
Corynebacterium pyruviciproducens Actinobacteria Rare + + neg neg neg
Corynebacterium riegelii Actinobacteria Rare + + neg neg +
Corynebacterium sanguinis Actinobacteria Rare + + neg neg + neg neg +
Corynebacterium simulans Actinobacteria Rare + + + + + neg neg neg + 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Corynebacterium singulare Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg + neg +
Corynebacterium stationis Actinobacteria Rare + + neg + + neg neg neg + neg neg neg + neg
Corynebacterium striatum Actinobacteria Rare + + vr + neg neg neg neg neg + neg
Corynebacterium suicordis Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg + neg
Corynebacterium sundsvallense Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg + neg neg +
Corynebacterium tuberculostearicum Actinobacteria Rare + + neg d(neg) neg neg neg neg neg vr
Corynebacterium ulcerans Actinobacteria Rare + + neg w neg neg neg neg + d + neg + +
Corynebacterium urealyticum Actinobacteria Rare + + neg neg neg d neg + neg neg d 80(+)
Corynebacterium ureicelerivorans Actinobacteria Rare + + neg neg neg + neg + neg +
Corynebacterium urinapleomorphum Actinobacteria Rare + + neg neg
Corynebacterium variabile Actinobacteria Unlikely + + neg vr neg + + + vr neg neg neg
Corynebacterium wankanglinii Actinobacteria Rare + + neg
Corynebacterium xerosis Actinobacteria Rare + + neg + + neg neg vr d(neg)
Crassaminicella thermophila Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg
Criibacterium bergeronii Firmicutes Rare vr neg
Cronobacter condimenti Proteobacteria Unlikely neg + neg neg + + neg + +
Cronobacter muytjensii Proteobacteria Rare neg + neg neg + + + neg +
Cronobacter sakazakii Proteobacteria Minor neg + neg neg + + + + + neg neg neg + neg
Cronobacter turicensis Proteobacteria Rare neg + neg neg + neg + neg +
Cruoricaptor ignavus Bacteroidetes Rare neg + + neg neg neg neg neg + + + + neg neg neg 80(+)
Cryptobacterium curtum Actinobacteria Minor + neg neg neg neg neg neg neg +
Culturomica massiliensis Bacteroidetes Rare neg + neg
Cupriavidus metallidurans Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg neg neg 80(neg)
Curtobacterium flaccumfaciens Actinobacteria Unlikely + + neg neg + neg vr + neg neg
Cutibacterium acnes Actinobacteria Moderate + vr d + neg neg neg vr neg
Cutibacterium acnes subsp. defendens Actinobacteria Rare + + neg + neg +
Cutibacterium avidum Actinobacteria Rare + neg neg + curdle
Cutibacterium granulosum Actinobacteria Minor +
Cytophaga hutchinsonii Bacteroidetes Rare neg + + + neg neg neg neg
Dakarella massiliensis Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg
Dakotella fusiforme Firmicutes Rare +
Dehalobacter restrictus Firmicutes Non neg neg neg neg neg neg neg
Dehalobacterium formicoaceticum Firmicutes Unlikely +
Dehalococcoides mccartyi Chloroflexi Unlikely unk
Deinococcus aquaticus Deinococcus-Thermus Unlikely neg + + neg + neg neg + neg
Deinococcus caeni Deinococcus-Thermus Unlikely neg + neg neg neg neg neg + neg
Deinococcus geothermalis Deinococcus-Thermus Non + + + neg d + + 40(+) 80(neg)
Deinococcus proteolyticus Deinococcus-Thermus Unlikely + + neg + +
Deinococcus reticulitermitis Deinococcus-Thermus Unlikely neg neg + + + +
Deinococcus wulumuqiensis Deinococcus-Thermus Unlikely + neg neg w
Delftia acidovorans Proteobacteria Rare neg + + + neg neg neg 80(+)
Delftia lacustris Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg + 40(+) 80(+)
Delftia tsuruhatensis Proteobacteria Rare neg + + + neg + neg w neg 80(+)
Dellaglioa algida Firmicutes Rare + neg neg neg neg + neg neg
Denitrobacterium detoxificans Actinobacteria Rare + + neg neg
Dermabacter hominis Actinobacteria Rare + + neg neg neg + neg + + + neg neg neg neg neg 80(d(w))
Dermacoccus barathri Actinobacteria Non + + neg neg + 20(+) 40(+) 80(neg)
Dermacoccus nishinomiyaensis Actinobacteria Rare + + + neg neg vr neg neg neg + vr + 80(vr)
Desemzia incerta Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg neg +
Desnuesiella massiliensis Firmicutes Rare + neg neg
Desulfitobacterium dichloroeliminans Firmicutes Unlikely + + neg neg neg
Desulfitobacterium hafniense Firmicutes Minor neg w + + neg neg neg neg
Desulfococcus multivorans Proteobacteria Rare neg neg neg + neg
Desulfocurvibacter africanus Proteobacteria Unlikely neg w neg neg +
Desulfofarcimen acetoxidans Firmicutes Unlikely neg neg + HCO3-
Desulfomicrobium baculatum Proteobacteria Unlikely neg neg
Desulfomicrobium orale Proteobacteria Unlikely neg + +
Desulforamulus reducens Firmicutes Unlikely + + + + +
Desulforudis audaxviator Firmicutes Unlikely + neg neg neg + HCO3- neg
Desulfoscipio gibsoniae Firmicutes Rare neg neg neg + +
Desulfosporosinus youngiae Firmicutes Rare neg neg neg + neg
Desulfotomaculum ruminis Firmicutes Unlikely + neg neg + +
Desulfovibrio desulfuricans Proteobacteria Minor neg + neg neg + neg
Desulfovibrio diazotrophicus Proteobacteria Rare neg neg +
Desulfovibrio fairfieldensis Proteobacteria Minor neg + neg neg +
Desulfovibrio intestinalis Proteobacteria Rare neg + neg neg +
Desulfovibrio legallii Proteobacteria Rare + neg neg +
Desulfovibrio longreachensis Proteobacteria Rare neg +
Desulfovibrio piger Proteobacteria Moderate neg neg neg +
Desulfovibrio trichonymphae Proteobacteria Non unk + +
Desulfovibrio vulgaris Proteobacteria Rare neg neg neg +
Desulfurispirillum indicum Chrysiogenetes Unlikely neg + neg neg
Desulfurobacterium thermolithotrophum Aquificae Non neg neg + +
Devosia chinhatensis Proteobacteria Rare neg + + neg + + neg neg neg
Devosia limi Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg
Devosia riboflavina Proteobacteria Unlikely neg + + vr + vr neg neg
Dialister hominis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Dialister invisus Firmicutes Moderate neg neg neg neg neg
Dialister massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg neg
Dialister micraerophilus Firmicutes Rare neg
Dialister pneumosintes Firmicutes Minor neg neg neg neg neg
Dialister propionicifaciens Firmicutes Rare neg
Dialister succinatiphilus Firmicutes Minor neg neg neg neg neg neg
Dielma fastidiosa Firmicutes Minor neg neg neg neg +
Dietzia cercidiphylli Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + neg neg neg 20(+) 40(+) 80(+)
Dietzia cinnamea Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg + neg neg neg neg
Dietzia kunjamensis Actinobacteria Unlikely + + + neg + neg neg neg neg neg neg 40(+) 80(+)
Dietzia maris Actinobacteria Rare + + vr neg neg vr neg
Dietzia natronolimnaea Actinobacteria Rare + + neg + + neg neg
Dolosigranulum pigrum Firmicutes Unlikely + neg alpha(w) neg neg
Dorea faecis Firmicutes Minor
Dorea formicigenerans Firmicutes Widespread + neg neg neg neg neg neg neg neg vr
Dorea hylemonae Firmicutes Rare
Dorea longicatena Firmicutes Widespread + neg neg neg neg + neg neg neg
Dorea phocaeensis Firmicutes Rare neg neg neg
Dorea scindens Firmicutes Rare
Drancourtella massiliensis Firmicutes Rare + neg neg neg
Dubosiella newyorkensis Firmicutes Rare + neg neg
Duncaniella dubosii Bacteroidetes Unlikely neg neg neg neg + neg neg
Duncaniella muris Bacteroidetes Rare neg neg neg + neg +
Duodenibacillus massiliensis Proteobacteria Minor + neg neg
Dyadobacter beijingensis Bacteroidetes Unlikely neg + + neg neg neg + neg neg neg neg
Dyadobacter fermentans Bacteroidetes Unlikely neg + + neg + neg neg neg neg neg
Dysgonomonas capnocytophagoides Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg neg d neg neg
Dysgonomonas gadei Bacteroidetes Rare neg + neg alpha neg neg + neg neg neg
Dysgonomonas massiliensis Bacteroidetes Rare neg + neg
Dysgonomonas mossii Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg neg + neg neg +
Dysosmobacter welbionis Firmicutes Moderate neg neg neg + neg neg
Edwardsiella tarda Proteobacteria Minor neg neg neg + neg neg vr neg neg neg neg
Eggerthella guodeyinii Actinobacteria Rare +
Eggerthella lenta Actinobacteria Widespread + neg + neg neg +
Eggerthella sinensis Actinobacteria Rare + + vr neg
Eggerthella timonensis Actinobacteria Rare + + neg
Eggerthia catenaformis Firmicutes Minor + neg + neg neg neg
Eikenella corrodens Proteobacteria Rare neg neg + neg + + + neg + neg
Eisenbergiella massiliensis Firmicutes Moderate neg
Eisenbergiella tayi Firmicutes Moderate neg + neg neg + neg neg
Elizabethkingia meningoseptica Bacteroidetes Unlikely neg + + neg neg neg + neg + neg +
Elizabethkingia miricola Bacteroidetes Non neg + + neg + + + neg +
Ellagibacter isourolithinifaciens Actinobacteria Rare + neg neg
Elusimicrobium minutum Elusimicrobia Unlikely neg neg neg neg neg
Emergencia timonensis Firmicutes Minor + neg neg
Empedobacter brevis Bacteroidetes Rare neg + + neg neg neg + + + neg 20(+) 80(d)
Empedobacter falsenii Bacteroidetes Rare neg + + neg vr neg + + w + neg 80(+)
Enhydrobacter aerosaccus Proteobacteria Rare neg + + + neg 80(+)
Enorma massiliensis Actinobacteria Minor + neg neg vr
Enorma phocaeensis Actinobacteria Rare neg neg neg neg
Enorma timonensis Actinobacteria Rare + neg neg neg
Ensifer adhaerens Proteobacteria Unlikely neg w + neg + + + + neg neg neg neg neg
Enterobacter asburiae Proteobacteria Minor neg neg + + + d(+) + vr neg neg
Enterobacter cancerogenus Proteobacteria Minor neg neg + neg + neg neg neg 80(d(neg))
Enterobacter cloacae Proteobacteria Moderate neg neg + neg vr
Enterobacter cloacae subsp. dissolvens Proteobacteria Rare neg neg + + + + neg
Enterobacter himalayensis Proteobacteria Minor
Enterobacter hormaechei subsp. hormaechei Proteobacteria Minor neg neg + + neg vr neg
Enterobacter hormaechei subsp. steigerwaltii Proteobacteria Rare neg neg + + neg vr neg
Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis Proteobacteria Rare neg
Enterobacter kobei Proteobacteria Rare neg + neg + + d d(+) neg neg neg 80(neg)
Enterobacter ludwigii Proteobacteria Rare neg + neg + d(neg) neg + neg
Enterobacter massiliensis Proteobacteria Rare neg + neg neg + + neg neg neg
Enterobacter mori Proteobacteria Rare neg + + neg + + +
Enterobacter roggenkampii Proteobacteria Rare neg
Enterobacter soli Proteobacteria Rare neg w neg neg
Enterobacter timonensis Proteobacteria Rare neg
Enterocloster aldenensis Firmicutes Minor + neg neg d(neg) vr neg neg neg
Enterocloster asparagiformis Firmicutes Moderate + d + d neg +
Enterocloster bolteae Firmicutes Widespread + neg neg neg neg + neg + +
Enterocloster citroniae Firmicutes Moderate + neg neg neg neg neg neg +
Enterocloster clostridioformis Firmicutes Widespread + neg neg neg + + neg neg neg neg curdle(vr)
Enterocloster lavalensis Firmicutes Minor + neg neg vr neg neg neg neg + d
Enterococcus asini Firmicutes Rare + neg neg + + neg neg +
Enterococcus avium Firmicutes Minor + neg alpha neg + + neg neg neg neg
Enterococcus burkinafasonensis Firmicutes Rare + neg neg
Enterococcus caccae Firmicutes Rare + neg alpha neg + + neg neg d neg vr
Enterococcus canintestini Firmicutes Rare + + + + neg
Enterococcus canis Firmicutes Rare + neg alpha d + d neg neg
Enterococcus casseliflavus Firmicutes Moderate + neg alpha neg + + neg neg d(+) curdle d(+)
Enterococcus cecorum Firmicutes Rare + neg neg alpha neg + + neg neg neg neg
Enterococcus columbae Firmicutes Rare + neg neg + + + neg neg
Enterococcus devriesei Firmicutes Moderate + alpha + neg
Enterococcus diestrammenae Firmicutes Rare + neg neg
Enterococcus dispar Firmicutes Rare + neg neg + + neg neg vr
Enterococcus durans Firmicutes Moderate + neg alpha, beta(vr) neg + + neg + neg +
Enterococcus eurekensis Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg + + neg
Enterococcus faecalis Firmicutes Widespread + vr neg neg + + neg d(neg) neg +
Enterococcus faecium Firmicutes Widespread + neg alpha neg + + neg neg d +
Enterococcus gallinarum Firmicutes Rare + beta neg + + neg neg + +
Enterococcus gilvus Firmicutes Rare + neg + neg neg
Enterococcus haemoperoxidus Firmicutes Rare + vr neg + + w +
Enterococcus hermanniensis Firmicutes Rare + neg alpha + w neg
Enterococcus hirae Firmicutes Minor + + + neg neg neg
Enterococcus italicus Firmicutes Rare + neg alpha + + curdle neg
Enterococcus lactis Firmicutes Rare + neg neg alpha > gamma + + + + + neg
Enterococcus malodoratus Firmicutes Rare + neg neg + vr
Enterococcus massiliensis Firmicutes Rare + neg neg neg +
Enterococcus mediterraneensis Firmicutes Rare + neg neg gamma
Enterococcus moraviensis Firmicutes Rare + neg neg + + w +
Enterococcus mundtii Firmicutes Rare + neg neg + + neg + neg
Enterococcus pallens Firmicutes Rare + neg + neg neg +
Enterococcus phoeniculicola Firmicutes Rare + neg neg neg neg + neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Enterococcus pseudoavium Firmicutes Rare + neg alpha + + neg +
Enterococcus raffinosus Firmicutes Rare + neg + + neg neg
Enterococcus saccharolyticus Firmicutes Rare + neg neg neg neg + neg neg curdle neg
Enterococcus saigonensis Firmicutes Unlikely + neg neg alpha(w) + + neg neg
Enterococcus sulfureus Firmicutes Rare + + neg
Enterococcus thailandicus Firmicutes Rare + neg alpha neg + + neg neg + neg neg
Enterococcus timonensis Firmicutes Rare + neg neg + + +
Enterococcus villorum Firmicutes Rare + neg alpha + + neg neg
Enteroscipio rubneri Actinobacteria Rare + neg neg neg neg neg neg
Enterovibrio nigricans Proteobacteria Unlikely neg neg neg neg neg w neg 80(+)
Ereboglobus luteus Verrucomicrobia Unlikely neg neg neg neg neg
Erwinia billingiae Proteobacteria Unlikely neg + neg + + + + neg neg neg neg 20(d) 40(+) 60(+) 80(neg)
Erwinia tasmaniensis Proteobacteria Unlikely neg neg + neg
Erwinia teleogrylli Proteobacteria Rare neg + neg + + neg neg
Erysipelatoclostridium ramosum Firmicutes Widespread + neg neg neg neg neg + neg d(neg) neg neg curdle neg
Erysipelatoclostridium saccharogumia Firmicutes Minor
Erysipelatoclostridium spiroforme Firmicutes Minor
Erysipelothrix larvae Firmicutes Rare + neg neg + + 40(neg) 80(neg)
Escherichia albertii Proteobacteria Minor neg + neg + + neg neg neg
Escherichia coli Proteobacteria Widespread neg + neg + + + + neg d(neg) neg neg neg
Escherichia dysenteriae Proteobacteria Rare
Escherichia fergusonii Proteobacteria Minor neg + neg + + d(+) neg w neg neg neg
Escherichia marmotae Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg neg
Escherichia ruysiae Proteobacteria Rare neg + neg neg neg
Ethanoligenens harbinense Firmicutes Rare + neg neg + neg neg + + + + w curdle
Eubacterium barkeri Firmicutes Rare + neg neg neg neg + neg neg neg neg neg
Eubacterium biforme Firmicutes Moderate + neg neg neg d neg neg neg neg neg
Eubacterium brachy Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg
Eubacterium callanderi Firmicutes Minor + neg neg neg neg
Eubacterium cellulosolvens Firmicutes Minor + neg neg neg + neg neg neg w d neg
Eubacterium coprostanoligenes Firmicutes Minor + neg + neg neg
Eubacterium dolichum Firmicutes Moderate + neg neg vr neg neg neg neg neg
Eubacterium infirmum Firmicutes Rare + neg neg neg
Eubacterium limosum Firmicutes Moderate + neg + + neg + + neg d d neg neg neg + neg neg + neg
Eubacterium maltosivorans Firmicutes Rare + + neg neg neg neg +
Eubacterium multiforme Firmicutes Rare + neg + d(neg) + d neg neg curdle
Eubacterium nodatum Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg
Eubacterium oxidoreducens Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Eubacterium plexicaudatum Firmicutes Rare + + w neg
Eubacterium pyruvativorans Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Eubacterium ramulus Firmicutes Moderate + neg neg neg + neg neg neg neg curdle
Eubacterium rectale Firmicutes Widespread + neg neg neg + neg neg + neg neg neg
Eubacterium ruminantium Firmicutes Rare + neg d + w neg neg neg
Eubacterium saphenum Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg
Eubacterium siraeum Firmicutes Widespread + neg neg d neg neg d neg neg
Eubacterium sulci Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Eubacterium tenue Firmicutes Minor + neg neg neg neg + neg + neg vr d neg
Eubacterium uniforme Firmicutes Rare + neg neg + + w
Eubacterium ventriosum Firmicutes Widespread + neg neg + + neg neg neg neg curdle
Eubacterium xylanophilum Firmicutes Rare + neg neg + neg neg
Eubacterium yurii Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg d(neg) neg
Ewingella americana Proteobacteria Rare neg + neg + + + + + vr neg 40(+) 60(+) 80(neg)
Exiguobacterium aurantiacum Firmicutes Rare + + neg + + + neg + + + neg 80(neg)
Exiguobacterium marinum Firmicutes Rare vr + neg + + neg + neg + neg neg 80(neg)
Exiguobacterium mexicanum Firmicutes Rare + + + 40(neg) 80(neg)
Exiguobacterium undae Firmicutes Rare + + + neg neg + + + + 40(neg) 80(neg)
Ezakiella coagulans Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg + + 80(neg)
Ezakiella massiliensis Bacteroidetes Rare + + +
Ezakiella peruensis Firmicutes Rare + neg neg neg
Facklamia hominis Firmicutes Rare + neg alpha neg neg neg neg +
Facklamia languida Firmicutes Rare + neg neg alpha neg neg neg
Faecalibacillus faecis Firmicutes Rare + neg neg +
Faecalibacillus intestinalis Firmicutes Rare + neg neg
Faecalibacterium prausnitzii Firmicutes Widespread neg neg neg neg +
Faecalibaculum rodentium Firmicutes Rare + neg neg
Faecalicatena contorta Firmicutes Minor + neg neg d + neg neg neg d neg
Faecalicatena faecis Firmicutes Moderate
Faecalicatena fissicatena Firmicutes Minor + neg neg + neg neg
Faecalicatena glycyrrhizinilyticum Firmicutes Minor
Faecalicatena gnavus Firmicutes Moderate
Faecalicatena lactaris Firmicutes Moderate
Faecalicatena orotica Firmicutes Minor + neg beta(w) + neg neg neg w neg neg neg neg
Faecalicatena torques Firmicutes Moderate
Faecalicoccus pleomorphus Firmicutes Minor + neg beta(vr) neg neg neg neg neg neg neg neg w
Faecalimonas umbilicata Firmicutes Rare + neg neg +
Faecalitalea cylindroides Firmicutes Widespread + neg neg d + neg neg d neg neg neg
Fannyhessea vaginae Actinobacteria Minor + neg neg neg neg
Fastidiosipila sanguinis Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg +
Fenollaria massiliensis Firmicutes Minor neg neg neg w
Fenollaria timonensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Fermentimonas caenicola Bacteroidetes Rare neg + w neg neg
Ferrimonas balearica Proteobacteria Rare neg + + + neg neg neg + 20(+) 80(+)
Fibrobacter succinogenes Fibrobacteres Unlikely neg
Fictibacillus arsenicus Firmicutes Unlikely + + + neg neg neg + neg + + neg neg 20(neg) 40(neg) 60(neg)
Filifactor alocis Firmicutes Minor neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Filifactor villosus Firmicutes Unlikely + neg w
Finegoldia magna Firmicutes Widespread + w neg neg neg neg vr neg +
Flaviflexus massiliensis Actinobacteria Rare + + neg
Flavobacterium banpakuense Bacteroidetes Unlikely neg + neg + + + + + +
Flavobacterium caeni Bacteroidetes Non neg + + neg neg neg neg neg neg + w + neg neg 20(+) 40(neg) 60(w) 80(+)
Flavobacterium cheniae Bacteroidetes Rare neg + + + neg neg neg neg + w neg + neg neg + neg neg 40(neg) 80(neg)
Flavobacterium daejeonense Bacteroidetes Unlikely neg + + neg + + neg neg + neg neg neg neg neg neg neg neg
Flavobacterium lindanitolerans Bacteroidetes Rare neg + neg neg neg neg neg + neg neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Flavobacterium oncorhynchi Bacteroidetes Unlikely neg + + neg + + + neg neg + vr + neg neg neg
Flavobacterium sakaeratica Bacteroidetes Rare neg
Flavonifractor plautii Firmicutes Widespread vr neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Flexispira rappini Proteobacteria Rare neg neg + neg neg
Flintibacter butyricus Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg
Fournierella massiliensis Firmicutes Moderate neg neg neg + neg neg neg
Francisella tularensis Proteobacteria Non neg w neg neg neg neg
Franconibacter pulveris Proteobacteria Rare neg + w neg + + neg + neg
Fredinandcohnia humi Firmicutes Non + + + + neg + neg neg neg neg neg
Fretibacterium fastidiosum Synergistetes Rare neg neg neg neg w neg
Fructilactobacillus florum Firmicutes Unlikely + vr neg
Fructilactobacillus fructivorans Firmicutes Unlikely + neg neg +
Fructilactobacillus sanfranciscensis Firmicutes Rare + neg neg neg
Fucophilus fucoidanolyticus Verrucomicrobia Rare neg + neg
Fundidesulfovibrio putealis Proteobacteria Rare neg neg +
Furfurilactobacillus rossiae Firmicutes Unlikely + neg neg +
Fusicatenibacter saccharivorans Firmicutes Moderate + neg + neg
Fusobacterium canifelinum Fusobacteria Rare neg beta(neg) neg neg neg
Fusobacterium gonidiaformans Fusobacteria Minor neg neg neg neg neg neg neg neg
Fusobacterium massiliense Fusobacteria Rare neg neg neg neg neg
Fusobacterium mortiferum Fusobacteria Moderate neg neg neg + neg neg neg +
Fusobacterium naviforme Fusobacteria Rare neg neg neg
Fusobacterium necrogenes Fusobacteria Rare neg neg +
Fusobacterium necrophorum Fusobacteria Minor neg neg neg
Fusobacterium necrophorum subsp. funduliforme Fusobacteria Rare neg neg beta neg neg + neg +
Fusobacterium nucleatum Fusobacteria Minor neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Fusobacterium nucleatum subsp. animalis Fusobacteria Rare neg neg neg neg neg neg w
Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum Fusobacteria Minor neg neg neg neg neg neg w
Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum Fusobacteria Rare neg neg neg neg neg neg w
Fusobacterium nucleatum subsp. vincentii Fusobacteria Rare neg neg neg neg neg neg w
Fusobacterium perfoetens Fusobacteria Rare neg neg beta(neg) neg neg neg neg neg
Fusobacterium periodonticum Fusobacteria Minor neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg + + 80(neg)
Fusobacterium pseudoperiodonticum Fusobacteria Unlikely neg d(neg) d(neg)
Fusobacterium russii Fusobacteria Minor neg neg neg neg neg
Fusobacterium ulcerans Fusobacteria Rare neg neg neg neg + neg neg neg neg neg
Fusobacterium varium Fusobacteria Moderate neg neg neg neg neg neg neg
Gabonia massiliensis Bacteroidetes Rare neg + neg neg neg
Gabonibacter massiliensis Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg +
Gabonibacter timonensis Bacteroidetes Rare + neg neg
Gallibacterium anatis Proteobacteria Rare neg + + neg + + neg neg neg 20(neg) 80(neg)
Gardnerella leopoldii Actinobacteria Unlikely neg +
Gardnerella vaginalis Actinobacteria Minor neg neg neg beta neg neg
Gemella asaccharolytica Firmicutes Rare vr neg neg alpha neg neg neg neg neg +
Gemella haemolysans Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg neg neg
Gemella morbillorum Firmicutes Minor + neg neg vr neg neg neg neg neg neg neg 80(+)
Gemella sanguinis Firmicutes Minor + neg neg + neg + neg neg neg neg
Gemmatimonas groenlandica Gemmatimonadetes Non neg neg neg
Gemmiger formicilis Firmicutes Moderate neg neg neg + + + neg neg curdle neg
Gemmiger variabile Firmicutes Moderate
Geobacillus stearothermophilus Firmicutes Unlikely + + + d neg neg d neg + neg
Geobacillus vulcani Firmicutes Unlikely + + neg neg neg neg neg + + + neg
Geodermatophilus obscurus Actinobacteria Non + neg w neg + neg
Georgenia muralis Actinobacteria Rare + w w neg + + + + + neg neg 80(neg)
Georgenia satyanarayanai Actinobacteria Unlikely + + neg + +
Geosporobacter ferrireducens Firmicutes Unlikely neg neg neg
Gleimia europaea Actinobacteria Rare + neg neg d neg
Globicatella sulfidifaciens Firmicutes Rare vr neg alpha neg + w neg
Glutamicibacter arilaitensis Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg +
Glutamicibacter protophormiae Actinobacteria Rare + + + neg d(neg) + d(neg)
Gorbachella massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Gordonia alkanivorans Actinobacteria Rare + + neg neg + neg neg neg + neg neg neg neg 40(+) 80(+)
Gordonia rubripertincta Actinobacteria Unlikely + + neg vr + neg vr + neg neg neg
Gordonia terrae Actinobacteria Rare + + neg + + + neg
Gordonibacter massiliensis Actinobacteria Rare + + neg neg
Gordonibacter pamelaeae Actinobacteria Moderate + + neg neg neg neg +
Gordonibacter urolithinfaciens Actinobacteria Minor + + neg neg neg
Gorillibacterium timonense Firmicutes Rare neg neg neg
Gottschalkia acidurici Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg neg neg
Gracilibacillus dipsosauri Firmicutes Rare + + + + neg w + neg
Gracilibacillus massiliensis Firmicutes Rare + + neg neg + +
Gracilibacillus phocaeensis Firmicutes Rare + + +
Gracilibacillus thailandensis Firmicutes Non + + + + + neg + neg + neg neg neg neg neg 80(neg)
Gracilibacillus timonensis Firmicutes Rare + + neg
Granulicatella adiacens Firmicutes Minor + neg neg alpha neg neg neg neg neg neg neg
Granulicatella elegans Firmicutes Minor + neg neg alpha neg neg neg neg vr vr
Granulicatella para-adiacens Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Grimontia hollisae Proteobacteria Rare neg + neg + + neg neg neg neg neg neg
Gulosibacter bifidus Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg neg neg
Haemophilus ducreyi Proteobacteria Rare neg neg + beta(w) + neg
Haemophilus haemolyticus Proteobacteria Minor neg + + + + + d neg +
Haemophilus influenzae Proteobacteria Minor neg + + neg + neg neg neg + neg
Haemophilus parahaemolyticus Proteobacteria Minor neg d + beta + + +
Haemophilus parainfluenzae Proteobacteria Widespread neg d(+) + beta(d) + + neg + neg
Haemophilus paraphrohaemolyticus Proteobacteria Rare neg + + beta + + + d + + neg
Haemophilus pittmaniae Proteobacteria Minor neg d d beta +
Haemophilus quentini Proteobacteria Rare neg + + + neg
Haemophilus sputorum Proteobacteria Minor neg vr + beta
Hafnia alvei Proteobacteria Minor neg + neg d(neg) + + neg neg neg neg neg neg neg neg 20(d(neg)) 80(neg)
Hafnia paralvei Proteobacteria Rare neg neg + d(+) neg neg neg neg
Hahella ganghwensis Proteobacteria Rare neg + + neg neg + neg +
Halanaerobaculum tunisiense Firmicutes Unlikely neg neg neg neg
Halobacillus dabanensis Firmicutes Unlikely + + + neg neg neg neg + + neg + 80(neg)
Halobacillus ihumii Firmicutes Rare + + neg +
Halobacillus karajensis Firmicutes Non + + + neg neg + neg + + + + 20(neg) 80(neg)
Halobacillus massiliensis Firmicutes Unlikely + neg +
Halobacillus salinus Firmicutes Rare + + + neg + neg + neg + neg neg 80(+)
Halobacillus trueperi Firmicutes Unlikely + + + neg neg neg + neg neg neg + 80(neg)
Halobacteroides halobius Firmicutes Unlikely neg neg neg
Haloferax alexandrinus Euryarchaeota Unlikely neg + + + + neg neg + neg neg 80(+)
Haloferax massiliensis Euryarchaeota Rare neg + +
Haloimpatiens massiliensis Firmicutes Rare + neg neg
Halomonas massiliensis Proteobacteria Rare neg neg neg
Halomonas muralis Proteobacteria Non neg + + + + neg
Halomonas salina Proteobacteria Non neg + + neg neg + d neg d(neg) neg neg neg neg + d(neg) 20(d(+)) 80(d(neg))
Halomonas utahensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg + + + neg + neg
Halopseudomonas bauzanensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg 40(+) 80(+)
Halopseudomonas pelagia Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg neg neg + 20(+) 40(+) 60(+) 80(neg)
Haploplasma axanthum Tenericutes Unlikely neg beta neg neg
Harryflintia acetispora Firmicutes Rare neg + neg neg neg
Hathewaya histolytica Firmicutes Rare + beta
Hathewaya limosa Firmicutes Rare + neg beta neg neg neg + neg + + d(+)
Hathewaya massiliensis Firmicutes Rare + + neg
Helcobacillus massiliensis Actinobacteria Rare + + neg + neg + 40(d) 80(d)
Helcococcus sueciensis Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Helicobacter bilis Proteobacteria Unlikely neg d + neg + neg
Helicobacter canadensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg d d neg neg neg neg neg neg
Helicobacter canis Proteobacteria Unlikely neg neg + alpha neg neg
Helicobacter cinaedi Proteobacteria Rare neg vr + neg + neg neg neg neg neg neg neg
Helicobacter felis Proteobacteria Non neg + + d(+) + neg
Helicobacter fennelliae Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg neg neg neg neg
Helicobacter heilmannii Proteobacteria Non neg + + + +
Helicobacter macacae Proteobacteria Unlikely neg w + neg neg
Helicobacter pametensis Proteobacteria Rare neg + + + neg neg
Helicobacter pullorum Proteobacteria Minor neg + + neg + neg neg neg neg neg neg neg
Helicobacter pylori Proteobacteria Non neg + + neg neg neg + neg neg neg neg neg +
Helicobacter rodentium Proteobacteria Rare neg + w neg + neg neg
Helicobacter winghamensis Proteobacteria Rare neg neg + neg
Heliomicrobium modesticaldum Firmicutes Unlikely neg
Herbaspirillum autotrophicum Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg + neg neg neg neg
Herbaspirillum huttiense Proteobacteria Rare neg + + neg + + neg neg neg 40(neg) 80(neg)
Herbinix hemicellulosilytica Firmicutes Unlikely + neg + neg
Herbinix luporum Firmicutes Unlikely + neg neg neg
Herminiimonas contaminans Proteobacteria Unlikely neg + + neg w
Hespellia porcina Firmicutes Rare + neg neg neg + neg +
Hespellia stercorisuis Firmicutes Rare + neg neg neg + neg +
Heyndrickxia oleronia Firmicutes Unlikely neg + + neg + neg w d neg
Heyndrickxia sporothermodurans Firmicutes Unlikely + + + + neg vr + neg + neg neg
Histophilus somni Proteobacteria Rare neg neg + d + + neg neg neg
Holdemanella biformis Firmicutes Moderate + neg +
Holdemania filiformis Firmicutes Moderate + neg neg + neg neg neg neg neg 80(+)
Holdemania massiliensis Firmicutes Minor + neg + alpha neg neg
Holophaga foetida Acidobacteria Non neg
Howardella ureilytica Firmicutes Rare + +
Hugonella massiliensis Actinobacteria Rare + neg neg neg
Humisphaera borealis Planctomycetes Unlikely neg + + +
Hungatella effluvii Firmicutes Minor + neg neg + neg neg neg + neg neg neg neg
Hungatella hathewayi Firmicutes Widespread + neg neg neg neg neg + neg neg + neg neg neg
Hungatella saccharolyticum Firmicutes Rare
Hungatella xylanolytica Firmicutes Rare neg neg neg +
Hydrogenibacillus schlegelii Firmicutes Unlikely vr + w neg + + neg neg neg neg w +
Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans Firmicutes Rare neg neg neg neg + neg + neg
Hydrogenophaga pseudoflava Proteobacteria Unlikely neg w + + + neg neg neg neg neg 80(+)
Hydrogenovibrio crunogenus Proteobacteria Unlikely neg + +
Hymenobacter rigui Bacteroidetes Rare neg + neg neg neg neg w + +
Hymenobacter russus Bacteroidetes Unlikely neg + neg neg neg + + w
Hyphomicrobium facile Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg
Ihubacter massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg
Ihuprevotella massiliensis Bacteroidetes Rare neg neg
Ileibacterium valens Firmicutes Rare + neg
Inediibacterium massiliense Firmicutes Rare + neg neg
Intestinibacillus massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Intestinibacter bartlettii Firmicutes Widespread + neg beta neg neg neg neg neg neg + d
Intestinibaculum porci Firmicutes Unlikely + neg + neg neg
Intestinimonas butyriciproducens Firmicutes Moderate +
Intestinimonas gabonensis Firmicutes Rare neg neg neg
Intestinimonas massiliensis Firmicutes Moderate neg neg neg neg +
Intestinimonas timonensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Isoptericola variabilis Actinobacteria Rare + +
Janibacter anophelis Actinobacteria Rare +
Janibacter hoylei Actinobacteria Non + + + neg + neg + + + 80(neg)
Janibacter limosus Actinobacteria Unlikely + + neg + + neg neg neg + + + + w neg neg 80(+)
Janibacter terrae Actinobacteria Rare + + w neg + neg neg neg + + + + neg 80(+)
Jeotgalibaca arthritidis Firmicutes Unlikely + neg beta neg neg neg neg +
Jeotgalibaca porci Firmicutes Unlikely + neg alpha neg neg neg + +
Jeotgalicoccus halotolerans Firmicutes Rare + + + neg neg neg neg neg + neg 80(neg)
Johnsonella ignava Firmicutes Rare neg neg neg neg neg
Jonquetella anthropi Synergistetes Rare neg neg neg
Kalamiella piersonii Proteobacteria Unlikely neg neg
Kallipyga gabonensis Firmicutes Rare + + neg
Kallipyga massiliensis Firmicutes Rare + neg neg neg w neg
Kandleria vitulina Firmicutes Rare + neg neg vr neg neg neg neg
Kerstersia gyiorum Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Khelaifiella massiliensis Firmicutes Rare + neg neg
Kineothrix alysoides Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg neg +
Kingella denitrificans Proteobacteria Unlikely neg neg + neg + + neg neg neg neg neg d 20(d) 40(neg) 80(neg)
Kingella kingae Proteobacteria Rare neg neg + beta neg neg neg
Kingella oralis Proteobacteria Unlikely neg d(neg) + neg neg neg vr neg neg neg
Kiritimatiella glycovorans Kiritimatiellaeota Unlikely neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Klebsiella aerogenes Proteobacteria Moderate neg + neg neg + + + + + neg w
Klebsiella grimontii Proteobacteria Minor neg neg + + neg
Klebsiella michiganensis Proteobacteria Minor neg + neg neg + + + neg neg neg
Klebsiella oxytoca Proteobacteria Moderate neg neg + + + + + vr neg
Klebsiella pneumoniae Proteobacteria Widespread neg neg neg + + + + + + neg
Klebsiella pneumoniae subsp. ozaenae Proteobacteria Rare neg neg neg + neg + d neg neg
Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis Proteobacteria Rare neg neg neg + neg neg neg neg
Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae Proteobacteria Minor neg + + +
Klebsiella quasivariicola Proteobacteria Minor
Klebsiella variicola Proteobacteria Minor neg neg + vr neg
Kluyvera ascorbata Proteobacteria Minor neg + neg + + + + neg + neg neg neg
Kluyvera cryocrescens Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg + neg neg neg neg
Kluyvera georgiana Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg + neg neg neg
Kluyvera intermedia Proteobacteria Rare neg + neg + + + + neg neg neg
Kocuria carniphila Actinobacteria Unlikely + + neg + neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Kocuria marina Actinobacteria Rare + + neg vr neg neg vr vr neg + neg neg neg neg 20(neg) 40(+) 80(neg)
Kocuria palustris Actinobacteria Unlikely + + neg vr + vr neg + neg neg 80(neg)
Kocuria polaris Actinobacteria Unlikely + + + + neg neg neg neg +
Kocuria rhizophila Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg neg neg + neg 40(+) 80(+)
Kocuria rosea Actinobacteria Unlikely + + neg w + neg neg d(+) neg neg + 80(neg)
Kocuria salsicia Actinobacteria Unlikely + + neg + neg + w + neg
Kocuria varians Actinobacteria Rare + + neg d(+) d(+) neg neg d(+) d d neg 80(neg)
Kosakonia cowanii Proteobacteria Minor neg + + + neg neg neg neg 40(+) 80(neg)
Krasilnikoviella flava Actinobacteria Rare + neg + neg neg neg neg curdle +
Kurthia gibsonii Firmicutes Rare + + neg neg + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg + + neg 20(+) 40(d) 60(+) 80(neg)
Kurthia massiliensis Firmicutes Rare + + neg +
Kurthia senegalensis Firmicutes Rare + + neg w
Kurthia sp. Dielmo Firmicutes Rare +
Kurthia zopfii Firmicutes Rare + + neg + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg + neg 20(+) 40(d) 60(+) 80(d)
Kushneria sinocarnis Firmicutes Unlikely neg + neg neg + + neg neg + neg neg neg neg neg neg 20(+) 80(neg)
Kytococcus schroeteri Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg + neg neg 80(+)
Kytococcus sedentarius Actinobacteria Rare + + d(neg) neg neg d(neg) neg neg neg neg + neg 80(neg)
Labilithrix luteola Proteobacteria Non neg + + neg
Lachnoanaerobaculum orale Firmicutes Rare + neg +
Lachnoanaerobaculum saburreum Firmicutes Rare + neg + neg
Lachnoanaerobaculum umeaense Firmicutes Rare + neg
Lachnobacterium bovis Firmicutes Rare +
Lachnoclostridium bouchesdurhonense Firmicutes Rare neg neg neg
Lachnoclostridium edouardi Firmicutes Minor + neg neg neg
Lachnoclostridium massiliosenegalense Firmicutes Rare + neg neg
Lachnoclostridium pacaense Firmicutes Rare vr neg neg neg
Lachnoclostridium phocaeense Firmicutes Rare + neg neg
Lachnoclostridium phytofermentans Firmicutes Minor neg neg neg neg +
Lachnoclostridium touaregense Firmicutes Rare + neg neg
Lachnospira eligens Firmicutes Widespread + neg neg neg vr neg neg neg neg curdle neg
Lachnospira multipara Firmicutes Rare + neg neg + neg neg
Lachnospira pectinoschiza Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg neg
Lachnospira rogosae Firmicutes Moderate
Lacrimispora aerotolerans Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg neg neg neg +
Lacrimispora amygdalina Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Lacrimispora celerecrescens Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg +
Lacrimispora indolis Firmicutes Minor neg neg neg neg d + neg neg neg d
Lacrimispora saccharolytica Firmicutes Moderate neg neg neg neg + + neg neg + neg neg curdle
Lacrimispora sphenoides Firmicutes Minor + + neg neg + neg neg d neg neg +
Lacticaseibacillus casei Firmicutes Rare + + neg neg + + + neg neg + + +
Lacticaseibacillus paracasei Firmicutes Minor + neg neg + + neg neg neg neg +
Lacticaseibacillus paracasei subsp. tolerans Firmicutes Unlikely + neg neg
Lacticaseibacillus paragasseri Firmicutes Unlikely + neg + neg neg neg
Lacticaseibacillus rhamnosus Firmicutes Moderate + neg neg neg + + neg neg neg neg +
Lacticaseibacillus saniviri Firmicutes Unlikely + neg alpha neg + neg neg neg
Lacticaseibacillus sharpeae Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg neg
Lacticaseibacillus zeae Firmicutes Unlikely + neg neg neg + neg neg neg
Lacticigenium naphtae Firmicutes Non vr neg neg neg neg
Lactiplantibacillus paraplantarum Firmicutes Rare + + + neg neg neg
Lactiplantibacillus pentosus Firmicutes Rare + neg neg + + neg neg neg curdle
Lactiplantibacillus plantarum Firmicutes Moderate + neg d + neg neg
Lactiplantibacillus xiangfangensis Firmicutes Rare + neg +
Lactobacillus acidophilus Firmicutes Widespread + neg neg neg + neg neg neg neg curdle(w) neg
Lactobacillus amylolyticus Firmicutes Unlikely + neg neg d neg neg
Lactobacillus amylovorus Firmicutes Minor + neg neg + neg neg neg vr
Lactobacillus crispatus Firmicutes Moderate + neg neg neg + neg neg + neg neg neg
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg neg
Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg d
Lactobacillus equicursoris Firmicutes Rare + neg
Lactobacillus gasseri Firmicutes Moderate + neg neg neg vr neg neg neg neg neg
Lactobacillus gigeriorum Firmicutes Unlikely + neg neg
Lactobacillus hamsteri Firmicutes Rare + neg neg neg
Lactobacillus helveticus Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg
Lactobacillus hominis Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg + neg
Lactobacillus iners Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg +
Lactobacillus intestinalis Firmicutes Unlikely + neg neg neg
Lactobacillus jensenii Firmicutes Unlikely + vr neg neg + neg neg neg + neg
Lactobacillus johnsonii Firmicutes Minor + neg neg + + neg neg neg neg
Lactobacillus kalixensis Firmicutes Minor + neg + neg neg
Lactobacillus kefiranofaciens Firmicutes Rare + neg d neg curdles
Lactobacillus leichmannii Firmicutes Rare + neg neg neg neg d
Lactobacillus pasteurii Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg neg neg
Lactobacillus psittaci Firmicutes Unlikely + neg neg alpha neg + neg neg
Lactobacillus rogosae Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg
Lactobacillus timonensis Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg
Lactobacillus ultunensis Firmicutes Minor + neg + neg neg
Lactococcus cremoris Firmicutes Rare + neg neg + d neg neg +
Lactococcus garvieae Firmicutes Minor + neg neg neg + + neg neg vr
Lactococcus lactis subsp. lactis Firmicutes Widespread + neg neg neg + + neg neg neg + vr
Lactococcus petauri Firmicutes Rare + neg neg beta
Lactococcus plantarum Firmicutes Rare + neg neg + + neg neg neg neg neg
Lactococcus raffinolactis Firmicutes Minor + neg neg + + neg neg neg vr neg
Lactonifactor longoviformis Firmicutes Minor neg neg
Lacunisphaera limnophila Verrucomicrobia Unlikely neg neg +
Lagierella massiliensis Firmicutes Rare + + neg neg
Lancefieldella parvula Actinobacteria Minor + neg d neg neg neg neg neg curdle neg 80(+)
Lancefieldella rimae Actinobacteria Minor + neg neg d(+) neg d(neg) d(+) neg neg neg neg
Lapidilactobacillus dextrinicus Firmicutes Non + neg neg neg + neg neg + neg neg
Laribacter hongkongensis Proteobacteria Rare neg + + + neg neg neg
Lascolabacillus massiliensis Bacteroidetes Rare neg neg neg
Latilactobacillus curvatus Firmicutes Minor + + neg + + neg neg neg neg neg
Latilactobacillus sakei Firmicutes Minor + + neg + neg neg neg neg neg neg
Latilactobacillus sakei subsp. carnosus Firmicutes Rare + d(+) +
Lautropia mirabilis Proteobacteria Minor neg + + neg + + neg neg d(+) + neg neg neg 80(neg)
Lawsonella clevelandensis Actinobacteria Rare vr
Lawsonia intracellularis Proteobacteria Unlikely neg neg
Lawsonibacter asaccharolyticus Firmicutes Moderate + neg neg neg neg
Leclercia adecarboxylata Proteobacteria Rare neg neg + + + neg + neg neg neg 80(neg)
Lederbergia galactosidilyticus Firmicutes Rare + + + + neg + d neg w
Lederbergia lentus Firmicutes Unlikely + + + neg + + neg + neg
Legionella bozemanae Proteobacteria Non neg + d neg neg + + neg
Legionella pneumophila Proteobacteria Non neg + d neg neg + +
Lelliottia amnigena Proteobacteria Rare neg neg + + + d neg neg neg neg neg
Lelliottia nimipressuralis Proteobacteria Rare neg neg + + + neg neg neg 80(neg)
Leminorella grimontii Proteobacteria Rare neg + neg + + neg neg neg neg neg + neg
Leminorella richardii Proteobacteria Rare neg + neg neg + neg neg neg neg neg + neg
Lentibacillus massiliensis Firmicutes Rare + neg +
Lentibacillus timonensis Firmicutes Rare +
Lentilactobacillus buchneri subsp. buchneri Firmicutes Minor + neg + + neg neg neg + neg
Lentilactobacillus diolivorans Firmicutes Unlikely +
Lentilactobacillus farraginis Firmicutes Unlikely + neg neg
Lentilactobacillus hilgardii Firmicutes Rare + +
Lentilactobacillus kefiri Firmicutes Non + neg neg +
Lentilactobacillus kisonensis Firmicutes Unlikely + neg neg + +
Lentilactobacillus otakiensis Firmicutes Unlikely + neg neg w +
Lentilactobacillus parabuchneri Firmicutes Rare + + neg neg neg neg +
Lentilactobacillus parafarraginis Firmicutes Unlikely + neg neg
Lentilactobacillus senioris Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg neg +
Leptospira interrogans Spirochaetes Non neg + +
Leptotrichia amnionii Fusobacteria Rare neg neg neg
Leptotrichia buccalis Fusobacteria Rare neg neg alpha neg neg + neg neg neg
Leptotrichia hofstadii Fusobacteria Rare neg + neg beta +
Leptotrichia hongkongensis Fusobacteria Rare vr neg neg
Leptotrichia massiliensis Fusobacteria Rare + + neg
Leptotrichia shahii Fusobacteria Rare neg + neg w
Leptotrichia wadei Fusobacteria Rare neg + neg beta +
Leucobacter aridicollis Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + neg
Leuconostoc carnosum Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg neg d neg + neg
Leuconostoc citreum Firmicutes Minor + + + neg neg
Leuconostoc gelidum Firmicutes Rare + neg neg + neg + neg
Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum Firmicutes Non + neg neg
Leuconostoc holzapfelii Firmicutes Rare + neg neg
Leuconostoc inhae Firmicutes Unlikely + neg neg
Leuconostoc kimchii Firmicutes Rare + neg
Leuconostoc lactis Firmicutes Minor + neg neg + neg neg neg curdle
Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg + neg neg
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides Firmicutes Minor + neg neg neg + + neg neg neg curdle(d) neg
Leuconostoc pseudomesenteroides Firmicutes Unlikely +
Levilactobacillus brevis Firmicutes Minor + neg neg + d neg neg neg neg +
Levilactobacillus brevis subsp. gravesensis Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg neg +
Levilactobacillus namurensis Firmicutes Unlikely + neg +
Levilactobacillus parabrevis Firmicutes Unlikely + neg +
Levyella massiliensis Firmicutes Rare + neg neg neg
Ligilactobacillus acidipiscis Firmicutes Unlikely + neg neg neg + neg neg neg neg neg neg
Ligilactobacillus agilis Firmicutes Rare + + + neg neg neg neg + +
Ligilactobacillus animalis Firmicutes Minor + neg + + neg neg neg neg neg
Ligilactobacillus ceti Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg +
Ligilactobacillus equi Firmicutes Unlikely + neg d
Ligilactobacillus murinus Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg
Ligilactobacillus pobuzihii Firmicutes Unlikely + neg
Ligilactobacillus ruminis Firmicutes Widespread + + neg neg neg
Ligilactobacillus salivarius Firmicutes Widespread + neg neg + neg neg neg neg neg neg
Limnobacter thiooxidans Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg
Limnochorda pilosa Firmicutes Unlikely neg neg neg neg
Limosilactobacillus antri Firmicutes Rare + + w neg neg neg +
Limosilactobacillus caccae Firmicutes Rare + neg neg
Limosilactobacillus coleohominis Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Limosilactobacillus fermentum Firmicutes Widespread + vr neg vr neg vr neg neg neg
Limosilactobacillus frumenti Firmicutes Non + neg + +
Limosilactobacillus gastricus Firmicutes Unlikely + neg vr neg neg neg neg
Limosilactobacillus ingluviei Firmicutes Non + neg neg neg + neg +
Limosilactobacillus mucosae Firmicutes Rare + neg neg + neg neg neg + neg
Limosilactobacillus oris Firmicutes Minor + neg neg d neg neg d
Limosilactobacillus reuteri Firmicutes Minor + neg neg vr vr vr neg neg neg neg neg
Limosilactobacillus vaginalis Firmicutes Rare + neg neg neg d(w) neg neg neg neg
Limosilactobacillus walteri Firmicutes Rare + neg
Liquorilactobacillus mali Firmicutes Unlikely + d(+) + neg neg
Liquorilactobacillus satsumensis Firmicutes Non + neg neg
Liquorilactobacillus vini Firmicutes Unlikely + neg + d
Listeria floridensis Firmicutes Rare + + neg neg neg neg +
Listeria grayi Firmicutes Rare + + neg neg + neg neg + + neg neg d(+) neg neg neg + d neg 80(+)
Listeria innocua Firmicutes Rare + + neg + neg neg + + vr neg d vr 80(+)
Listeria ivanovii Firmicutes Rare + + neg beta + neg neg + + neg neg d vr 80(d)
Listeria marthii Firmicutes Rare + + neg neg + neg + + neg neg neg neg
Listeria monocytogenes Firmicutes Rare + + beta + neg neg + + neg neg d + neg 80(+)
Listeria seeligeri Firmicutes Rare + + neg beta + neg neg + + neg neg d vr 80(d)
Listeria welshimeri Firmicutes Rare + + neg neg + neg neg + + neg neg d vr 80(+)
Litchfieldia alkalitelluris Firmicutes Rare + + + neg + neg + neg 80(neg)
Loigolactobacillus bifermentans Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg
Loigolactobacillus coryniformis Firmicutes Minor + vr neg neg
Loigolactobacillus coryniformis subsp. torquens Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg
Longicatena caecimuris Firmicutes Rare + +
Lutispora thermophila Firmicutes Unlikely neg neg neg neg neg w w neg
Luxibacter massiliensis Firmicutes Rare + neg + neg + +
Lysinibacillus boronitolerans Firmicutes Rare + + + neg + + + + neg neg neg + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(neg)
Lysinibacillus fusiformis Firmicutes Rare vr + + neg neg neg neg + + +
Lysinibacillus macroides Firmicutes Unlikely vr + neg neg + neg neg neg neg
Lysinibacillus meyeri Firmicutes Unlikely + + + neg neg + neg neg + neg + neg + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(neg)
Lysinibacillus sphaericus Firmicutes Rare + + + neg neg neg neg neg + + neg vr neg neg 20(+) 80(vr)
Lysinibacillus varians Firmicutes Rare + + + + neg neg neg 40(neg) 80(neg)
Lysinibacillus xylanilyticus Firmicutes Rare + + + neg neg + neg + neg + neg + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(neg)
Lysobacter soli Proteobacteria Rare neg + + + +
Macellibacteroides fermentans Bacteroidetes Rare + neg neg neg neg + neg +
Macrococcus caseolyticus Firmicutes Unlikely + + + + + + d d
Mageeibacillus indolicus Firmicutes Rare vr neg neg neg neg neg neg
Mahella australiensis Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg
Mailhella massiliensis Proteobacteria Rare neg neg neg +
Mameliella alba Proteobacteria Unlikely neg d d neg + d + + + d neg neg 80(neg)
Mammaliicoccus fleurettii Firmicutes Rare + + + + neg +
Mammaliicoccus lentus Firmicutes Rare + + neg + neg neg + + +
Mammaliicoccus sciuri Firmicutes Rare + + + w + neg + neg + + + 80(neg)
Mammaliicoccus vitulinus Firmicutes Unlikely + + + + d(+) neg d neg + +
Mannheimia granulomatis Proteobacteria Rare neg w + neg + neg neg neg
Mannheimia haemolytica Proteobacteria Rare neg + beta + neg
Mannheimia succiniciproducens Proteobacteria Rare neg
Marasmitruncus massiliensis Firmicutes Rare +
Marseilla massiliensis Bacteroidetes Rare neg
Marseillibacter massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg
Marvinbryantia formatexigens Firmicutes Moderate + neg neg neg
Massilia aurea Proteobacteria Unlikely neg + w neg neg neg + neg vr + + + 80(neg)
Massilia brevitalea Proteobacteria Non neg w neg neg + neg + + neg + + neg curdle + 20(+) 80(+)
Massilia haematophila Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg
Massilia norwichensis Proteobacteria Unlikely neg + neg neg +
Massilia timonae Proteobacteria Non neg + + d(neg) + neg + + + neg
Massilia varians Proteobacteria Unlikely neg neg + + neg
Massilibacillus massiliensis Firmicutes Rare +
Massilibacterium senegalense Firmicutes Rare neg neg neg + +
Massilicoli timonensis Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg
Massiliimalia massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Massiliimalia timonensis Firmicutes Minor + neg neg
Massilimicrobiota timonensis Firmicutes Moderate neg neg neg + neg + +
Massilioclostridium coli Firmicutes Moderate neg neg neg neg
Massiliprevotella massiliensis Bacteroidetes Rare neg neg neg
Massilistercora timonensis Firmicutes Rare neg neg neg + + neg neg
Mediterranea massiliensis Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg +
Mediterraneibacter faecis Firmicutes Minor + + neg neg neg + neg neg
Mediterraneibacter glycyrrhizinilyticus Firmicutes Minor + neg neg neg neg
Mediterraneibacter massiliensis Firmicutes Rare + + neg neg
Megalodesulfovibrio gigas Proteobacteria Unlikely neg neg + +
Megamonas funiformis Firmicutes Minor neg neg beta(w) neg neg neg neg neg
Megamonas hypermegale Firmicutes Moderate neg neg neg neg + neg neg neg +
Megamonas rupellensis Firmicutes Rare neg neg neg neg neg
Megasphaera cerevisiae Firmicutes Rare neg neg neg
Megasphaera elsdenii Firmicutes Moderate neg neg neg neg + w neg neg neg neg neg
Megasphaera indica Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Megasphaera massiliensis Firmicutes Rare neg neg + +
Megasphaera micronuciformis Firmicutes Minor neg neg neg neg neg neg neg
Megasphaera stantonii Firmicutes Rare neg neg
Meiothermus silvanus Deinococcus-Thermus Unlikely neg neg + + + + +
Merdibacter massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg
Merdimonas faecis Firmicutes Rare + neg neg neg
Mesobacillus jeotgali Firmicutes Rare vr + neg + + + + + neg neg neg 80(d)
Mesobacillus subterraneus Firmicutes Rare neg + neg + + + neg + + neg
Mesorhizobium australicum Proteobacteria Unlikely neg
Mesorhizobium jarvisii Proteobacteria Unlikely neg neg + + neg
Mesorhizobium loti Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Mesorhizobium muleiense Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg w
Mesosutterella multiformis Proteobacteria Rare neg + neg neg
Metabacillus galliciensis Firmicutes Unlikely + + + neg + neg
Metabacillus idriensis Firmicutes Rare + + +
Metabacillus litoralis Firmicutes Rare vr + neg + neg + + + neg neg 80(+)
Metabacillus niabensis Firmicutes Rare + + neg + neg + + + + neg
Metakosakonia massiliensis Proteobacteria Rare neg + neg neg neg
Metamycoplasma anseris Tenericutes Unlikely unk neg +
Metaprevotella massiliensis Bacteroidetes Rare neg neg neg
Methanobrevibacter arboriphilus Euryarchaeota Rare +
Methanobrevibacter millerae Euryarchaeota Rare +
Methanobrevibacter oralis Euryarchaeota Rare +
Methanobrevibacter ruminantium Euryarchaeota Rare +
Methanobrevibacter smithii Euryarchaeota Moderate +
Methanococcus voltae Euryarchaeota Rare neg +
Methanomassiliicoccus intestinalis Euryarchaeota Rare +
Methanomassiliicoccus luminyensis Candidatus Thermoplasmatota Rare +
Methanomethylophilus alvus Candidatus Thermoplasmatota Rare
Methanosphaera stadtmanae Euryarchaeota Minor + neg neg
Methylibium petroleiphilum Proteobacteria Unlikely neg neg + + + neg
Methylobacterium adhaesivum Proteobacteria Unlikely neg + w neg neg neg + neg neg neg neg neg
Methylobacterium brachiatum Proteobacteria Unlikely neg + +
Methylobacterium jeotgali Proteobacteria Non neg + + neg neg w + w neg + neg neg
Methylobacterium mesophilicum Proteobacteria Non neg + vr neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg 20(neg) 80(neg)
Methylobacterium organophilum Proteobacteria Unlikely neg + + +
Methylobacterium oryzae Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg neg neg neg neg neg
Methylobacterium phyllosphaerae Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg + neg neg neg neg 80(+)
Methylobacterium radiotolerans Proteobacteria Non neg + + neg + neg neg + neg neg
Methylomusa anaerophila Firmicutes Unlikely neg neg neg neg neg neg
Methylorubrum aminovorans Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg + neg neg neg
Methylorubrum extorquens Proteobacteria Non neg + + neg neg neg + neg neg neg neg
Methylorubrum populi Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg
Methylorubrum thiocyanatum Proteobacteria Unlikely neg + d neg neg neg neg +
Methylorubrum zatmanii Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg + neg neg neg neg neg neg
Methyloversatilis discipulorum Proteobacteria Rare neg
Methyloversatilis universalis Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg
Microbacterium aurum Actinobacteria Rare + neg neg neg + neg + + neg 60(w)
Microbacterium chocolatum Actinobacteria Unlikely + neg neg neg neg neg neg w 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Microbacterium deminutum Actinobacteria Unlikely + +
Microbacterium esteraromaticum Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg neg + neg neg + 40(+) 60(+) 80(+)
Microbacterium foliorum Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + + + w neg + 60(d) 80(neg)
Microbacterium ginsengisoli Actinobacteria Non + + neg + neg neg neg + neg neg
Microbacterium gubbeenense Actinobacteria Unlikely + + neg neg + neg neg neg neg
Microbacterium hydrocarbonoxydans Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg
Microbacterium kitamiense Actinobacteria Unlikely + + neg d neg neg + + neg + neg neg
Microbacterium lacticum Actinobacteria Unlikely + vr + neg + neg neg neg
Microbacterium liquefaciens Actinobacteria Unlikely + + + neg + + + neg + + neg neg
Microbacterium luteolum Actinobacteria Non + + neg + + neg + + neg neg neg
Microbacterium maritypicum Actinobacteria Unlikely + neg + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Microbacterium mitrae Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + + neg +
Microbacterium natoriense Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + neg
Microbacterium oleivorans Actinobacteria Unlikely + + neg neg + neg neg
Microbacterium oxydans Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg neg + neg + neg
Microbacterium paraoxydans Actinobacteria Rare + + neg neg neg w + neg + neg + 20(+) 80(neg)
Microbacterium phyllosphaerae Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + + + w(d) d + 80(vr)
Microbacterium saccharophilum Actinobacteria Unlikely + + neg neg + neg
Microbacterium schleiferi Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + + neg neg neg 20(d) 40(+) 60(d) 80(d)
Microbacterium sediminicola Actinobacteria Unlikely + +
Microbacterium testaceum Actinobacteria Non + + neg neg + + + + 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Microbispora rosea Actinobacteria Rare + + neg +
Micrococcus cohnii Actinobacteria Unlikely + + + neg neg + + + +
Micrococcus endophyticus Actinobacteria Unlikely + + + + neg + neg 80(neg)
Micrococcus luteus Actinobacteria Minor + + + neg neg neg vr neg neg vr neg 20(+) 80(neg)
Micrococcus lylae Actinobacteria Rare + + neg neg d neg neg + neg 20(+) 80(+)
Micrococcus terreus Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg + neg neg neg 20(+) 80(+)
Microlunatus phosphovorus Actinobacteria Unlikely + + w + neg
Micromonospora aurantiaca Actinobacteria Rare + + neg + + vr + + neg neg
Micropruina glycogenica Actinobacteria Rare + + + + neg +
Microvirga aerophila Proteobacteria Unlikely neg + neg + neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Microvirga massiliensis Proteobacteria Rare neg + neg + neg neg neg neg
Microvirgula aerodenitrificans Proteobacteria Unlikely neg + + + +
Millionella massiliensis Bacteroidetes Rare neg + neg
Miniphocaeibacter massiliensis Firmicutes Rare + + neg
Mitsuokella jalaludinii Firmicutes Minor neg neg + + + + + neg + 80(neg)
Mitsuokella multacida Firmicutes Moderate neg neg d(w) + + + + + neg + neg curdle 80(neg)
Mixta calida Proteobacteria Rare neg + neg + + neg
Mixta intestinalis Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg neg w + neg
Mobilibacterium massiliense Firmicutes Rare neg neg neg
Mobilibacterium timonense Firmicutes Rare neg neg neg
Mobilicoccus massiliensis Actinobacteria Rare + + neg
Mobiluncus curtisii Actinobacteria Rare vr neg vr neg neg neg neg neg + + neg +
Moellerella wisconsensis Proteobacteria Rare neg neg + d(+) + neg neg neg neg neg neg
Mogibacterium diversum Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg
Mogibacterium neglectum Firmicutes Rare + neg neg neg
Mogibacterium pumilum Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg
Mogibacterium timidum Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Mogibacterium vescum Firmicutes Unlikely + neg neg
Monoglobus pectinilyticus Firmicutes Minor + + neg neg neg neg neg +
Moorella glycerini Firmicutes Unlikely + neg neg neg +
Moraxella catarrhalis Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg neg neg + neg 80(neg)
Moraxella osloensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg d neg neg neg neg 80(neg)
Mordavella massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg
Morganella morganii Proteobacteria Minor neg + neg + d neg + neg
Moryella indoligenes Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg
Mucispirillum schaedleri Deferribacteres Rare neg + + neg neg neg neg
Murdochiella asaccharolytica Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg
Murdochiella massiliensis Firmicutes Rare + neg neg
Murdochiella vaginalis Firmicutes Rare + neg neg
Muribaculum gordoncarteri Bacteroidetes Unlikely neg neg neg +
Muribaculum intestinale Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg +
Murimonas intestini Firmicutes Rare +
Mycobacterium abscessus Actinobacteria Unlikely vr + neg + + neg 80(neg)
Mycobacterium avium Actinobacteria Unlikely vr + neg neg neg neg 80(neg)
Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Actinobacteria Unlikely vr d neg neg 80(d)
Mycobacterium colombiense Actinobacteria Rare vr + neg + neg
Mycobacterium florentinum Actinobacteria Rare vr vr vr + 80(neg)
Mycobacterium fortuitum Actinobacteria Rare vr d + vr + neg 80(neg)
Mycobacterium gastri Actinobacteria Rare vr w w + 80(+)
Mycobacterium gordonae Actinobacteria Rare vr + neg
Mycobacterium interjectum Actinobacteria Rare vr + neg + neg
Mycobacterium kansasii Actinobacteria Unlikely vr +
Mycobacterium lentiflavum Actinobacteria Rare vr + neg neg
Mycobacterium simiae Actinobacteria Rare vr + neg + neg
Mycobacterium terrae Actinobacteria Rare vr + d 80(+)
Mycobacterium tuberculosis Actinobacteria Non vr neg + +
Mycobacterium tuberculosis variant africanum Actinobacteria Non vr neg + +
Mycobacterium tuberculosis variant bovis Actinobacteria Unlikely + neg neg +
Mycobacteroides abscessus subsp. bolletii Actinobacteria Unlikely + neg neg
Mycolicibacterium aubagnense Actinobacteria Non + + neg + + neg
Mycolicibacterium cosmeticum Actinobacteria Unlikely vr +
Mycolicibacterium houstonense Actinobacteria Rare + + +
Mycolicibacterium mageritense Actinobacteria Unlikely + neg d(+) d neg
Mycolicibacterium neoaurum Actinobacteria Rare + neg + 80(+)
Mycoplasma hominis Tenericutes Rare neg neg neg neg neg
Mycoplasma muris Tenericutes Rare neg neg +
Mycoplasma pneumoniae Tenericutes Rare neg
Mycoplasmopsis arginini Tenericutes Unlikely neg neg +
Mycoplasmopsis californica Tenericutes Unlikely neg neg neg
Myroides odoratimimus Bacteroidetes Unlikely neg + + neg neg + neg + + 40(+) 80(+)
Myroides odoratus Bacteroidetes Unlikely neg + + neg neg + neg + +
Nakamurella multipartita Actinobacteria Unlikely + + neg
Nanosynbacter lyticus Candidatus Saccharibacteria Unlikely +
Natronorubrum bangense Euryarchaeota Non neg + + neg neg neg 40(neg) 60(neg) 80(neg)
Nautilia nitratireducens Proteobacteria Unlikely neg + + +
Ndongobacter massiliensis Firmicutes Unlikely neg neg neg
Necropsobacter rosorum Proteobacteria Rare neg + + beta(neg) + + neg neg 20(neg) 80(neg)
Negativibacillus massiliensis Firmicutes Minor neg neg neg neg
Negativicoccus massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Negativicoccus succinicivorans Firmicutes Rare neg neg
Neglecta timonensis Firmicutes Rare + + neg
Neisseria bacilliformis Proteobacteria Rare neg d + d
Neisseria canis Proteobacteria Rare neg + + vr + + neg neg neg d neg neg
Neisseria cinerea Proteobacteria Minor neg + + neg neg + neg neg neg neg 80(neg)
Neisseria elongata Proteobacteria Minor neg d + neg neg neg + neg neg neg d neg neg neg
Neisseria flava Proteobacteria Rare neg + + d + neg neg neg neg neg neg
Neisseria flavescens Proteobacteria Minor neg + + neg neg + neg vr neg 80(neg)
Neisseria gonorrhoeae Proteobacteria Non neg + + neg neg d neg neg neg neg neg neg
Neisseria lactamica Proteobacteria Rare neg + + vr neg + neg neg neg neg neg neg
Neisseria macacae Proteobacteria Rare neg + + vr neg + neg +
Neisseria meningitidis Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg d neg neg neg neg neg neg
Neisseria mucosa Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg vr neg neg
Neisseria oralis Proteobacteria Rare neg + + alpha + neg neg neg
Neisseria perflava Proteobacteria Rare neg + + + neg + neg neg d(neg) neg neg
Neisseria polysaccharea Proteobacteria Rare neg neg neg + neg neg
Neisseria shayeganii Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg
Neisseria sicca Proteobacteria Rare neg + + d d + neg neg neg neg
Neisseria subflava Proteobacteria Rare neg + + neg neg + neg neg neg d neg neg
Neoactinobaculum massilliense Actinobacteria Rare + + neg
Neobacillus bataviensis Firmicutes Rare + + neg + neg + neg
Neobacillus fumarioli Firmicutes Unlikely + + neg + + + neg
Neobacillus jeddahensis Firmicutes Rare + neg + + neg neg
Neobacillus massiliamazoniensis Firmicutes Rare + neg +
Neobacillus niacini Firmicutes Rare + + + neg + + neg d + d neg neg
Neobacillus pocheonensis Firmicutes Unlikely + + w + neg neg neg neg neg neg neg
Neobacillus soli Firmicutes Rare + + neg + neg + +
Neobittarella massiliensis Firmicutes Moderate + neg neg
Neofamilia massiliensis Firmicutes Rare
Nesterenkonia massiliensis Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg
Nevskia ramosa Proteobacteria Unlikely neg w neg neg neg neg + w 20(+) 80(+)
Niallia nealsonii Firmicutes Rare + + neg neg neg neg neg
Niameybacter massiliensis Firmicutes Rare +
Nigerium massiliense Actinobacteria Rare + + neg
Nitriliruptor alkaliphilus Actinobacteria Unlikely + + + + neg neg neg neg neg
Nitrosomonas eutropha Proteobacteria Rare neg +
Nocardia asteroides Actinobacteria Rare + + + neg neg
Nocardia brevicatena Actinobacteria Rare + + neg d neg neg neg neg neg neg d neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(neg)
Nocardia cyriacigeorgica Actinobacteria Rare + + + + neg neg neg
Nocardia mangyaensis Actinobacteria Unlikely + + neg neg + neg + + 40(+) 80(neg)
Nocardia otitidiscaviarum Actinobacteria Rare + + + neg neg +
Nocardioides jensenii Actinobacteria Unlikely + + neg + neg + + neg + + + 80(+)
Nocardioides kribbensis Actinobacteria Unlikely + + + + + neg + neg + + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Nocardioides massiliensis Actinobacteria Unlikely + + neg neg +
Nosocomiicoccus massiliensis Firmicutes Rare + + neg neg neg +
Noviherbaspirillum massiliense Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg neg neg neg neg
Novosphingobium capsulatum Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg + neg neg + + 80(+)
Numidum massiliense Firmicutes Rare + + neg + neg
Obesumbacterium proteus Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg
Oceanidesulfovibrio marinus Proteobacteria Unlikely neg + + +
Oceanithermus profundus Deinococcus-Thermus Unlikely neg + + + neg neg neg
Oceanobacillus caeni Firmicutes Rare + + + neg neg + neg neg neg
Oceanobacillus iheyensis Firmicutes Unlikely + + vr neg neg neg + neg + 40(+) 60(+)
Oceanobacillus jeddahense Firmicutes Rare + + + + neg
Oceanobacillus manasiensis Firmicutes Rare + neg neg + neg + neg neg neg neg 20(+) 80(+)
Oceanobacillus massiliensis Firmicutes Rare + + + neg +
Oceanobacillus oncorhynchi Firmicutes Non + + + + neg neg neg neg neg 20(neg) 40(+) 60(neg) 80(neg)
Oceanobacillus picturae Firmicutes Unlikely + + + + neg w neg w
Oceanobacillus senegalensis Firmicutes Unlikely + + +
Oceanobacillus sojae Firmicutes Rare + + + neg neg neg neg neg neg 20(+) 40(neg) 60(+) 80(neg)
Oceanobacillus timonensis Firmicutes Unlikely + +
Ochrobactrum anthropi Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg + neg 40(+), 80(+)
Ochrobactrum intermedium Proteobacteria Unlikely neg + + vr neg neg neg neg 40(+), 80(+)
Odoribacter laneus Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg neg +
Odoribacter massiliensis Bacteroidetes Minor
Odoribacter splanchnicus Bacteroidetes Widespread neg + neg neg w
Oenococcus oeni Firmicutes Unlikely + neg neg neg + d
Oerskovia turbata Actinobacteria Rare + + + + neg + + +
Okadaella gastrococcus Firmicutes Rare neg neg neg
Olegusella massiliensis Actinobacteria Rare + neg neg neg
Oleidesulfovibrio alaskensis Proteobacteria Rare neg neg +
Oleidesulfovibrio vietnamensis Proteobacteria Rare neg neg +
Oligella urethralis Proteobacteria Rare neg + + neg neg + neg neg neg neg neg 80(neg)
Olsenella congonensis Actinobacteria Rare + neg neg
Olsenella massiliensis Actinobacteria Rare + neg neg neg
Olsenella phocaeensis Actinobacteria Rare + neg neg
Olsenella profusa Actinobacteria Rare + neg neg + neg vr neg neg neg +
Olsenella timonensis Actinobacteria Rare + neg neg
Olsenella uli Actinobacteria Rare + neg neg + neg neg vr d(+) neg neg curdle(d(neg)) neg +
Olsenella urininfantis Actinobacteria Rare + neg neg
Oribacterium asaccharolyticum Firmicutes Rare vr neg neg neg neg + neg
Oribacterium parvum Firmicutes Rare vr neg neg neg neg neg neg
Oribacterium sinus Firmicutes Minor vr neg neg neg neg neg neg neg
Ornithinibacillus contaminans Firmicutes Unlikely + + +
Ornithinibacillus massiliensis Firmicutes Rare +
Ornithobacterium rhinotracheale Bacteroidetes Rare neg neg + neg neg neg + + neg + neg neg neg
Oscillibacter massiliensis Firmicutes Rare neg neg
Oscillibacter ruminantium Firmicutes Rare neg neg + neg + +
Oscillibacter valericigenes Firmicutes Minor neg neg neg neg neg
Oscillospira guillermondii Firmicutes Rare +
Ottowia massiliensis Pseudomonadota Rare neg neg neg
Oxalobacter formigenes Proteobacteria Moderate neg neg
Pacaella massiliensis Synergistetes Rare neg neg neg
Paenarthrobacter aurescens Actinobacteria Rare + + neg + +
Paenarthrobacter ilicis Actinobacteria Non + + neg neg neg neg neg + + neg + + neg + + + + 20(+) 60(neg) 80(neg)
Paenibacillus alvei Firmicutes Unlikely + vr neg neg + + d + + + d
Paenibacillus amylolyticus Firmicutes Rare + + neg neg + neg neg + + w neg neg neg 80(neg)
Paenibacillus anaericanus Firmicutes Rare neg + + neg neg + vr + + neg neg + neg neg + neg 20(neg) 80(neg)
Paenibacillus antibioticophila Firmicutes Rare + neg neg +
Paenibacillus azoreducens Firmicutes Rare vr + neg neg neg neg + + neg neg
Paenibacillus barcinonensis Firmicutes Unlikely + + neg neg neg neg + neg neg
Paenibacillus barengoltzii Firmicutes Unlikely + + + + + + + + neg neg
Paenibacillus borealis Firmicutes Unlikely neg + neg + + neg neg + neg neg + + +
Paenibacillus bouchesdurhonensis Firmicutes Rare neg + neg neg
Paenibacillus chibensis Firmicutes Unlikely + + neg + + neg neg neg + neg neg neg neg 20(neg) 40(neg) 80(neg)
Paenibacillus chitinolyticus Firmicutes Rare vr + vr + + d neg d +
Paenibacillus cineris Firmicutes Rare vr + + + + d + neg neg w
Paenibacillus cookii Firmicutes Unlikely vr + + + + + neg d w
Paenibacillus daejeonensis Firmicutes Rare vr + + neg + neg neg +
Paenibacillus dendritiformis Firmicutes Rare neg + + w neg neg + + + neg 80(neg)
Paenibacillus donghaensis Firmicutes Unlikely + neg neg neg + neg neg + neg
Paenibacillus durus Firmicutes Rare + neg neg neg + neg neg + neg neg neg neg neg
Paenibacillus faecis Firmicutes Rare + + + + + neg + 80(neg)
Paenibacillus favisporus Firmicutes Rare vr + + + neg + + + neg neg
Paenibacillus glucanolyticus Firmicutes Rare neg + + + + neg + neg d + d neg + neg neg
Paenibacillus graminis Firmicutes Unlikely + + neg + + + + + +
Paenibacillus ihuae Firmicutes Rare + + neg neg
Paenibacillus ihumii Firmicutes Rare neg neg neg + neg
Paenibacillus illinoisensis Firmicutes Rare + + neg neg neg neg + + w neg neg neg 20(+) 60(neg) 80(neg)
Paenibacillus jamilae Firmicutes Rare vr + neg + + + + + +
Paenibacillus kribbensis Firmicutes Rare vr + neg + + neg + + + neg neg 80(+)
Paenibacillus lactis Firmicutes Rare neg + + vr neg + neg neg + neg
Paenibacillus larvae Firmicutes Rare + neg vr neg neg + neg + neg + neg
Paenibacillus lautus Firmicutes Rare vr + neg neg vr + vr neg + neg neg
Paenibacillus macerans Firmicutes Rare + + + neg d + neg neg d
Paenibacillus motobuensis Firmicutes Rare neg + + + neg
Paenibacillus mucilaginosus Firmicutes Unlikely neg + d d(+) neg neg + neg
Paenibacillus naphthalenovorans Firmicutes Unlikely + + d neg + neg + neg d neg
Paenibacillus odorifer Firmicutes Unlikely + + neg + + + +
Paenibacillus pabuli Firmicutes Rare + + neg neg neg neg neg + d(+) neg neg neg +
Paenibacillus pasadenensis Firmicutes Rare + + + neg + + +
Paenibacillus phocaensis Firmicutes Rare neg + + + neg neg +
Paenibacillus polymyxa Firmicutes Rare neg + neg + + + neg + + + neg +
Paenibacillus provencensis Firmicutes Rare neg + neg neg + neg
Paenibacillus pueri Firmicutes Rare + + + + neg + + neg 80(+)
Paenibacillus rhizosphaerae Firmicutes Unlikely + + + + + + + neg neg neg neg neg
Paenibacillus riograndensis Firmicutes Unlikely vr + neg neg neg neg neg neg + neg
Paenibacillus rubinfantis Firmicutes Rare neg + neg neg
Paenibacillus sabinae Firmicutes Rare + + neg + + + + neg neg neg neg
Paenibacillus senegalensis Firmicutes Rare neg
Paenibacillus senegalimassiliensis Firmicutes Rare vr neg neg neg neg
Paenibacillus stellifer Firmicutes Unlikely + + neg neg + neg + neg + + neg
Paenibacillus thiaminolyticus Firmicutes Unlikely + + + d(+) neg neg + + + 80(neg)
Paenibacillus timonensis Firmicutes Rare + + + neg w neg + neg neg +
Paenibacillus tuaregi Firmicutes Rare vr + neg neg
Paenibacillus typhae Firmicutes Rare + + neg + + + neg + neg + neg neg + + 20(neg) 80(neg)
Paenibacillus urinalis Firmicutes Rare neg + neg neg neg + neg neg
Paenibacillus xylanilyticus Firmicutes Rare + + neg + neg neg + + neg neg
Paeniclostridium ghonii Firmicutes Rare + neg neg beta(d(+)) neg neg + neg neg neg + + d
Paeniclostridium sordellii Firmicutes Minor + + neg beta(w) neg + d + + neg w d w w d(+)
Paenisporosarcina quisquiliarum Firmicutes Unlikely + + + w neg neg neg neg + + neg neg neg neg
Paludibacter jiangxiensis Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg
Paludibacter propionicigenes Bacteroidetes Unlikely neg neg neg neg neg + neg neg
Paludibaculum fermentans Acidobacteria Unlikely neg + neg + neg neg + neg + neg neg neg
Paludicola psychrotolerans Firmicutes Rare + neg neg +
Pannonibacter phragmitetus Proteobacteria Unlikely neg + + neg + + + neg neg neg neg + neg neg 80(neg)
Pantoea agglomerans Proteobacteria Minor neg neg d(+) neg vr neg
Pantoea conspicua Proteobacteria Rare neg neg neg neg
Pantoea eucalypti Proteobacteria Rare neg + neg
Pantoea rodasii Proteobacteria Unlikely neg + neg + neg 40(+) 80(+)
Pantoea septica Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg
Pantoea vagans Proteobacteria Rare neg neg + 40(+) 80(+)
Papillibacter cinnamivorans Firmicutes Rare + neg neg
Parabacteroides bouchesdurhonensis Bacteroidetes Minor neg + neg
Parabacteroides chinchillae Bacteroidetes Minor neg neg neg + neg
Parabacteroides distasonis Bacteroidetes Widespread neg + neg + neg neg + neg curdle
Parabacteroides faecis Bacteroidetes Rare neg + neg + neg
Parabacteroides goldsteinii Bacteroidetes Moderate neg neg + neg
Parabacteroides gordonii Bacteroidetes Minor neg vr neg neg neg neg
Parabacteroides johnsonii Bacteroidetes Moderate neg + neg + neg neg
Parabacteroides massiliensis Bacteroidetes Rare neg neg neg + neg +
Parabacteroides merdae Bacteroidetes Widespread neg neg neg w neg neg neg + neg neg neg neg neg
Parabacteroides pacaensis Bacteroidetes Rare neg + neg
Parabacteroides pekinense Bacteroidetes Rare neg neg + neg
Parabacteroides provencensis Bacteroidetes Rare neg + neg
Parabacteroides timonensis Bacteroidetes Minor neg + neg
Paraburkholderia fungorum Proteobacteria Rare neg d d neg + neg neg neg neg neg 80(+)
Paraburkholderia phytofirmans Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg neg neg neg neg 80(+)
Paracholeplasma brassicae Tenericutes Unlikely neg neg neg
Paraclostridium benzoelyticum Firmicutes Rare + neg neg neg + HCO3- neg + + + +
Paraclostridium bifermentans Firmicutes Moderate + neg neg beta(d(+)) neg neg neg + neg +
Paracoccus aminovorans Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg neg
Paracoccus carotinifaciens Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg
Paracoccus denitrificans Proteobacteria Rare neg neg + + neg neg neg neg d neg 40(neg) 60(neg) 80(neg)
Paracoccus haeundaensis Proteobacteria Unlikely neg + + + neg +
Paracoccus marcusii Proteobacteria Non neg + + neg neg 40(neg) 80(neg)
Paracoccus marinus Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg 20(+) 40(neg) 80(neg)
Paracoccus sphaerophysae Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg + neg neg neg neg neg + neg
Paracoccus yeei Proteobacteria Rare neg + + + neg neg + neg
Paraeggerthella hongkongensis Actinobacteria Rare + + neg neg
Parafannyhessea umbonata Actinobacteria Unlikely + neg neg neg neg neg + +
Paraliobacillus quinghaiensis Firmicutes Non + + + + + neg neg neg + neg neg neg 20(neg) 80(neg)
Paramuribaculum intestinale Bacteroidetes Rare neg +
Paraprevotella clara Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg neg neg
Paraprevotella xylaniphila Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg neg neg
Pararheinheimera texasensis Proteobacteria Rare neg + + + + + 20(+) 40(+) 80(+)
Parascardovia denticolens Actinobacteria Rare + neg neg + + neg neg + neg
Parasphingorhabdus flavimaris Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Parasporobacterium paucivorans Firmicutes Rare neg
Parasutterella excrementihominis Proteobacteria Moderate neg neg neg neg neg neg neg
Parasutterella secunda Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg neg
Paratractidigestivibacter faecalis Actinobacteria Rare + neg neg + neg neg
Paremcibacter congregatus Proteobacteria Unlikely neg w + + + neg neg neg neg neg
Parolsenella catena Actinobacteria Rare + neg neg neg +
Parolsenella massiliensis Actinobacteria Rare + neg neg vr neg
Parvibacter caecicola Actinobacteria Rare + neg
Parvimonas micra Firmicutes Moderate + neg beta neg neg neg neg neg neg
Pasteurella aerogenes Proteobacteria Rare neg + d neg d + neg d neg 20(neg) 80*neg)
Pasteurella dagmatis Proteobacteria Rare neg + + neg + neg + w neg
Pasteurella multocida Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg neg neg 20(neg) 80(neg)
Paucilactobacillus oligofermentans Firmicutes Non +
Paucilactobacillus suebicus Firmicutes Unlikely + neg neg neg
Paucilactobacillus vaccinostercus Firmicutes Unlikely + neg neg d neg neg
Paucisalibacillus globulus Firmicutes Unlikely + + neg neg + neg + + neg + + 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Pauljensenia bouchesdurhonensis Actinobacteria Minor + neg neg
Pauljensenia cellulosilytica Actinobacteria Rare + neg neg
Pauljensenia hongkongensis Actinobacteria Rare + neg neg neg neg neg
Pauljensenia keddieii Actinobacteria Minor + neg neg
Pauljensenia odontolyticus Actinobacteria Rare + neg neg
Pauljensenia turicensis Actinobacteria Rare + neg neg
Pectobacterium wasabiae Proteobacteria Unlikely neg + neg + neg + + neg +
Pediococcus acidilactici Firmicutes Rare + pseudo(vr) neg neg + + neg neg d(+) vr
Pediococcus claussenii Firmicutes Rare
Pediococcus damnosus Firmicutes Unlikely + + neg
Pediococcus pentosaceus Firmicutes Minor + pseudo(d(+)) neg neg + + neg neg d(neg) vr
Pedobacter cryoconitis Proteobacteria Non neg + + neg +
Pedobacter daejeonensis Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg + neg neg + neg + + neg neg 20(+) 80(neg)
Pedobacter panaciterrae Bacteroidetes Unlikely neg + + neg + + neg neg neg neg + neg
Pedobacter terricola Bacteroidetes Non neg + + neg + neg neg neg neg neg neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Pedomicrobium ferrugineum Proteobacteria Rare neg + +
Pelistega indica Proteobacteria Rare neg neg + neg + neg neg neg neg neg
Pelobacter propionicus Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg neg HCO3- neg neg
Pelomonas aquatica Proteobacteria Rare neg
Pelomonas puraquae Proteobacteria Rare neg
Pelomonas saccharophila Proteobacteria Rare neg + + + neg neg + +
Peptacetobacter hiranonis Firmicutes Minor + neg neg
Peptoclostridium acidaminophilum Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg
Peptococcus niger Firmicutes Rare + neg neg neg
Peptoniphilus asaccharolyticus Firmicutes Minor + neg neg neg +
Peptoniphilus catoniae Firmicutes Rare + neg neg
Peptoniphilus colimassiliensis Firmicutes Rare + neg neg
Peptoniphilus duerdenii Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg
Peptoniphilus gorbachii Firmicutes Rare + neg neg neg
Peptoniphilus grossensis Firmicutes Rare + neg neg neg neg
Peptoniphilus harei Firmicutes Minor + + neg neg neg
Peptoniphilus indolicus Firmicutes Rare + neg + neg neg neg neg
Peptoniphilus ivorii Firmicutes Rare + d neg neg
Peptoniphilus koenoeneniae Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg
Peptoniphilus lacrimalis Firmicutes Minor + neg neg neg neg
Peptoniphilus obesi Firmicutes Rare + neg neg neg
Peptoniphilus pacaensis Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg
Peptoniphilus phoceensis Firmicutes Rare + + neg +
Peptoniphilus senegalensis Firmicutes Rare + + neg neg
Peptoniphilus timonensis Firmicutes Rare + + neg neg neg
Peptostreptococcus anaerobius Firmicutes Moderate + neg neg neg neg neg neg +
Peptostreptococcus russellii Firmicutes Rare + neg neg neg
Peptostreptococcus stomatis Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg neg neg vr
Peribacillus psychrosaccharolyticus Firmicutes Unlikely vr d + d + d + + + + + neg + neg neg neg 20(+) 80(+)
Peribacillus simplex Firmicutes Rare vr + neg neg + neg neg neg vr + d d neg 20(+), 80(d)
Petrimonas mucosa Bacteroidetes Unlikely neg + w
Petrimonas sulfuriphila Bacteroidetes Rare neg + +
Petrobacter succinatimandens Proteobacteria Rare neg + + + neg neg neg
Petrocella atlantisensis Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg
Phascolarctobacterium faecium Firmicutes Minor neg neg neg neg
Phascolarctobacterium succinatutens Firmicutes Moderate neg neg neg neg neg neg neg
Phenylobacterium falsum Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg + neg neg neg neg +
Phenylobacterium haematophilum Proteobacteria Rare neg
Phenylobacterium lituiforme Proteobacteria Unlikely neg + neg neg
Phocaeicola barnesiae Bacteroidetes Moderate neg neg neg + neg neg
Phocaeicola coprocola Bacteroidetes Widespread neg neg neg + neg neg
Phocaeicola coprophilus Bacteroidetes Widespread neg neg neg neg neg
Phocaeicola dorei Bacteroidetes Widespread neg neg neg neg neg
Phocaeicola massiliensis Bacteroidetes Minor neg neg neg neg + neg neg
Phocaeicola paurosaccharolyticus Bacteroidetes Rare neg neg neg neg + neg neg neg
Phocaeicola plebeius Bacteroidetes Widespread neg neg neg + neg neg
Phocaeicola salanitronis Bacteroidetes Minor neg neg neg + neg neg
Phocaeicola sartorii Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg + neg neg
Phocaeicola vulgatus Bacteroidetes Widespread neg neg neg neg neg neg + curdle(d) neg +
Phocea massiliensis Firmicutes Minor neg neg neg
Phoenicibacter congonensis Actinobacteria Rare + neg neg
Phyllobacterium myrsinacearum Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg neg + vr neg neg neg vr neg neg neg 20(+) 40(neg) 80(+)
Pigmentiphaga kullae Proteobacteria Rare neg + +
Planococcus massiliensis Firmicutes Unlikely + neg + neg neg
Planococcus rifietoensis Firmicutes Unlikely + + + neg neg neg neg + neg +
Planomicrobium chinense Firmicutes Unlikely + + neg + neg + neg 80(neg)
Planomicrobium koreense Firmicutes Unlikely + + neg neg + neg + neg + 80(neg)
Planomicrobium okeanokoites Firmicutes Unlikely + + w neg neg neg neg neg + + + neg neg 80(neg)
Plesiomonas shigelloides Proteobacteria Rare neg + + neg neg + vr neg neg neg neg neg
Pluralibacter gergoviae Proteobacteria Rare neg neg d(neg) + + + + + neg neg 80(neg)
Pontibacillus litoralis Firmicutes Rare + + + + + neg neg + neg + neg neg neg 20(neg) 40(+) 60(neg) 80(neg)
Porphyromonas asaccharolytica Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg neg + neg
Porphyromonas bennonis Bacteroidetes Rare neg d beta neg neg neg +
Porphyromonas cangingivalis Bacteroidetes Unlikely neg + neg neg neg neg
Porphyromonas canoris Bacteroidetes Rare neg + neg neg neg neg +
Porphyromonas crevioricanis Bacteroidetes Unlikely neg d neg neg neg +
Porphyromonas endodontalis Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg neg + neg +
Porphyromonas gingivalis Bacteroidetes Unlikely neg neg neg neg neg neg + neg +
Porphyromonas levii Bacteroidetes Rare neg neg neg neg + neg + + + neg
Porphyromonas macacae Bacteroidetes Rare neg + +
Porphyromonas somerae Bacteroidetes Minor neg neg neg + neg neg +
Porphyromonas uenonis Bacteroidetes Minor neg neg beta(w) neg neg neg
Pragia fontium Proteobacteria Rare neg + neg neg d(+) + + neg d(+) neg neg neg neg
Prevotella albensis Bacteroidetes Rare neg neg neg
Prevotella amnii Bacteroidetes Rare neg neg neg + +
Prevotella aurantiaca Bacteroidetes Rare neg neg neg neg +
Prevotella baroniae Bacteroidetes Rare neg neg neg + neg w neg
Prevotella bergensis Bacteroidetes Moderate neg neg neg + neg neg neg
Prevotella bivia Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg neg neg + + + + +
Prevotella brevis Bacteroidetes Minor neg
Prevotella bryantii Bacteroidetes Rare neg neg neg
Prevotella buccae Bacteroidetes Minor neg neg neg neg + neg d(+) + neg +
Prevotella buccalis Bacteroidetes Minor neg neg + neg neg
Prevotella conceptionensis Bacteroidetes Rare neg
Prevotella copri Bacteroidetes Widespread neg neg neg + neg neg
Prevotella corporis Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg neg neg + + vr d(+)
Prevotella dentalis Bacteroidetes Minor neg alpha neg vr neg neg neg
Prevotella dentasini Bacteroidetes Rare neg neg neg neg +
Prevotella denticola Bacteroidetes Minor neg neg beta(neg) neg + neg vr + neg +
Prevotella disiens Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg neg neg + + + + +
Prevotella enoeca Bacteroidetes Rare neg neg neg d neg + d neg curdle
Prevotella falsenii Bacteroidetes Rare
Prevotella fusca Bacteroidetes Unlikely neg neg neg neg neg neg neg
Prevotella herbatica Bacteroidetes Unlikely neg + + +
Prevotella histicola Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg + neg
Prevotella ihumii Bacteroidetes Rare neg neg neg
Prevotella intermedia Bacteroidetes Minor neg neg beta neg neg neg + + d +
Prevotella jejuni Bacteroidetes Rare neg + neg neg neg +
Prevotella lascolaii Bacteroidetes Minor neg neg + neg + neg
Prevotella loescheii Bacteroidetes Rare neg neg beta(d(neg)) neg + neg + + neg curdles
Prevotella maculosa Bacteroidetes Rare neg neg neg + neg neg neg
Prevotella marseillensis Bacteroidetes Rare neg neg neg
Prevotella marshii Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg + neg
Prevotella melaninogenica Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg d(+) neg + + neg curdle
Prevotella merdae Bacteroidetes Rare neg
Prevotella micans Bacteroidetes Rare neg neg neg neg neg + neg
Prevotella multiformis Bacteroidetes Rare neg neg neg +
Prevotella multisaccharivorax Bacteroidetes Minor neg neg + neg +
Prevotella nanceiensis Bacteroidetes Rare neg neg beta neg + neg neg
Prevotella nigrescens Bacteroidetes Minor neg neg beta neg neg neg + +
Prevotella oralis Bacteroidetes Minor neg neg neg + neg d(+) +
Prevotella oris Bacteroidetes Moderate neg neg neg + + neg curdle
Prevotella oryzae Bacteroidetes Unlikely neg neg neg neg + neg neg
Prevotella oulorum Bacteroidetes Rare neg + neg
Prevotella pallens Bacteroidetes Rare neg neg neg neg +
Prevotella paludivivens Bacteroidetes Rare neg neg neg neg + neg neg
Prevotella phocaeensis Bacteroidetes Rare neg neg neg + neg neg
Prevotella pleuritidis Bacteroidetes Rare neg neg neg neg +
Prevotella rara Bacteroidetes Rare neg neg + neg +
Prevotella rectalis Bacteroidetes Rare neg + neg
Prevotella ruminicola Bacteroidetes Minor neg neg neg neg + d(+) d(+)
Prevotella saccharolytica Bacteroidetes Rare neg neg neg + neg w neg
Prevotella salivae Bacteroidetes Rare neg neg + neg neg
Prevotella scopos Bacteroidetes Unlikely neg neg neg neg neg + neg
Prevotella seregens Bacteroidetes Rare
Prevotella shahii Bacteroidetes Rare neg neg neg +
Prevotella stercorea Bacteroidetes Moderate neg neg neg neg neg neg
Prevotella timonensis Bacteroidetes Minor neg neg neg neg neg +
Prevotella veroralis Bacteroidetes Minor neg neg neg neg + neg d(+) d(+) neg curdle
Prevotellamassilia timonensis Bacteroidetes Minor neg neg neg
Priestia flexa Firmicutes Rare vr neg neg neg neg + neg neg + + + + neg + neg neg neg 20(+), 80(d)
Priestia koreensis Firmicutes Unlikely + + neg neg + + + + neg neg 80(neg)
Priestia megaterium Firmicutes Rare + + neg neg d(+) d(neg) + neg + neg + + + d neg neg neg neg 20(+) 80(d)
Prochlorococcus marinus Cyanobacteria Rare neg
Prolixibacter bellariivorans Bacteroidetes Unlikely neg neg neg neg neg neg neg + neg +
Propionibacterium acidifaciens Actinobacteria Rare + neg neg neg neg neg neg
Propionibacterium freudenreichii Actinobacteria Rare + + vr vr + vr neg neg neg
Propionimicrobium lymphophilum Actinobacteria Rare neg d neg d neg neg neg
Prosthecobacter fluviatilis Verrucomicrobia Rare neg
Proteiniphilum saccharofermentans Bacteroidetes Unlikely neg + w
Proteus mirabilis Proteobacteria Moderate neg + neg d + + neg vr neg + + neg neg + d
Proteus penneri Proteobacteria Rare neg + neg + + neg neg neg + d(+) + w
Proteus vulgaris Proteobacteria Rare neg + neg + d(+) neg neg d + d + +
Provencibacterium massiliense Firmicutes Moderate neg neg neg
Providencia alcalifaciens Proteobacteria Minor neg + neg + + neg neg neg neg neg +
Providencia heimbachae Proteobacteria Rare neg + neg + + neg neg neg neg neg + neg neg 80(neg)
Providencia rettgeri Proteobacteria Minor neg + neg + + neg d(neg) + neg + neg
Providencia rustigianii Proteobacteria Rare neg neg d + neg neg neg neg neg + neg
Providencia stuartii Proteobacteria Rare neg neg + + + neg neg neg neg neg + neg
Pseudarthrobacter oxydans Actinobacteria Rare + + + neg + + + 80(vr)
Pseudarthrobacter polychromogenes Actinobacteria Unlikely vr + + neg + neg
Pseudescherichia vulneris Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg neg neg neg neg
Pseudobutyrivibrio ruminis Firmicutes Rare neg neg neg neg neg
Pseudobutyrivibrio xylanivorans Firmicutes Unlikely neg neg neg neg neg d d d(neg)
Pseudochrobactrum asaccharolyticum Proteobacteria Rare neg + neg
Pseudochrobactrum saccharolyticum Proteobacteria Rare neg + neg
Pseudocitrobacter anthropi Proteobacteria Rare neg neg neg + + + neg
Pseudocitrobacter faecalis Proteobacteria Rare neg + neg neg + + neg + neg
Pseudoclavibacter alba Actinobacteria Rare + + neg neg neg neg neg neg
Pseudoclavibacter helvolus Actinobacteria Unlikely + + w neg neg 40(+) 80(+)
Pseudoclavibacter sp. Timone Actinobacteria Rare + + neg
Pseudoclostridium thermosuccinogenes Firmicutes Unlikely neg neg + w neg curdle
Pseudodesulfovibrio aespoeensis Proteobacteria Unlikely neg neg + +
Pseudodesulfovibrio indicus Proteobacteria Unlikely neg w neg +
Pseudoflavonifractor capillosus Firmicutes Moderate neg neg + neg d(neg)
Pseudoglutamicibacter albus Actinobacteria Rare + + neg neg neg w neg neg
Pseudoglutamicibacter cumminsii Actinobacteria Unlikely + + neg neg d + +
Pseudomonas aeruginosa Proteobacteria Rare neg + + neg + + vr neg vr + neg 80(w)
Pseudomonas alcaligenes Proteobacteria Non neg + + + neg neg +
Pseudomonas alcaliphila Proteobacteria Rare neg + + + + neg neg + neg + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Pseudomonas asiatica Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg 40(neg)
Pseudomonas asplenii Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg neg
Pseudomonas boreopolis Proteobacteria Non neg + neg neg + neg + + neg 80(+)
Pseudomonas caricapapayae Proteobacteria Non neg + + + neg +
Pseudomonas chlororaphis Proteobacteria Non neg + + +
Pseudomonas citronellolis Proteobacteria Rare neg + + + neg + + neg + neg neg curdle 80(neg)
Pseudomonas fluorescens Proteobacteria Unlikely neg + + vr neg vr neg neg neg neg
Pseudomonas fragi Proteobacteria Rare neg + neg +
Pseudomonas fulva Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg
Pseudomonas gessardii Proteobacteria Non neg + + neg neg neg neg neg neg d neg
Pseudomonas japonica Proteobacteria Non neg + + neg neg 40(+) 80(+)
Pseudomonas libanensis Proteobacteria Non neg + + neg + neg neg + + neg
Pseudomonas lundensis Proteobacteria Non neg + + d neg neg neg d + neg d neg neg 80(neg)
Pseudomonas luteola Proteobacteria Unlikely neg + neg neg + + d + neg + + + neg 20(+) 80(d)
Pseudomonas massiliensis Proteobacteria Non neg neg neg alpha + neg
Pseudomonas mendocina Proteobacteria Rare neg + + + + neg neg +
Pseudomonas migulae Proteobacteria Non neg + + neg d + neg neg neg neg neg neg
Pseudomonas monteilii Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg d neg neg d(+) neg
Pseudomonas mosselii Proteobacteria Non neg + + neg neg neg neg neg neg neg 80(d)
Pseudomonas nitroreducens Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg neg neg 40(+) 80(+)
Pseudomonas oleovorans Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg neg + neg neg 20(neg) 80(neg)
Pseudomonas oryzihabitans Proteobacteria Unlikely neg + neg + neg neg + neg neg + neg 80(+)
Pseudomonas parafulva Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg
Pseudomonas protegens Proteobacteria Unlikely neg + neg neg + neg 80(+)
Pseudomonas putida Biovar A Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Pseudomonas putida Biovar B Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Pseudomonas rhodesiae Proteobacteria Non neg + + neg + neg neg d neg neg + neg
Pseudomonas saudiphocaensis Proteobacteria Rare neg + +
Pseudomonas straminea Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg
Pseudomonas stutzeri Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg + neg neg neg + neg 80(+)
Pseudomonas taetrolens Proteobacteria Non neg + neg neg neg
Pseudomonas tolaasii Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg + neg + + curdle
Pseudomonas veronii Proteobacteria Rare neg neg + d(neg) d
Pseudomonas weihenstephanensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg
Pseudomonas xanthomarina Proteobacteria Non neg + + + + neg neg neg neg d neg neg 80(neg)
Pseudomonas yamanorum Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg + neg neg
Pseudomonas zhaodongensis Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg + neg
Pseudonocardia dioxanivorans Actinobacteria Unlikely + + + + neg + 80(+)
Pseudoprevotella muciniphila Bacteroidetes Rare neg neg +
Pseudopropionibacterium massiliense Actinobacteria Rare + neg neg
Pseudoramibacter alactolyticus Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Pseudoruegeria marinistellae Proteobacteria Rare neg + +
Pseudoruminococcus massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg neg neg neg
Pseudoxanthomonas broegbernensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg + + + neg neg neg + 80(+)
Pseudoxanthomonas japonensis Proteobacteria Unlikely neg neg + + neg + neg + neg + + 80(+)
Pseudoxanthomonas mexicana Proteobacteria Rare neg + + + neg neg + neg + d + 80(vr)
Pseudoxanthomonas spadix Proteobacteria Rare neg + + neg + + neg neg neg
Pseudoxanthomonas suwonensis Proteobacteria Rare neg + + + neg neg neg + neg + neg 20(+)
Pseudoxanthomonas taiwanensis Proteobacteria Rare neg + + + neg + neg neg + 80(+)
Psychrobacter alimentarius Proteobacteria Unlikely + + + neg neg neg neg neg + neg 40(+) 80(+)
Psychrobacter arenosus Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg neg neg neg neg 40(+) 80(+)
Psychrobacter cibarius Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg neg neg neg + neg 80(+)
Psychrobacter faecalis Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg 80(+)
Psychrobacter fulvigenes Proteobacteria Rare neg + + + neg neg neg neg w neg neg neg 20(+) 40(d) 80(neg)
Psychrobacter maritimus Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg + neg neg neg 40(+) 80(+)
Psychrobacter namhaensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg + neg 40(+) 80(+)
Psychrobacter phenylpyruvicus Proteobacteria Rare neg + + neg + neg + neg neg neg neg neg neg 80(+)
Psychrobacter pulmonis Proteobacteria Unlikely neg + + + + + neg neg neg 80(+)
Pusillimonas faecalis Firmicutes Rare neg
Pygmaiobacter massiliensis Firmicutes Minor + neg neg
Pyramidobacter piscolens Synergistetes Minor neg neg neg neg neg neg
Rahnella aquatilis Proteobacteria Unlikely neg + neg + + + + + neg 80(+)
Ralstonia mannitolilytica Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg + neg neg 80(+)
Ralstonia pickettii Biovar Va-1&2 Proteobacteria Rare neg + + + neg neg + neg neg 80(+)
Raoultella ornithinolytica Proteobacteria Minor neg + neg + + + + neg neg neg 80(neg)
Raoultella planticola Proteobacteria Rare neg + neg d(neg) + + neg neg
Raoultella terrigena Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg neg neg neg neg 80(neg)
Raoultibacter massiliensis Actinobacteria Rare + + neg neg neg +
Raoultibacter timonensis Actinobacteria Rare + + neg neg +
Rheinheimera perlucida Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg + + 80(w)
Rhizobium metallidurans Proteobacteria Unlikely neg
Rhizorhabdus wittichii Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg neg neg 80(neg)
Rhodanobacter ginsenosidimutans Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg
Rhodococcus erythropolis Actinobacteria Rare + + + neg neg + + neg neg neg neg
Rhodococcus hoagii Actinobacteria Rare + neg neg
Rhodococcus jostii Actinobacteria Non + + neg neg neg neg neg neg + 80(neg)
Rhodococcus opacus Actinobacteria Unlikely + + neg + + neg neg neg neg neg
Rhodococcus qingshengii Actinobacteria Unlikely + + neg neg neg + neg
Rhodococcus rhodochrous Actinobacteria Rare + + + + + d + d neg
Rhodoplanes serenus Proteobacteria Unlikely neg
Rhodothermus marinus Bacteroidetes Non neg + neg neg neg
Riemerella columbina Bacteroidetes Rare neg + + neg + d(+) +
Rikenella microfusus Bacteroidetes Rare neg neg beta neg neg neg neg + neg neg +
Risungbinella massiliensis Firmicutes Rare + + + + neg +
Robertmurraya andreesenii Firmicutes Unlikely + + neg + neg w neg neg neg
Robertmurraya kyonggiensis Firmicutes Rare + + +
Robertmurraya massiliosenegalensis Firmicutes Rare + + neg + neg
Robinsoniella peoriensis Firmicutes Rare + neg neg neg
Romboutsia hominis Firmicutes Rare + neg neg neg
Romboutsia ilealis Firmicutes Rare vr neg neg neg neg neg 80(+)
Romboutsia lituseburensis Firmicutes Minor + neg neg + neg + d
Romboutsia maritimum Firmicutes Rare +
Romboutsia timonensis Firmicutes Moderate + neg neg
Romboutsia weinsteinii Firmicutes Rare +
Roseburia faecis Firmicutes Widespread vr neg neg neg
Roseburia hominis Firmicutes Widespread vr neg neg neg
Roseburia intestinalis Firmicutes Widespread vr neg neg + neg
Roseburia inulinivorans Firmicutes Widespread vr neg neg neg
Roseobacter denitrificans Proteobacteria Non neg + + + + + 80(+)
Roseomonas gilardii Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg neg neg + neg neg
Roseomonas mucosa Proteobacteria Rare neg + d(neg) neg neg neg + neg neg
Rossellomorea aquimaris Firmicutes Unlikely vr + neg neg + + neg neg 80(+)
Rossellomorea marisflavi Firmicutes Rare vr + neg + neg + neg neg 80(neg)
Rossellomorea vietnamensis Firmicutes Rare + + + + neg + + + + neg +
Rothia aeria Actinobacteria Minor + + + + + neg neg neg 40(neg) 80(neg)
Rothia dentocariosa Actinobacteria Minor + vr neg neg + + vr + neg d neg neg neg neg 40(neg) 80(neg)
Rothia halotolerans Actinobacteria Unlikely + + neg + + neg 20(neg) 40(neg) 80(neg)
Rothia koreensis Actinobacteria Rare + + neg neg neg + neg
Rothia kristinae Actinobacteria Rare + + d(+) d(neg) neg neg + + neg d neg neg
Rothia mucilaginosa Actinobacteria Moderate + d(+) neg neg neg + vr + neg + neg neg 80(neg)
Rothia terrae Actinobacteria Rare + + + + + neg + neg neg neg
Rubeoparvulum massiliense Firmicutes Rare neg neg + + +
Rubinisphaera brasiliensis Planctomycetes Non neg + + + + + neg 80(neg)
Rubneribacter badeniensis Actinobacteria Minor + neg neg neg neg neg neg
Rubrobacter xylanophilus Actinobacteria Non + + + + + + neg neg neg neg neg + 80(neg)
Rudanella lutea Bacteroidetes Unlikely neg neg neg neg neg + + + neg neg neg neg neg 80(+)
Ruminiclostridium cellobioparum Firmicutes Rare vr neg
Ruminiclostridium cellulolyticum Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg + neg neg neg neg + neg neg
Ruminiclostridium herbifermentans Firmicutes Unlikely vr neg neg
Ruminiclostridium josui Firmicutes Rare + neg + neg neg neg + neg
Ruminococcus albus Firmicutes Moderate + neg neg neg neg vr neg + neg neg
Ruminococcus bicirculans Firmicutes Moderate +
Ruminococcus bovis Firmicutes Unlikely + neg neg
Ruminococcus bromii Firmicutes Widespread + neg neg neg neg neg + neg neg
Ruminococcus callidus Firmicutes Widespread + neg beta d(+) neg curdle neg
Ruminococcus champanellensis Firmicutes Moderate + neg neg neg + neg neg +
Ruminococcus flavefaciens Firmicutes Moderate + neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Ruminococcus gauvreauii Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg neg neg neg neg
Ruminococcus gnavus Firmicutes Widespread + neg neg neg + neg neg neg +
Ruminococcus lactaris Firmicutes Widespread + neg neg neg neg neg neg neg curdle neg
Ruminococcus phoceensis Firmicutes Rare + + neg
Ruminococcus torques Firmicutes Widespread + neg neg + vr + neg curdle neg +
Rummeliibacillus pycnus Firmicutes Unlikely + + neg neg neg neg neg neg neg neg neg 40(neg) 80(neg)
Rummeliibacillus stabekisii Firmicutes Rare + neg + neg
Rummeliibacillus suwonensis Firmicutes Rare + + + + +
Ruoffia tabacinasalis Firmicutes Rare + neg neg alpha neg neg
Ruthenibacterium lactatiformans Firmicutes Moderate neg neg neg + neg neg +
Saccharibacillus brassicae Firmicutes Unlikely + + +
Saccharofermentans acetigenes Firmicutes Non + neg neg + neg neg neg + neg neg neg neg
Salimicrobium jeotgali Firmicutes Non + + + + neg + + + + neg neg 20(+) 80(neg)
Salinicoccus halodurans Firmicutes Unlikely + + + + + neg + + + neg neg neg neg
Salinisphaera halophila Proteobacteria Non neg + neg + neg neg neg neg neg neg neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Salinivibrio costicola Proteobacteria Rare neg + + d(neg) neg + + neg +
Salmonella bongori Proteobacteria Rare neg + + neg neg neg neg
Salmonella enterica Proteobacteria Unlikely neg neg + neg vr neg neg neg
Salmonella enterica subsp. arizonae Proteobacteria Non neg neg + + neg neg + neg
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis Proteobacteria Unlikely neg neg + neg neg neg neg neg neg
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis Proteobacteria Rare neg neg + neg neg neg neg neg neg
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A Proteobacteria Rare neg neg + neg neg neg neg neg neg
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Proteobacteria Rare neg neg + neg neg neg neg neg neg
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Proteobacteria Rare neg neg + neg neg neg neg neg neg
Sanguibacter massiliensis Actinobacteria Rare + + neg
Sarcina maxima Firmicutes Rare + neg
Sarcina ventriculi Firmicutes Minor + neg
Scardovia inopinata Actinobacteria Rare + neg neg + + neg neg
Scardovia wiggsiae Actinobacteria Minor + neg neg d neg neg neg
Schaalia cardiffensis Actinobacteria Rare + neg neg neg d neg neg neg neg neg
Schaalia hyovaginalis Actinobacteria Rare + neg neg + + neg neg neg + 80(+)
Schaalia meyeri Actinobacteria Rare + neg d neg neg neg neg neg neg curdle neg
Schaalia odontolytica Actinobacteria Moderate + neg neg neg + neg neg neg curdle(d)
Schaalia radingae Actinobacteria Rare + neg w(neg) d neg neg neg neg
Schaalia turicensis Actinobacteria Rare + neg w neg neg neg neg
Schleiferilactobacillus harbinensis Firmicutes Unlikely + neg neg + neg
Schleiferilactobacillus perolens Firmicutes Unlikely + neg neg neg + neg
Schleiferilactobacillus shenzhenensis Firmicutes Unlikely
Schlesneria paludicola Planctomycetes Unlikely neg + + + neg + neg neg +
Schnuerera ultunensis Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg neg neg
Sebaldella termitidis Fusobacteria Unlikely neg neg neg neg neg
Sediminibacillus massiliensis Firmicutes Rare + + +
Sediminispirochaeta smaragdinae Spirochaetes Unlikely neg +
Selenomonas artemidis Firmicutes Rare neg neg neg neg d(+) neg neg neg neg neg
Selenomonas bovis Firmicutes Rare neg neg neg neg +
Selenomonas flueggei Firmicutes Rare neg neg neg + neg neg neg neg neg
Selenomonas infelix Firmicutes Rare neg neg neg + + neg neg neg neg
Selenomonas noxia Firmicutes Rare neg neg neg neg d(neg) neg neg neg neg neg neg
Selenomonas ruminantium Firmicutes Minor neg neg d d d neg neg neg neg
Selenomonas sputigena Firmicutes Rare neg neg d neg + neg
Selenomonas timonae Firmicutes Unlikely neg
Sellimonas intestinalis Firmicutes Minor + neg neg neg
Senegalia massiliensis Firmicutes Rare +
Senegalimassilia anaerobia Actinobacteria Minor + neg neg +
Senegalimassilia faecalis Actinobacteria Rare + + neg +
Serratia ficaria Proteobacteria Rare neg + neg neg + + + + + + neg + + + 40(+) 60(+) 80(+)
Serratia fonticola Proteobacteria Rare neg neg + + neg + neg neg neg 80(+)
Serratia liquefaciens Proteobacteria Rare neg + vr d(neg) d + neg + + d 80(+)
Serratia marcescens Proteobacteria Minor neg + neg neg + + + + neg + neg + + 80(+)
Serratia odorifera Proteobacteria Rare neg + neg neg + + d d(+) neg + neg + neg neg 40(neg) 60(neg) 80(neg)
Serratia quinivorans Proteobacteria Rare neg + neg + neg neg + + 80(+)
Serratia ureilytica Proteobacteria Rare neg + neg + + + + + + neg + 80(+)
Sharpea azabuensis Firmicutes Rare + neg
Shewanella algae Proteobacteria Unlikely neg + + + + + neg d + neg + neg neg 80(+)
Shewanella carassii Proteobacteria Rare neg + + + + neg neg neg +
Shewanella decolorationis Proteobacteria Rare neg + + + + + neg 40(+) 80(+)
Shewanella xiamenensis Proteobacteria Rare neg + + + + neg + + 80(+)
Shigella boydii Proteobacteria Rare neg + neg + d neg neg neg neg
Shigella dysenteriae Proteobacteria Unlikely neg d neg + d neg neg neg neg
Shigella flexneri Proteobacteria Minor neg + neg + neg neg neg neg neg
Shigella sonnei Proteobacteria Minor neg neg + + neg neg neg
Shuttleworthia satelles Firmicutes Rare + neg neg + neg neg neg
Silanimonas lenta Proteobacteria Non neg + + neg neg neg + + + +
Skermanella aerolata Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg + + + neg neg + neg neg neg 80(+)
Slackia equolifaciens Actinobacteria Rare + neg neg neg neg
Slackia exigua Actinobacteria Rare + neg neg neg neg neg neg neg neg + +
Slackia faecicanis Actinobacteria Rare + neg + neg
Slackia heliotrinireducens Actinobacteria Rare + neg + + neg neg neg + neg neg
Slackia isoflavoniconvertens Actinobacteria Rare + neg neg neg neg
Slackia piriformis Actinobacteria Minor + neg neg neg neg neg neg
Sneathia sanguinegens Fusobacteria Rare neg neg neg beta neg neg neg + neg neg +
Sneathia vaginalis Fusobacteria Rare neg neg alpha
Sodaliphilus pleomorphus Bacteroidetes Rare neg
Soleaferrea massiliensis Firmicutes Rare + neg +
Solibacillus silvestris Firmicutes Unlikely + + neg neg neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Solibaculum mannosilyticum Firmicutes Rare vr neg neg neg
Solobacterium moorei Firmicutes Minor + neg neg + neg neg neg neg
Sorangium cellulosum Proteobacteria Rare neg + + + d d(+)
Sphaerotilus natans Proteobacteria Unlikely neg + d d neg d
Sphingobacterium alimentarium Bacteroidetes Unlikely neg + + gamma neg + + neg neg neg neg + w neg 20(+) 80(+)
Sphingobacterium faecium Bacteroidetes Rare neg + + neg neg + + neg neg + neg neg neg
Sphingobacterium mizutaii Bacteroidetes Unlikely neg + + neg neg + + + neg neg neg neg 80(neg)
Sphingobacterium multivorum Bacteroidetes Rare neg + + neg neg neg neg + + neg neg d 80(vr)
Sphingobacterium nematocida Bacteroidetes Unlikely neg + + neg + neg + neg neg 20(neg) 40(neg) 80(neg)
Sphingobacterium siyangense Bacteroidetes Rare neg + + + neg neg + neg + neg 20(+) 80(neg)
Sphingobacterium spiritivorum Bacteroidetes Rare neg + + neg neg + neg neg neg neg + 20(+) 80(+)
Sphingobacterium thalpophilum Bacteroidetes Unlikely neg + + neg + neg + + neg neg neg 20(+) 80(+)
Sphingobium xenophagum Proteobacteria Unlikely neg + + neg +
Sphingomonas adhaesiva Proteobacteria Unlikely neg + neg neg neg neg neg + neg neg + + 80(+)
Sphingomonas aerolata Proteobacteria Non neg + + neg + neg neg neg w
Sphingomonas aestuarii Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg
Sphingomonas azotifigens Proteobacteria Rare neg + + neg + + neg 80(+)
Sphingomonas bisphenolicum Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg + neg neg neg neg neg 80(neg)
Sphingomonas echinoides Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg
Sphingomonas glacialis Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg 80(+)
Sphingomonas hankookensis Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg neg neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Sphingomonas koreensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg vr neg neg
Sphingomonas melonis Proteobacteria Rare neg + neg + neg neg neg 80(neg)
Sphingomonas panni Proteobacteria Rare neg + neg neg + neg neg + neg
Sphingomonas paucimobilis Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg neg + neg d + neg 80(+)
Sphingomonas pseudosanguinis Proteobacteria Rare neg + neg + neg neg
Sphingomonas sinipercae Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg neg
Sphingomonas yabuuchiae Proteobacteria Rare neg + neg neg neg + 80(+)
Sphingopyxis bauzanensis Proteobacteria Unlikely neg + + neg + neg neg neg 80(neg)
Spiribacter roseus Proteobacteria Non neg + + neg neg neg + neg neg neg 80(neg)
Spirochaeta coccoides Spirochaetes Rare neg neg
Spirochaeta thermophila Spirochaetes Non neg neg neg neg + neg
Spirosoma linguale Bacteroidetes Unlikely neg + neg neg neg d neg w d(w) 20(+) 40(+) 80(+)
Sporobacter termitidis Firmicutes Rare +
Sporolactobacillus laevolacticus Firmicutes Unlikely + + neg neg neg + neg + neg neg neg
Sporolactobacillus nakayamae subsp. racemicus Firmicutes Rare + neg neg curdles
Sporomusa termitida Firmicutes Unlikely neg + neg neg neg +
Sporosarcina aquimarina Firmicutes Non + + + + neg + + neg neg w neg neg 80(neg)
Sporosarcina koreensis Firmicutes Unlikely + + + neg neg + + neg neg neg 80(neg)
Sporosarcina luteola Firmicutes Rare vr + + + neg + neg neg neg 20(neg) 40(neg) 60(+) 80(+)
Sporosarcina siberiensis Firmicutes Unlikely + + + + neg neg neg neg + neg neg neg neg
Stackebrandtia nassauensis Actinobacteria Unlikely + + w + + + + + neg
Staphylococcus arlettae Firmicutes Rare + + neg neg neg neg vr neg w neg neg 80(neg)
Staphylococcus aureus subsp. aureus Firmicutes Minor + + neg + + vr neg vr vr neg + vr
Staphylococcus auricularis Firmicutes Rare + + neg vr d vr neg neg
Staphylococcus capitis subsp. capitis Firmicutes Rare + + neg + vr vr neg + vr w neg
Staphylococcus caprae Firmicutes Rare + + neg w + + neg + vr neg 80(neg)
Staphylococcus carnosus Firmicutes Rare + + neg neg neg + + neg neg neg neg neg neg w 80(neg)
Staphylococcus cohnii subsp. cohnii Firmicutes Rare + + neg vr neg d neg neg neg +
Staphylococcus condimenti Firmicutes Rare + + neg + + neg neg +
Staphylococcus devriesei Firmicutes Rare + + neg + d + w d neg
Staphylococcus epidermidis Firmicutes Widespread + + neg w + + neg + + neg vr
Staphylococcus equorum subsp. equorum Firmicutes Rare + + neg vr d(+) neg w + neg vr neg 80(neg)
Staphylococcus gallinarum Firmicutes Rare + + neg + neg + + + 80(neg)
Staphylococcus haemolyticus Firmicutes Minor + + neg w vr + neg neg neg
Staphylococcus hominis subsp. hominis Firmicutes Minor + + neg neg d vr neg vr neg neg
Staphylococcus hyicus Firmicutes Rare + + neg neg + + neg neg + + + + 80(+)
Staphylococcus intermedius Firmicutes Rare + + neg d + + + neg + + d
Staphylococcus kloosii Firmicutes Rare + + neg d neg d(neg) vr d(+) neg neg 80(neg)
Staphylococcus lugdunensis Firmicutes Rare + + neg w vr + neg vr neg +
Staphylococcus nepalensis Firmicutes Rare + + neg + neg + + 80(+)
Staphylococcus pasteuri Firmicutes Minor + + neg + vr + neg +
Staphylococcus petrasii Firmicutes Rare + + neg delta(w) + + neg + neg w 80(neg)
Staphylococcus pettenkoferi Firmicutes Rare + + + neg neg + neg neg
Staphylococcus pseudintermedius Firmicutes Rare + + beta + + + +
Staphylococcus saccharolyticus Firmicutes Rare + + neg neg + + neg vr neg neg neg + neg neg
Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus Firmicutes Rare + + neg neg d vr neg + d d neg
Staphylococcus schleiferi subsp. schleiferi Firmicutes Rare + + neg w + + + neg neg d
Staphylococcus simiae Firmicutes Rare + + neg beta(w) + neg neg d neg d neg neg 80(d)
Staphylococcus simulans Firmicutes Rare + + neg neg + vr neg + neg neg
Staphylococcus succinus subsp. succinus Firmicutes Unlikely + + neg neg neg + + neg
Staphylococcus warneri Firmicutes Minor + + neg d vr + neg + neg neg
Staphylococcus xylosus Firmicutes Rare + + neg neg + vr + + neg
Starkeya novella Proteobacteria Unlikely neg + neg
Stenotrophomonas acidaminiphila Proteobacteria Unlikely neg + + + + + 80(+)
Stenotrophomonas bentonitica Proteobacteria Unlikely neg + neg + neg + +
Stenotrophomonas maltophilia Proteobacteria Minor neg + neg neg neg d(+) + neg + neg + neg + + 80(+)
Stenotrophomonas rhizophila Proteobacteria Rare neg + neg + + neg +
Stomatobaculum longum Firmicutes Minor vr neg neg neg neg neg neg neg
Streptobacillus hongkongensis Fusobacteria Rare neg neg neg neg
Streptobacillus moniliformis Fusobacteria Unlikely neg neg neg alpha(d) neg
Streptococcus acidominimus Firmicutes Unlikely + neg alpha neg + neg +
Streptococcus agalactiae Firmicutes Minor + neg beta neg vr neg neg neg neg + +
Streptococcus alactolyticus Firmicutes Rare + neg alpha(vr) neg + neg vr neg neg
Streptococcus anginosus Firmicutes Widespread + neg alpha(vr) neg + + neg neg neg + neg +
Streptococcus anginosus subsp. whileyi Firmicutes Rare + neg beta neg + + neg neg + neg +
Streptococcus australis Firmicutes Minor + neg alpha neg neg vr neg + + neg
Streptococcus caballi Firmicutes Rare + neg alpha neg + + neg neg neg
Streptococcus canis Firmicutes Unlikely + neg beta neg + neg neg neg
Streptococcus castoreus Firmicutes Rare + neg beta neg neg + neg neg
Streptococcus constellatus subsp. constellatus Firmicutes Minor + neg beta(vr) neg neg + neg neg neg + neg neg neg
Streptococcus cristatus Firmicutes Minor + neg alpha neg neg neg neg neg d(+) d
Streptococcus danieliae Firmicutes Rare + neg beta neg neg neg neg neg
Streptococcus didelphis Firmicutes Rare + + beta neg neg neg neg d +
Streptococcus downei Firmicutes Rare + neg neg + neg neg neg neg
Streptococcus dysgalactiae Firmicutes Rare + neg alpha(vr), beta(vr) neg + neg vr neg + neg
Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis Firmicutes Unlikely + neg beta neg d(+) neg + d
Streptococcus equi subsp. equi Firmicutes Rare + neg beta neg neg vr neg neg + neg
Streptococcus equinus Firmicutes Moderate + neg alpha neg + + neg neg neg neg neg
Streptococcus ferus Firmicutes Rare + neg neg d(+) + + neg neg
Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus Firmicutes Minor + neg neg neg + + vr neg neg
Streptococcus gordonii Firmicutes Minor + neg alpha neg neg + neg neg d(+) + vr
Streptococcus gwangjuense Firmicutes Unlikely + neg alpha neg neg neg neg
Streptococcus henryi Firmicutes Rare + neg alpha neg neg + neg neg
Streptococcus hyovaginalis Firmicutes Rare + neg alpha neg + neg neg neg +
Streptococcus ilei Firmicutes Unlikely + alpha + 80(neg)
Streptococcus infantarius Firmicutes Minor + neg alpha neg + d(neg) neg neg + neg neg
Streptococcus infantarius subsp. infantarius Firmicutes Minor + neg alpha neg + d(neg) neg neg neg
Streptococcus infantis Firmicutes Minor + neg alpha neg neg neg neg neg neg neg
Streptococcus intermedius Firmicutes Moderate + neg beta, alpha(vr) neg d(neg) + neg vr + neg curdle neg
Streptococcus koreensis Firmicutes Unlikely + alpha neg neg + neg
Streptococcus lactarius Firmicutes Rare + alpha neg + +
Streptococcus lutetiensis Firmicutes Minor + neg alpha neg + + neg d neg neg
Streptococcus macedonicus Firmicutes Rare + alpha + neg neg + neg
Streptococcus merionis Firmicutes Rare + neg neg neg neg + neg neg +
Streptococcus mitis Firmicutes Moderate + neg alpha neg neg neg neg vr d(+) d neg +
Streptococcus mutans Firmicutes Moderate + neg alpha(vr), beta(vr) neg + + neg neg + neg neg +
Streptococcus oralis Firmicutes Minor + neg alpha neg + neg neg neg neg + neg neg neg +
Streptococcus oralis subsp. tigurinus Firmicutes Rare + neg alpha neg neg neg neg neg +
Streptococcus orisratti Firmicutes Rare + neg alpha neg + + neg neg
Streptococcus ovis Firmicutes Rare + neg neg alpha neg neg + neg neg
Streptococcus pantholopis Firmicutes Rare + neg alpha neg + + + neg +
Streptococcus parasanguinis Firmicutes Widespread + neg alpha neg neg d neg neg + neg
Streptococcus parasuis Firmicutes Rare + neg alpha neg neg neg neg neg
Streptococcus parauberis Firmicutes Rare + neg alpha(vr) neg + + neg + vr
Streptococcus pasteurianus Firmicutes Minor + neg alpha neg + + neg neg neg neg
Streptococcus periodonticum Firmicutes Unlikely + alpha + neg neg
Streptococcus peroris Firmicutes Rare + neg alpha neg neg neg neg neg vr
Streptococcus pluranimalium Firmicutes Unlikely + neg neg + +
Streptococcus plurextorum Firmicutes Rare + neg neg alpha neg neg neg neg neg
Streptococcus pneumoniae Firmicutes Minor + neg alpha neg neg d neg neg neg + neg
Streptococcus porci Firmicutes Rare + neg alpha neg neg neg neg neg
Streptococcus pseudopneumoniae Firmicutes Minor + neg neg neg vr neg neg neg
Streptococcus pseudoporcinus Firmicutes Rare + neg beta neg d + neg neg + neg
Streptococcus pyogenes Firmicutes Minor + neg beta neg neg d neg neg + neg
Streptococcus rubneri Firmicutes Rare + neg beta neg neg neg neg neg neg
Streptococcus salivarius Firmicutes Widespread + neg neg > alpha, beta neg + + d neg + neg neg
Streptococcus sanguinis Firmicutes Moderate + neg alpha neg neg d neg vr d + neg +
Streptococcus sinensis Firmicutes Rare + neg alpha neg + + neg + neg
Streptococcus sobrinus Firmicutes Minor + neg alpha(d) neg + neg neg neg +
Streptococcus suis Firmicutes Rare + neg alpha, beta neg neg + neg + + neg
Streptococcus thermophilus Firmicutes Widespread + neg alpha neg + neg neg d neg neg neg
Streptococcus thoraltensis Firmicutes Rare + neg alpha neg + + neg + +
Streptococcus timonensis Firmicutes Minor + neg neg alpha neg neg neg neg
Streptococcus uberis Firmicutes Rare + neg alpha neg + + neg + neg +
Streptococcus vestibularis Firmicutes Moderate + neg alpha neg + + + + neg neg
Streptococcus viridans Firmicutes Rare + neg alpha(vr) neg
Streptomyces albus Actinobacteria Unlikely + + neg + + + + + +
Streptomyces flavogriseus Actinobacteria Unlikely + +
Streptomyces hygroscopicus Actinobacteria Unlikely + +
Streptomyces koyangensis Actinobacteria Rare + + + + + + + neg + neg +
Streptomyces lividans Actinobacteria Unlikely +
Streptomyces massiliensis Actinobacteria Unlikely + + +
Streptomyces misionensis Actinobacteria Rare +
Streptomyces specialis Actinobacteria Unlikely + +
Streptomyces thermoviolaceus Actinobacteria Rare + + neg neg + + + + + + + + neg
Streptomyces thermovulgaris Actinobacteria Unlikely + + + + + + + + + neg
Streptomyces violaceusniger Actinobacteria Unlikely + +
Streptosporangium roseum Actinobacteria Unlikely + + + neg + + + neg 20(neg)
Subdoligranulum formicile Firmicutes Rare neg neg neg + neg
Subdoligranulum variabile Firmicutes Moderate neg neg neg neg + neg neg
Succinatimonas hippei Proteobacteria Minor neg neg neg neg neg neg neg
Succinivibrio dextrinosolvens Proteobacteria Rare neg neg neg neg vr neg neg neg neg +
Sulfurospirillum deleyianum Proteobacteria Rare neg neg + + + neg
Sutcliffiella cohnii Firmicutes Unlikely + + + + + neg neg + + + + 60(+)
Sutterella faecalis Proteobacteria Rare neg + neg neg neg neg
Sutterella massiliensis Proteobacteria Rare neg neg neg
Sutterella megalosphaeroides Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg neg neg
Sutterella parvirubra Proteobacteria Minor neg neg neg neg neg neg
Sutterella seckii Proteobacteria Rare neg neg
Sutterella stercoricanis Proteobacteria Rare neg neg neg +
Sutterella timonensis Proteobacteria Rare neg neg neg
Sutterella wadsworthensis Proteobacteria Widespread neg neg neg + neg neg neg neg neg
Symbiobacterium thermophilum Firmicutes Unlikely neg +
Symbiobacterium toebii Firmicutes Unlikely neg +
Syntrophobotulus glycolicus Firmicutes Unlikely neg neg neg neg
Syntrophococcus sucromutans Firmicutes Rare neg +
Syntrophomonas zehnderi Firmicutes Rare vr neg
Tannerella forsythia Bacteroidetes Minor neg +
Tannerella serpentiformis Bacteroidetes Unlikely neg neg
Taonella mepensis Proteobacteria Unlikely neg + + + neg neg + +
Tatumella ptyseos Proteobacteria Rare neg + neg neg + neg + + neg neg neg neg neg
Tepidanaerobacter acetatoxydans Firmicutes Rare vr neg neg neg neg neg
Tepiditoga spiralis Thermotogae Unlikely neg + +
Terrahaemophilus aromaticivorans Proteobacteria Rare neg
Terribacillus aidingensis Firmicutes Rare + neg + neg neg + + + + neg 80(+)
Terribacillus halophilus Firmicutes Unlikely + + neg neg + neg +
Terrisporobacter glycolicus Firmicutes Minor + neg neg neg neg neg neg vr d
Terrisporobacter mayombei Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg
Terrisporobacter othiniensis Firmicutes Rare +
Terrisporobacter petrolearius Firmicutes Rare + neg neg neg neg neg neg neg
Tessaracoccus massiliensis Actinobacteria Rare + + neg + neg
Tetragenococcus halophilus Firmicutes Unlikely + neg neg neg neg +
Tetragenococcus koreensis Firmicutes Rare + neg neg neg + +
Tetragenococcus solitarius Firmicutes Rare + neg neg neg vr + neg
Thalassobacillus devorans Firmicutes Non + neg neg + neg neg neg neg
Thauera terpenica Proteobacteria Rare neg + +
Thermaerobacter marianensis Firmicutes Non vr + +
Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum Firmicutes Rare neg neg neg +
Thermobacillus composti Firmicutes Unlikely neg + + neg
Thermobispora bispora Actinobacteria Unlikely +
Thermoclostridium stercorarium Firmicutes Unlikely neg neg neg neg neg neg
Thermolithobacter ferrireducens Firmicutes Non + neg neg neg +
Thermomonas carbonis Proteobacteria Unlikely neg neg neg + + neg + neg neg neg 20(neg) 80(neg)
Thermomonospora curvata Actinobacteria Unlikely + + neg + + + + neg neg + neg neg 20(+) 80(+)
Thermophilibacter immobilis Actinobacteria Unlikely +
Thermophilibacter mediterraneus Actinobacteria Rare + neg neg
Thermophilibacter provencensis Actinobacteria Minor + neg neg
Thermus scotoductus Deinococcus-Thermus Unlikely neg + + + + neg neg
Thiomonas islandica Proteobacteria Unlikely neg
Thomasclavelia saccharogumia Firmicutes Rare + neg neg neg
Thomasclavelia spiroformis Firmicutes Moderate + neg neg + vr neg neg neg +
Tidjanibacter inops Bacteroidetes Moderate
Tidjanibacter massiliensis Bacteroidetes Rare neg neg neg
Timonella senegalensis Actinobacteria Rare + + neg + + +
Tissierella praeacuta Firmicutes Rare + vr neg neg vr vr
Trabulsiella guamensis Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg vr neg vr vr neg
Tractidigestivibacter scatoligenes Actinobacteria Rare + neg neg neg + neg neg
Traorella massiliensis Firmicutes Rare neg neg neg neg
Treponema berlinense Spirochaetes Rare neg neg neg neg neg
Treponema brennaborense Spirochaetes Unlikely neg neg
Treponema denticola Spirochaetes Rare neg neg
Treponema medium Spirochaetes Unlikely neg + +
Treponema parvum Spirochaetes Unlikely neg
Treponema pectinovorum Spirochaetes Rare neg neg neg neg neg neg + neg
Treponema pedis Spirochaetes Unlikely neg beta
Treponema peruense Spirochaetes Rare neg neg neg
Treponema phagedenis Spirochaetes Unlikely neg neg neg neg
Treponema primitia Spirochaetes Unlikely neg neg +
Treponema ruminis Spirochaetes Unlikely neg neg
Treponema socranskii Spirochaetes Unlikely neg neg neg neg d(neg) d d(neg)
Treponema succinifaciens Spirochaetes Rare neg neg neg
Treponema vincentii Spirochaetes Rare neg neg d
Tropheryma whipplei Actinobacteria Unlikely neg
Trueperella bernardiae Actinobacteria Rare + neg neg neg neg neg neg neg
Trueperella pyogenes Actinobacteria Rare + neg beta neg neg neg + + +
Tsukamurella pulmonis Actinobacteria Unlikely + + neg + + neg neg neg neg 80(+)
Tumebacillus avium Firmicutes Unlikely + neg + neg neg neg + neg + neg neg neg neg
Tumebacillus permanentifrigoris Firmicutes Unlikely + neg neg
Turicibacter sanguinis Firmicutes Moderate + neg neg neg neg neg
Turicimonas muris Proteobacteria Rare neg neg neg neg neg neg
Tyzzerella nexilis Firmicutes Widespread + neg neg + neg neg neg
Ureaplasma parvum Tenericutes Rare unk + neg
Ureaplasma urealyticum Tenericutes Rare unk
Ureibacillus massiliensis Firmicutes Rare neg + + neg + neg
Ureibacillus suwonensis Firmicutes Unlikely neg + + neg neg neg neg neg neg neg
Ureibacillus thermosphaericus Firmicutes Non neg neg neg + + neg neg neg neg
Urinicoccus timonensis Firmicutes Rare + neg neg
Urmitella timonensis Firmicutes Rare +
Uruburuella suis Proteobacteria Rare neg + + neg + + neg d neg
Vaginimicrobium propionicum Actinobacteria Unlikely + neg neg neg neg neg
Vagococcus carniphilus Firmicutes Rare + neg + neg neg neg
Vagococcus fluvialis Firmicutes Rare + neg neg + neg neg
Vagococcus lutrae Firmicutes Rare + neg neg neg + neg neg neg
Vagococcus penaei Firmicutes Rare + neg + neg neg
Vagococcus teuberi Firmicutes Rare + alpha neg neg neg
Vampirovibrio chlorellavorus Cyanobacteria Unlikely neg
Varibaculum cambriense Actinobacteria Rare + neg neg d(+) neg neg neg neg neg +
Varibaculum timonense Actinobacteria Rare + neg neg neg + neg
Variovorax boronicumulans Proteobacteria Rare neg + + neg + neg neg neg
Variovorax ginsengisoli Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg neg neg neg neg neg
Variovorax paradoxus Proteobacteria Unlikely neg + + neg neg neg
Veillonella atypica Firmicutes Widespread neg neg + neg neg neg
Veillonella denticariosi Firmicutes Rare neg neg +
Veillonella dispar Firmicutes Moderate neg neg d neg neg neg
Veillonella infantium Firmicutes Rare neg neg neg +
Veillonella magna Firmicutes Rare neg neg neg neg + +
Veillonella montpellierensis Firmicutes Rare neg vr neg + neg neg neg
Veillonella nakazawae Firmicutes Rare neg + neg +
Veillonella parvula Firmicutes Widespread neg neg neg + neg neg neg neg neg
Veillonella ratti Firmicutes Rare neg neg + neg
Veillonella rodentium Firmicutes Unlikely neg + neg
Veillonella rogosae Firmicutes Minor neg neg neg + neg neg neg
Veillonella tobetsuensis Firmicutes Minor neg neg neg +
Vescimonas coprocola Firmicutes Rare neg
Vescimonas fastidiosa Firmicutes Rare neg
Vibrio alginolyticus Proteobacteria Rare neg + + + + + neg neg + + + + + neg neg
Vibrio cholerae Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg + + + + neg neg +
Vibrio cincinnatiensis Proteobacteria Rare neg + + + + d(+) neg neg neg neg + neg neg + + neg neg neg
Vibrio fluvialis Proteobacteria Rare neg + + + + + d(w) neg neg neg + + + + + + + neg neg 80(+)
Vibrio furnissii Proteobacteria Rare neg + + + + d(neg) neg neg neg + d d + + neg neg
Vibrio metoecus Proteobacteria Rare neg + + neg neg +
Vibrio metschnikovii Proteobacteria Rare neg neg neg d + d neg d + d + neg
Vibrio mimicus Proteobacteria Rare neg + + + + neg neg neg + d(w) + neg
Vibrio natriegens Proteobacteria Rare neg + + + d(neg) neg d d neg neg
Vibrio neptunius Proteobacteria Unlikely neg + + + + + + 80(neg)
Vibrio parahaemolyticus Proteobacteria Rare neg + + + + neg neg neg + + + + neg neg
Vibrio proteolyticus Proteobacteria Rare neg + + neg + + + neg
Vibrio rumoiensis Proteobacteria Unlikely neg + + + + neg neg + neg + + neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Vibrio vulnificus Proteobacteria Rare neg + + d neg d + + + neg
Victivallis vadensis Lentisphaerae Minor neg neg neg
Virgibacillus dakarensis Firmicutes Rare + + + neg +
Virgibacillus dokdonensis Firmicutes Rare vr + + neg neg + neg + + + neg neg 20(+) 40(+) 60(+) 80(+)
Virgibacillus doumboii Firmicutes Rare + + neg + +
Virgibacillus halodenitrificans Firmicutes Rare vr + + neg + neg neg neg + neg + neg neg neg 80(neg)
Virgibacillus ihumii Firmicutes Rare + + neg neg
Virgibacillus massiliensis Firmicutes Rare + + + neg + neg +
Virgibacillus ndiopensis Firmicutes Rare + + + neg +
Virgibacillus pantothenticus Firmicutes Rare + + d neg + neg + + 80(+)
Virgibacillus profundi Firmicutes Unlikely vr + + neg + + neg + + + neg + neg neg neg + + neg
Virgibacillus proomii Firmicutes Rare + + neg neg + neg d(+) +
Virgibacillus salexigens Firmicutes Unlikely + + + d neg d + neg d neg + 80(neg)
Virgibacillus senegalensis Firmicutes Non + + neg + neg neg +
Virgibacillus siamensis Firmicutes Unlikely + + + neg neg neg + + w + 80(neg)
Vitreoscilla massiliensis Proteobacteria Rare neg neg neg neg
Vitreoscilla stercoraria Proteobacteria Rare neg + CO-binding o type neg neg neg
Weeksella virosa Firmicutes Rare neg + + neg neg neg neg neg neg + d(neg) neg neg 80(neg)
Weissella cibaria Firmicutes Minor + neg neg + + neg + neg
Weissella confusa Firmicutes Minor + + neg + + neg neg + neg
Weissella paramesenteroides Firmicutes Minor + vr neg neg
Weissella viridescens Firmicutes Minor + neg neg neg
Weizmannia coagulans Firmicutes Rare + + neg neg d d d neg d + neg neg
Winkia neuii Actinobacteria Rare + + alpha + neg neg neg
Wolinella succinogenes Proteobacteria Rare neg neg neg + + + neg neg neg neg neg neg neg
Xanthomonas massiliensis Proteobacteria Unlikely neg + neg neg
Xylanimonas cellulosilytica Actinobacteria Rare + w + + + + + neg +
Yangia pacifica Proteobacteria Non neg + w neg neg neg + neg neg
Yersinia aldovae Proteobacteria Rare neg + neg + + + + + neg neg
Yersinia aleksiciae Proteobacteria Rare neg + neg + neg neg + neg
Yersinia alsatica Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg 80(+)
Yersinia artesiana Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg 80(neg)
Yersinia bercovieri Proteobacteria Rare neg neg + + + + neg d + neg neg 80(neg)
Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica Proteobacteria Unlikely neg + neg + + + d(w) + neg 80(vr)
Yersinia frederiksenii Proteobacteria Rare neg + neg + + + + + + neg neg w 80(+)
Yersinia intermedia Proteobacteria Rare neg + neg + + + + + + neg neg 80(d)
Yersinia kristensenii subsp. kristensenii Proteobacteria Rare neg + neg + + neg neg + neg neg 80(d)
Yersinia kristensenii subsp. rochesterensis Proteobacteria Rare neg + neg + + + + neg neg + neg
Yersinia massiliensis Proteobacteria Rare neg + neg + neg + + neg
Yersinia mollaretii Proteobacteria Rare neg neg + + neg neg neg + neg neg 80(neg)
Yersinia occitanica Proteobacteria Rare neg + neg + + 80(neg)
Yersinia pestis Proteobacteria Non neg + neg + + neg + neg neg
Yersinia proxima Proteobacteria Rare neg + neg + + neg 80(+)
Yersinia pseudotuberculosis Proteobacteria Unlikely neg + neg neg vr + neg neg + + neg neg
Yersinia rohdei Proteobacteria Rare neg neg + + neg neg d neg
Yersinia vastinensis Proteobacteria Rare neg + neg + + + neg 80(neg)
Yokenella regensburgei Proteobacteria Rare neg + neg + + neg neg neg neg neg neg neg 80(neg)
Yonghaparkia alkaliphila Actinobacteria Non + + neg + neg neg + + neg neg 20(neg) 40(+) 60(neg) 80(neg)
Zunongwangia profunda Bacteroidetes Non neg + + neg + neg + neg neg neg 20(+) 40(+) 80(+)

Click on table headings to sort. Table abbreviations: Cata - catalase; Oxid - oxidase; EggY - egg yolk react; Haem - haemolysis; MRed - methyl red; NO3R - nitrate reduction; 2NO2 - nitrate to nitrite; NO2R - nitrite reduction; ONPG - o-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside; Sred - sulfur reduction; SO4R - sulfate reduction; CO2 - CO2 use; VP - Voges Proskauer test; Aesc - aesculin hydrolysis; Urea - urea hydrolysis; Gela - gelatin digestion; Star - starch hydrolysis; Case - casein digestion; Tyro - tyrosine digestion; Arg - arginine hydrolysis; Cell - cellulose hydrolysis; Dext - dextrin hydrolysis; DNA - DNA digestion; Meat - meat digestion; Milk - milk curdle; Chit - chitin digestion; Algn - alginate digestion; Agar - agar digestion; Pect - pectin digestion; Hipp - hippurate hydrolysis; Mucn - mucin hydrolysis; Xnth - xanthine hydrolysis; Tw'n - tween digestion;