Pu•biome

FILTERS

Coloniser

Gram Stain

Oxygen tolerance

Total 2651

Current 2651

Bacteria	Phylum	Coloniser	Gram	Glc	Fru	Gal	Celb	Gent	Lact	Malt	Melz	Melb	Raff	Sucr	Treh	Tura	Amyg	Cell	Dext	Aesc	Glyg	Inul	Pect	Pull	Star	Xyln
Abiotrophia defectiva	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg		neg	+	+	neg	neg		neg		neg	neg		+	neg
Absiella argi	Firmicutes	Rare	+	+			+			neg	neg		neg	neg	neg
Absiella innocuum	Firmicutes	Moderate
Absiella tortuosum	Firmicutes	Rare	+	+	d(neg)	neg	neg		neg	neg	neg	w	w	+	+		neg			neg	neg	neg			neg
Acetanaerobacterium elongatum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		neg	+		neg	+	+	neg		neg				neg	+			neg
Acetatifactor muris	Firmicutes	Rare	+	neg									neg		neg
Acetitomaculum ruminis	Firmicutes	Rare	+
Acetivibrio cellulolyticus	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg	neg	+		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	+		neg		neg			neg
Acetivibrio clariflavus	Firmicutes	Unlikely	vr										neg
Acetivibrio ethanolgignens	Firmicutes	Minor	neg	+	+	+	w		+	+	neg		w	neg	neg										w
Acetivibrio saccincola	Firmicutes	Unlikely	+
Acetivibrio thermocellus	Firmicutes	Unlikely	neg	neg										neg	neg			+
Acetoanaerobium sticklandii	Firmicutes	Rare	+	w		w			neg	w(+)				neg
Acetobacter pasteurianus	Proteobacteria	Unlikely	neg	d
Acetobacterium woodii	Firmicutes	Rare	+
Acetomicrobium hydrogeniformans	Synergistetes	Unlikely	neg
Achromobacter denitrificans	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg		neg		neg	neg				neg	neg		neg
Achromobacter insuavis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Achromobacter spanius	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg					neg
Achromobacter xylosoxidans	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg	+	neg		neg	neg				neg	neg		neg
Acidaminococcus fermentans	Firmicutes	Widespread	neg	d(w)	neg	neg	d(w)		d(w)	neg	neg		neg	neg	neg		neg					neg
Acidaminococcus intestini	Firmicutes	Moderate	neg	neg					neg	neg			neg	neg
Acidaminococcus massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Acidaminococcus provencensis	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Acidaminococcus timonensis	Firmicutes	Rare	neg
Acidipropionibacterium acidipropionici	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	+			+	neg				+
Acidipropionibacterium jensenii	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	vr	vr	neg	+	+	+	+	+	+	+	d(neg)			+	neg				vr
Acidisarcina polymorpha	Acidobacteria	Rare	neg																					neg		neg
Acidovorax facilis	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg					neg
Acidovorax sp. strain KKS102	Proteobacteria	Rare	neg
Acidovorax temperans	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg					neg
Acidovorax wautersii	Proteobacteria	Rare	neg	+					+
Acinetobacter baumannii	Proteobacteria	Unlikely	neg	+										neg			neg
Acinetobacter bereziniae	Proteobacteria	Unlikely	neg	d(+)
Acinetobacter calcoaceticus	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg			neg				neg	neg		neg
Acinetobacter guillouiae	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg		neg			neg
Acinetobacter haemolyticus	Proteobacteria	Unlikely	neg	d
Acinetobacter idrijaensis	Proteobacteria	Rare
Acinetobacter johnsonii	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg			neg				neg	neg
Acinetobacter junii	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Acinetobacter lwoffii	Proteobacteria	Unlikely	neg	d(neg)										neg			neg
Acinetobacter parvus	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Acinetobacter pittii	Proteobacteria	Unlikely	neg	+			neg			neg				neg	neg
Acinetobacter radioresistens	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Acinetobacter schindleri	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Acinetobacter septicus	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Acinetobacter towneri	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg		neg		neg	neg
Acinetobacter ursingii	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Acinetobacter variabilis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Actinobacillus capsulatus	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	d(+)	+	+	neg	+	+	+	+	neg	d(+)			d(+)	neg	neg
Actinobacillus minor	Proteobacteria	Unlikely	neg	+						+			+	+						neg		neg
Actinobacillus pleuropneumoniae	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	w	neg		d	+		neg	d	+	neg		neg			neg		neg
Actinobacillus succinogenes	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+		neg	neg	+	+	neg	neg	+			+	neg	neg
Actinobacillus ureae	Proteobacteria	Non	neg	+	+				neg													neg
Actinobaculum massiliense	Actinobacteria	Minor	+	+					neg	+			w		+							neg			neg
Actinomyces bouchesdurhonensis	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+				+	+				+
Actinomyces canis	Actinobacteria	Non	+	d					+	+	neg	neg	d	d	neg				neg		+			+
Actinomyces dentalis	Actinobacteria	Non	+	+	+		+		w	+	neg	+	+	+	+						neg			neg
Actinomyces georgiae	Actinobacteria	Non	+	+	+		neg		+	+		neg	neg	+	+		neg				w				+
Actinomyces gerencseriae	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+		d(+)		+	+	d(+)	d(+)	+	+	+		d(+)			d	neg				d
Actinomyces graevenitzii	Actinobacteria	Minor	+	+	+	+	neg	neg	+	+	vr	neg	vr	+	vr		neg		vr		neg	neg
Actinomyces ihuae	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg				+	neg				+
Actinomyces israelii	Actinobacteria	Non	+							+			+	+	+
Actinomyces johnsonii	Actinobacteria	Rare	+		d		neg		+				neg		d						+				d
Actinomyces marseillensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+				neg	+				+
Actinomyces massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	neg	neg	+	+	+	neg			neg	neg	neg			neg
Actinomyces mediterranea	Actinobacteria	Rare	+
Actinomyces minihominis	Actinobacteria	Rare	+
Actinomyces naeslundii	Actinobacteria	Minor	+	+	+		d		d	+	neg		neg	+	d				neg		neg	neg			neg
Actinomyces oris	Actinobacteria	Rare	+	+	+		neg		d	+	neg		neg	+	d				vr		d
Actinomyces pacaensis	Actinobacteria	Rare	+
Actinomyces polynesiensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+			+	+			+						neg
Actinomyces provencensis	Actinobacteria	Rare	+
Actinomyces sp. ph3	Actinobacteria	Rare	+
Actinomyces timonensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg			+	w	neg			neg
Actinomyces urogenitalis	Actinobacteria	Rare	+	+					+	+	+	+	+	+	+				neg		neg
Actinomyces viscosus	Actinobacteria	Minor	+	+					vr	+	neg		+	+	+				neg		neg	+			neg
Actinosynnema mirum	Actinobacteria	Non	+	+	+	+	+		+	+			+	+	+				+		+	neg			+
Actinotignum schaalii	Actinobacteria	Rare	+	+					neg	+	neg	neg	neg	d	d						neg				d
Acutalibacter muris	Firmicutes	Rare	+
Acutalibacter timonensis	Firmicutes	Minor
Adhaeribacter aquaticus	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg
Adlercreutzia caecimuris	Actinobacteria	Rare	+
Adlercreutzia equolifaciens	Actinobacteria	Moderate	+
Adlercreutzia equolifaciens subsp. celatus	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Adlercreutzia hattorii	Actinobacteria	Rare	+
Adlercreutzia mucosicola	Actinobacteria	Rare	+
Adlercreutzia rubneri	Actinobacteria	Rare	+										neg
Aeribacillus pallidus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+		+			d				+	+		+			+
Aerococcus vaginalis	Firmicutes	Non	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Aerococcus viridans	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Aeromicrobium massiliense	Actinobacteria	Rare	+	neg
Aeromicrobium tamlense	Actinobacteria	Rare	+
Aeromonas allosaccharophila	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		neg	+		vr	vr	+	+		+
Aeromonas bestiarum	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		d	+		neg	neg	+	+		neg
Aeromonas caviae	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		+	vr		w	+			neg	+	+							neg			+
Aeromonas dhakensis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg				+	neg
Aeromonas encheleia	Proteobacteria	Unlikely	neg	+			neg		neg	+		neg	neg	d(+)	+		neg
Aeromonas enteropelogenes	Proteobacteria	Rare	neg	+			+			+				neg	+
Aeromonas eucrenophila	Proteobacteria	Non	neg	+	+					+	neg				+							neg
Aeromonas hydrophila	Proteobacteria	Unlikely	neg	+			neg		neg	+				+	+
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila	Proteobacteria	Unlikely	neg	+			neg		neg					+
Aeromonas jandaei	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg			+		neg	neg	neg	+		neg
Aeromonas media	Proteobacteria	Rare	neg	+			+			+				+	+		+
Aeromonas popoffii	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		+	neg		neg	+		neg	neg	neg	+
Aeromonas salmonicida	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg		+	+	neg	neg	neg	d	+		neg		+	+	+	neg			+
Aeromonas schubertii	Proteobacteria	Non	neg	+		+	neg		neg	+		neg	neg	neg	+
Aeromonas sobria	Proteobacteria	Rare	neg				d(+)			+		neg	neg		+
Aeromonas taiwanensis	Proteobacteria	Non	neg	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	+	+	+	neg	+					neg
Aeromonas tecta	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	d(neg)	neg		neg			neg		neg
Aeromonas trota	Proteobacteria	Rare	neg	+			+							neg			+
Aeromonas veronii	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	d(+)		neg	+			neg	+	+
Aestuariimicrobium kwangyangense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	+
Afipia birgiae	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg					neg	neg				neg
Afipia broomeae	Proteobacteria	Rare	neg	neg					neg	neg				neg
Afipia lausannensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg					neg	neg				neg
Africanella massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Agathobacter ruminis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	d(+)	neg	+				+	+
Agathobaculum butyriciproducens	Firmicutes	Moderate	+	+			+		+	+	+		neg	+	+
Agathobaculum desmolans	Firmicutes	Minor	+	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg		neg		neg
Aggregatibacter actinomycetemcomitans	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg	neg	neg	neg
Aggregatibacter aphrophilus	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	+	neg		+	+	neg	neg	+	+	+				neg	neg	neg	neg			neg
Aggregatibacter segnis	Proteobacteria	Minor	neg	w(+)	w	w	neg		neg	w	neg	neg	neg	+	neg					neg		neg
Agrilactobacillus composti	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg		neg	+	+	+	neg	+	+										neg
Agrobacterium radiobacter	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	+		+	+				+	+
Agrobacterium rhizogenes	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		+
Agrobacterium tumefaciens	Proteobacteria	Unlikely	neg
Agrococcus casei	Actinobacteria	Rare	+	+	neg		neg			neg				neg	neg
Agrococcus jejuensis	Actinobacteria	Rare	+	neg		neg			neg		neg		neg									neg
Agrococcus jenensis	Actinobacteria	Rare	+	neg	+	neg	+		neg	neg			neg	neg	neg							w			neg
Agrococcus terreus	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+		+			vr				+	+	+
Akkermansia glycaniphila	Verrucomicrobia	Rare	neg
Akkermansia muciniphila	Verrucomicrobia	Widespread	neg	+			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Alcaligenes faecalis	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg			neg				neg	neg		neg
Alcaligenes faecalis subsp. faecalis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg			neg				neg	neg		neg
Aliagarivorans marinus	Proteobacteria	Rare	neg	+	w	+	+		+	+	+	+	w	w	+
Aliarcobacter butzleri	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg					neg				neg
Aliarcobacter cryaerophilus	Proteobacteria	Rare	neg	neg									neg
Aliarcobacter skirrowii	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Alicyclobacillus acidocaldarius	Firmicutes	Rare	+	+			+		neg	+				+								neg
Aliiruegeria sabulilitoris	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	+		+	+	neg	+	neg	+	+
Alistipes communis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			w		+	+	w		+	w	+
Alistipes dispar	Bacteroidetes	Rare	neg	+			w		+	+	w		+	+	+
Alistipes finegoldii	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		neg	+	+
Alistipes ihumii	Bacteroidetes	Moderate	neg										+
Alistipes indistinctus	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	+			+	+
Alistipes inops	Bacteroidetes	Rare	neg
Alistipes marseilloanorexicus	Bacteroidetes	Rare	neg
Alistipes massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Alistipes megaguti	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg		neg	+			+	neg	neg			w
Alistipes montrealensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+				+
Alistipes obesi	Bacteroidetes	Moderate	neg										neg
Alistipes onderdonkii	Bacteroidetes	Moderate	neg										+
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris	Bacteroidetes	Rare	neg	+			w		+	+	w		+	+	+
Alistipes provencensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	+	neg	+	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Alistipes putredinis	Bacteroidetes	Widespread	neg										neg
Alistipes senegalensis	Bacteroidetes	Moderate	neg										neg
Alistipes shahii	Bacteroidetes	Widespread	neg										vr
Alistipes timonensis	Bacteroidetes	Moderate	neg										neg
Alkalibacillus halophilus	Firmicutes	Unlikely	+
Alkalihalobacillus alcalophilus	Firmicutes	Unlikely	+
Alkalihalobacillus gibsonii	Firmicutes	Rare	+																					neg	neg
Alkalihalobacillus halodurans	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg				neg	neg			+
Alkalihalobacillus oshimensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	neg		neg		neg	+		+	+	neg	+									neg
Alkaliphilus metalliredigens	Firmicutes	Rare	+
Alkaliphilus oremlandii	Firmicutes	Non	+		+
Alkaliphilus transvaalensis	Firmicutes	Non	+
Alkanindiges illinoisensis	Proteobacteria	Non	vr
Allisonella histaminiformans	Firmicutes	Minor	neg
Allobaculum fili	Firmicutes	Rare	+										neg
Allobaculum mucilyticum	Firmicutes	Rare	+										neg
Alloprevotella rava	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+				+	+	neg	neg	neg	neg	neg
Alloprevotella tannerae	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+		neg		+	+	neg		d	d	d		neg		d(+)	neg	+	neg	neg		+
Alloscardovia omnicolens	Actinobacteria	Minor	+	+						+			+	+
Alteracholeplasma palmae	Tenericutes	Rare	unk	+
Alterileibacterium massiliense	Firmicutes	Rare	neg
Amaricoccus kaplicensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+					neg				neg	+
Amedibacillus dolichus	Firmicutes	Minor	+	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Amedibacterium intestinale	Firmicutes	Rare	+	+			+		neg	+	neg		neg	neg	+
Aminipila butyrica	Firmicutes	Rare	+
Aminipila terrae	Firmicutes	Rare	+	+									+
Aminomonas paucivorans	Synergistetes	Rare	neg
Ammonifex degensii	Firmicutes	Non	neg
Amycolatopsis alba	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	neg	+			neg	neg		neg	neg
Amycolatopsis mediterranei	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+		+	+		+	+	+	+				+
Amycolatopsis thailandensis	Actinobacteria	Rare	+	+		+	+		+	+		+	+		+
Amycolatopsis vancoresmycina	Actinobacteria	Unlikely	+
Anaerobiospirillum succiniciproducens	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg		+	vr		vr	+	+	vr					neg		+
Anaerobiospirillum thomasii	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg	+	neg		neg	+			neg	neg	neg							neg
Anaerobutyricum hallii	Firmicutes	Widespread	+	w	w	+	neg		w	w		neg	neg	d(neg)	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Anaerobutyricum soehngenii	Firmicutes	Rare	+	+	+					+				+
Anaerococcus hydrogenalis	Firmicutes	Rare	+	+	neg		neg		+	neg	neg		+	+	neg				neg		neg
Anaerococcus jeddahensis	Firmicutes	Rare	+
Anaerococcus lactolyticus	Firmicutes	Rare	+	+	+				+				neg	neg	neg
Anaerococcus marasmi	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	+	+	+	+	+	neg			neg	neg	neg			neg
Anaerococcus mediterraneensis	Firmicutes	Rare	+
Anaerococcus murdochii	Firmicutes	Rare	+	+									neg
Anaerococcus obesiensis	Firmicutes	Rare	+
Anaerococcus octavius	Firmicutes	Rare	+	+	+		neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Anaerococcus prevotii	Firmicutes	Minor	+	d(+)	+		neg		neg	neg			+	neg
Anaerococcus provencensis	Firmicutes	Rare	+
Anaerococcus rubeinfantis	Firmicutes	Rare	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Anaerococcus senegalensis	Firmicutes	Rare	+										neg
Anaerococcus tetradius	Firmicutes	Rare	+	d(+)					neg	neg			neg	neg				neg
Anaerococcus vaginalis	Firmicutes	Minor	+	+	+				neg	+			neg	neg
Anaerocolumna aminovalerica	Firmicutes	Rare	+		neg		neg		neg	neg				neg	neg		neg				neg		neg		neg
Anaerocolumna cellulosilytica	Firmicutes	Rare	+
Anaerocolumna chitinilytica	Firmicutes	Rare	+																							+
Anaerocolumna sedimenticola	Firmicutes	Rare	+	+			+		neg	+	+		+	+	+
Anaerocolumna xylanovorans	Firmicutes	Rare	+
Anaerofilum pentosovorans	Firmicutes	Rare	+
Anaerofustis stercorihominis	Firmicutes	Minor	+		+				neg	neg	neg	neg	neg	neg
Anaeroglobus geminatus	Firmicutes	Minor	neg	neg	neg	+	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg					neg					neg
Anaeromassilibacillus senegalensis	Firmicutes	Rare	neg
Anaerorhabdus furcosa	Firmicutes	Rare	neg
Anaerosalibacter bizertensis	Firmicutes	Rare	+
Anaerosalibacter massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	neg				neg	neg				neg							+
Anaerosphaera massiliensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+		neg			neg
Anaerospora hongkongensis	Firmicutes	Rare	neg
Anaerostipes butyraticus	Firmicutes	Rare	+	+			+			+	neg		+	+	+
Anaerostipes caccae	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	+	w	+		+	neg				neg	neg			+
Anaerostipes coli	Firmicutes	Rare	+										neg
Anaerostipes hadrus	Firmicutes	Moderate	+	w(+)	w(+)	+	d(w)		d(+)	d(+)	neg	neg	neg	w(+)	neg		neg			neg	neg	+			neg
Anaerostipes hominis	Firmicutes	Rare	vr
Anaerostipes rhamnosivorans	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+				+				+	+	+
Anaerostipes rhamnosus	Firmicutes	Rare	+
Anaerotignum faecicola	Firmicutes	Rare	+										neg							neg
Anaerotignum lactatifermentans	Firmicutes	Moderate	neg
Anaerotignum neopropionicum	Firmicutes	Rare	neg
Anaerotignum propionicum	Firmicutes	Rare	+		neg		neg		neg	neg				neg	neg		neg				neg				neg
Anaerotruncus colihominis	Firmicutes	Moderate	+	+			neg		neg	neg		neg	neg		neg
Anaerotruncus massiliensis	Firmicutes	Rare	neg	+	neg	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			+	+	+			+
Anaerotruncus rubiinfantis	Firmicutes	Moderate	+
Anaerovorax odorimutans	Firmicutes	Rare	vr
Ancylobacter polymorphus	Proteobacteria	Rare	neg	+	+		+		+	+	neg	+	neg		neg						neg	+			neg
Aneurinibacillus aneurinilyticus	Firmicutes	Rare	+	+	neg	neg	neg		neg	+	+	+	neg	+	neg
Aneurinibacillus migulanus	Firmicutes	Rare	+	neg	+
Angelakisella massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Anoxybacillus flavithermus	Firmicutes	Non	+
Anoxybacillus gonensis	Firmicutes	Unlikely	+
Anoxynatronum sibiricum	Firmicutes	Rare	+
Anseongella ginsenosidimutans	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+
Aquabacterium citratiphilum	Proteobacteria	Rare	neg
Aquabacterium commune	Proteobacteria	Rare	neg
Aquabacterium parvum	Proteobacteria	Rare	neg
Aquamicrobium lusatiense	Proteobacteria	Unlikely	neg	+
Aquincola tertiaricarbonis	Proteobacteria	Non	neg	neg
Arabia massiliensis	Actinobacteria	Rare	neg
Arachnia propionica	Actinobacteria	Rare	+
Arcanobacterium haemolyticum	Actinobacteria	Rare	+	+					+	vr	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Arthrobacter agilis	Actinobacteria	Non	+	neg		neg			neg
Arthrobacter castelli	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg				neg							neg
Arthrobacter citreus	Actinobacteria	Unlikely	vr
Arthrobacter gandavensis	Actinobacteria	Unlikely	+	d	w		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			w		neg			neg
Arthrobacter globiformis	Actinobacteria	Unlikely	+	+
Arthrobacter koreensis	Actinobacteria	Unlikely	+
Arthrobacter luteolus	Actinobacteria	Unlikely	+	+					neg	+				+
Arthrobacter parietis	Actinobacteria	Non	+	+					d	d				d							neg
Arthrobacter pigmenti	Actinobacteria	Non	+	d					neg	d				d							neg
Arthrobacter russicus	Actinobacteria	Unlikely	+
Asaccharospora irregularis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg					neg			neg
Asticcacaulis biprosthecium	Proteobacteria	Unlikely	neg
Asticcacaulis excentricus	Proteobacteria	Unlikely	neg
Atlantibacter hermannii	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		d	+		neg	d	d	+		+
Atopobium minutum	Actinobacteria	Minor	+	d(+)	vr		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg	neg
Atopostipes suicloacalis	Firmicutes	Unlikely	+	+
Aureimonas altamirensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		+		neg				w
Aureimonas ureilytica	Proteobacteria	Unlikely	neg	vr
Averyella dalhousiensis	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		w	+		neg	neg	neg	+
Azoarcus pumilus	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Azospirillum lipoferum	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg			neg			neg
Azotobacter vinelandii	Proteobacteria	Non	neg
Bacilliculturomica massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Bacillus altitudinis	Firmicutes	Rare	+	+
Bacillus amyloliquefaciens	Firmicutes	Rare	+	+	+	d	+	+	neg	+	neg	d(+)	neg	+	d(+)	neg	neg				+	neg			+
Bacillus andreraoultii	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+		neg			+
Bacillus aneurinolyticus	Firmicutes	Rare	+	neg	vr	neg	neg		neg	neg		neg	neg	vr	vr										neg
Bacillus anthracis	Firmicutes	Non	+	+	d	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg				+	neg			+
Bacillus atrophaeus	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	vr	neg	d(+)	neg	neg	neg	+	+	neg	vr				neg	neg			neg
Bacillus badius DSM 23T	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg		neg				neg	neg			neg
Bacillus badius DSM 5610	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg				neg	neg			neg
Bacillus baekryungensis	Firmicutes	Non	+	+	+	+	+		neg	+	neg	+	+	+	+
Bacillus benzoevorans	Firmicutes	Rare	+	neg																	neg				neg
Bacillus caccae	Firmicutes	Rare	+
Bacillus cereus	Firmicutes	Minor	+	d	+	neg	d(+)	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	vr	vr		neg		d	neg			+
Bacillus circulans	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	d(neg)	+	+	+	+	vr	+				+	+			+
Bacillus clausii	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	+	neg	+	neg		neg	+	+	+	+				neg	neg		neg	+
Bacillus cytotoxicus	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg		+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	w			+	neg	neg			neg
Bacillus dakarensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Bacillus endophyticus	Firmicutes	Unlikely	+	+		neg	neg		neg	+	neg	+	d(+)	+	neg						neg
Bacillus firmus	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	vr	neg	vr	+	vr	neg	vr	+	d(+)	vr	neg				vr	vr		+	+
Bacillus fordii	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg				neg	neg			neg
Bacillus halotolerans	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	+	neg	+	neg	neg	+	+	+	neg	+			+	+	neg			+
Bacillus idriensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg		neg	+	+	neg	neg				vr	vr			+
Bacillus infantis	Firmicutes	Rare	+
Bacillus kwashiorkori	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg	neg		+	+		+	+	+	neg				+	neg	neg			+
Bacillus licheniformis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	d(+)	+	+	+	vr	+				+	d(+)		d	+
Bacillus marasmi	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+				+	+			+
Bacillus massilioanorexius	Firmicutes	Rare	+	+	+		w	w	neg	neg				neg	+					w
Bacillus massiliogabonensis	Firmicutes	Unlikely	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	+	neg	neg	neg	+			+	+	+			+
Bacillus massilionigeriensis	Firmicutes	Rare	+	+	neg				neg	neg				neg
Bacillus mediterraneensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	+	neg	neg	+	+	neg	neg				neg	neg			neg
Bacillus methanolicus	Firmicutes	Non	+	+	d(+)	neg			neg	d(+)			d(+)	neg	d(+)						neg	neg			neg
Bacillus mojavensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		neg	+		neg		+	+
Bacillus mycoides	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	w	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			+	+	neg			+
Bacillus niameyensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			+	neg	neg			+
Bacillus pakistanensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	+	neg	+			+	+	neg			neg
Bacillus phocaeensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	+
Bacillus pseudofirmus	Firmicutes	Rare	+																					neg
Bacillus pseudomycoides	Firmicutes	Unlikely	+	+
Bacillus pumilus	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	+	neg	neg	neg	d(+)	neg	+	+	neg	+				neg	neg			neg
Bacillus rubiinfantis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	+	+	neg	+	neg	d	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Bacillus sinesaloumensis	Firmicutes	Unlikely	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Bacillus siralis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	vr				neg	neg			vr
Bacillus smithii	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	d(+)	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			d(+)	neg	neg		neg	neg
Bacillus sonorensis	Firmicutes	Rare	+	+
Bacillus subtilis	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	+	+	neg	+	neg	d(+)	+	+	+	neg	+				+	d(+)			+
Bacillus testis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	d		+						neg	+			+
Bacillus thuringiensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	d(+)	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg				+	neg			+
Bacillus timonensis	Firmicutes	Rare	neg						+			+		+	+	+				w
Bacillus tuaregi	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Bacillus vallismortis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg	+	+	+	neg	neg				neg	neg			neg
Bacillus velezensis Variant polyfermenticus	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	+	+	neg	neg	+	+	+	neg	+			+	+	neg
Bacillus wiedmannii	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	d(neg)			+	+	neg			+
Bacteroides acidifaciens	Bacteroidetes	Moderate	neg
Bacteroides bouchesdurhonensis	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	+	+	+			+				+	+					+	+				+
Bacteroides caccae	Bacteroidetes	Widespread	neg	+	+		d(+)	+	+	+	d(+)	+	+	+	+					+	w(+)	+			d(+)	neg
Bacteroides caecimuris	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+			+	+	+
Bacteroides cellulosilyticus	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			w		w	+	neg		w	+	neg			+		w			+		+	w
Bacteroides clarus	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Bacteroides congonensis	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	neg	neg				+	+	neg			+
Bacteroides coprosuis	Bacteroidetes	Rare	neg										neg
Bacteroides cutis	Bacteroidetes	Moderate	neg
Bacteroides eggerthii	Bacteroidetes	Widespread	neg	w	vr	+	d(+)		+	+	neg	neg	neg	neg	neg		w		+		w(neg)	neg			+	+
Bacteroides faecalis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			w		+	+	+		+	+	+						+			+
Bacteroides faecichinchillae	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+		+	+	+	+
Bacteroides faecis	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Bacteroides finegoldii	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Bacteroides fluxus	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		neg	+	+
Bacteroides fragilis	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			d(+)		+	+	neg	w(+)	+	+	neg				+		+				+	neg
Bacteroides galacturonicus	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg			neg	neg				neg				neg	+		neg	neg
Bacteroides gallinarum	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Bacteroides graminisolvens	Bacteroidetes	Rare	neg								neg		neg		neg										+	+
Bacteroides helcogenes	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	neg		+				+	neg			+	+
Bacteroides heparinolyticus	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		+		+	+			neg	+						+					+
Bacteroides ihuae	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+			+
Bacteroides ilei	Bacteroidetes	Minor	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+			+	+	neg				neg
Bacteroides intestinalis	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Bacteroides luhongzhouii	Bacteroidetes	Rare	neg
Bacteroides luti	Bacteroidetes	Rare	neg				+								w			+								+
Bacteroides mediterraneensis	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	neg		+		neg	+		+	+	+						+		+			+
Bacteroides ndongoniae	Bacteroidetes	Minor	neg	neg	neg				neg	neg				neg
Bacteroides neonati	Bacteroidetes	Minor	neg	neg			neg		neg		neg	neg		neg	neg
Bacteroides nordii	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			d		+	+	neg		+	+	neg											neg
Bacteroides oleiciplenus	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		+	+	+
Bacteroides ovatus	Bacteroidetes	Widespread	neg	+	+	+	+		+	+	+		+	+	+		w			+	+	+			+
Bacteroides pectinophilus	Bacteroidetes	Moderate	neg	neg	w	neg	neg		neg	neg				neg				neg				neg	+		neg	neg
Bacteroides propionicifaciens	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+		w	+			neg	neg	neg		+			w	+				+
Bacteroides pyogenes	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+	+	d		+	d		d	d	d			d				d				d	neg
Bacteroides reticulotermitis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg										+	+
Bacteroides salyersiae	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			d		+	+	neg		+	+	neg											neg
Bacteroides sp. Strain D8	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		+	+		neg	+	+	neg
Bacteroides stercorirosoris	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Bacteroides stercoris	Bacteroidetes	Widespread	neg	+	+	+	neg		+	+	neg	neg	+	+	neg		neg		+	d	+	+			+	d
Bacteroides thetaiotaomicron	Bacteroidetes	Widespread	neg	w	+	+	+		w	+	+		+	+	+		+			+	+	+	+		+
Bacteroides timonensis	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg
Bacteroides togonis	Bacteroidetes	Minor	neg	neg	neg			+	neg	neg	+	+	+	neg			+			+
Bacteroides uniformis	Bacteroidetes	Widespread	neg	+	+	+	+		+	+	w		+	+	w		+			+	+	+
Bacteroides xylanisolvens	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			+		+	+	+		+	+	+			neg	neg		+				neg	+
Bacteroides zhangwenhongi	Bacteroidetes	Rare	neg
Bacteroides zoogleoformans	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	w	d(+)		d(neg)	+	neg	d	d(neg)	+	neg		d		+	neg	d(neg)	d(neg)	neg		+	neg
Bariatricus massiliensis	Firmicutes	Minor	+
Barnesiella intestinihominis	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			w		+	+	neg		neg	neg	neg
Barnesiella viscericola	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		neg	+	neg		neg	+	neg
Bartonella vinsonii	Proteobacteria	Non	neg	neg					neg	neg				neg
Bavariicoccus seileri	Firmicutes	Rare	+																					neg
Bdellovibrio bacteriovorus	Bdellovibrionota	Moderate	neg
Beduinella massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Beduini massiliensis	Firmicutes	Rare	neg	+	neg				neg	neg				neg											+
Beduinibacterium massiliense	Firmicutes	Rare	+
Belnapia soli	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Berryella intestinalis	Actinobacteria	Rare	+
Bhargavaea beijingensis	Firmicutes	Rare	+	neg	+	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	+						neg	neg
Bhargavaea cecembensis	Firmicutes	Non	+	neg	neg	neg			neg	neg			neg	neg	neg
Bifidobacterium adolescentis	Actinobacteria	Widespread	+	+	d	d	d	+	+	+	neg	+	+	+	d	+	+		neg		d	d	neg		d(+)	d(+)
Bifidobacterium aerophilum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	w	w	+	neg	+	neg			neg	neg	neg			neg
Bifidobacterium angulatum	Actinobacteria	Moderate	+	+	+	+	neg	+	+	+	neg	+	+	+		+	vr		neg		neg	vr			+
Bifidobacterium animalis	Actinobacteria	Moderate	+	+	+	+	d(+)	d	+	+	d	+	+	+	d(neg)	neg	neg		+		neg	neg			+
Bifidobacterium animalis subsp. lactis	Actinobacteria	Rare	+	+	neg	neg	neg	+	+	+	neg	+	+	+	neg	neg	+			+	neg	neg			neg
Bifidobacterium asteroides	Actinobacteria	Rare	+	+	+	d	+		neg	d	neg	+	+	+	neg							neg			neg	d(neg)
Bifidobacterium avesanii	Actinobacteria	Rare	+	+	+	w	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	+	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Bifidobacterium biavatii	Actinobacteria	Rare	+	+	w	neg	w	+	+	neg	neg	+	neg	+	neg	neg	w			neg	+	neg			+
Bifidobacterium bifidum	Actinobacteria	Widespread	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg		neg	vr	neg	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Bifidobacterium boum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg	neg	d(neg)	+	neg	+	+	+	neg	neg	neg				+	+			+
Bifidobacterium breve	Actinobacteria	Widespread	+	+	+	+	vr	vr	+	+	neg		+	+	neg	+	+		neg		+	neg	neg		+	neg
Bifidobacterium callitrichidarum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	w	+	w	+	w	neg	+	+	+	neg	neg	w			+	neg	neg			neg
Bifidobacterium catenulatum	Actinobacteria	Moderate	+	+	vr	+	+	vr	+	+	neg		+	+	vr	vr	+		neg		neg	neg			d
Bifidobacterium catenulatum subsp. kashiwanohense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	neg							neg			neg
Bifidobacterium choerinum	Actinobacteria	Rare	+	+	neg	+	neg		+	+	neg	+	+	+	neg							neg			+	neg
Bifidobacterium coryneforme	Actinobacteria	Rare	+				+		+	+	d(neg)	+	d	+	neg		vr			d(neg)	neg				neg
Bifidobacterium cuniculi	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg		neg	+	neg	+	neg	+	neg							neg			+
Bifidobacterium dentium	Actinobacteria	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		neg			neg			+
Bifidobacterium eulemuris	Actinobacteria	Rare	+	+	w	neg	neg	+	w		neg	+	+		w	+	+				neg
Bifidobacterium faecale	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+
Bifidobacterium gallicum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	+	neg				+	neg			+
Bifidobacterium imperatoris	Actinobacteria	Rare	+	+	neg	+	neg		+	+			+	+	neg	+					+	neg		neg	neg
Bifidobacterium indicum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	d	+		neg	d	neg	+	+	+	neg							neg			neg	neg
Bifidobacterium lemurum	Actinobacteria	Rare	+	+	d	+	+		+	+	+	+	+	+	+	w	w			+	+	neg			neg
Bifidobacterium longum subsp. infantis	Actinobacteria	Moderate	+	+	+	+	neg	neg	+	+	d	+	+	+	d(neg)	vr	neg		d	neg	neg	d	neg		d	d(+)
Bifidobacterium longum subsp. longum	Actinobacteria	Widespread	+	+	+	+	neg	neg	+	+	d(+)	+	+	+	neg	vr	neg		neg	neg	neg	d(neg)	neg		neg	neg
Bifidobacterium longum subsp. suis	Actinobacteria	Rare	+	+	d	+	neg		+	+	neg	+	+	+	neg							neg			neg	neg
Bifidobacterium merycicum	Actinobacteria	Rare	+	+	w	+	d		+	+	neg	+	+	+	neg				+			neg			+
Bifidobacterium minimum	Actinobacteria	Rare	+	+	+		neg		neg	neg	neg	neg	neg	d	neg		neg			neg	+				+
Bifidobacterium mongoliense	Actinobacteria	Unlikely	+	+	neg	+	vr	vr	+	+	neg	+	+	+	neg	+	vr				+	neg			w
Bifidobacterium moukalabense	Actinobacteria	Rare	+	+			neg		+	+	+		+	+	neg
Bifidobacterium myosotis	Actinobacteria	Rare	+	+	d	d	+	neg	+	+	w	+		+	+	d	d				neg	neg			neg
Bifidobacterium pseudocatenulatum	Actinobacteria	Widespread	+	+	+	+	d(+)	+	+	+	neg	+	+	+	vr	vr	+		neg		+	d(neg)			+
Bifidobacterium pseudolongum	Actinobacteria	Minor	+	+	+	+	neg	neg	+	+	neg		+	+	neg	+	neg				+	neg			+
Bifidobacterium pseudolongum subsp. globosum	Actinobacteria	Rare	+	+	+		d		+	+	neg	+	+	+	neg		neg			neg	+				+
Bifidobacterium pullorum subsp. gallinarum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	d(+)			d(+)	+	d(neg)	+	+	+	d(+)		+			+	neg	+			neg
Bifidobacterium pullorum subsp. saeculare	Actinobacteria	Rare	+				neg		d		+						neg						neg			+
Bifidobacterium ramosum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Bifidobacterium reuteri	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	w	+	+	+	w	+	+	+	w	w	w				+	neg			+
Bifidobacterium ruminantium	Actinobacteria	Minor	+	+	+	+	neg	neg	vr	+	neg	+	+	+	neg	neg	neg		+		+	neg			+
Bifidobacterium saguini	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	neg	+	+			neg	neg	neg			neg
Bifidobacterium scardovii	Actinobacteria	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	vr	+	+	+	+	+	+		neg		neg	neg		neg	+
Bifidobacterium stellenboschense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg	w	+	+	+	+	+	neg	+	+	+				neg	neg			neg
Bifidobacterium subtile	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	d		neg	d(+)	d(+)	+	+	+	d(neg)		neg			neg	d(+)	d			d(+)	neg
Bifidobacterium thermacidophilum	Actinobacteria	Rare	+		+	+			vr		vr	+	+	+	neg							neg			vr
Bifidobacterium thermophilum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg		+	+	neg	neg	neg			d	neg	w			+
Bifissio spartinae	Bacteroidetes	Rare	neg
Bilophila wadsworthia	Desulfobacterota	Widespread	neg										neg
Bittarella massiliensis	Firmicutes	Moderate	neg
Blastococcus massiliensis	Actinobacteria	Rare	+
Blastomonas natatoria	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+					+	+			+
Blautia brookingsii	Firmicutes	Rare	+										neg
Blautia caecimuris	Firmicutes	Rare	+	+					+	+			+	+	+
Blautia coccoides	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	+		+		neg	w	neg	neg			w
Blautia faecicola	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	w	neg	neg	neg	neg	w	neg	w	w	neg	neg				+	neg	neg			neg
Blautia faecis	Firmicutes	Rare	+		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg			+	neg				neg
Blautia glucerasea	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+			+										+		+	+
Blautia hansenii	Firmicutes	Moderate	+	+	neg		neg		+	+	neg	w	+	neg	neg					d(neg)					neg
Blautia hominis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	neg	neg			+
Blautia hydrogenotrophica	Firmicutes	Moderate	+	+			+						neg	neg
Blautia intestinalis	Firmicutes	Rare	+
Blautia liquoris	Firmicutes	Rare	+
Blautia luti	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+		+	+		+	+	+	+		d				neg	+			+
Blautia marasmi	Firmicutes	Rare	+
Blautia massiliensis	Firmicutes	Moderate	neg	+			+	+	+	+	+		+	+	+		+			+		+			+
Blautia obeum	Firmicutes	Widespread	+	+	+		+		+	+		+	vr	neg	neg	vr	d(neg)			d	neg
Blautia phocaeensis	Firmicutes	Rare	+
Blautia producta	Firmicutes	Widespread	+	+	+		+		+	+	neg	+	+	+	neg	neg			neg	+	neg		neg		neg	neg
Blautia provencensis	Firmicutes	Rare	+
Blautia pseudococcoides	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	+		+		neg	w	neg	neg			w
Blautia schinkii	Firmicutes	Rare	+	+			+			+			+	+
Blautia stercoris	Firmicutes	Minor	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg			+	neg
Blautia wexlerae	Firmicutes	Moderate	+	+			d		d	d			d	d						+
Bordetella bronchiseptica	Proteobacteria	Non	neg	neg
Bordetella hinzii	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg			neg				neg	neg
Bordetella trematum	Proteobacteria	Non	neg	neg			neg			neg				neg	neg
Bosea massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg									neg
Brachybacterium conglomeratum	Actinobacteria	Rare	+	+	d	+	d(neg)		d	+	neg		neg	d	neg
Brachybacterium faecium	Actinobacteria	Unlikely	+	+			d			+				d
Brachybacterium ginsengisoli	Actinobacteria	Unlikely	+	+
Brachybacterium massiliense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	+	+	+	+	+	neg			+	+	+			+
Brachybacterium muris	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+			+	+		neg	neg	+
Brachybacterium paraconglomeratum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	w		w	+	w	w	neg	+	neg						neg
Brachymonas chironomi	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	neg			neg					neg	neg
Brachyspira aalborgi	Spirochaetes	Rare	neg	+	+				+	+					+
Brachyspira hyodysenteriae	Spirochaetes	Rare	neg
Brachyspira pilosicoli	Spirochaetes	Unlikely	neg	+	d(+)	d	+			d(+)			neg	+	+
Bradyrhizobium denitrificans	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Bradyrhizobium elkanii	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Bradyrhizobium ganzhouense	Proteobacteria	Unlikely	neg
Bradyrhizobium icense	Proteobacteria	Unlikely	neg
Bradyrhizobium japonicum	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Bradyrhizobium neotropicale	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Brassicibacter mesophilus	Firmicutes	Rare	neg
Brenneria populi Li et al. 2015	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	d(neg)	d	d(neg)	+	neg	+	+	+	d(+)	neg	+			+	neg				neg
Brevibacillus agri	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	neg	neg	neg	w	neg		neg	neg	w(neg)	neg	neg				neg	neg			neg
Brevibacillus borstelensis	Firmicutes	Rare	+	neg	w	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Brevibacillus brevis	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+		neg	+		neg		+	+						+
Brevibacillus centrosporus	Firmicutes	Unlikely	+	+	neg	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg				neg	neg			neg
Brevibacillus choshinensis	Firmicutes	Rare	+	+	d	neg			neg	neg				neg	d										neg
Brevibacillus formosus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	neg		neg	+		neg	neg	neg	neg
Brevibacillus laterosporus	Firmicutes	Rare	vr	+	+					+					+	neg
Brevibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg	neg
Brevibacillus parabrevis	Firmicutes	Unlikely	vr	+	neg					+					+	+
Brevibacillus thermoruber	Firmicutes	Non	+
Brevibacterium aurantiacum	Actinobacteria	Unlikely	+	+	d	+					neg		neg		neg							neg
Brevibacterium casei	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Brevibacterium celere	Actinobacteria	Rare	+	neg		neg			neg	neg				neg
Brevibacterium epidermidis	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg				+							neg
Brevibacterium ihuae	Actinobacteria	Rare	+
Brevibacterium iodinum	Actinobacteria	Unlikely	vr	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Brevibacterium linens	Actinobacteria	Unlikely	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Brevibacterium luteolum	Actinobacteria	Rare	+
Brevibacterium mcbrellneri	Actinobacteria	Unlikely	+
Brevibacterium otitidis	Actinobacteria	Non	+
Brevibacterium paucivorans	Actinobacteria	Rare	+
Brevibacterium pityocampae	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg		neg		neg			neg				neg
Brevibacterium ravenspurgense	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Brevibacterium samyangense	Actinobacteria	Rare	+	w						w				w							neg
Brevibacterium sanguinis	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg				neg				neg	neg
Brevibacterium senegalense	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg				neg							neg
Brevundimonas aurantiaca	Proteobacteria	Rare	neg
Brevundimonas bacteroides	Proteobacteria	Rare	neg
Brevundimonas bullata	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg	neg			neg	neg				neg	neg										neg
Brevundimonas diminuta	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg		neg	neg				neg	neg						neg
Brevundimonas intermedia	Proteobacteria	Rare	neg
Brevundimonas nasdae	Proteobacteria	Rare	neg	+		+								+
Brevundimonas terrae	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg		neg	neg				neg	neg						neg
Brevundimonas vesicularis	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg		neg	neg				neg	neg						neg
Brochothrix thermosphacta	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	vr	w	neg	+	+	neg	+		neg		neg	vr			neg
Brucella anthropi	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+		+		neg	+			neg	+	d(+)
Brucella cytisi	Proteobacteria	Rare	neg
Brucella melitensis	Proteobacteria	Non	neg
Brucella tritici	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	+								neg	neg			neg
Buchnera aphidicola	Proteobacteria	Non	neg
Bulleidia extructa	Firmicutes	Rare	+
Burkholderia arboris	Proteobacteria	Rare	neg	+					+	+				+
Burkholderia cepacia	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		+	+	neg	neg	neg	+	+							neg
Burkholderia gladioli	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	d		neg	neg	neg	+	neg	neg	+							+
Burkholderia mallei	Proteobacteria	Unlikely	neg
Burkholderia multivorans	Proteobacteria	Rare	neg	+	+		+		+	+			neg	neg	+
Burkholderia pseudomallei	Proteobacteria	Unlikely	neg
Burkholderia pyrrocinia	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		+				neg			neg	+	neg							neg			neg
Burkholderia vietnamiensis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+		+	+	+	+			d(+)	+
Buttiauxella agrestis	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+	+	+	+		d	d(neg)	neg	+
Butyribacter intestini	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	+	neg	+	neg	+	neg				neg	neg			+
Butyricicoccus faecihominis	Firmicutes	Rare	+	+					neg	neg	neg			neg	neg
Butyricicoccus porcorum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg		+	+	neg		w	+	neg										neg
Butyricicoccus pullicaecorum	Firmicutes	Minor	+	+			+		neg	+	neg		neg	+	+
Butyricimonas faecalis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Butyricimonas faecihominis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg		neg	neg	+		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Butyricimonas paravirosa	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg		neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Butyricimonas phoceensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+					+
Butyricimonas synergistica	Bacteroidetes	Minor	neg	+	neg		neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Butyricimonas virosa	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	neg		neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Butyrivibrio crossotus	Firmicutes	Widespread	neg	w	w	neg	neg		+	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	w	neg			w
Butyrivibrio fibrisolvens	Firmicutes	Minor	neg	+	+	+	+		+	+			neg	+	d			neg		d		+	+		d	d
Butyrivibrio hungatei	Firmicutes	Unlikely	neg
Butyrivibrio proteoclasticus	Firmicutes	Rare	+
Caballeronia novacaledonica	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Caecibacter massiliensis	Firmicutes	Rare
Caldibacillus thermoamylovorans	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	w(+)	+	w(+)	neg	neg	+	+	neg	+				+	neg			+
Caldicellulosiruptor diazotrophicus	Firmicutes	Non	+	+
Caldicoprobacter faecalis	Firmicutes	Unlikely	neg	+	+	+	+		+	+		+		+				neg			neg		w		neg	neg
Caloranaerobacter azorensis	Firmicutes	Non	neg	+			neg							neg				neg							+	+
Campylobacter avium	Proteobacteria	Non	neg
Campylobacter coli	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg									neg
Campylobacter concisus	Proteobacteria	Minor	neg	neg	neg					neg				neg
Campylobacter curvus	Proteobacteria	Rare	neg	neg									neg
Campylobacter faecalis	Proteobacteria	Rare	neg
Campylobacter fetus subsp. fetus	Proteobacteria	Rare	neg
Campylobacter gracilis	Proteobacteria	Minor	neg	neg									neg
Campylobacter hominis	Proteobacteria	Minor	neg	+
Campylobacter hyointestinalis subsp. hyointestinalis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Campylobacter jejuni subsp. doylei	Proteobacteria	Rare	neg
Campylobacter jejuni subsp. jejuni	Proteobacteria	Unlikely	neg
Campylobacter lanienae	Proteobacteria	Rare	neg
Campylobacter lari subsp. concheus	Proteobacteria	Rare	neg
Campylobacter lari subsp. lari	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg					neg			neg	neg
Campylobacter mucosalis	Proteobacteria	Rare	neg
Campylobacter peloridis	Proteobacteria	Rare	neg
Campylobacter rectus	Proteobacteria	Rare	neg	neg									neg
Campylobacter showae	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Campylobacter sputorum	Proteobacteria	Non	neg	neg
Campylobacter troglodytis	Proteobacteria	Rare	neg
Campylobacter upsaliensis	Proteobacteria	Rare	neg	neg									neg
Campylobacter ureolyticus	Proteobacteria	Minor	neg
Candidatus Babela massiliensis	Candidatus Dependentiae	Unlikely	neg
Candidatus Dorea massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Candidatus Stoquefichus massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+
Capnocytophaga canimorsus	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	d	d(+)	d		+	+		neg	neg	neg	neg				d(+)		d(+)	neg			d(+)
Capnocytophaga gingivalis	Bacteroidetes	Non	neg	+	neg	neg	neg			+	neg		neg	+	neg					neg	neg				neg
Capnocytophaga granulosa	Bacteroidetes	Rare	neg	+	vr				+	+				+				neg			neg	neg			+
Capnocytophaga leadbetteri	Bacteroidetes	Rare	neg	w(neg)	neg	neg	neg		w(neg)			neg	neg	neg			neg				neg	neg			neg
Capnocytophaga ochracea	Bacteroidetes	Rare	neg	+	d(+)	d	neg		d(+)	+	neg	neg	+	+	neg		d(+)		neg	d(+)	d(+)	+			+
Capnocytophaga sputigena	Bacteroidetes	Rare	neg	+	d(+)	neg			vr	+	neg	neg	+	+	neg				neg		neg	+			+
Capnocytophaga stomatis	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+					+			+	d(+)	+			+
Caproicibacter fermentans	Firmicutes	Rare	neg	+	+
Cardiobacterium hominis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg		neg	+	neg	neg			neg							neg
Cardiobacterium valvarum	Proteobacteria	Rare	neg	+	d	neg			neg	neg				neg
Carnobacterium divergens	Firmicutes	Non	+	+	+	d(neg)	+	+	neg	+	d	neg	neg	+	+	neg	+				neg	neg			neg
Carnobacterium inhibens	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	w	+	neg	neg	neg	+	+	neg				+	neg	w		neg	neg
Carnobacterium maltaromaticum	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	+			+		neg			+
Carnobacterium mobile	Firmicutes	Non	+	+	+	+	+	d	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg				neg	+			neg
Casaltella massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Catenibacillus scindens	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Catenibacterium mitsuokai	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+		+	+	neg		neg		neg		neg			neg	neg				neg
Catenulispora acidiphila	Actinobacteria	Unlikely	+
Catonella morbi	Firmicutes	Rare	neg	d(+)	neg		d		d	d	neg	d(neg)	+	+	d(neg)		d(neg)		d	neg	d	neg	neg		neg
Caulobacter vibrioides	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	neg		w	+		+		neg	neg	neg	+		w				neg				w
Cedecea davisae	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		d(neg)	+		neg	neg	+	+		+			vr
Cedecea lapagei	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		d(+)	+		neg	neg	neg	+
Cedecea neteri	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		w	+		neg	neg	+	+
Cellulomonas carbonis	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	+	+
Cellulomonas composti	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	w	+				+	+						+	w			+
Cellulomonas denverensis	Actinobacteria	Rare	+	+		+	+		+	+	neg	d	neg	+	+						neg
Cellulomonas fimi	Actinobacteria	Rare	+
Cellulomonas flavigena	Actinobacteria	Rare	+	+
Cellulomonas hominis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	+				neg
Cellulomonas massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	neg
Cellulomonas parahominis	Actinobacteria	Rare	+
Cellulomonas timonensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	+	neg			+
Cellulosilyticum lentocellum	Firmicutes	Rare	neg
Cellulosilyticum ruminicola	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg	neg	+		w	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg	+			neg		w		neg	+
Cellulosimicrobium cellulans	Actinobacteria	Rare	+	+	+		+		neg	+			neg	+		+					+
Centipeda periodontii	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	neg		+	+	+	+	+	+	+		neg			neg	neg	neg			neg
Cerasibacillus quisquiliarum	Firmicutes	Non	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		+	neg	neg	+	neg	neg				neg	neg
Cetobacterium somerae	Fusobacteria	Rare	neg
Chelatococcus asaccharovorans	Proteobacteria	Unlikely	neg
Chitinophaga agri	Bacteroidetes	Unlikely	neg
Chlamydia trachomatis	Chlamydiae	Non	neg
Chloracidobacterium thermophilum	Acidobacteria	Non	neg
Christensenella hongkongensis	Firmicutes	Minor	+	+			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Christensenella massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Christensenella minuta	Firmicutes	Minor	neg	+			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Christensenella timonensis	Firmicutes	Minor	neg
Chromobacterium violaceum	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	d(neg)	+						+	neg			d(+)
Chromohalobacter japonicus	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	neg	+	+			+				+	neg
Chromohalobacter salexigens	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+			+	+				+	neg
Chryseobacterium gallinarum	Bacteroidetes	Unlikely	neg	w					neg	neg		neg	neg	neg	neg
Chryseobacterium gleum	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	+		neg		neg	+			neg	neg	+	d
Chryseobacterium hominis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		neg		neg	+				d	neg
Chryseobacterium indologenes	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	neg	neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	+						+	neg
Chryseobacterium oranimense	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg				neg	neg					neg					+
Chryseobacterium taklimakanense	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg				neg	+		+		neg	neg					+	+				+
Chryseobacterium viscerum	Bacteroidetes	Non	neg	neg
Chryseomicrobium amylolyticum	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg		neg	neg	neg	+							neg
Citrobacter amalonaticus	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		d	+		neg	neg	neg	+		+
Citrobacter braakii	Proteobacteria	Rare	neg	+			d(+)		d(+)	+		+	neg	neg	+					neg
Citrobacter europaeus	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	+	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Citrobacter farmeri	Proteobacteria	Minor	neg	+			+		neg	+	neg	+	+	+	+		+			neg
Citrobacter freundii	Proteobacteria	Minor	neg	+			vr		+	+		+	vr	vr	+					neg
Citrobacter gillenii	Proteobacteria	Rare	neg	+			+			+				neg	+		+
Citrobacter intermedius	Proteobacteria	Unlikely	neg
Citrobacter koseri	Proteobacteria	Minor	neg	+			+		d(+)	+		neg	neg	d	+		+			neg
Citrobacter murliniae	Proteobacteria	Rare	neg	vr			+		+	+			neg	d(neg)	+					w
Citrobacter pasteurii	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+		+		neg	neg	vr	+		neg			+					+
Citrobacter portucalensis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Citrobacter rodentium	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		+	+		neg	neg	neg	+
Citrobacter sedlakii	Proteobacteria	Rare	neg	+	+		+		+	+		+	neg	neg	+		+			neg					neg
Citrobacter werkmanii	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		d			neg	neg	neg	+		neg			neg
Citrobacter youngae	Proteobacteria	Rare	neg				d(+)		d(neg)	+		neg	neg	neg	+		neg			neg					neg
Citroniella saccharovorans	Firmicutes	Rare	+	+						+			neg
Cloacibacillus evryensis	Synergistetes	Minor	neg
Cloacibacillus porcorum	Synergistetes	Rare	neg
Cloacibacterium normanense	Bacteroidetes	Rare	neg	+					neg		neg	neg	neg	neg	neg						neg
Clostridioides difficile	Firmicutes	Widespread	+	+	+		neg		neg	neg	vr		neg	vr	vr
Clostridioides mangenotii	Firmicutes	Rare	+	+					neg
Clostridium acetobutylicum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+			+	+	+	neg	+	+	vr	w	vr	neg	+	vr	+		+		+
Clostridium amazonense	Firmicutes	Rare	+
Clostridium amazonitimonense	Firmicutes	Rare	+	+	+				neg	neg				neg
Clostridium aminobutyricum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+				w					w			neg	neg		w
Clostridium aminophilum	Firmicutes	Rare	+
Clostridium amylolyticum	Firmicutes	Rare	+	+
Clostridium anorexicamassiliense	Firmicutes	Rare	+
Clostridium argentinense	Firmicutes	Rare	+
Clostridium aurantibutyricum	Firmicutes	Rare	+	+		+	neg		+	+	d		neg	+	neg			neg				neg	+		+
Clostridium autoethanogenum	Firmicutes	Rare	+
Clostridium baratii	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+		+	+	neg	vr	neg	+	vr					neg		neg			+
Clostridium beijerinckii	Firmicutes	Minor	+	+	+				+	+				+									+
Clostridium boliviensis	Firmicutes	Rare	+																							+
Clostridium bornimense	Firmicutes	Rare	vr
Clostridium botulinum Gp I	Firmicutes	Unlikely	+										neg
Clostridium botulinum Gp II	Firmicutes	Unlikely	+
Clostridium botulinum Gp III	Firmicutes	Unlikely	+
Clostridium botulinum Gp IV	Firmicutes	Unlikely	+
Clostridium budayi	Firmicutes	Rare	+	+	+		w(+)		d(+)	w(+)	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	w(+)		+		neg
Clostridium butyricum	Firmicutes	Widespread	+	neg									neg
Clostridium cadaveris	Firmicutes	Rare	+
Clostridium cagae	Firmicutes	Rare	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg			neg	neg	+			neg
Clostridium carboxidivorans	Firmicutes	Rare	+
Clostridium carnis	Firmicutes	Rare	+
Clostridium celatum	Firmicutes	Minor	+
Clostridium cellulosi	Firmicutes	Unlikely	neg	+	+	+	+		+		neg	+	+	+	+			+		+	+	+			+
Clostridium cellulovorans	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+		+									+					+		neg	+
Clostridium chartatabidum	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+		d	neg		neg	neg	+	neg		neg	+							neg	neg
Clostridium chauvoei	Firmicutes	Rare	+	+			+		+	+	+		+	+	+
Clostridium cochlearium	Firmicutes	Minor	+
Clostridium cocleatum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+		neg	d	d	+	d		d			+	neg	+			neg
Clostridium colicanis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+		+	+	neg	neg	neg	+	neg		neg			w	neg				w
Clostridium colinum	Firmicutes	Rare	+	+	w		neg		neg	w	neg	neg	+	+	+						neg
Clostridium combesii	Firmicutes	Rare	+	w	neg		neg		neg	w	neg	neg	neg	neg	neg					neg	neg
Clostridium culturomicium	Firmicutes	Rare	+																	+
Clostridium dakarense	Firmicutes	Rare	+	+	neg	+			neg	+				+
Clostridium diolis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+		w	+	neg		+		+			w	+				neg
Clostridium disporicum	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+		+	+			+	+	+					+					+
Clostridium drakei	Firmicutes	Unlikely	+
Clostridium estertheticum	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+			+												+			+
Clostridium fallax	Firmicutes	Rare	+
Clostridium felsineum	Firmicutes	Rare	+
Clostridium fessum	Firmicutes	Rare	+	+			neg		neg	neg	neg		w	neg	neg
Clostridium gasigenes	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	+		neg	+			neg	neg	+							neg
Clostridium haemolyticum	Firmicutes	Rare	+
Clostridium herbivorans	Firmicutes	Rare	+				+			+							neg	+			+				+
Clostridium hylemonae	Firmicutes	Minor	+	+	vr	+	neg		neg	vr	neg	neg	+	+	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Clostridium ihumii	Firmicutes	Rare	+
Clostridium innocuum	Firmicutes	Widespread	+	+					neg	vr				+
Clostridium intestinale	Firmicutes	Rare	+	+						neg					+										neg
Clostridium isatidis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+		neg	+	neg		neg	+	+		+				neg	neg			+
Clostridium jeddahense	Firmicutes	Rare	+
Clostridium jeddahitimonense	Firmicutes	Rare	+																	+
Clostridium kluyveri	Firmicutes	Unlikely	vr
Clostridium leptum	Firmicutes	Widespread	+
Clostridium magnum	Firmicutes	Rare	neg
Clostridium malenominatum	Firmicutes	Rare	+
Clostridium manihotivorum	Firmicutes	Rare	+																					+		+
Clostridium massiliamazoniense	Firmicutes	Rare	+	+	neg				neg	+				neg
Clostridium massiliodielmoense	Firmicutes	Rare	+	+	+				neg	+				neg
Clostridium mediterraneense	Firmicutes	Rare	+
Clostridium merdae	Firmicutes	Rare	+	+	neg				neg	+				neg
Clostridium metallolevans	Firmicutes	Rare	+	+						+				+											+
Clostridium methoxybenzovorans	Firmicutes	Rare	+
Clostridium methylpentosum	Firmicutes	Moderate	+
Clostridium minihomine	Firmicutes	Rare	+
Clostridium moniliforme	Firmicutes	Rare	+	+	w(+)	+	neg		neg	d(+)	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Clostridium neonatale	Firmicutes	Minor	+
Clostridium niameyense	Firmicutes	Rare	+	+	+				neg	neg				neg
Clostridium nigeriense	Firmicutes	Rare	+	+	+				+	+				+
Clostridium nitritogenes	Firmicutes	Rare	+	+	w(+)		w(+)		neg	w(+)	neg	neg	neg	d(+)	d(+)		neg			neg	neg				neg
Clostridium novyi A	Firmicutes	Rare	+
Clostridium oceanicum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+			neg	+			neg	neg				neg		neg	neg	neg
Clostridium paraputrificum	Firmicutes	Moderate	+						+	+	neg		neg		neg				neg		+
Clostridium pasteurianum	Firmicutes	Rare	+
Clostridium perfringens	Firmicutes	Widespread	+	+	+		neg		+	+	neg		neg	+	+
Clostridium phoceensis	Firmicutes	Rare	neg	+	neg				neg	neg				neg
Clostridium polyendosporum	Firmicutes	Rare	+
Clostridium polynesiense	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	+	+	+			+	neg	neg
Clostridium polysaccharolyticum	Firmicutes	Rare	neg	neg	d	neg	+		neg	w			neg	neg	neg			+				neg	d(neg)		+	+
Clostridium populeti	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+		neg	+	neg			+	neg			+					+			+
Clostridium punense	Firmicutes	Rare	+
Clostridium putrefaciens	Firmicutes	Minor	+
Clostridium rectalis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+	+	+	+			neg	+	neg			+
Clostridium roseum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	neg	neg	neg	neg	+	neg		neg				neg	neg	+		+
Clostridium saccharobutylicum	Firmicutes	Unlikely	+
Clostridium saccharoperbutylacetonicum	Firmicutes	Rare	+	+					+	+	+	+	+	+	+	+	+		+		+	+	+		+
Clostridium sardiniense	Firmicutes	Rare	+	+	+	+			+	+			neg	+								neg
Clostridium sartagoforme	Firmicutes	Minor	+
Clostridium saudiense	Firmicutes	Minor	+
Clostridium scatologenes	Firmicutes	Rare	+
Clostridium schirmacherense	Firmicutes	Unlikely	+
Clostridium scindens	Firmicutes	Moderate	+	+						neg				neg
Clostridium senegalense	Firmicutes	Rare	+
Clostridium septicum	Firmicutes	Rare	+						neg	neg	neg		neg		neg				neg		neg
Clostridium sporogenes	Firmicutes	Minor	+	+			neg		neg	+	neg		neg	neg	+
Clostridium sporosphaeroides	Firmicutes	Minor	+
Clostridium subterminale	Firmicutes	Rare	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Clostridium sulfidigenes	Firmicutes	Rare	+
Clostridium symbiosum	Firmicutes	Widespread	neg	+	+	+	neg		d(neg)		neg	neg	neg	+	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Clostridium taeniosporum	Firmicutes	Unlikely	+
Clostridium tertium	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	neg		neg	+	+	neg	+		neg		+	neg			+
Clostridium tetani	Firmicutes	Unlikely	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Clostridium thermarum	Firmicutes	Unlikely	+	+			+						neg													+
Clostridium thermobutyricum	Firmicutes	Rare	vr	+	+	neg	+			+			neg	neg											neg
Clostridium thiosulfatireducens	Firmicutes	Rare	+
Clostridium transplantifaecale	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			neg	+	+			+
Clostridium tyrobutyricum	Firmicutes	Rare	+	+			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Clostridium vincentii	Firmicutes	Rare	+
Clostridium viride	Firmicutes	Rare	+
Colibacter massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+								+		+			+
Colidextribacter massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Collinsella aerofaciens	Actinobacteria	Widespread	+	+	+	+	d(+)		+	+	neg		d(neg)	+	d(neg)		d(neg)		neg	w(neg)	neg				neg
Collinsella bouchesdurhonensis	Actinobacteria	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+					neg	neg			neg
Collinsella ihumii	Actinobacteria	Rare	+	+			+		+	+	+				+
Collinsella intestinalis	Actinobacteria	Moderate	+	+	+	+	+		neg	neg	neg		neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Collinsella massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Collinsella phocaeensis	Actinobacteria	Rare	neg
Collinsella provencensis	Actinobacteria	Rare	+
Collinsella stercoris	Actinobacteria	Minor	+	+	+	+	+		+	+	neg		neg				neg			neg	neg				neg
Collinsella tanakaei	Actinobacteria	Minor	+	+			+		+	+	neg		d	+	+
Collinsella vaginalis	Actinobacteria	Rare	+
Comamonas aquatica	Proteobacteria	Non	neg
Comamonas denitrificans	Proteobacteria	Rare	neg
Comamonas kerstersii	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Comamonas koreensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Comamonas terrigena	Proteobacteria	Unlikely	neg
Comamonas testosteroni	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Comamonas thiooxydans	Proteobacteria	Rare	neg
Companilactobacillus alimentarius	Firmicutes	Rare	+	+	+	vr	+	vr	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+		neg	+	neg	neg			d
Companilactobacillus farciminis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	w	neg	neg	neg	+	w	neg	neg			+	neg	neg			neg
Companilactobacillus mindensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	+		neg	w	neg	neg	neg	neg	neg		d			+
Companilactobacillus versmoldensis	Firmicutes	Unlikely	+	+		+	neg		+	+	neg	+	neg	neg	neg		neg			neg		neg
Conexibacter woesei	Actinobacteria	Rare	+	neg
Congobacterium massiliense	Firmicutes	Rare	+
Coprobacillus cateniformis	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+		+	+	neg		neg	+	+		neg			neg	neg				neg
Coprobacter fastidiosus	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			neg		+	+	neg		+	neg	neg						neg
Coprobacter secundus	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		+	+	+
Coprobacter secundus subsp. similis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+	neg		+	+	+
Coprococcus catus	Firmicutes	Widespread	+	w	+		neg		neg	w(neg)	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg		neg			neg
Coprococcus comes	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	neg		+	+	neg	vr	+	+	neg		w			neg		vr
Coprococcus eutactus	Firmicutes	Widespread	+	+	+		+		+	+	+	+	+	+	neg		+			vr		neg			+
Coprococcus phoceensis	Firmicutes	Rare	vr	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Coraliomargarita akajimensis	Verrucomicrobia	Non	neg	neg	+	w	neg	neg	neg		neg	neg	neg		+	+	neg				neg	neg			neg
Coriobacterium glomerans	Actinobacteria	Unlikely	+	+			+		neg	+		neg	neg	+								neg			neg
Corynebacterium accolens	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+			neg	+			neg	d	neg							neg
Corynebacterium afermentans	Actinobacteria	Rare	+	neg		neg			neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Corynebacterium ammoniagenes	Actinobacteria	Rare	+	+					neg	vr				+			neg				neg
Corynebacterium amycolatum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	d	d(neg)	neg	neg	+	neg	d(neg)	neg	d	d	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Corynebacterium appendicis	Actinobacteria	Rare	+	d(+)			neg		neg	d(+)	neg	neg	neg	neg	neg						neg	neg		+
Corynebacterium argentoratense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg			neg	neg				neg	neg						neg
Corynebacterium aurimucosum	Actinobacteria	Rare	+	+	+		neg		neg	+	neg		neg	+	neg		neg		neg		neg	neg
Corynebacterium bouchesdurhonense	Actinobacteria	Rare	+
Corynebacterium bovis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+			neg	+			neg	neg	d										neg
Corynebacterium callunae	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	neg			neg	+			neg	+	+				neg						neg
Corynebacterium casei	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	d(neg)	neg	neg				neg	neg
Corynebacterium coyleae	Actinobacteria	Rare	+	w	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Corynebacterium cystitidis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg			neg	+			neg	neg	+										+
Corynebacterium diphtheriae	Actinobacteria	Non	vr											d
Corynebacterium doosanense	Actinobacteria	Rare	+	+						neg
Corynebacterium durum	Actinobacteria	Minor	+	+	+	+			neg	+				+	neg						neg
Corynebacterium efficiens	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg			neg	+											neg				neg
Corynebacterium falsenii	Actinobacteria	Rare	+	+	d	+	neg	neg	d	d	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg				neg
Corynebacterium flavescens	Actinobacteria	Rare	vr	+	+	+			neg	neg		neg	neg	neg	neg							neg			neg
Corynebacterium freneyi	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	d(neg)	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	d(+)	neg		neg		neg	d			d(neg)
Corynebacterium genitalium	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg					neg				neg
Corynebacterium glaucum	Actinobacteria	Rare	+	+			neg		neg	neg			neg	+	neg						neg	neg
Corynebacterium glucuronolyticum	Actinobacteria	Rare	+	+					vr	d				+							neg
Corynebacterium glutamicum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg			neg	+			neg	+	+				neg						neg
Corynebacterium ihumii	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	+	+	+	+	neg	+			neg	+	+			+
Corynebacterium jeddahense	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Corynebacterium jeikeium	Actinobacteria	Rare	+	+	neg	+	neg		neg	d		neg	neg	neg	neg				neg		neg
Corynebacterium kroppenstedtii	Actinobacteria	Minor	+	+					neg	w	neg		neg	+					neg		neg
Corynebacterium lipophiloflavum	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg				neg							neg
Corynebacterium lujinxingii	Actinobacteria	Rare	+
Corynebacterium matruchotii	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+									+
Corynebacterium minutissimum	Actinobacteria	Rare	+	+	+		neg		neg	+	neg		neg	+	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Corynebacterium mucifaciens	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	vr	neg	neg			neg		neg
Corynebacterium neomassiliense	Actinobacteria	Rare	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Corynebacterium otitidis	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg				neg							neg
Corynebacterium pacaense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	w	neg	neg			+	neg	neg			neg
Corynebacterium propinquum	Actinobacteria	Rare	+	neg		neg			neg	neg					neg						neg
Corynebacterium provencense	Actinobacteria	Rare	+
Corynebacterium pseudodiphtheriticum	Actinobacteria	Rare	+
Corynebacterium pseudogenitalium	Actinobacteria	Rare	+	d	+					+				d
Corynebacterium pyruviciproducens	Actinobacteria	Rare	+	+	neg				neg	+				+							neg
Corynebacterium riegelii	Actinobacteria	Rare	+	neg			neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg				neg	neg			neg
Corynebacterium sanguinis	Actinobacteria	Rare	+	+	d(+)				neg	neg											neg
Corynebacterium simulans	Actinobacteria	Rare	+	+	+	vr	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Corynebacterium singulare	Actinobacteria	Rare	+	+					neg	+				+	neg						neg
Corynebacterium stationis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg			neg	neg			neg		neg					neg	neg
Corynebacterium striatum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	vr			neg	neg	neg		neg	d	vr		neg		neg		neg				+
Corynebacterium suicordis	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg
Corynebacterium sundsvallense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg			neg	+	neg		neg	+	neg		neg		neg		neg
Corynebacterium tuberculostearicum	Actinobacteria	Rare	+	vr	+	+			neg	vr	neg		vr	d(+)	vr				neg		neg	neg			neg
Corynebacterium ulcerans	Actinobacteria	Rare	+	+	+				neg	+				neg							+
Corynebacterium urealyticum	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg			neg	neg	neg						neg	neg			neg
Corynebacterium ureicelerivorans	Actinobacteria	Rare	+	+					neg	neg			neg	neg	neg						neg	neg
Corynebacterium urinapleomorphum	Actinobacteria	Rare	+	neg
Corynebacterium variabile	Actinobacteria	Unlikely	+	vr	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg		neg	neg
Corynebacterium wankanglinii	Actinobacteria	Rare	+
Corynebacterium xerosis	Actinobacteria	Rare	+	+		+	neg	d(neg)	neg	+		neg	neg	+	+	d(+)	d(neg)				neg	d
Crassaminicella thermophila	Firmicutes	Unlikely	+
Criibacterium bergeronii	Firmicutes	Rare	vr
Cronobacter condimenti	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg				+
Cronobacter muytjensii	Proteobacteria	Rare	neg	+			+			+		+	+	+	+
Cronobacter sakazakii	Proteobacteria	Minor	neg	+			+		+	+		+	+	+	+		+
Cronobacter turicensis	Proteobacteria	Rare	neg	+			+			+		+	neg	neg	+
Cruoricaptor ignavus	Bacteroidetes	Rare	neg	neg								neg		neg			neg
Cryptobacterium curtum	Actinobacteria	Minor	+
Culturomica massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Cupriavidus metallidurans	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	+	neg	neg	neg							neg
Curtobacterium flaccumfaciens	Actinobacteria	Unlikely	+						neg	neg											neg
Cutibacterium acnes	Actinobacteria	Moderate	+	+					neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Cutibacterium acnes subsp. defendens	Actinobacteria	Rare	+							neg				neg
Cutibacterium avidum	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg		w	+	+		w	+	+		neg			neg	d	w			+
Cutibacterium granulosum	Actinobacteria	Minor	+
Cytophaga hutchinsonii	Bacteroidetes	Rare	neg
Dakarella massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		+	+			+	+	+	+				+	+				+
Dakotella fusiforme	Firmicutes	Rare	+
Dehalobacter restrictus	Firmicutes	Non	neg
Dehalobacterium formicoaceticum	Firmicutes	Unlikely	+
Dehalococcoides mccartyi	Chloroflexi	Unlikely	unk
Deinococcus aquaticus	Deinococcus-Thermus	Unlikely	neg
Deinococcus caeni	Deinococcus-Thermus	Unlikely	neg
Deinococcus geothermalis	Deinococcus-Thermus	Non	+
Deinococcus proteolyticus	Deinococcus-Thermus	Unlikely	+	+	+
Deinococcus reticulitermitis	Deinococcus-Thermus	Unlikely	neg	+
Deinococcus wulumuqiensis	Deinococcus-Thermus	Unlikely	+	neg
Delftia acidovorans	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Delftia lacustris	Proteobacteria	Unlikely	neg
Delftia tsuruhatensis	Proteobacteria	Rare	neg
Dellaglioa algida	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d		d	d	neg	d	d(neg)	d(neg)	+	neg	d(neg)			d(+)	neg	neg			neg
Denitrobacterium detoxificans	Actinobacteria	Rare	+
Dermabacter hominis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		neg		neg	neg
Dermacoccus barathri	Actinobacteria	Non	+	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg	neg	neg	neg						neg	neg
Dermacoccus nishinomiyaensis	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg											neg
Desemzia incerta	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg			+	+	neg	+	+	+	+
Desnuesiella massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+				+	+				+
Desulfitobacterium dichloroeliminans	Firmicutes	Unlikely	+
Desulfitobacterium hafniense	Firmicutes	Minor	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Desulfococcus multivorans	Proteobacteria	Rare	neg
Desulfocurvibacter africanus	Proteobacteria	Unlikely	neg
Desulfofarcimen acetoxidans	Firmicutes	Unlikely	neg
Desulfomicrobium baculatum	Proteobacteria	Unlikely	neg
Desulfomicrobium orale	Proteobacteria	Unlikely	neg
Desulforamulus reducens	Firmicutes	Unlikely	+
Desulforudis audaxviator	Firmicutes	Unlikely	+
Desulfoscipio gibsoniae	Firmicutes	Rare	neg
Desulfosporosinus youngiae	Firmicutes	Rare	neg
Desulfotomaculum ruminis	Firmicutes	Unlikely	+
Desulfovibrio desulfuricans	Proteobacteria	Minor	neg
Desulfovibrio diazotrophicus	Proteobacteria	Rare	neg
Desulfovibrio fairfieldensis	Proteobacteria	Minor	neg
Desulfovibrio intestinalis	Proteobacteria	Rare	neg
Desulfovibrio legallii	Proteobacteria	Rare	+
Desulfovibrio longreachensis	Proteobacteria	Rare	neg
Desulfovibrio piger	Proteobacteria	Moderate	neg
Desulfovibrio trichonymphae	Proteobacteria	Non	unk
Desulfovibrio vulgaris	Proteobacteria	Rare	neg
Desulfurispirillum indicum	Chrysiogenetes	Unlikely	neg
Desulfurobacterium thermolithotrophum	Aquificae	Non	neg
Devosia chinhatensis	Proteobacteria	Rare	neg
Devosia limi	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Devosia riboflavina	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	neg			neg	neg				neg
Dialister hominis	Firmicutes	Rare	neg
Dialister invisus	Firmicutes	Moderate	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg
Dialister massiliensis	Firmicutes	Rare	neg	neg									neg
Dialister micraerophilus	Firmicutes	Rare	neg
Dialister pneumosintes	Firmicutes	Minor	neg										neg
Dialister propionicifaciens	Firmicutes	Rare	neg
Dialister succinatiphilus	Firmicutes	Minor	neg
Dielma fastidiosa	Firmicutes	Minor	neg	neg	neg				neg	neg			neg	neg
Dietzia cercidiphylli	Actinobacteria	Unlikely	+
Dietzia cinnamea	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg		neg		neg	neg			neg	neg	neg	neg					neg
Dietzia kunjamensis	Actinobacteria	Unlikely	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg			neg	+
Dietzia maris	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg		neg	neg			neg	neg							neg
Dietzia natronolimnaea	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg											neg
Dolosigranulum pigrum	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+			neg	+			neg	d										neg
Dorea faecis	Firmicutes	Minor
Dorea formicigenerans	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+			+	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg
Dorea hylemonae	Firmicutes	Rare
Dorea longicatena	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	neg	+	+	+	neg		w	+	neg	neg	+			+	neg	+			neg
Dorea phocaeensis	Firmicutes	Rare	neg	neg	+	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			d	neg	neg			neg
Dorea scindens	Firmicutes	Rare
Drancourtella massiliensis	Firmicutes	Rare	+													+
Dubosiella newyorkensis	Firmicutes	Rare	+
Duncaniella dubosii	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Duncaniella muris	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Duodenibacillus massiliensis	Proteobacteria	Minor	+
Dyadobacter beijingensis	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	+	neg								+
Dyadobacter fermentans	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+						+				+
Dysgonomonas capnocytophagoides	Bacteroidetes	Rare	neg	+					+	+		+	+	+	neg
Dysgonomonas gadei	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		+		+	+	+	+	+	+	+						neg				+
Dysgonomonas massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+		+	+	+							+			+	+				+
Dysgonomonas mossii	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		+		+	+			d	+	+
Dysosmobacter welbionis	Firmicutes	Moderate	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Edwardsiella tarda	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	+	neg		neg	+	neg		neg	neg	neg				neg	neg	neg	neg			neg
Eggerthella guodeyinii	Actinobacteria	Rare	+
Eggerthella lenta	Actinobacteria	Widespread	+	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg		neg			neg
Eggerthella sinensis	Actinobacteria	Rare	+	neg									neg		neg
Eggerthella timonensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		+			+					+
Eggerthia catenaformis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+		+	+	neg	neg	+	d(+)	+		+			d	+	d			d
Eikenella corrodens	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg	neg							neg
Eisenbergiella massiliensis	Firmicutes	Moderate	neg
Eisenbergiella tayi	Firmicutes	Moderate	neg						neg		neg		neg							+
Elizabethkingia meningoseptica	Bacteroidetes	Unlikely	neg	w(+)	w(+)	neg	neg		w(+)	w(+)		d	neg	neg	w(+)
Elizabethkingia miricola	Bacteroidetes	Non	neg	+	+		neg		+	+			neg	neg	+
Ellagibacter isourolithinifaciens	Actinobacteria	Rare	+
Elusimicrobium minutum	Elusimicrobia	Unlikely	neg	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	w	neg				neg	neg			neg
Emergencia timonensis	Firmicutes	Minor	+
Empedobacter brevis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg		neg		neg	+			neg	neg	neg
Empedobacter falsenii	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg	neg		neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+		neg			+
Enhydrobacter aerosaccus	Proteobacteria	Rare	neg	+
Enorma massiliensis	Actinobacteria	Minor	+
Enorma phocaeensis	Actinobacteria	Rare	neg
Enorma timonensis	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg				neg
Ensifer adhaerens	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Enterobacter asburiae	Proteobacteria	Minor	neg	+		+	+		+	+		d(+)	d(+)	+	+		+
Enterobacter cancerogenus	Proteobacteria	Minor	neg	+			+		neg	+		neg	neg	neg	+		+
Enterobacter cloacae	Proteobacteria	Moderate	neg	+			vr			vr				vr	vr		+
Enterobacter cloacae subsp. dissolvens	Proteobacteria	Rare	neg
Enterobacter himalayensis	Proteobacteria	Minor
Enterobacter hormaechei subsp. hormaechei	Proteobacteria	Minor	neg	vr			neg			+		d		+	+		+
Enterobacter hormaechei subsp. steigerwaltii	Proteobacteria	Rare	neg	vr			neg			+		+		+	+		+
Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg	neg			neg		neg			neg
Enterobacter kobei	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	d
Enterobacter ludwigii	Proteobacteria	Rare	neg									+
Enterobacter massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg		neg	neg	+		+		neg		neg	neg
Enterobacter mori	Proteobacteria	Rare	neg
Enterobacter roggenkampii	Proteobacteria	Rare	neg
Enterobacter soli	Proteobacteria	Rare	neg	+								+		+			+
Enterobacter timonensis	Proteobacteria	Rare	neg
Enterocloster aldenensis	Firmicutes	Minor	+	+			neg		d(+)	+	neg		+	+	vr					neg					neg
Enterocloster asparagiformis	Firmicutes	Moderate	+	+
Enterocloster bolteae	Firmicutes	Widespread	+	+	+				neg	+	+	neg	neg	+	+							neg
Enterocloster citroniae	Firmicutes	Moderate	+	+			neg		neg	+	neg		neg	+	vr					neg					neg
Enterocloster clostridioformis	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	vr		neg	+	d(neg)		vr	+	+					neg	d(neg)	neg			neg
Enterocloster lavalensis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	vr		+	+	neg	vr	vr	+	+		neg				neg	neg			neg
Enterococcus asini	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	+		neg		neg	neg			d
Enterococcus avium	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	d(+)	neg	neg	d	+	+	+		neg		neg	neg			neg
Enterococcus burkinafasonensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Enterococcus caccae	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+		neg		neg	neg		neg	d(+)
Enterococcus canintestini	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	d(+)	+	neg	neg	neg	+	+	d(+)	+				neg	neg			neg
Enterococcus canis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	d	d	neg	+				neg	neg			d
Enterococcus casseliflavus	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+		+		vr	+			+
Enterococcus cecorum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	vr	+	vr	+		neg		neg	neg			neg
Enterococcus columbae	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	d	+	d	+	+	+	+	d	d			+	neg	+			+
Enterococcus devriesei	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	d	neg	d	+	+	neg	+				neg	neg			neg
Enterococcus diestrammenae	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	+			+	neg	neg			neg
Enterococcus dispar	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	vr	neg	vr	+	neg	+		vr		neg	neg			neg
Enterococcus durans	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	d(+)	d	neg	+	+	+	+		vr		neg	neg			+
Enterococcus eurekensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg		+	+	+	+					neg			neg	+
Enterococcus faecalis	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	d(+)	d(+)	+	neg	+		vr		neg	neg			neg
Enterococcus faecium	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	d(+)	vr	+	+	neg	+		vr		vr	neg			d(+)
Enterococcus gallinarum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	vr	+	d(+)	+	+	neg	+		+		neg	neg			d(+)
Enterococcus gilvus	Firmicutes	Rare	+						+			+	+	+	+							neg
Enterococcus haemoperoxidus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+	d(neg)	+				d(neg)	neg			d(+)
Enterococcus hermanniensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	w	neg	+	neg	neg	neg	neg	w	neg	neg				neg	neg			neg
Enterococcus hirae	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	vr	neg	vr	+	neg	+		+		neg	neg			vr
Enterococcus italicus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	w	d	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg			+
Enterococcus lactis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg				neg	neg			w
Enterococcus malodoratus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	vr	+				neg	neg
Enterococcus massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+								+		+
Enterococcus mediterraneensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	+	+	neg	+			+	neg	neg			neg
Enterococcus moraviensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	d(neg)	+	+	+	+				d(neg)	neg			d
Enterococcus mundtii	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	d(+)	+	+	neg	+		+		neg	neg
Enterococcus pallens	Firmicutes	Rare	+	+					+			+	+	+	+							neg
Enterococcus phoeniculicola	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	+	w	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+		neg		neg	neg			neg
Enterococcus pseudoavium	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+		+		+		neg	+			+
Enterococcus raffinosus	Firmicutes	Rare	+	+					+		+	+	+	+	+						neg	neg			d
Enterococcus saccharolyticus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	neg	+			+
Enterococcus saigonensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+			+	neg	neg		neg	+
Enterococcus sulfureus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		+				neg	neg
Enterococcus thailandicus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+				neg	neg			neg
Enterococcus timonensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Enterococcus villorum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	+		+
Enteroscipio rubneri	Actinobacteria	Rare	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Enterovibrio nigricans	Proteobacteria	Unlikely	neg		+	+	neg		+	neg		+		w	neg		neg
Ereboglobus luteus	Verrucomicrobia	Unlikely	neg
Erwinia billingiae	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg	+	neg	d(+)	neg	neg	neg	d(neg)	+	neg	neg				neg	neg			neg
Erwinia tasmaniensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+
Erwinia teleogrylli	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	neg	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg				neg	neg			neg
Erysipelatoclostridium ramosum	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	+	+	+	+	neg	w		neg	w	neg	neg	+		neg
Erysipelatoclostridium saccharogumia	Firmicutes	Minor
Erysipelatoclostridium spiroforme	Firmicutes	Minor
Erysipelothrix larvae	Firmicutes	Rare	+
Escherichia albertii	Proteobacteria	Minor	neg	+			neg		neg	vr		neg	neg	neg	vr		neg
Escherichia coli	Proteobacteria	Widespread	neg	+	+	+	neg	v	+	+	neg	d(+)	d	d	+	neg	neg				neg	neg			neg
Escherichia dysenteriae	Proteobacteria	Rare
Escherichia fergusonii	Proteobacteria	Minor	neg	+		+	+		w	+		neg	neg	neg	+		+
Escherichia marmotae	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Escherichia ruysiae	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg
Ethanoligenens harbinense	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	+	+					neg	neg			w
Eubacterium barkeri	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Eubacterium biforme	Firmicutes	Moderate	+	+	+		neg		d(+)	neg	neg	neg	neg	d(+)	d(+)		neg			neg	neg				neg
Eubacterium brachy	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg
Eubacterium callanderi	Firmicutes	Minor	+										neg
Eubacterium cellulosolvens	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+		d(+)	+	d	neg	w(+)	w(+)	neg		w	+		+	neg	+	+		neg	neg
Eubacterium coprostanoligenes	Firmicutes	Minor	+	w	w		w		+			w					+
Eubacterium dolichum	Firmicutes	Moderate	+	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Eubacterium infirmum	Firmicutes	Rare	+	neg		neg	neg		neg				neg	neg
Eubacterium limosum	Firmicutes	Moderate	+	+	+	d(neg)	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	+		neg
Eubacterium maltosivorans	Firmicutes	Rare	+							+			+	+
Eubacterium multiforme	Firmicutes	Rare	+	w(+)	w(+)	d	neg		w(+)	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	w		neg	neg	neg			neg
Eubacterium nodatum	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg
Eubacterium oxidoreducens	Firmicutes	Rare	+
Eubacterium plexicaudatum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	+		neg				neg	neg
Eubacterium pyruvativorans	Firmicutes	Rare	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg		neg
Eubacterium ramulus	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+		+	w	neg	w	w	neg	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Eubacterium rectale	Firmicutes	Widespread	+	+	+		w(+)		d(+)	+	+	+	+	+	d(+)		d(+)	+		neg	d(+)				w
Eubacterium ruminantium	Firmicutes	Rare	+	+	w(+)		+		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				+
Eubacterium saphenum	Firmicutes	Rare	+	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Eubacterium siraeum	Firmicutes	Widespread	+	neg	neg		w(+)		w(+)	w(+)	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				w
Eubacterium sulci	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg		neg		neg
Eubacterium tenue	Firmicutes	Minor	+	w(+)	neg		neg		neg	w(+)	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Eubacterium uniforme	Firmicutes	Rare	+	+	d(neg)	+	+		+	+		d(neg)	neg	neg	neg			neg	w	w		neg	+		+	+
Eubacterium ventriosum	Firmicutes	Widespread	+	w	+	+	neg		d(+)	+	neg	neg	neg	d(+)	neg		d(+)			d(+)	neg	neg			d(+)
Eubacterium xylanophilum	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	+		neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg	neg	vr		neg	neg		neg	+
Eubacterium yurii	Firmicutes	Rare	+	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg			neg		neg			neg
Ewingella americana	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		+	+		neg	neg	neg	+					+
Exiguobacterium aurantiacum	Firmicutes	Rare	+	+	d	+	neg	+	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+				+	neg
Exiguobacterium marinum	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+		neg	+	neg	+	w	+	neg
Exiguobacterium mexicanum	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+			+	+	neg
Exiguobacterium undae	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d	+	neg	+	neg	+	d	+	+	neg	d			+	+				+
Ezakiella coagulans	Bacteroidetes	Minor	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg						neg					neg
Ezakiella massiliensis	Bacteroidetes	Rare	+
Ezakiella peruensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Facklamia hominis	Firmicutes	Rare	+	neg			neg		neg	neg			neg	neg	neg		neg				neg	neg		neg
Facklamia languida	Firmicutes	Rare	+	+					neg	neg	neg	neg	neg	neg	+						neg			neg
Faecalibacillus faecis	Firmicutes	Rare	+	w			+		+	w	w		w	+	neg
Faecalibacillus intestinalis	Firmicutes	Rare	+	w			+		+	w	neg		neg	+	neg
Faecalibacterium prausnitzii	Firmicutes	Widespread	neg	+	+		d			d	d(neg)	neg	neg	d(w)	neg										+
Faecalibaculum rodentium	Firmicutes	Rare	+										+
Faecalicatena contorta	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+			neg		d	d	d(neg)	d	+		+
Faecalicatena faecis	Firmicutes	Moderate
Faecalicatena fissicatena	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	neg		neg	+			neg	+											neg
Faecalicatena glycyrrhizinilyticum	Firmicutes	Minor
Faecalicatena gnavus	Firmicutes	Moderate
Faecalicatena lactaris	Firmicutes	Moderate
Faecalicatena orotica	Firmicutes	Minor	+	+	+		+		+	+	vr	vr	+	+	+					neg	neg	+			vr
Faecalicatena torques	Firmicutes	Moderate
Faecalicoccus pleomorphus	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	neg		neg	neg				neg											neg
Faecalimonas umbilicata	Firmicutes	Rare	+	+			neg		+	+	neg		+	+	neg
Faecalitalea cylindroides	Firmicutes	Widespread	+	+	+	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	d(+)	neg		neg			neg	neg	+			neg
Fannyhessea vaginae	Actinobacteria	Minor	+										neg
Fastidiosipila sanguinis	Firmicutes	Rare	+
Fenollaria massiliensis	Firmicutes	Minor	neg
Fenollaria timonensis	Firmicutes	Rare	neg
Fermentimonas caenicola	Bacteroidetes	Rare	neg										neg
Ferrimonas balearica	Proteobacteria	Rare	neg
Fibrobacter succinogenes	Fibrobacteres	Unlikely	neg	+	neg	neg	+		neg	+	neg	neg	neg	neg	+			+	+			neg	neg		+
Fictibacillus arsenicus	Firmicutes	Unlikely	+	neg					neg	neg		neg	neg	neg	neg
Filifactor alocis	Firmicutes	Minor	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg
Filifactor villosus	Firmicutes	Unlikely	+	neg	neg				neg	neg		neg		neg						neg
Finegoldia magna	Firmicutes	Widespread	+	neg	w		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg		neg	neg			neg
Flaviflexus massiliensis	Actinobacteria	Rare	+
Flavobacterium banpakuense	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg
Flavobacterium caeni	Bacteroidetes	Non	neg	neg					w	w										+	w				w
Flavobacterium cheniae	Bacteroidetes	Rare	neg	neg
Flavobacterium daejeonense	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	+	+			+	+		+	+	+						+		+
Flavobacterium lindanitolerans	Bacteroidetes	Rare	neg	neg					neg					neg
Flavobacterium oncorhynchi	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg
Flavobacterium sakaeratica	Bacteroidetes	Rare	neg
Flavonifractor plautii	Firmicutes	Widespread	vr	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg		neg		neg		neg				neg	neg
Flexispira rappini	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Flintibacter butyricus	Firmicutes	Rare	neg	neg			neg		neg	neg			neg	neg	neg
Fournierella massiliensis	Firmicutes	Moderate	neg	+	+	+	neg	neg	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg			+	neg	neg			neg
Francisella tularensis	Proteobacteria	Non	neg	+					neg	+				neg
Franconibacter pulveris	Proteobacteria	Rare	neg	+			+			+				+	+
Fredinandcohnia humi	Firmicutes	Non	+	neg	neg	neg	neg	neg	w	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg				neg
Fretibacterium fastidiosum	Synergistetes	Rare	neg	neg	neg	neg			neg	neg				neg
Fructilactobacillus florum	Firmicutes	Unlikely	+	+	+		neg	neg	neg	neg		neg		neg	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Fructilactobacillus fructivorans	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	neg		neg	d	neg	neg	neg	d	neg		neg
Fructilactobacillus sanfranciscensis	Firmicutes	Rare	+	+	neg	+	neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg
Fucophilus fucoidanolyticus	Verrucomicrobia	Rare	neg
Fundidesulfovibrio putealis	Proteobacteria	Rare	neg
Furfurilactobacillus rossiae	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	w	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Fusicatenibacter saccharivorans	Firmicutes	Moderate	+	+			+		+	+	w		+	+	+							+
Fusobacterium canifelinum	Fusobacteria	Rare	neg	d(w)	w		neg		neg	neg			neg	neg
Fusobacterium gonidiaformans	Fusobacteria	Minor	neg										neg
Fusobacterium massiliense	Fusobacteria	Rare	neg	neg	neg			+	neg	neg			+							+
Fusobacterium mortiferum	Fusobacteria	Moderate	neg	+			+		+	+			+	+	w
Fusobacterium naviforme	Fusobacteria	Rare	neg
Fusobacterium necrogenes	Fusobacteria	Rare	neg
Fusobacterium necrophorum	Fusobacteria	Minor	neg										neg
Fusobacterium necrophorum subsp. funduliforme	Fusobacteria	Rare	neg	w	w	neg	neg		neg	w		neg	neg	neg	neg		neg				neg	neg			neg
Fusobacterium nucleatum	Fusobacteria	Minor	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg				neg
Fusobacterium nucleatum subsp. animalis	Fusobacteria	Rare	neg	w			neg		neg	neg	neg		neg								neg	neg
Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum	Fusobacteria	Minor	neg	w			neg		neg	neg	neg		neg								neg	neg
Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum	Fusobacteria	Rare	neg	w			neg		neg	neg	neg		neg								neg	neg
Fusobacterium nucleatum subsp. vincentii	Fusobacteria	Rare	neg	w			neg		neg	neg	neg		neg								neg	neg
Fusobacterium perfoetens	Fusobacteria	Rare	neg	+	w	w	neg		neg	neg		neg	neg	+	w		neg		neg
Fusobacterium periodonticum	Fusobacteria	Minor	neg	+	+	+	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Fusobacterium pseudoperiodonticum	Fusobacteria	Unlikely	neg	d(+)
Fusobacterium russii	Fusobacteria	Minor	neg										neg
Fusobacterium ulcerans	Fusobacteria	Rare	neg	+	neg				neg	neg			neg	neg
Fusobacterium varium	Fusobacteria	Moderate	neg	+	+	+	neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Gabonia massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg		+		+	+	neg		+	+	+					+		+			+
Gabonibacter massiliensis	Bacteroidetes	Minor	neg	+	neg				neg	neg				neg	+
Gabonibacter timonensis	Bacteroidetes	Rare	+
Gallibacterium anatis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg	neg	d	neg	neg	neg	+	+	+	neg				neg	neg	neg
Gardnerella leopoldii	Actinobacteria	Unlikely	neg
Gardnerella vaginalis	Actinobacteria	Minor	neg	+	+	+	neg		vr	+			neg	vr	neg										+
Gemella asaccharolytica	Firmicutes	Rare	vr	neg					neg	neg				neg	neg
Gemella haemolysans	Firmicutes	Minor	+	+	+				neg	+	neg		neg	vr	neg				neg		neg	neg			neg
Gemella morbillorum	Firmicutes	Minor	+	+	neg	neg	neg	vr	neg	w	neg		neg	w	neg	neg	neg		neg		neg	neg
Gemella sanguinis	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	neg	neg	neg	d(+)	neg		neg	+	neg	neg	neg		neg		neg	neg		neg	neg
Gemmatimonas groenlandica	Gemmatimonadetes	Non	neg
Gemmiger formicilis	Firmicutes	Moderate	neg		w	d(neg)	d(+)		neg	+	neg	d(neg)	neg	neg	neg		neg			d(w)	neg				neg	d(neg)
Gemmiger variabile	Firmicutes	Moderate
Geobacillus stearothermophilus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg				+	neg			+
Geobacillus vulcani	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+		+	+	d(+)	d(+)	d(+)	+	+		d(+)				+	neg			d(+)
Geodermatophilus obscurus	Actinobacteria	Non	+	+	+
Georgenia muralis	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg				+							neg
Georgenia satyanarayanai	Actinobacteria	Unlikely	+
Geosporobacter ferrireducens	Firmicutes	Unlikely	neg
Gleimia europaea	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+		neg	neg	+		d	neg	d		d	neg				d				d
Globicatella sulfidifaciens	Firmicutes	Rare	vr	+	+	neg	+	neg		+	neg	+	+	+	+	neg	neg			+	+	+
Glutamicibacter arilaitensis	Actinobacteria	Unlikely	+	neg					neg	neg				neg							neg
Glutamicibacter protophormiae	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg					neg					neg						neg
Gorbachella massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Gordonia alkanivorans	Actinobacteria	Rare	+	neg	+									+
Gordonia rubripertincta	Actinobacteria	Unlikely	+	+					neg	neg											neg
Gordonia terrae	Actinobacteria	Rare	+	+		neg							neg		+
Gordonibacter massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	neg			+	neg	neg			neg
Gordonibacter pamelaeae	Actinobacteria	Moderate	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Gordonibacter urolithinfaciens	Actinobacteria	Minor	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Gorillibacterium timonense	Firmicutes	Rare	neg
Gottschalkia acidurici	Firmicutes	Unlikely	+
Gracilibacillus dipsosauri	Firmicutes	Rare	+	w										w
Gracilibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg				neg	neg				neg
Gracilibacillus phocaeensis	Firmicutes	Rare	+
Gracilibacillus thailandensis	Firmicutes	Non	+	+	+	+	+		neg	+	+	+		+	+							neg
Gracilibacillus timonensis	Firmicutes	Rare	+
Granulicatella adiacens	Firmicutes	Minor	+	+					neg	d(+)	neg	neg	neg	+	neg				neg		neg	vr		neg	neg
Granulicatella elegans	Firmicutes	Minor	+	+					neg	+	neg	neg	vr	vr	neg				neg		neg	neg		neg	neg
Granulicatella para-adiacens	Firmicutes	Rare	+	+					neg					+	neg									neg
Grimontia hollisae	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg		neg
Gulosibacter bifidus	Actinobacteria	Unlikely	+	neg	neg
Haemophilus ducreyi	Proteobacteria	Rare	neg	w	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg					neg		neg
Haemophilus haemolyticus	Proteobacteria	Minor	neg	+	w	+	neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg					neg
Haemophilus influenzae	Proteobacteria	Minor	neg	+	neg	+	neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg	neg	neg
Haemophilus parahaemolyticus	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	d	neg		neg	+	neg	neg	neg	+	neg					neg		neg
Haemophilus parainfluenzae	Proteobacteria	Widespread	neg	+	+	+	neg		neg	+	neg	neg	d	+	neg				neg	neg	neg	neg
Haemophilus paraphrohaemolyticus	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	d	neg		d	+	neg	neg	neg	+	neg				d	neg		neg
Haemophilus pittmaniae	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	+			neg	+		neg		+			neg			neg		neg
Haemophilus quentini	Proteobacteria	Rare	neg	+	+				neg	+				neg
Haemophilus sputorum	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	vr			neg	+				+
Hafnia alvei	Proteobacteria	Minor	neg	+			d			+		neg	neg	d	+		+							neg
Hafnia paralvei	Proteobacteria	Rare	neg	+					neg	+		neg		neg	+		neg
Hahella ganghwensis	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Halanaerobaculum tunisiense	Firmicutes	Unlikely	neg	+		+	+			+				+											+
Halobacillus dabanensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg				+				+	+
Halobacillus ihumii	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg				neg	neg			neg
Halobacillus karajensis	Firmicutes	Non	+	+	+	neg				+			+	neg
Halobacillus massiliensis	Firmicutes	Unlikely	+
Halobacillus salinus	Firmicutes	Rare	+	+	+	w	+		neg	+	w	w	neg	+	+
Halobacillus trueperi	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+				+				+	+									+
Halobacteroides halobius	Firmicutes	Unlikely	neg	+	+	+				+			+	+
Haloferax alexandrinus	Euryarchaeota	Unlikely	neg	+	+	neg			neg	+				+
Haloferax massiliensis	Euryarchaeota	Rare	neg
Haloimpatiens massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+
Halomonas massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg
Halomonas muralis	Proteobacteria	Non	neg
Halomonas salina	Proteobacteria	Non	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg		d(neg)	neg							neg
Halomonas utahensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Halopseudomonas bauzanensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg								neg		neg			neg
Halopseudomonas pelagia	Proteobacteria	Unlikely	neg
Haploplasma axanthum	Tenericutes	Unlikely	neg	+	neg	+	+		neg	+				neg					+		+				+
Harryflintia acetispora	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	neg			+			neg	neg	+							neg
Hathewaya histolytica	Firmicutes	Rare	+
Hathewaya limosa	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg
Hathewaya massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			neg	+	+			+
Helcobacillus massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	w	neg	neg	+	w	+	neg			neg	neg	neg			neg
Helcococcus sueciensis	Firmicutes	Rare	+	+			neg		+	+	neg	neg	neg	neg	+						neg			neg	w
Helicobacter bilis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Helicobacter canadensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Helicobacter canis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Helicobacter cinaedi	Proteobacteria	Rare	neg	vr									neg
Helicobacter felis	Proteobacteria	Non	neg	neg	neg	neg			neg	neg			neg	neg
Helicobacter fennelliae	Proteobacteria	Rare	neg
Helicobacter heilmannii	Proteobacteria	Non	neg
Helicobacter macacae	Proteobacteria	Unlikely	neg
Helicobacter pametensis	Proteobacteria	Rare	neg
Helicobacter pullorum	Proteobacteria	Minor	neg	neg
Helicobacter pylori	Proteobacteria	Non	neg	neg
Helicobacter rodentium	Proteobacteria	Rare	neg
Helicobacter winghamensis	Proteobacteria	Rare	neg
Heliomicrobium modesticaldum	Firmicutes	Unlikely	neg
Herbaspirillum autotrophicum	Proteobacteria	Unlikely	neg
Herbaspirillum huttiense	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Herbinix hemicellulosilytica	Firmicutes	Unlikely	+
Herbinix luporum	Firmicutes	Unlikely	+						neg
Herminiimonas contaminans	Proteobacteria	Unlikely	neg
Hespellia porcina	Firmicutes	Rare	+	+
Hespellia stercorisuis	Firmicutes	Rare	+	+
Heyndrickxia oleronia	Firmicutes	Unlikely	neg	+	+	d	+	neg	neg	d	neg	neg	neg	neg	d	neg	neg				neg				d
Heyndrickxia sporothermodurans	Firmicutes	Unlikely	+	w	w	neg	d	d	neg	w	d	neg	neg	w	w	d	d				neg	neg			d(w)
Histophilus somni	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg	neg				neg			neg	neg	neg					neg
Holdemanella biformis	Firmicutes	Moderate	+	+			neg		neg	neg	neg		+	neg	neg
Holdemania filiformis	Firmicutes	Moderate	+	+	+		neg		vr	vr	neg	neg	neg	+	neg		neg			+	neg				neg
Holdemania massiliensis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	+		neg	+			+			+
Holophaga foetida	Acidobacteria	Non	neg
Howardella ureilytica	Firmicutes	Rare	+
Hugonella massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+			+	neg	+			neg
Humisphaera borealis	Planctomycetes	Unlikely	neg
Hungatella effluvii	Firmicutes	Minor	+	+		+				+				+
Hungatella hathewayi	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	+		+	neg			neg	neg			+
Hungatella saccharolyticum	Firmicutes	Rare
Hungatella xylanolytica	Firmicutes	Rare	neg	+	neg		+		+	+				neg	+			neg								+
Hydrogenibacillus schlegelii	Firmicutes	Unlikely	vr	neg
Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans	Firmicutes	Rare	neg	+	neg		neg		+	+			+	+	+						+	+			neg
Hydrogenophaga pseudoflava	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	+			+				+	+
Hydrogenovibrio crunogenus	Proteobacteria	Unlikely	neg
Hymenobacter rigui	Bacteroidetes	Rare	neg	neg																					+
Hymenobacter russus	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg
Hyphomicrobium facile	Proteobacteria	Rare	neg
Ihubacter massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Ihuprevotella massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Ileibacterium valens	Firmicutes	Rare	+
Inediibacterium massiliense	Firmicutes	Rare	+	+			+		+	+	neg		+	+	+
Intestinibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Intestinibacter bartlettii	Firmicutes	Widespread	+	+	+				neg	+	neg	neg		+
Intestinibaculum porci	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	+	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Intestinimonas butyriciproducens	Firmicutes	Moderate	+
Intestinimonas gabonensis	Firmicutes	Rare	neg
Intestinimonas massiliensis	Firmicutes	Moderate	neg	neg	w	+	neg	+	neg	neg	+	+	+	neg	+	neg	+			+	+	+			+
Intestinimonas timonensis	Firmicutes	Rare	neg
Isoptericola variabilis	Actinobacteria	Rare	+	+			+			neg		+	+	neg
Janibacter anophelis	Actinobacteria	Rare	+	neg			neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg
Janibacter hoylei	Actinobacteria	Non	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg			neg		neg
Janibacter limosus	Actinobacteria	Unlikely	+	+	neg	neg	neg		neg	neg			neg	neg	neg				neg		neg	neg			neg
Janibacter terrae	Actinobacteria	Rare	+	vr	neg	neg	neg		neg	neg			neg	+	neg					neg	neg	neg			neg
Jeotgalibaca arthritidis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg			+	neg	neg		neg	neg
Jeotgalibaca porci	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg		neg	neg
Jeotgalicoccus halotolerans	Firmicutes	Rare	+		neg	neg			neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg
Johnsonella ignava	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg				neg				neg	neg
Jonquetella anthropi	Synergistetes	Rare	neg
Kalamiella piersonii	Proteobacteria	Unlikely	neg
Kallipyga gabonensis	Firmicutes	Rare	+	+	neg				neg	neg		+	+	+								+
Kallipyga massiliensis	Firmicutes	Rare	+	w	w								neg
Kandleria vitulina	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	neg		+			+		vr
Kerstersia gyiorum	Proteobacteria	Rare	neg							neg
Khelaifiella massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Kineothrix alysoides	Firmicutes	Rare	neg
Kingella denitrificans	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		neg	neg		neg	+			neg	neg	neg
Kingella kingae	Proteobacteria	Rare	neg	+		w			neg	+				neg
Kingella oralis	Proteobacteria	Unlikely	neg	w	neg				neg	neg				neg
Kiritimatiella glycovorans	Kiritimatiellaeota	Unlikely	neg
Klebsiella aerogenes	Proteobacteria	Moderate	neg	+			+		+	+		+	+	+	+		+								neg
Klebsiella grimontii	Proteobacteria	Minor	neg	+							neg
Klebsiella michiganensis	Proteobacteria	Minor	neg	+							+			+			+
Klebsiella oxytoca	Proteobacteria	Moderate	neg	+			+			+				+	+		+
Klebsiella pneumoniae	Proteobacteria	Widespread	neg	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	+		+		+	+	neg	neg			neg
Klebsiella pneumoniae subsp. ozaenae	Proteobacteria	Rare	neg	+
Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis	Proteobacteria	Rare	neg	+
Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	+	+	+	+	+		+	+	+	+	d(neg)	neg			+	neg	d(neg)			d(neg)
Klebsiella quasivariicola	Proteobacteria	Minor
Klebsiella variicola	Proteobacteria	Minor	neg	+										+			+
Kluyvera ascorbata	Proteobacteria	Minor	neg	+		+	+		+	+		+	+	+	+		+
Kluyvera cryocrescens	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		+	+		+	+	+	+
Kluyvera georgiana	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+	+	+	+		+	+	+	+
Kluyvera intermedia	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		+	+		+	+	+	+		+
Kocuria carniphila	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+		neg		+	w		neg	neg	w	neg	neg
Kocuria marina	Actinobacteria	Rare	+	neg		neg	neg		neg	neg			neg	neg	neg	neg					neg
Kocuria palustris	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg		neg	+	neg	neg					neg				neg
Kocuria polaris	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+			+	+				+	+
Kocuria rhizophila	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	neg		neg	neg	neg	neg			+	neg	neg					neg				neg
Kocuria rosea	Actinobacteria	Unlikely	+	neg	neg		neg		neg	neg			neg	neg	neg	neg
Kocuria salsicia	Actinobacteria	Unlikely	+	neg
Kocuria varians	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg			neg	neg			neg	d
Kosakonia cowanii	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg
Krasilnikoviella flava	Actinobacteria	Rare	+
Kurthia gibsonii	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Kurthia massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Kurthia senegalensis	Firmicutes	Rare	+
Kurthia sp. Dielmo	Firmicutes	Rare	+
Kurthia zopfii	Firmicutes	Rare	+	neg					neg	neg											neg
Kushneria sinocarnis	Firmicutes	Unlikely	neg	+	+				+	+	neg		neg	neg	+
Kytococcus schroeteri	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg		neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg		neg
Kytococcus sedentarius	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg		neg		neg	neg			neg	neg	neg	neg					neg
Labilithrix luteola	Proteobacteria	Non	neg
Lachnoanaerobaculum orale	Firmicutes	Rare	+
Lachnoanaerobaculum saburreum	Firmicutes	Rare	+	+					+	+			neg	+	+
Lachnoanaerobaculum umeaense	Firmicutes	Rare	+	+					+	+	+		+	+	+
Lachnobacterium bovis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+		+	+				+				neg							neg	neg
Lachnoclostridium bouchesdurhonense	Firmicutes	Rare	neg
Lachnoclostridium edouardi	Firmicutes	Minor	+
Lachnoclostridium massiliosenegalense	Firmicutes	Rare	+
Lachnoclostridium pacaense	Firmicutes	Rare	vr	neg	neg				neg	neg				neg
Lachnoclostridium phocaeense	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg				+
Lachnoclostridium phytofermentans	Firmicutes	Minor	neg
Lachnoclostridium touaregense	Firmicutes	Rare	+
Lachnospira eligens	Firmicutes	Widespread	+	d(+)	+	neg	+		d(+)	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg	neg	d(+)		w(+)	neg
Lachnospira multipara	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+		neg	neg				+	neg			neg	neg	+		neg	+			neg
Lachnospira pectinoschiza	Firmicutes	Minor	+	neg	+		+		+
Lachnospira rogosae	Firmicutes	Moderate
Lacrimispora aerotolerans	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+		+			+	+	+	d			neg		w					+	+
Lacrimispora amygdalina	Firmicutes	Rare	+
Lacrimispora celerecrescens	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		w(+)	+	w(+)	w(+)	+	w(+)	+			+		+		neg			neg
Lacrimispora indolis	Firmicutes	Minor	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Lacrimispora saccharolytica	Firmicutes	Moderate	neg
Lacrimispora sphenoides	Firmicutes	Minor	+	+	+	+			d(+)	+			neg	+								neg			neg
Lacticaseibacillus casei	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	vr	+	+	+	neg	neg	+	+	neg	+		neg	+	neg	neg			neg
Lacticaseibacillus paracasei	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	d(+)	+	+		neg	w	+	vr	+		neg		neg	d(neg)			neg
Lacticaseibacillus paracasei subsp. tolerans	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg		neg			neg
Lacticaseibacillus paragasseri	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	vr	+			+	neg	neg			+
Lacticaseibacillus rhamnosus	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	w	+	+	+		neg	+	neg	neg			neg
Lacticaseibacillus saniviri	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+	neg	+				neg	neg			w
Lacticaseibacillus sharpeae	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+		+	+		neg	neg	d(neg)	neg		+
Lacticaseibacillus zeae	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	d	neg	+	neg	neg	+	+	neg	+				neg	neg			neg
Lacticigenium naphtae	Firmicutes	Non	vr	+	+		+	+		+				+	+		+
Lactiplantibacillus paraplantarum	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	d	+				neg	neg			neg
Lactiplantibacillus pentosus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	d(neg)	+	+	+	+	d	+			+	neg	neg			neg
Lactiplantibacillus plantarum	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	d(+)	d(+)	d(+)	+	d(+)	d(neg)	+				neg	neg			neg
Lactiplantibacillus xiangfangensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			d	neg	neg			neg
Lactobacillus acidophilus	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	+	vr	+	+	neg	d(+)	d	+	d	neg	+		neg		neg	neg			neg
Lactobacillus amylolyticus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg		neg	+	neg	d	d	+	neg		d
Lactobacillus amylovorus	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	d	+	d(+)	+	neg	d	d	+	neg	neg	d		neg	d		neg			d
Lactobacillus crispatus	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	vr	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	+		neg			neg			+
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	d		+	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg
Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	neg	neg	neg		neg		neg	+	d	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis	Firmicutes	Unlikely	+	+		d(neg)	d		d(+)	+	neg	neg	neg	+	+		d			d
Lactobacillus equicursoris	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+		w		w		neg										w
Lactobacillus gasseri	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	vr	d	d(+)	neg	d(+)	d	+	d	vr	+		neg		neg	neg			d(+)
Lactobacillus gigeriorum	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	+			+	neg	neg			+
Lactobacillus hamsteri	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	d		+		+	+					neg
Lactobacillus helveticus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	+	+	neg	neg	neg	neg	d	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Lactobacillus hominis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	neg	neg			+	neg	neg			+
Lactobacillus iners	Firmicutes	Rare	+	+	vr	neg	neg	neg	neg	d	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		vr		neg	neg		neg	+
Lactobacillus intestinalis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	d		d	+	neg	d	d	+	neg		neg			neg					neg
Lactobacillus jensenii	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	+	vr	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+		neg	+	neg	neg			vr
Lactobacillus johnsonii	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	vr	d(+)	+	neg	d	d	+	d	neg	+		neg	+	neg	neg			neg
Lactobacillus kalixensis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg	+				neg	neg			+
Lactobacillus kefiranofaciens	Firmicutes	Rare	+	+	+	+		d	+	d	neg	d	d	d	d	d					neg	d			neg
Lactobacillus leichmannii	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+		d	+	neg	neg	neg	+	d		+			+
Lactobacillus pasteurii	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	w	+			+	neg	neg			+
Lactobacillus psittaci	Firmicutes	Unlikely	+	+					neg		neg	neg	+	+	neg						neg			neg
Lactobacillus rogosae	Firmicutes	Rare	+	neg	+		vr		vr	neg			neg				neg				neg	neg			neg
Lactobacillus timonensis	Firmicutes	Unlikely	+
Lactobacillus ultunensis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	d(+)	d	+	+	neg	d(w)				neg	neg			d
Lactococcus cremoris	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d	d(neg)	+	neg	neg	neg	neg	neg	d(neg)	neg	neg			d(+)	neg	neg			neg
Lactococcus garvieae	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	neg	vr	neg	neg	neg	d	+	neg	+		vr		neg	neg			neg
Lactococcus lactis subsp. lactis	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	d(+)	d(+)	+	+	neg	neg	neg	d(neg)	+	neg	d(neg)		vr		neg	neg			d
Lactococcus petauri	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+			+					neg
Lactococcus plantarum	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	d	neg	+	+	neg	neg	+	+	d	+		+		neg	neg			neg
Lactococcus raffinolactis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	d	+	+	d	+	+	+	+	d	d		vr		neg	d			+
Lactonifactor longoviformis	Firmicutes	Minor	neg
Lacunisphaera limnophila	Verrucomicrobia	Unlikely	neg
Lagierella massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+			+	+	+			+	+		+
Lancefieldella parvula	Actinobacteria	Minor	+	+	+				+	+	neg	neg	neg	+	+		neg			d(neg)	neg	d(+)
Lancefieldella rimae	Actinobacteria	Minor	+	+	+		d(+)		neg	+	neg	neg	neg	+	+		neg			neg		d(neg)			neg
Lapidilactobacillus dextrinicus	Firmicutes	Non	+	+	+	+	+		neg	d	neg	neg	neg	w	w		+					w			+
Laribacter hongkongensis	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Lascolabacillus massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Latilactobacillus curvatus	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	d(+)	vr	d(neg)	+	neg	neg	neg	d(+)	d(+)	neg	d(+)		neg		neg	neg			neg
Latilactobacillus sakei	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	d(+)	vr	d(neg)	d(neg)	neg	d	neg	+	d(+)	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Latilactobacillus sakei subsp. carnosus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d	w	neg	d	neg	+	neg	+	+		neg
Lautropia mirabilis	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	d(neg)			neg	+	neg		neg	+	neg				neg		neg	neg			neg
Lawsonella clevelandensis	Actinobacteria	Rare	vr
Lawsonia intracellularis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Lawsonibacter asaccharolyticus	Firmicutes	Moderate	+	w			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Leclercia adecarboxylata	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	d	d	+	neg	neg
Lederbergia galactosidilyticus	Firmicutes	Rare	+	+	+	d	d	d	d	d	d	d	d	d	d	d	d				neg	d			d
Lederbergia lentus	Firmicutes	Unlikely	+	w	w	w	w	w	+	w	w	w	w	+	+	d	w					neg			w
Legionella bozemanae	Proteobacteria	Non	neg
Legionella pneumophila	Proteobacteria	Non	neg
Lelliottia amnigena	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		neg	+	neg	+	+	d	+				neg	+	d(neg)	neg	neg		neg
Lelliottia nimipressuralis	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		+	+		+	d	neg	+
Leminorella grimontii	Proteobacteria	Rare	neg	+		neg	neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg
Leminorella richardii	Proteobacteria	Rare	neg	+		neg	neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg
Lentibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Lentibacillus timonensis	Firmicutes	Rare	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Lentilactobacillus buchneri subsp. buchneri	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	+	neg	d(+)	neg	vr	neg		neg		neg	vr			neg
Lentilactobacillus diolivorans	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	+	w	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Lentilactobacillus farraginis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg		neg	+	+	+	+	+	neg										neg
Lentilactobacillus hilgardii	Firmicutes	Rare	+	+	+	d	neg	neg	neg	+	d	neg	neg	d	neg	neg	neg	neg		neg		neg			neg
Lentilactobacillus kefiri	Firmicutes	Non	+	+	d(+)	+	neg	neg	+	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg			vr	neg	neg			neg
Lentilactobacillus kisonensis	Firmicutes	Unlikely	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	d	neg				neg	neg			neg
Lentilactobacillus otakiensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg		d	+	neg	+	d	+	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Lentilactobacillus parabuchneri	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	+	+	+	neg	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Lentilactobacillus parafarraginis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg		neg	+	+	+	+	+	neg										neg
Lentilactobacillus senioris	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Leptospira interrogans	Spirochaetes	Non	neg
Leptotrichia amnionii	Fusobacteria	Rare	neg										neg
Leptotrichia buccalis	Fusobacteria	Rare	neg	+	+	neg		+	vr	+	neg		+	vr	+	+	+		neg		neg	neg			neg
Leptotrichia hofstadii	Fusobacteria	Rare	neg										neg
Leptotrichia hongkongensis	Fusobacteria	Rare	vr	neg									neg		neg
Leptotrichia massiliensis	Fusobacteria	Rare	+
Leptotrichia shahii	Fusobacteria	Rare	neg										neg
Leptotrichia wadei	Fusobacteria	Rare	neg										neg
Leucobacter aridicollis	Actinobacteria	Unlikely	+
Leuconostoc carnosum	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	+	+		neg
Leuconostoc citreum	Firmicutes	Minor	+	+	+	d(neg)	d(+)	d(+)	neg	+	neg	neg	neg	+	+	+	d(+)		neg	+	neg	neg			neg
Leuconostoc gelidum	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	neg	d	neg	+	+	+	+	+	neg				neg	neg			neg
Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum	Firmicutes	Non	+	+	+	d	+	+	neg	+	neg	+	+	+	+	+	neg			+	neg	neg			neg
Leuconostoc holzapfelii	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	+	+	neg	+	+	neg			neg	neg	neg
Leuconostoc inhae	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	d	+		neg	+	neg	neg	neg	+	+	d	d				neg				neg
Leuconostoc kimchii	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	neg	neg		+	+	+					neg			neg
Leuconostoc lactis	Firmicutes	Minor	+	+	d(+)	+	neg	d	+	+	neg	+	d(+)	+	neg	d	neg				neg	neg			neg
Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d		d(neg)	+	neg	+	d	+	+		d(neg)	d		d		neg			neg
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	d(neg)	vr	d(neg)	+	neg	vr	vr	+	+	+	d(neg)		neg	vr	neg	neg			neg
Leuconostoc pseudomesenteroides	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	d(+)	d(+)	d	d(+)	+	neg	+	+	d(+)	+	d(+)	d(neg)			d		neg
Levilactobacillus brevis	Firmicutes	Minor	+	+	+	d(+)	neg	neg	neg	+	neg	+	d	d(neg)	neg	neg	neg		neg	d	neg	neg			neg
Levilactobacillus brevis subsp. gravesensis	Firmicutes	Unlikely	+	+		d	neg			+	neg	+	d	d	neg					d
Levilactobacillus namurensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Levilactobacillus parabrevis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	d	neg	neg	d	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Levyella massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Ligilactobacillus acidipiscis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg		d	+	neg	neg	neg	d	d		d				neg			neg
Ligilactobacillus agilis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	neg	+		neg		neg	neg			neg
Ligilactobacillus animalis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	neg	neg	+		neg		neg	neg			neg
Ligilactobacillus ceti	Firmicutes	Unlikely	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg
Ligilactobacillus equi	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg	neg	+	+	neg	+	+	+	neg	d	neg				neg	d(neg)			neg
Ligilactobacillus murinus	Firmicutes	Rare	+				+				neg	+	+	+			d			+
Ligilactobacillus pobuzihii	Firmicutes	Unlikely	+	+	+		+		+	+	neg	neg	neg		+	neg	neg				neg	neg
Ligilactobacillus ruminis	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	+	vr	+	+	neg	+	+	+	neg	neg	+				neg	neg			neg
Ligilactobacillus salivarius	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	neg	neg	vr	+	neg		vr	+	+	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Limnobacter thiooxidans	Proteobacteria	Unlikely	neg
Limnochorda pilosa	Firmicutes	Unlikely	neg
Limosilactobacillus antri	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	+	+	+	neg	w	neg		neg		neg	neg			neg
Limosilactobacillus caccae	Firmicutes	Rare	+		+	+	neg	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	neg			neg	+				+
Limosilactobacillus coleohominis	Firmicutes	Unlikely	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	vr	neg	neg	neg		neg		neg	neg		neg	neg
Limosilactobacillus fermentum	Firmicutes	Widespread	+	vr	+	+	vr	neg	+	+	neg	+	+	+	d(+)	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Limosilactobacillus frumenti	Firmicutes	Non	+	+	+	+	+		+	+	d	+	+	+	+		+			+
Limosilactobacillus gastricus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+		neg		neg	neg			neg
Limosilactobacillus ingluviei	Firmicutes	Non	+	d	+	neg	neg	neg	neg	d	neg	d	d	+	neg	neg	neg			d	neg	neg			neg
Limosilactobacillus mucosae	Firmicutes	Rare	+	+	neg	d	neg	neg	d(neg)	+	neg	+	+	+	neg	neg	neg		neg	+	neg	neg			neg
Limosilactobacillus oris	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	d	+	+	+	neg	+	+	+	d	neg	+				neg	neg			neg
Limosilactobacillus reuteri	Firmicutes	Minor	+	+	vr	+	neg	neg	+	+	neg	+	+	+	neg	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Limosilactobacillus vaginalis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	+	+	neg	+	+	+	neg	neg	neg		neg		neg	neg			neg
Limosilactobacillus walteri	Firmicutes	Rare	+	+		+			+	+		+	+	w						+
Liquorilactobacillus mali	Firmicutes	Unlikely	+	+		+	+	+	d	d	d	d	d		+	neg	+			+	neg	+
Liquorilactobacillus satsumensis	Firmicutes	Non	+	+	+	d	neg		neg		d	neg	neg	+	+										neg
Liquorilactobacillus vini	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+				neg	neg			neg
Listeria floridensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	neg	neg	neg		neg	+			+	neg	neg
Listeria grayi	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	d	+	+	+	d(+)	+	neg	+	+	d		+		neg	neg			neg
Listeria innocua	Firmicutes	Rare	+	+	d	neg	d	d	+	d	d	neg	neg	d	+	+	d		+		neg	neg			neg
Listeria ivanovii	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	+	+	d	+	neg	neg	+	+	neg	+		vr		neg	neg			neg
Listeria marthii	Firmicutes	Rare	+	+
Listeria monocytogenes	Firmicutes	Rare	+	+	+	d(neg)	+	+	+	+	d	neg	neg	vr	+	neg	+		+		neg	neg			neg
Listeria seeligeri	Firmicutes	Rare	+	+		neg			+	+	d	neg	neg	+	+	+			vr		neg				d
Listeria welshimeri	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	+		vr		neg	neg			+
Litchfieldia alkalitelluris	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg			neg		neg		neg			neg				+	neg
Loigolactobacillus bifermentans	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg					neg
Loigolactobacillus coryniformis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	d(neg)	d(neg)	+	neg	neg	neg			d(neg)	neg	neg			neg
Loigolactobacillus coryniformis subsp. torquens	Firmicutes	Unlikely	+				neg				neg	neg	neg	+			neg			neg
Longicatena caecimuris	Firmicutes	Rare	+	+
Lutispora thermophila	Firmicutes	Unlikely	neg
Luxibacter massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg	+			+	neg	neg			+
Lysinibacillus boronitolerans	Firmicutes	Rare	+	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			w	neg				neg
Lysinibacillus fusiformis	Firmicutes	Rare	vr	neg	neg	neg	neg		neg	neg				neg	neg
Lysinibacillus macroides	Firmicutes	Unlikely	vr	neg
Lysinibacillus meyeri	Firmicutes	Unlikely	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg		neg			neg
Lysinibacillus sphaericus	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Lysinibacillus varians	Firmicutes	Rare	+
Lysinibacillus xylanilyticus	Firmicutes	Rare	+	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg				neg
Lysobacter soli	Proteobacteria	Rare	neg				neg	neg		w		neg	neg	neg	neg	w	neg
Macellibacteroides fermentans	Bacteroidetes	Rare	+	+			+		+	+	+		+	+	+
Macrococcus caseolyticus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+		neg			+	neg		neg	d	+	neg
Mageeibacillus indolicus	Firmicutes	Rare	vr	neg	neg	neg	neg		neg	neg				neg
Mahella australiensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+							+
Mailhella massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg
Mameliella alba	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg						+		neg		neg	+		neg
Mammaliicoccus fleurettii	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg		neg	+	neg		neg	+	+	+
Mammaliicoccus lentus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	d(+)	d(+)	+	+	neg				+
Mammaliicoccus sciuri	Firmicutes	Rare	+	+	+		+		vr	+			neg	+		+					neg
Mammaliicoccus vitulinus	Firmicutes	Unlikely	+	vr	+	neg	vr		neg	neg	neg		neg	+	vr	neg			neg		neg
Mannheimia granulomatis	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	d		+	d		neg		+	neg		d			d
Mannheimia haemolytica	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg	neg		+		neg			neg		neg			neg
Mannheimia succiniciproducens	Proteobacteria	Rare	neg
Marasmitruncus massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Marseilla massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Marseillibacter massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Marvinbryantia formatexigens	Firmicutes	Moderate	+	+
Massilia aurea	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Massilia brevitalea	Proteobacteria	Non	neg
Massilia haematophila	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg			neg
Massilia norwichensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Massilia timonae	Proteobacteria	Non	neg	w	+		neg		neg	neg				neg							neg
Massilia varians	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg			neg
Massilibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Massilibacterium senegalense	Firmicutes	Rare	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	+	+	neg	neg	+			neg	neg	+			neg
Massilicoli timonensis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	neg	neg	+	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	+			neg	+	+			neg
Massiliimalia massiliensis	Firmicutes	Rare	neg	+	+				neg	+
Massiliimalia timonensis	Firmicutes	Minor	+	neg	neg				neg	neg
Massilimicrobiota timonensis	Firmicutes	Moderate	neg	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+
Massilioclostridium coli	Firmicutes	Moderate	neg	neg	neg	neg				neg				neg						neg
Massiliprevotella massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Massilistercora timonensis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	d	neg	d	neg	neg	neg	neg	neg	d	d	neg	neg				d	neg			d
Mediterranea massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg				neg	neg															+
Mediterraneibacter faecis	Firmicutes	Minor	+	+			neg		+	+	neg		+	neg	neg
Mediterraneibacter glycyrrhizinilyticus	Firmicutes	Minor	+	+			neg		+	+	neg		neg	neg	neg
Mediterraneibacter massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Megalodesulfovibrio gigas	Proteobacteria	Unlikely	neg
Megamonas funiformis	Firmicutes	Minor	neg	+	+		neg		+	+	neg	neg	+	+	+		neg			neg	neg	d			neg
Megamonas hypermegale	Firmicutes	Moderate	neg	+	+		d		+	+	neg	+	+	+	+		d			neg	neg	d			neg
Megamonas rupellensis	Firmicutes	Rare	neg	+			+		+	+	neg		+	+	+
Megasphaera cerevisiae	Firmicutes	Rare	neg	neg	+		neg			neg					neg
Megasphaera elsdenii	Firmicutes	Moderate	neg	+	+	neg	neg		neg	+	neg		neg	neg	neg							neg			neg
Megasphaera indica	Firmicutes	Rare	neg
Megasphaera massiliensis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+			neg	neg	+		w			+
Megasphaera micronuciformis	Firmicutes	Minor	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg					neg					neg
Megasphaera stantonii	Firmicutes	Rare	neg
Meiothermus silvanus	Deinococcus-Thermus	Unlikely	neg
Merdibacter massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Merdimonas faecis	Firmicutes	Rare	+	neg					neg	neg
Mesobacillus jeotgali	Firmicutes	Rare	vr	+	+	neg	d	d	neg	+	neg	neg	neg	d	+	neg	neg			+	+	neg			+
Mesobacillus subterraneus	Firmicutes	Rare	neg			neg						neg		neg
Mesorhizobium australicum	Proteobacteria	Unlikely	neg
Mesorhizobium jarvisii	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg				neg
Mesorhizobium loti	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Mesorhizobium muleiense	Proteobacteria	Unlikely	neg
Mesosutterella multiformis	Proteobacteria	Rare	neg										neg
Metabacillus galliciensis	Firmicutes	Unlikely	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Metabacillus idriensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	+	neg	+		+	+	+	+		+			+	+	neg			+
Metabacillus litoralis	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+		+	neg	+	+	+	+	+
Metabacillus niabensis	Firmicutes	Rare	+	+
Metakosakonia massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg	+
Metamycoplasma anseris	Tenericutes	Unlikely	unk
Metaprevotella massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Methanobrevibacter arboriphilus	Euryarchaeota	Rare	+
Methanobrevibacter millerae	Euryarchaeota	Rare	+
Methanobrevibacter oralis	Euryarchaeota	Rare	+
Methanobrevibacter ruminantium	Euryarchaeota	Rare	+
Methanobrevibacter smithii	Euryarchaeota	Moderate	+
Methanococcus voltae	Euryarchaeota	Rare	neg
Methanomassiliicoccus intestinalis	Euryarchaeota	Rare	+
Methanomassiliicoccus luminyensis	Candidatus Thermoplasmatota	Rare	+
Methanomethylophilus alvus	Candidatus Thermoplasmatota	Rare
Methanosphaera stadtmanae	Euryarchaeota	Minor	+
Methylibium petroleiphilum	Proteobacteria	Unlikely	neg
Methylobacterium adhaesivum	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+				+
Methylobacterium brachiatum	Proteobacteria	Unlikely	neg
Methylobacterium jeotgali	Proteobacteria	Non	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Methylobacterium mesophilicum	Proteobacteria	Non	neg	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Methylobacterium organophilum	Proteobacteria	Unlikely	neg
Methylobacterium oryzae	Proteobacteria	Unlikely	neg
Methylobacterium phyllosphaerae	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Methylobacterium radiotolerans	Proteobacteria	Non	neg	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Methylomusa anaerophila	Firmicutes	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Methylorubrum aminovorans	Proteobacteria	Rare	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Methylorubrum extorquens	Proteobacteria	Non	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Methylorubrum populi	Proteobacteria	Unlikely	neg
Methylorubrum thiocyanatum	Proteobacteria	Unlikely	neg	w	neg	w	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Methylorubrum zatmanii	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Methyloversatilis discipulorum	Proteobacteria	Rare	neg
Methyloversatilis universalis	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Microbacterium aurum	Actinobacteria	Rare	+	w	w	w	w		neg	w	neg	neg	w	w	w				neg		neg	w			w
Microbacterium chocolatum	Actinobacteria	Unlikely	+	neg		neg			neg	neg	neg		neg	w	neg						neg	neg
Microbacterium deminutum	Actinobacteria	Unlikely	+
Microbacterium esteraromaticum	Actinobacteria	Unlikely	+
Microbacterium foliorum	Actinobacteria	Unlikely	+	neg	+	+	+	d	d	+	d	d	d	+	+		+				d	d			d
Microbacterium ginsengisoli	Actinobacteria	Non	+		+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	+	neg			+	neg	neg			neg
Microbacterium gubbeenense	Actinobacteria	Unlikely	+	+		+			+		neg		neg	+	+							neg
Microbacterium hydrocarbonoxydans	Actinobacteria	Unlikely	+	neg										+
Microbacterium kitamiense	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+	d		neg	+		neg	+	+	+
Microbacterium lacticum	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg		neg	vr	neg	neg	neg		neg		vr	neg			+
Microbacterium liquefaciens	Actinobacteria	Unlikely	+	+		+
Microbacterium luteolum	Actinobacteria	Non	+	neg					neg	neg											neg
Microbacterium maritypicum	Actinobacteria	Unlikely	+	+		neg					neg		neg	w	neg							neg
Microbacterium mitrae	Actinobacteria	Unlikely	+	neg
Microbacterium natoriense	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+
Microbacterium oleivorans	Actinobacteria	Unlikely	+	neg										+
Microbacterium oxydans	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+			d	+				+				neg
Microbacterium paraoxydans	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+				+				+
Microbacterium phyllosphaerae	Actinobacteria	Unlikely	+	neg	+	+	+	+	neg	neg	d	d	d	+	+		+				d	d			d
Microbacterium saccharophilum	Actinobacteria	Unlikely	+		+
Microbacterium schleiferi	Actinobacteria	Unlikely	+	neg					neg	neg											neg
Microbacterium sediminicola	Actinobacteria	Unlikely	+
Microbacterium testaceum	Actinobacteria	Non	+	+					neg					neg											neg
Microbispora rosea	Actinobacteria	Rare	+
Micrococcus cohnii	Actinobacteria	Unlikely	+	+						+		neg		+	+	+
Micrococcus endophyticus	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg	+	+	+		neg			+	neg	neg			neg
Micrococcus luteus	Actinobacteria	Minor	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Micrococcus lylae	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	+	+	+	neg	+	neg	+	+	neg	neg				+	+			+
Micrococcus terreus	Actinobacteria	Rare	+							+				+	+	+
Microlunatus phosphovorus	Actinobacteria	Unlikely	+
Micromonospora aurantiaca	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg											neg
Micropruina glycogenica	Actinobacteria	Rare	+	+
Microvirga aerophila	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Microvirga massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			neg	neg	neg
Microvirgula aerodenitrificans	Proteobacteria	Unlikely	neg
Millionella massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Miniphocaeibacter massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Mitsuokella jalaludinii	Firmicutes	Minor	neg	+	+	+	+	neg	+	+	neg	+	+	+	+	+	neg			+	neg	neg			+
Mitsuokella multacida	Firmicutes	Moderate	neg	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+	+		neg		+	+	d(neg)	neg			+
Mixta calida	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+		neg	+			+		neg				neg	neg			neg
Mixta intestinalis	Proteobacteria	Rare	neg
Mobilibacterium massiliense	Firmicutes	Rare	neg
Mobilibacterium timonense	Firmicutes	Rare	neg
Mobilicoccus massiliensis	Actinobacteria	Rare	+
Mobiluncus curtisii	Actinobacteria	Rare	vr	w	w(neg)	vr	neg		neg	w	neg	+	neg	neg	neg		neg		neg	neg	w	neg		neg	neg
Moellerella wisconsensis	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	neg		+	neg		+	+	+	neg
Mogibacterium diversum	Firmicutes	Rare	+
Mogibacterium neglectum	Firmicutes	Rare	+
Mogibacterium pumilum	Firmicutes	Rare	+
Mogibacterium timidum	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg
Mogibacterium vescum	Firmicutes	Unlikely	+
Monoglobus pectinilyticus	Firmicutes	Minor	+		+
Moorella glycerini	Firmicutes	Unlikely	+
Moraxella catarrhalis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg		neg
Moraxella osloensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	vr	neg					neg				neg
Mordavella massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Morganella morganii	Proteobacteria	Minor	neg	+		+	neg		neg	neg			neg	neg	neg		neg
Moryella indoligenes	Firmicutes	Rare	+	vr	neg	vr	neg		neg	vr	neg	neg	neg	neg	neg					neg					neg
Mucispirillum schaedleri	Deferribacteres	Rare	neg
Murdochiella asaccharolytica	Firmicutes	Rare	+	neg					neg						neg
Murdochiella massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+
Murdochiella vaginalis	Firmicutes	Rare	+	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Muribaculum gordoncarteri	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+			+		+	+			+	+
Muribaculum intestinale	Bacteroidetes	Minor	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Murimonas intestini	Firmicutes	Rare	+
Mycobacterium abscessus	Actinobacteria	Unlikely	vr	neg		neg			neg	neg				neg	neg						neg
Mycobacterium avium	Actinobacteria	Unlikely	vr	neg					neg	neg											neg
Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis	Actinobacteria	Unlikely	vr
Mycobacterium colombiense	Actinobacteria	Rare	vr
Mycobacterium florentinum	Actinobacteria	Rare	vr
Mycobacterium fortuitum	Actinobacteria	Rare	vr	+		neg			neg	neg				neg	neg						neg
Mycobacterium gastri	Actinobacteria	Rare	vr
Mycobacterium gordonae	Actinobacteria	Rare	vr	+	+	neg			neg	neg		neg	neg	neg	neg
Mycobacterium interjectum	Actinobacteria	Rare	vr
Mycobacterium kansasii	Actinobacteria	Unlikely	vr
Mycobacterium lentiflavum	Actinobacteria	Rare	vr
Mycobacterium simiae	Actinobacteria	Rare	vr
Mycobacterium terrae	Actinobacteria	Rare	vr
Mycobacterium tuberculosis	Actinobacteria	Non	vr
Mycobacterium tuberculosis variant africanum	Actinobacteria	Non	vr
Mycobacterium tuberculosis variant bovis	Actinobacteria	Unlikely	+
Mycobacteroides abscessus subsp. bolletii	Actinobacteria	Unlikely	+
Mycolicibacterium aubagnense	Actinobacteria	Non	+	neg					neg	neg				neg							neg
Mycolicibacterium cosmeticum	Actinobacteria	Unlikely	vr
Mycolicibacterium houstonense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg		neg	neg		neg	neg	neg	+										neg
Mycolicibacterium mageritense	Actinobacteria	Unlikely	+
Mycolicibacterium neoaurum	Actinobacteria	Rare	+
Mycoplasma hominis	Tenericutes	Rare	neg						neg	neg	neg		neg		neg				neg		neg
Mycoplasma muris	Tenericutes	Rare	neg	neg
Mycoplasma pneumoniae	Tenericutes	Rare	neg
Mycoplasmopsis arginini	Tenericutes	Unlikely	neg
Mycoplasmopsis californica	Tenericutes	Unlikely	neg
Myroides odoratimimus	Bacteroidetes	Unlikely	neg
Myroides odoratus	Bacteroidetes	Unlikely	neg
Nakamurella multipartita	Actinobacteria	Unlikely	+
Nanosynbacter lyticus	Candidatus Saccharibacteria	Unlikely	+
Natronorubrum bangense	Euryarchaeota	Non	neg
Nautilia nitratireducens	Proteobacteria	Unlikely	neg
Ndongobacter massiliensis	Firmicutes	Unlikely	neg
Necropsobacter rosorum	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg	neg	w	+	neg	+	+	+	+	neg	neg			neg	neg	neg
Negativibacillus massiliensis	Firmicutes	Minor	neg	+				+	+						+
Negativicoccus massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Negativicoccus succinicivorans	Firmicutes	Rare	neg
Neglecta timonensis	Firmicutes	Rare	+
Neisseria bacilliformis	Proteobacteria	Rare	neg	neg					neg	neg				neg
Neisseria canis	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria cinerea	Proteobacteria	Minor	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria elongata	Proteobacteria	Minor	neg	d	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria flava	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg		neg	+	neg	neg	neg	d	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria flavescens	Proteobacteria	Minor	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria gonorrhoeae	Proteobacteria	Non	neg	d(+)	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria lactamica	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg	neg	neg	neg	d(+)	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria macacae	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg		neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria meningitidis	Proteobacteria	Unlikely	neg	d	neg	neg	neg	neg	neg	d	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria mucosa	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria oralis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+				d(neg)	+			neg	d
Neisseria perflava	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria polysaccharea	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg				neg	+				d
Neisseria shayeganii	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg		neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg							neg
Neisseria sicca	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neisseria subflava	Proteobacteria	Rare	neg	+	d(+)	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	d	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg
Neoactinobaculum massilliense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	+	+	+	+	neg			neg	neg	neg			neg
Neobacillus bataviensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	d	+	d	+	+	d				neg	d			d
Neobacillus fumarioli	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	d	neg	neg	d	d	d	d	d	+	w	d	neg				neg	neg			neg
Neobacillus jeddahensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	w	neg	neg	neg	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Neobacillus massiliamazoniensis	Firmicutes	Rare	+	+	w	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	+	neg			+
Neobacillus niacini	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d(+)	d(+)	d(+)	+	d(+)	+	d(+)	+	+		+				d(+)	d(+)			+
Neobacillus pocheonensis	Firmicutes	Unlikely	+	neg								neg		neg			neg
Neobacillus soli	Firmicutes	Rare	+	+	+	d	neg	neg	neg	w	neg	neg	neg	d	w	neg	neg				+	neg			+
Neobittarella massiliensis	Firmicutes	Moderate	+
Neofamilia massiliensis	Firmicutes	Rare
Nesterenkonia massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+				+	+					neg
Nevskia ramosa	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Niallia nealsonii	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	neg	neg			+
Niameybacter massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Nigerium massiliense	Actinobacteria	Rare	+
Nitriliruptor alkaliphilus	Actinobacteria	Unlikely	+
Nitrosomonas eutropha	Proteobacteria	Rare	neg
Nocardia asteroides	Actinobacteria	Rare	+
Nocardia brevicatena	Actinobacteria	Rare	+																							neg
Nocardia cyriacigeorgica	Actinobacteria	Rare	+
Nocardia mangyaensis	Actinobacteria	Unlikely	+
Nocardia otitidiscaviarum	Actinobacteria	Rare	+
Nocardioides jensenii	Actinobacteria	Unlikely	+
Nocardioides kribbensis	Actinobacteria	Unlikely	+
Nocardioides massiliensis	Actinobacteria	Unlikely	+	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg		neg			neg
Nosocomiicoccus massiliensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg				neg	neg				neg
Noviherbaspirillum massiliense	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Novosphingobium capsulatum	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+			+	+	+	+	+	+	+							neg
Numidum massiliense	Firmicutes	Rare	+	+	+				+	+				neg
Obesumbacterium proteus	Proteobacteria	Rare	neg	+					neg	+				w
Oceanidesulfovibrio marinus	Proteobacteria	Unlikely	neg
Oceanithermus profundus	Deinococcus-Thermus	Unlikely	neg
Oceanobacillus caeni	Firmicutes	Rare	+	+	+					+		w
Oceanobacillus iheyensis	Firmicutes	Unlikely	+	+		neg				+		neg			neg	+
Oceanobacillus jeddahense	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg			neg	+				+
Oceanobacillus manasiensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Oceanobacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Oceanobacillus oncorhynchi	Firmicutes	Non	+	+	+	+			neg	+		+	+	+	+
Oceanobacillus picturae	Firmicutes	Unlikely	+	w	w	w						w			w	w	neg				w
Oceanobacillus senegalensis	Firmicutes	Unlikely	+
Oceanobacillus sojae	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	+	neg	neg	+	+	neg	neg			+					neg
Oceanobacillus timonensis	Firmicutes	Unlikely	+
Ochrobactrum anthropi	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	+							neg	neg
Ochrobactrum intermedium	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	+							neg	neg
Odoribacter laneus	Bacteroidetes	Minor	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Odoribacter massiliensis	Bacteroidetes	Minor
Odoribacter splanchnicus	Bacteroidetes	Widespread	neg										neg
Oenococcus oeni	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	d(neg)	d(+)		neg	neg		d(+)	neg	neg	+				neg	+
Oerskovia turbata	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+		neg	+		d	d(neg)	+	+						d
Okadaella gastrococcus	Firmicutes	Rare	neg
Olegusella massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	+	neg				neg	neg				+
Oleidesulfovibrio alaskensis	Proteobacteria	Rare	neg
Oleidesulfovibrio vietnamensis	Proteobacteria	Rare	neg
Oligella urethralis	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg					neg
Olsenella congonensis	Actinobacteria	Rare	+
Olsenella massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	+
Olsenella phocaeensis	Actinobacteria	Rare	+
Olsenella profusa	Actinobacteria	Rare	+	+			+		+	+	neg	+	+	+	+
Olsenella timonensis	Actinobacteria	Rare	+
Olsenella uli	Actinobacteria	Rare	+	+	+		neg		d(neg)	+	neg	neg	neg	+	neg		neg			neg	+	neg			+
Olsenella urininfantis	Actinobacteria	Rare	+
Oribacterium asaccharolyticum	Firmicutes	Rare	vr
Oribacterium parvum	Firmicutes	Rare	vr	+			neg		+	+			w		neg										neg
Oribacterium sinus	Firmicutes	Minor	vr	+	neg	+	neg		neg	neg	neg	neg	+	+	neg					neg					neg
Ornithinibacillus contaminans	Firmicutes	Unlikely	+	+
Ornithinibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Ornithobacterium rhinotracheale	Bacteroidetes	Rare	neg	d(+)	d(+)	+			+	d(+)				neg	neg										d(+)
Oscillibacter massiliensis	Firmicutes	Rare	neg
Oscillibacter ruminantium	Firmicutes	Rare	neg	+	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg										neg
Oscillibacter valericigenes	Firmicutes	Minor	neg	+	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg										neg
Oscillospira guillermondii	Firmicutes	Rare	+
Ottowia massiliensis	Pseudomonadota	Rare	neg
Oxalobacter formigenes	Proteobacteria	Moderate	neg
Pacaella massiliensis	Synergistetes	Rare	neg
Paenarthrobacter aurescens	Actinobacteria	Rare	+
Paenarthrobacter ilicis	Actinobacteria	Non	+	+
Paenibacillus alvei	Firmicutes	Unlikely	+	+	neg	d	+	d	neg	+	neg	neg	neg	neg	d	neg	d			+	neg	neg			d(+)
Paenibacillus amylolyticus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+		+		+	+
Paenibacillus anaericanus	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+
Paenibacillus antibioticophila	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	+	neg	+				+	+			+
Paenibacillus azoreducens	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+			+	+	+		+	+							+			+
Paenibacillus barcinonensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+			+	neg	neg			neg	+
Paenibacillus barengoltzii	Firmicutes	Unlikely	+	neg							neg	neg		neg		neg						neg			neg
Paenibacillus borealis	Firmicutes	Unlikely	neg	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+
Paenibacillus bouchesdurhonensis	Firmicutes	Rare	neg	+	+				+	+				+
Paenibacillus chibensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+		neg	+		+		+	+							+
Paenibacillus chitinolyticus	Firmicutes	Rare	vr	+
Paenibacillus cineris	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+				d	d			+
Paenibacillus cookii	Firmicutes	Unlikely	vr	+	d	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+				+	neg			+
Paenibacillus daejeonensis	Firmicutes	Rare	vr	neg			+					+	+				+				+				+
Paenibacillus dendritiformis	Firmicutes	Rare	neg	+	neg		+		neg					+	+
Paenibacillus donghaensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+			+	+	neg			+	+
Paenibacillus durus	Firmicutes	Rare	+	+	+				neg	+			+	+	+					neg
Paenibacillus faecis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+			+	+	neg			+
Paenibacillus favisporus	Firmicutes	Rare	vr	+					+	+		+	+	+
Paenibacillus glucanolyticus	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+		+	+			+	+	+									+
Paenibacillus graminis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	d	+	+	+	+	+	+	+	+	+				+	d			+
Paenibacillus ihuae	Firmicutes	Rare	+
Paenibacillus ihumii	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg	+			+	+	neg			+
Paenibacillus illinoisensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		neg	+		+	+	+	+							+			+
Paenibacillus jamilae	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	+	+	+			+	+
Paenibacillus kribbensis	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg	+			+	+	+			+
Paenibacillus lactis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	d	+	d	+	+	d	+	+	+	+	+	+				+	neg			+
Paenibacillus larvae	Firmicutes	Rare	+	+	d	d	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg				neg	neg			neg
Paenibacillus lautus	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+	+	+	+	+		+	+	+	+	+				+	+			+
Paenibacillus macerans	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			d	+	d			+
Paenibacillus motobuensis	Firmicutes	Rare	neg
Paenibacillus mucilaginosus	Firmicutes	Unlikely	neg	+										+
Paenibacillus naphthalenovorans	Firmicutes	Unlikely	+	+	d	+	neg	neg	neg	+	neg	d	neg	+	+	d	neg				neg				neg
Paenibacillus odorifer	Firmicutes	Unlikely	+	+
Paenibacillus pabuli	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+		+		+	+
Paenibacillus pasadenensis	Firmicutes	Rare	+	neg
Paenibacillus phocaensis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+			+	+				+
Paenibacillus polymyxa	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+	+
Paenibacillus provencensis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+	w	+	+	neg	+	+	w	neg	neg	+			+	+	neg			+
Paenibacillus pueri	Firmicutes	Rare	+	+	+	+		+	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg			+	neg	neg			neg
Paenibacillus rhizosphaerae	Firmicutes	Unlikely	+	+								+		+			+
Paenibacillus riograndensis	Firmicutes	Unlikely	vr	+	+	+			+	+			+	+	+
Paenibacillus rubinfantis	Firmicutes	Rare	neg	+	+				+	+				+
Paenibacillus sabinae	Firmicutes	Rare	+	neg	neg				neg	neg				neg
Paenibacillus senegalensis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+			+	+				+	+					+		+
Paenibacillus senegalimassiliensis	Firmicutes	Rare	vr	+	+				+	+				+
Paenibacillus stellifer	Firmicutes	Unlikely	+
Paenibacillus thiaminolyticus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+		+	+		+		+	+
Paenibacillus timonensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg	+			+	+	neg			+
Paenibacillus tuaregi	Firmicutes	Rare	vr	+	+				+	+				+
Paenibacillus typhae	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+
Paenibacillus urinalis	Firmicutes	Rare	neg	+	neg	+	+	w	+	+	neg	+	+	+	neg	neg	+			+	neg	neg			+
Paenibacillus xylanilyticus	Firmicutes	Rare	+	+						+		+		+
Paeniclostridium ghonii	Firmicutes	Rare	+
Paeniclostridium sordellii	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	neg		neg	+	neg		neg	neg	neg							neg
Paenisporosarcina quisquiliarum	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+			neg					+
Paludibacter jiangxiensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+		+	+				+									+		+
Paludibacter propionicigenes	Bacteroidetes	Unlikely	neg
Paludibaculum fermentans	Acidobacteria	Unlikely	neg	+	+		+		+	+	+	+		+
Paludicola psychrotolerans	Firmicutes	Rare	+
Pannonibacter phragmitetus	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	neg			neg	neg				neg						+
Pantoea agglomerans	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	+	vr		d	+			d	+	+		+
Pantoea conspicua	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		+	+			neg		+
Pantoea eucalypti	Proteobacteria	Rare	neg						+					+
Pantoea rodasii	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	+	+	neg			+	neg	+	+					+
Pantoea septica	Proteobacteria	Rare	neg		+	+	d		d	+			neg		+
Pantoea vagans	Proteobacteria	Rare	neg						w					+
Papillibacter cinnamivorans	Firmicutes	Rare	+
Parabacteroides bouchesdurhonensis	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+	+	neg	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			neg		+			+
Parabacteroides chinchillae	Bacteroidetes	Minor	neg	+			neg		+	+	neg		+	+	neg						neg
Parabacteroides distasonis	Bacteroidetes	Widespread	neg	+	+	+	+		+	+	+		+	+	+		+			d	neg	+			d
Parabacteroides faecis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+	+		+	+	+
Parabacteroides goldsteinii	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+							+	+											neg
Parabacteroides gordonii	Bacteroidetes	Minor	neg	+			neg		+	+	neg		+	+	neg
Parabacteroides johnsonii	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			neg		+	d	neg		d	+	d
Parabacteroides massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+	w	+	+	+	+	w	+	+	+				+	neg	neg			w
Parabacteroides merdae	Bacteroidetes	Widespread	neg	+	+	+	w		+	+	+	+	+	+	+		neg			d(w)	neg	d(w)			+	neg
Parabacteroides pacaensis	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	+	neg	neg	neg			+	+	neg			+
Parabacteroides pekinense	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		+	neg	neg		+		neg					+
Parabacteroides provencensis	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Parabacteroides timonensis	Bacteroidetes	Minor	neg
Paraburkholderia fungorum	Proteobacteria	Rare	neg
Paraburkholderia phytofirmans	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+					d(neg)
Paracholeplasma brassicae	Tenericutes	Unlikely	neg	+
Paraclostridium benzoelyticum	Firmicutes	Rare	+
Paraclostridium bifermentans	Firmicutes	Moderate	+										vr
Paracoccus aminovorans	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+			neg	neg				neg	neg										neg
Paracoccus carotinifaciens	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	neg	+			+	+				+	+
Paracoccus denitrificans	Proteobacteria	Rare	neg
Paracoccus haeundaensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Paracoccus marcusii	Proteobacteria	Non	neg
Paracoccus marinus	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Paracoccus sphaerophysae	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Paracoccus yeei	Proteobacteria	Rare	neg	+					d	neg				neg
Paraeggerthella hongkongensis	Actinobacteria	Rare	+	neg									neg		neg
Parafannyhessea umbonata	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+		neg		neg	+	neg		neg	+	d
Paraliobacillus quinghaiensis	Firmicutes	Non	+	neg						+		neg		neg			neg
Paramuribaculum intestinale	Bacteroidetes	Rare	neg
Paraprevotella clara	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			neg		+	w	neg		+	neg	neg
Paraprevotella xylaniphila	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			neg		+	neg	neg		+	neg	neg
Pararheinheimera texasensis	Proteobacteria	Rare	neg
Parascardovia denticolens	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+			+	+	neg	+	+	+	d				+			+	neg		+	neg
Parasphingorhabdus flavimaris	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg
Parasporobacterium paucivorans	Firmicutes	Rare	neg
Parasutterella excrementihominis	Proteobacteria	Moderate	neg
Parasutterella secunda	Proteobacteria	Rare	neg
Paratractidigestivibacter faecalis	Actinobacteria	Rare	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Paremcibacter congregatus	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	neg	+	neg	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg	+		w
Parolsenella catena	Actinobacteria	Rare	+	+			neg		neg	+	neg		neg		neg
Parolsenella massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Parvibacter caecicola	Actinobacteria	Rare	+										neg
Parvimonas micra	Firmicutes	Moderate	+	+	neg				neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Pasteurella aerogenes	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg	neg		+	neg	neg	d	+	neg	neg			+
Pasteurella dagmatis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+				+			neg	+	d(+)
Pasteurella multocida	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	d	neg	neg			neg	neg	neg
Paucilactobacillus oligofermentans	Firmicutes	Non	+	w	neg	neg	neg		neg	w	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg		neg			neg
Paucilactobacillus suebicus	Firmicutes	Unlikely	+	+	neg	+	d		d(neg)	+	neg	+	neg	d	neg		neg
Paucilactobacillus vaccinostercus	Firmicutes	Unlikely	+	+	d	d	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			d	neg
Paucisalibacillus globulus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	+	+				+				+
Pauljensenia bouchesdurhonensis	Actinobacteria	Minor	+
Pauljensenia cellulosilytica	Actinobacteria	Rare	+
Pauljensenia hongkongensis	Actinobacteria	Rare	+	neg									neg		neg
Pauljensenia keddieii	Actinobacteria	Minor	+
Pauljensenia odontolyticus	Actinobacteria	Rare	+
Pauljensenia turicensis	Actinobacteria	Rare	+
Pectobacterium wasabiae	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+		+	+	neg		neg	neg	+	+							neg			neg
Pediococcus acidilactici	Firmicutes	Rare	+	vr	+	+		vr	neg	neg	neg	neg	neg	neg	vr	neg	vr		neg		neg	neg			neg
Pediococcus claussenii	Firmicutes	Rare
Pediococcus damnosus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	neg	d	d		neg	neg	+	neg	+				neg	neg			neg
Pediococcus pentosaceus	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	d	+	neg	neg	neg	d(neg)	d	neg	+		neg		neg	neg			neg
Pedobacter cryoconitis	Proteobacteria	Non	neg
Pedobacter daejeonensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Pedobacter panaciterrae	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg								+		+			neg
Pedobacter terricola	Bacteroidetes	Non	neg									neg		neg			neg
Pedomicrobium ferrugineum	Proteobacteria	Rare	neg
Pelistega indica	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Pelobacter propionicus	Proteobacteria	Rare	neg
Pelomonas aquatica	Proteobacteria	Rare	neg
Pelomonas puraquae	Proteobacteria	Rare	neg
Pelomonas saccharophila	Proteobacteria	Rare	neg	+
Peptacetobacter hiranonis	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	+	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Peptoclostridium acidaminophilum	Firmicutes	Unlikely	+
Peptococcus niger	Firmicutes	Rare	+
Peptoniphilus asaccharolyticus	Firmicutes	Minor	+	neg	neg	neg			neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Peptoniphilus catoniae	Firmicutes	Rare	+
Peptoniphilus colimassiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	w	+	+	+	neg	neg	+	+	+	neg			+	neg	neg			neg
Peptoniphilus duerdenii	Firmicutes	Rare	+										neg
Peptoniphilus gorbachii	Firmicutes	Rare	+	neg
Peptoniphilus grossensis	Firmicutes	Rare	+										neg
Peptoniphilus harei	Firmicutes	Minor	+	neg	vr		neg		neg	neg			neg	neg	neg
Peptoniphilus indolicus	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg				neg			neg	neg	neg
Peptoniphilus ivorii	Firmicutes	Rare	+	neg			neg		neg	neg			neg	neg	neg
Peptoniphilus koenoeneniae	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg				neg			neg	neg
Peptoniphilus lacrimalis	Firmicutes	Minor	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Peptoniphilus obesi	Firmicutes	Rare	+
Peptoniphilus pacaensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg	neg			neg
Peptoniphilus phoceensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Peptoniphilus senegalensis	Firmicutes	Rare	+										neg
Peptoniphilus timonensis	Firmicutes	Rare	+										neg
Peptostreptococcus anaerobius	Firmicutes	Moderate	+	w(+)					neg	+	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Peptostreptococcus russellii	Firmicutes	Rare	+										neg
Peptostreptococcus stomatis	Firmicutes	Minor	+	w(+)	w(+)		neg		neg	w(+)	neg	neg	neg	neg	neg				neg		neg
Peribacillus psychrosaccharolyticus	Firmicutes	Unlikely	vr	+	+	neg	d		neg	+			neg	d	+									+
Peribacillus simplex	Firmicutes	Rare	vr	w(+)	+	vr	neg	neg	neg	d(w)	neg	neg	neg	+	d(w)	neg	neg				neg	w			neg
Petrimonas mucosa	Bacteroidetes	Unlikely	neg
Petrimonas sulfuriphila	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+		+	+				+
Petrobacter succinatimandens	Proteobacteria	Rare	neg
Petrocella atlantisensis	Firmicutes	Unlikely	+
Phascolarctobacterium faecium	Firmicutes	Minor	neg	neg	neg
Phascolarctobacterium succinatutens	Firmicutes	Moderate	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Phenylobacterium falsum	Proteobacteria	Unlikely	neg
Phenylobacterium haematophilum	Proteobacteria	Rare	neg
Phenylobacterium lituiforme	Proteobacteria	Unlikely	neg
Phocaeicola barnesiae	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Phocaeicola coprocola	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Phocaeicola coprophilus	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			w		+				+	+
Phocaeicola dorei	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			neg		+	+	neg		+	+	neg
Phocaeicola massiliensis	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+	+	neg		+	+	neg	+	+	+	neg		neg			+	neg	neg			+
Phocaeicola paurosaccharolyticus	Bacteroidetes	Rare	neg		neg				neg			neg	neg	neg
Phocaeicola plebeius	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			+		+	+	neg		vr	+	neg
Phocaeicola salanitronis	Bacteroidetes	Minor	neg	+			+		+	+	neg		d	+	neg
Phocaeicola sartorii	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	neg		+		+	+	neg	+	+	d	neg
Phocaeicola vulgatus	Bacteroidetes	Widespread	neg	+	+	+	neg		+	+	neg	w	+	+	neg		neg		+	d	+	+			+	d
Phocea massiliensis	Firmicutes	Minor	neg
Phoenicibacter congonensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+		+	+	+	+	+				+					+
Phyllobacterium myrsinacearum	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Pigmentiphaga kullae	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg
Planococcus massiliensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+				neg	neg				neg
Planococcus rifietoensis	Firmicutes	Unlikely	+
Planomicrobium chinense	Firmicutes	Unlikely	+	+			neg		neg			neg	neg	neg
Planomicrobium koreense	Firmicutes	Unlikely	+	w	neg	neg	+	neg	+	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Planomicrobium okeanokoites	Firmicutes	Unlikely	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Plesiomonas shigelloides	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg		neg		neg	+				neg	+		neg
Pluralibacter gergoviae	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		d	+		+	+	+	+
Pontibacillus litoralis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg			neg	+	neg	neg	neg	+	+	+
Porphyromonas asaccharolytica	Bacteroidetes	Minor	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Porphyromonas bennonis	Bacteroidetes	Rare	neg	+									neg
Porphyromonas cangingivalis	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg	neg		neg		neg					neg	neg						neg				neg
Porphyromonas canoris	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg		neg		neg	neg				neg	neg						neg				neg
Porphyromonas crevioricanis	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Porphyromonas endodontalis	Bacteroidetes	Minor	neg										neg
Porphyromonas gingivalis	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Porphyromonas levii	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		+	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg						neg
Porphyromonas macacae	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg	+	neg		neg	neg				+	neg						neg				neg
Porphyromonas somerae	Bacteroidetes	Minor	neg	w			neg		w	w	neg		neg	neg	neg
Porphyromonas uenonis	Bacteroidetes	Minor	neg										neg
Pragia fontium	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	neg		neg	neg	neg		neg		neg							neg			neg
Prevotella albensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+			neg	neg	neg	neg					+		neg
Prevotella amnii	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg		neg		+	+		neg		neg	neg
Prevotella aurantiaca	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		neg	+		neg	+	+	neg
Prevotella baroniae	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		+		+	+	neg	+	+	+	neg
Prevotella bergensis	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	+		+		+	+	neg	neg	neg	neg	d
Prevotella bivia	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	+	d(+)	neg		+	+	neg	neg	vr	neg	neg		neg			neg	+				+
Prevotella brevis	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+	+	+	+	+	+		+	+	+	neg					+		w
Prevotella bryantii	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+	neg	+	+		+	+	+	neg					+		+				+
Prevotella buccae	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+		+		+	vr	neg	+	+	+	neg						+				+
Prevotella buccalis	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+		+		+	+	neg			+	neg
Prevotella conceptionensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+			+	+	+					+
Prevotella copri	Bacteroidetes	Widespread	neg	+			+		+	+	vr		vr	+
Prevotella corporis	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	d(+)		neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	+	neg			+	neg
Prevotella dentalis	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+	+	+		+	+	neg	w	+	w
Prevotella dentasini	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		neg	+			+	+	neg
Prevotella denticola	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+		neg		+	+	neg	neg	+	+	neg		neg			d	+	+	neg		+	neg
Prevotella disiens	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+	neg	neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	+				+
Prevotella enoeca	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		neg		+	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg		+	neg	+	neg	d		+
Prevotella falsenii	Bacteroidetes	Rare
Prevotella fusca	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	+		+		+		neg		+	+	neg
Prevotella herbatica	Bacteroidetes	Unlikely	neg																							+
Prevotella histicola	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		neg		+	+	neg	neg	+	+	neg
Prevotella ihumii	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Prevotella intermedia	Bacteroidetes	Minor	neg	+	d(+)		neg		neg	+	neg	neg	d	+	neg		neg			neg	+	d(+)			+	neg
Prevotella jejuni	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		+	+	neg		+	+	neg
Prevotella lascolaii	Bacteroidetes	Minor	neg	neg	neg	+	neg		neg	neg	+			neg		+					+				neg
Prevotella loescheii	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		+		+	+		d	+	+	neg		neg			d	+	+	d(neg)		+	neg
Prevotella maculosa	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+				+		neg	+	+	+
Prevotella marseillensis	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	+	+			+
Prevotella marshii	Bacteroidetes	Rare	neg	+	d		neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg
Prevotella melaninogenica	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	+		neg		+	+	neg	neg	+	+	neg		neg			neg	+	d(+)	neg		+	neg
Prevotella merdae	Bacteroidetes	Rare	neg
Prevotella micans	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		+		+	+	neg	+	+	+	neg
Prevotella multiformis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Prevotella multisaccharivorax	Bacteroidetes	Minor	neg	+			+		+	+	+		+	+	+
Prevotella nanceiensis	Bacteroidetes	Rare	neg				vr		+		neg		+	+	neg											neg
Prevotella nigrescens	Bacteroidetes	Minor	neg		+		neg		neg	+	neg	neg	+	+	neg		neg			neg	+	d			+	neg
Prevotella oralis	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+		d(+)		+	+	neg	d(+)	+	+	neg		d(+)
Prevotella oris	Bacteroidetes	Moderate	neg	+	+				+	+	neg		+	+	neg										+
Prevotella oryzae	Bacteroidetes	Unlikely	neg
Prevotella oulorum	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		neg		+	+	neg		+	+	neg						+	+			+	neg
Prevotella pallens	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		neg	+			+	+						neg
Prevotella paludivivens	Bacteroidetes	Rare	neg
Prevotella phocaeensis	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	+	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Prevotella pleuritidis	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		+	+	neg		neg	neg	neg
Prevotella rara	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		neg	+	neg		+	+	neg
Prevotella rectalis	Bacteroidetes	Rare	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Prevotella ruminicola	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+	+	w(+)		neg	+		+	+	+	neg			neg		+		+	+			+
Prevotella saccharolytica	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		+		+	+	neg		+	+	neg
Prevotella salivae	Bacteroidetes	Rare	neg	+			+		+	+	neg		+	+	neg
Prevotella scopos	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	+		neg		+	+	+		+	+	neg
Prevotella seregens	Bacteroidetes	Rare
Prevotella shahii	Bacteroidetes	Rare	neg	+			neg		+	+	neg		+	+	neg
Prevotella stercorea	Bacteroidetes	Moderate	neg	+			neg		+	+	neg		+	+
Prevotella timonensis	Bacteroidetes	Minor	neg	+			neg		+	+	neg		neg	neg	neg					w
Prevotella veroralis	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+		d(+)		+	+	neg	neg	+	+	neg		neg			d(neg)	+	+	neg		+	d(neg)
Prevotellamassilia timonensis	Bacteroidetes	Minor	neg
Priestia flexa	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	neg		+	+			+	+	+									+
Priestia koreensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+				+	+		+	+	+	+
Priestia megaterium	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	d(neg)	+	+	+	neg	+	+	+	d(w)				+	+		+	+
Prochlorococcus marinus	Cyanobacteria	Rare	neg
Prolixibacter bellariivorans	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg		+	+		+	+	+	+	+	+	+	+				+					+
Propionibacterium acidifaciens	Actinobacteria	Rare	+	+	+		neg		+	+	neg	+	+	+
Propionibacterium freudenreichii	Actinobacteria	Rare	+	+	+				+	+	neg		neg	+	neg				neg		neg	neg			neg
Propionimicrobium lymphophilum	Actinobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg		neg	+	neg		neg				neg			neg		neg			+
Prosthecobacter fluviatilis	Verrucomicrobia	Rare	neg
Proteiniphilum saccharofermentans	Bacteroidetes	Unlikely	neg
Proteus mirabilis	Proteobacteria	Moderate	neg	+			neg		neg	neg				+	+		neg
Proteus penneri	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	neg		neg	+		neg	neg	+	w		neg
Proteus vulgaris	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		neg	+				+	d(+)		+
Provencibacterium massiliense	Firmicutes	Moderate	neg
Providencia alcalifaciens	Proteobacteria	Minor	neg	+			neg		neg	neg				neg	neg		neg			neg
Providencia heimbachae	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg		neg	w	neg	neg	neg	neg	neg						neg	neg			neg
Providencia rettgeri	Proteobacteria	Minor	neg	+			neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg		+
Providencia rustigianii	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	neg		neg	neg			neg	w	neg		neg
Providencia stuartii	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		neg	d				d	+		neg			neg
Pseudarthrobacter oxydans	Actinobacteria	Rare	+
Pseudarthrobacter polychromogenes	Actinobacteria	Unlikely	vr
Pseudescherichia vulneris	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		neg	+		+	+	neg	+
Pseudobutyrivibrio ruminis	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+		+	+				+	+										neg
Pseudobutyrivibrio xylanivorans	Firmicutes	Unlikely	neg																							+
Pseudochrobactrum asaccharolyticum	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudochrobactrum saccharolyticum	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudocitrobacter anthropi	Proteobacteria	Rare	neg	+					+			neg	+	neg	+
Pseudocitrobacter faecalis	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		+	+		neg	d	neg	+
Pseudoclavibacter alba	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg
Pseudoclavibacter helvolus	Actinobacteria	Unlikely	+
Pseudoclavibacter sp. Timone	Actinobacteria	Rare	+
Pseudoclostridium thermosuccinogenes	Firmicutes	Unlikely	neg
Pseudodesulfovibrio aespoeensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Pseudodesulfovibrio indicus	Proteobacteria	Unlikely	neg
Pseudoflavonifractor capillosus	Firmicutes	Moderate	neg	w	w	w	w		w	w	neg	neg	neg	w	neg						neg				w	neg
Pseudoglutamicibacter albus	Actinobacteria	Rare	+
Pseudoglutamicibacter cumminsii	Actinobacteria	Unlikely	+	d					neg	neg				neg							neg
Pseudomonas aeruginosa	Proteobacteria	Rare	neg	+	neg		neg			neg				neg	neg		neg
Pseudomonas alcaligenes	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas alcaliphila	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	neg	neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg									neg
Pseudomonas asiatica	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudomonas asplenii	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	d(neg)	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Pseudomonas boreopolis	Proteobacteria	Non	neg	w	w					+
Pseudomonas caricapapayae	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas chlororaphis	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas citronellolis	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg	neg			neg	neg				neg								neg
Pseudomonas fluorescens	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Pseudomonas fragi	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudomonas fulva	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudomonas gessardii	Proteobacteria	Non	neg	+	+				neg					neg
Pseudomonas japonica	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas libanensis	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas lundensis	Proteobacteria	Non	neg	+	neg	+	+		neg	+	neg	+	neg	neg	neg		neg				neg	neg			neg
Pseudomonas luteola	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg		neg	+			neg	neg	+							neg
Pseudomonas massiliensis	Proteobacteria	Non	neg	+	+		+		+	+					+					+
Pseudomonas mendocina	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudomonas migulae	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas monteilii	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Pseudomonas mosselii	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas nitroreducens	Proteobacteria	Unlikely	neg	+
Pseudomonas oleovorans	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	+	neg	+			neg			+	neg	neg
Pseudomonas oryzihabitans	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg		neg	+				neg	+							neg
Pseudomonas parafulva	Proteobacteria	Unlikely	neg
Pseudomonas protegens	Proteobacteria	Unlikely	neg
Pseudomonas putida Biovar A	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg			neg				neg	neg		neg
Pseudomonas putida Biovar B	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg			neg				neg	neg		neg
Pseudomonas rhodesiae	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas saudiphocaensis	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudomonas straminea	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg				neg	neg				neg											neg
Pseudomonas stutzeri	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg			neg				neg	neg
Pseudomonas taetrolens	Proteobacteria	Non	neg
Pseudomonas tolaasii	Proteobacteria	Unlikely	neg											+
Pseudomonas veronii	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudomonas weihenstephanensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Pseudomonas xanthomarina	Proteobacteria	Non	neg	d
Pseudomonas yamanorum	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	+	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Pseudomonas zhaodongensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+					+											+
Pseudonocardia dioxanivorans	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+		+			+					+
Pseudoprevotella muciniphila	Bacteroidetes	Rare	neg										neg
Pseudopropionibacterium massiliense	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	+	neg	+	neg	neg	+	neg			neg	neg	neg			+
Pseudoramibacter alactolyticus	Firmicutes	Rare	+	+	+		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			w	neg				neg
Pseudoruegeria marinistellae	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudoruminococcus massiliensis	Firmicutes	Rare	neg	neg									neg
Pseudoxanthomonas broegbernensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Pseudoxanthomonas japonensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Pseudoxanthomonas mexicana	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Pseudoxanthomonas spadix	Proteobacteria	Rare	neg	neg					neg	neg		neg	neg	neg	neg		neg				neg	neg
Pseudoxanthomonas suwonensis	Proteobacteria	Rare	neg
Pseudoxanthomonas taiwanensis	Proteobacteria	Rare	neg
Psychrobacter alimentarius	Proteobacteria	Unlikely	+	+	neg	+	+		+	neg	neg	+	neg	neg	neg
Psychrobacter arenosus	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		+			+	neg				neg
Psychrobacter cibarius	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg
Psychrobacter faecalis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+			neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg
Psychrobacter fulvigenes	Proteobacteria	Rare	neg	neg		neg	neg			neg
Psychrobacter maritimus	Proteobacteria	Unlikely	neg							neg				neg
Psychrobacter namhaensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	neg	+	+		+	neg	neg	+	neg	neg	neg
Psychrobacter phenylpyruvicus	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg
Psychrobacter pulmonis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg								neg		neg			neg
Pusillimonas faecalis	Firmicutes	Rare	neg
Pygmaiobacter massiliensis	Firmicutes	Minor	+
Pyramidobacter piscolens	Synergistetes	Minor	neg										neg
Rahnella aquatilis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		+	+		+	+			+	+
Ralstonia mannitolilytica	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		+	neg	neg	neg	neg	neg	neg							neg
Ralstonia pickettii Biovar Va-1&2	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		d	d	neg	neg	neg	neg	neg							neg
Raoultella ornithinolytica	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+		+
Raoultella planticola	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	+		+			+	neg	neg			neg
Raoultella terrigena	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	+		+			+	neg	w	neg		neg
Raoultibacter massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	neg	+	+	+	neg	+			+	neg				+
Raoultibacter timonensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	+	+	+	+	+			+	neg
Rheinheimera perlucida	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	+	neg			+
Rhizobium metallidurans	Proteobacteria	Unlikely	neg
Rhizorhabdus wittichii	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg							neg
Rhodanobacter ginsenosidimutans	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Rhodococcus erythropolis	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg
Rhodococcus hoagii	Actinobacteria	Rare	+
Rhodococcus jostii	Actinobacteria	Non	+	+	+				+	neg
Rhodococcus opacus	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+				+	+
Rhodococcus qingshengii	Actinobacteria	Unlikely	+
Rhodococcus rhodochrous	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg				neg			neg				neg
Rhodoplanes serenus	Proteobacteria	Unlikely	neg
Rhodothermus marinus	Bacteroidetes	Non	neg
Riemerella columbina	Bacteroidetes	Rare	neg	+	d					+					neg
Rikenella microfusus	Bacteroidetes	Rare	neg	+	neg	d(+)	neg		+	neg	neg	+	neg		neg		neg		neg	neg	neg				neg
Risungbinella massiliensis	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg		neg	+	neg	neg	neg	neg	neg		neg				neg	neg			neg
Robertmurraya andreesenii	Firmicutes	Unlikely	+
Robertmurraya kyonggiensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	w	+	neg	neg	neg	neg	+	w	+			+	neg	neg			+
Robertmurraya massiliosenegalensis	Firmicutes	Rare	+	+	neg		+		neg	+				neg	+					+
Robinsoniella peoriensis	Firmicutes	Rare	+	+			+		+	+			+							+
Romboutsia hominis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg					neg			neg
Romboutsia ilealis	Firmicutes	Rare	vr	+	neg	w	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	+	neg	neg	neg	neg			neg	w			neg
Romboutsia lituseburensis	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Romboutsia maritimum	Firmicutes	Rare	+
Romboutsia timonensis	Firmicutes	Moderate	+	+	+					+				+
Romboutsia weinsteinii	Firmicutes	Rare	+
Roseburia faecis	Firmicutes	Widespread	vr										neg
Roseburia hominis	Firmicutes	Widespread	vr										vr
Roseburia intestinalis	Firmicutes	Widespread	vr	+							neg		+	+	neg							neg			+	+
Roseburia inulinivorans	Firmicutes	Widespread	vr										neg
Roseobacter denitrificans	Proteobacteria	Non	neg
Roseomonas gilardii	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg			neg				neg	neg
Roseomonas mucosa	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Rossellomorea aquimaris	Firmicutes	Unlikely	vr	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			neg	+	neg			+
Rossellomorea marisflavi	Firmicutes	Rare	vr	+	+	w(+)	+	+	neg	+	neg	+	w(+)	+	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Rossellomorea vietnamensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	+	+			+
Rothia aeria	Actinobacteria	Minor	+	+					neg	+	neg		neg	+	+				neg		neg
Rothia dentocariosa	Actinobacteria	Minor	+	+	+		neg		neg	+	neg		neg	+	+	vr			neg		neg	neg			neg
Rothia halotolerans	Actinobacteria	Unlikely	+	w	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg	w	neg	+	+			+	neg	neg			neg
Rothia koreensis	Actinobacteria	Rare	+
Rothia kristinae	Actinobacteria	Rare	+	+	+	d			d	d(+)		neg		+
Rothia mucilaginosa	Actinobacteria	Moderate	+	+	+	+	neg		neg	d(+)	neg	neg	neg	+	d(+)	vr			neg		neg	neg			neg
Rothia terrae	Actinobacteria	Rare	+	+	+				+	+				+	+						neg
Rubeoparvulum massiliense	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg	neg	+	neg	+	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Rubinisphaera brasiliensis	Planctomycetes	Non	neg
Rubneribacter badeniensis	Actinobacteria	Minor	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Rubrobacter xylanophilus	Actinobacteria	Non	+
Rudanella lutea	Bacteroidetes	Unlikely	neg	neg
Ruminiclostridium cellobioparum	Firmicutes	Rare	vr
Ruminiclostridium cellulolyticum	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	w	+		neg	neg	neg		neg	neg	neg		neg	+			neg	neg				+
Ruminiclostridium herbifermentans	Firmicutes	Unlikely	vr				+											+								+
Ruminiclostridium josui	Firmicutes	Rare	+		neg	neg			w	+		w		neg				+
Ruminococcus albus	Firmicutes	Moderate	+	d	d(neg)	neg	+		+	neg			neg	+	neg			+		neg		neg			neg	+
Ruminococcus bicirculans	Firmicutes	Moderate	+
Ruminococcus bovis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+	+				+
Ruminococcus bromii	Firmicutes	Widespread	+	w	d(+)	d(+)	neg		neg	+	neg	d(neg)	neg	neg	neg		neg			neg	d(+)	neg	neg		d(+)	neg
Ruminococcus callidus	Firmicutes	Widespread	+	+	neg	neg	+		+	+	d(neg)		+	+	vr		vr	neg		neg		d(neg)			+	+
Ruminococcus champanellensis	Firmicutes	Moderate	+				+						neg					+					neg		neg	+
Ruminococcus flavefaciens	Firmicutes	Moderate	+	d(neg)	neg	neg	+		+	neg			neg	neg	neg			+		d(neg)		neg			neg	+
Ruminococcus gauvreauii	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	neg		neg	neg	neg	neg	neg	+	neg		neg				neg	neg			neg
Ruminococcus gnavus	Firmicutes	Widespread	+	+			neg		neg	+	neg		+	neg	neg				neg		neg
Ruminococcus lactaris	Firmicutes	Widespread	+	+	+	d	neg		+	vr	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Ruminococcus phoceensis	Firmicutes	Rare	+
Ruminococcus torques	Firmicutes	Widespread	+	vr	+	+	neg		+	w	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg		neg			neg
Rummeliibacillus pycnus	Firmicutes	Unlikely	+	+		neg	neg		neg
Rummeliibacillus stabekisii	Firmicutes	Rare	+	neg		neg	neg		neg
Rummeliibacillus suwonensis	Firmicutes	Rare	+	neg
Ruoffia tabacinasalis	Firmicutes	Rare	+							neg				neg	neg									neg
Ruthenibacterium lactatiformans	Firmicutes	Moderate	neg	w		+			neg	+			neg		neg
Saccharibacillus brassicae	Firmicutes	Unlikely	+
Saccharofermentans acetigenes	Firmicutes	Non	+	+	+	neg	w		w	neg		w	neg	+	w		w			+	neg	neg			+
Salimicrobium jeotgali	Firmicutes	Non	+	+	neg	+			+					neg
Salinicoccus halodurans	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	neg	+	neg	+	+	neg	neg	neg	+	+	+	neg				neg	neg
Salinisphaera halophila	Proteobacteria	Non	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Salinivibrio costicola	Proteobacteria	Rare	neg	+	+		+		neg	+				+	+
Salmonella bongori	Proteobacteria	Rare	neg	+					neg
Salmonella enterica	Proteobacteria	Unlikely	neg	+			neg		neg	+			neg	neg	vr		neg
Salmonella enterica subsp. arizonae	Proteobacteria	Non	neg	+			neg		d(neg)	+		+	neg	neg	+
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+			neg		neg	+		d	neg	neg	+
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		neg	+		+	neg	neg	+
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		neg	+		+	neg	neg	+
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		neg	+		+	neg	neg	+
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		neg	+		+	neg	neg	+
Sanguibacter massiliensis	Actinobacteria	Rare	+
Sarcina maxima	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg		vr	+		neg	neg	+	neg						neg				neg
Sarcina ventriculi	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	d		+	+		+	neg	+	neg						neg				neg
Scardovia inopinata	Actinobacteria	Rare	+	+	+	neg	neg	+	d(+)	+	d	+	+	+	neg	+	+				+	d(neg)	neg		+	neg
Scardovia wiggsiae	Actinobacteria	Minor	+	+	+	+	neg		d	+	neg	d	+	+	neg
Schaalia cardiffensis	Actinobacteria	Rare	+	+			neg		neg		neg	neg	neg	d	neg		neg				neg			neg
Schaalia hyovaginalis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	d	neg	d	+	neg	neg	neg	+	neg	+						neg
Schaalia meyeri	Actinobacteria	Rare	+	+	+	d	neg		d	+	neg	neg	neg	+	neg		d			neg	d	neg	neg		+
Schaalia odontolytica	Actinobacteria	Moderate	+	d	neg	d				neg				d	neg						neg	neg			neg
Schaalia radingae	Actinobacteria	Rare	+	+	vr	vr	vr		vr	+	vr	vr	vr	+	vr		neg
Schaalia turicensis	Actinobacteria	Rare	+	+	d	d	d		d	+	d	d	d	+	d		neg				neg
Schleiferilactobacillus harbinensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	neg	neg			d
Schleiferilactobacillus perolens	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	+	d	+	+	+	+	+	+	+	+			+	neg	d			d
Schleiferilactobacillus shenzhenensis	Firmicutes	Unlikely
Schlesneria paludicola	Planctomycetes	Unlikely	neg																					+
Schnuerera ultunensis	Firmicutes	Unlikely	+
Sebaldella termitidis	Fusobacteria	Unlikely	neg	+	+				d	+	neg			+	+										neg
Sediminibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Sediminispirochaeta smaragdinae	Spirochaetes	Unlikely	neg
Selenomonas artemidis	Firmicutes	Rare	neg	+	d	neg	neg		neg	d(+)	neg	neg	neg	+	neg		neg		neg		neg		neg		neg	neg
Selenomonas bovis	Firmicutes	Rare	neg
Selenomonas flueggei	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	neg		+	d(+)	neg	+	+	+	neg		neg		neg	neg	neg		neg		neg	neg
Selenomonas infelix	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	neg		+	+	neg	+	+	+	neg		neg		neg	neg	neg		neg		neg	neg
Selenomonas noxia	Firmicutes	Rare	neg	d	d	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg	neg	neg		neg	neg
Selenomonas ruminantium	Firmicutes	Minor	neg	+			+		vr	+	neg		+	+	neg							+
Selenomonas sputigena	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	neg		+	+	neg	+	+	+	neg		neg		neg	neg	neg	neg	neg			neg
Selenomonas timonae	Firmicutes	Unlikely	neg
Sellimonas intestinalis	Firmicutes	Minor	+	+					+	+			+		+
Senegalia massiliensis	Firmicutes	Rare	+	+	+		+			+						+	+				neg	neg			+
Senegalimassilia anaerobia	Actinobacteria	Minor	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Senegalimassilia faecalis	Actinobacteria	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg				neg
Serratia ficaria	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	d(neg)	+	+	+	+	+	+	+	+				neg	neg			neg
Serratia fonticola	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg		+	+	neg	+	+	vr	+		+				neg	neg
Serratia liquefaciens	Proteobacteria	Rare	neg	w	+		neg		neg	vr	+	+	+	+	+		+				neg
Serratia marcescens	Proteobacteria	Minor	neg	+	+	+	neg	vr	d(w)	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg				neg	neg			neg
Serratia odorifera	Proteobacteria	Rare	neg	+	+		+		w	+		+	d	d	+						neg
Serratia quinivorans	Proteobacteria	Rare	neg	+	+				neg												neg
Serratia ureilytica	Proteobacteria	Rare	neg	+	+				neg			+	neg	+							neg
Sharpea azabuensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+		neg	+	d		d										+
Shewanella algae	Proteobacteria	Unlikely	neg	d(w)					neg	neg				neg
Shewanella carassii	Proteobacteria	Rare	neg	neg								neg		neg			neg
Shewanella decolorationis	Proteobacteria	Rare	neg	+
Shewanella xiamenensis	Proteobacteria	Rare	neg	+
Shigella boydii	Proteobacteria	Rare	neg	+					neg			d	neg	neg
Shigella dysenteriae	Proteobacteria	Unlikely	neg	+			neg		neg			neg	neg	neg			neg
Shigella flexneri	Proteobacteria	Minor	neg	+			neg		neg	neg		d	d	neg	neg		neg
Shigella sonnei	Proteobacteria	Minor	neg	+			neg		w	vr		neg	w	w	+		neg
Shuttleworthia satelles	Firmicutes	Rare	+	+	+		+		d	+	+	+		+	+
Silanimonas lenta	Proteobacteria	Non	neg	+	+	neg	+		neg	+			neg		neg					+
Skermanella aerolata	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Slackia equolifaciens	Actinobacteria	Rare	+	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Slackia exigua	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Slackia faecicanis	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg		neg		neg											neg
Slackia heliotrinireducens	Actinobacteria	Rare	+
Slackia isoflavoniconvertens	Actinobacteria	Rare	+										neg
Slackia piriformis	Actinobacteria	Minor	+										neg
Sneathia sanguinegens	Fusobacteria	Rare	neg	+	+		+		neg	neg	neg	neg	d	neg	neg		neg			neg	neg		neg	neg
Sneathia vaginalis	Fusobacteria	Rare	neg	+		neg				+											+
Sodaliphilus pleomorphus	Bacteroidetes	Rare	neg
Soleaferrea massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Solibacillus silvestris	Firmicutes	Unlikely	+
Solibaculum mannosilyticum	Firmicutes	Rare	vr	w			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Solobacterium moorei	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	neg		neg	+	neg		neg	neg	neg		neg		neg	neg	neg				neg
Sorangium cellulosum	Proteobacteria	Rare	neg
Sphaerotilus natans	Proteobacteria	Unlikely	neg
Sphingobacterium alimentarium	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+					+			+		w			+
Sphingobacterium faecium	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+				d	+			+
Sphingobacterium mizutaii	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	+						neg	neg
Sphingobacterium multivorum	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+	+	+		+	+	+	+	+	+	+						+	+			+
Sphingobacterium nematocida	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	neg	neg	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	+	neg			+
Sphingobacterium siyangense	Bacteroidetes	Rare	neg	neg		neg	neg		neg		neg	neg	neg	neg	+
Sphingobacterium spiritivorum	Bacteroidetes	Rare	neg	+	+		+	+	+	+	+	+	+	+	+		+				+	d			d
Sphingobacterium thalpophilum	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	+		+		+	+			+	+	+
Sphingobium xenophagum	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg
Sphingomonas adhaesiva	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg							neg
Sphingomonas aerolata	Proteobacteria	Non	neg
Sphingomonas aestuarii	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Sphingomonas azotifigens	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		+	+	neg	+		+	+							neg
Sphingomonas bisphenolicum	Proteobacteria	Unlikely	neg	+						+				+
Sphingomonas echinoides	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg		neg	neg		neg
Sphingomonas glacialis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg								neg		neg			neg
Sphingomonas hankookensis	Proteobacteria	Rare	neg
Sphingomonas koreensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg			neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg
Sphingomonas melonis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		+	+	+	neg	neg	+	+							neg
Sphingomonas panni	Proteobacteria	Rare	neg	neg	+	+	neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg
Sphingomonas paucimobilis	Proteobacteria	Rare	neg	vr	+	+	+		+	+	+	w	w	+	vr							neg
Sphingomonas pseudosanguinis	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Sphingomonas sinipercae	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			+					neg
Sphingomonas yabuuchiae	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Sphingopyxis bauzanensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg					neg	neg		neg		neg			neg				neg
Spiribacter roseus	Proteobacteria	Non	neg
Spirochaeta coccoides	Spirochaetes	Rare	neg							+
Spirochaeta thermophila	Spirochaetes	Non	neg																					+
Spirosoma linguale	Bacteroidetes	Unlikely	neg	+	+	+	+		+	+		+	+	+	+							+
Sporobacter termitidis	Firmicutes	Rare	+
Sporolactobacillus laevolacticus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	d			w	+				+	+							+		+	w
Sporolactobacillus nakayamae subsp. racemicus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d		d	+		+	+	+	+							+			d
Sporomusa termitida	Firmicutes	Unlikely	neg
Sporosarcina aquimarina	Firmicutes	Non	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+	neg	neg			neg
Sporosarcina koreensis	Firmicutes	Unlikely	+	neg				neg
Sporosarcina luteola	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Sporosarcina siberiensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	+			+	+				neg
Stackebrandtia nassauensis	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	+				+
Staphylococcus arlettae	Firmicutes	Rare	+	vr	+	d(+)	vr		+	+	+		+	+	+	neg					neg
Staphylococcus aureus subsp. aureus	Firmicutes	Minor	+	+	+		neg		+	+	neg		neg	+	+	vr			neg		neg
Staphylococcus auricularis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	vr		neg	+	neg		neg	+	+	vr
Staphylococcus capitis subsp. capitis	Firmicutes	Rare	+	vr	+		neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg			neg		neg
Staphylococcus caprae	Firmicutes	Rare	+	vr	neg	+	neg		+	+	neg		neg	neg	d	neg					neg
Staphylococcus carnosus	Firmicutes	Rare	+	+	+	d	neg	neg	d(neg)	neg	neg	neg	neg	neg	d(+)	neg	neg				neg	neg			neg
Staphylococcus cohnii subsp. cohnii	Firmicutes	Rare	+	neg	+		neg		neg	vr	neg		neg	neg	neg	neg			neg		neg
Staphylococcus condimenti	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg		+	neg	neg		neg	w	+	neg
Staphylococcus devriesei	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	+	+	d(+)	neg	neg	+	+	+	neg
Staphylococcus epidermidis	Firmicutes	Widespread	+	+	+	d(+)	neg		+	+	vr		neg	+	neg	vr			neg		neg
Staphylococcus equorum subsp. equorum	Firmicutes	Rare	+	vr	+		neg		vr	+			neg	+	+	neg					neg
Staphylococcus gallinarum	Firmicutes	Rare	+		+		+	+	d	+	+	+	+	+	+	+	+
Staphylococcus haemolyticus	Firmicutes	Minor	+	vr	+	d(+)	neg		+	+	neg		neg	+	+	vr					neg
Staphylococcus hominis subsp. hominis	Firmicutes	Minor	+	vr	+		neg		+	+			neg	+	vr	vr					neg
Staphylococcus hyicus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	neg	+	+	neg
Staphylococcus intermedius	Firmicutes	Rare	+	vr	+	+	neg		+	+	neg		neg	+	+	vr					neg
Staphylococcus kloosii	Firmicutes	Rare	+	vr	+	w(+)	neg		vr	d	w(+)		neg	neg	d	neg					neg
Staphylococcus lugdunensis	Firmicutes	Rare	+	vr	+		neg		+	+	neg		neg	+	+	vr			neg		neg
Staphylococcus nepalensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg	neg	+	+	neg	neg	neg	+	+	d	neg				neg	neg			neg
Staphylococcus pasteuri	Firmicutes	Minor	+	+	+		neg		neg	+			neg	+	+	d
Staphylococcus petrasii	Firmicutes	Rare	+	+	+	d(neg)	neg	neg	d(neg)	+	neg	neg	neg	+	+	w	neg				neg	neg			neg
Staphylococcus pettenkoferi	Firmicutes	Rare	+	d	+		neg		neg	neg			neg	d	neg	neg					neg
Staphylococcus pseudintermedius	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg		+	+	neg	neg	neg	+	+	w	neg			neg	neg	neg			neg
Staphylococcus saccharolyticus	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg		neg
Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus	Firmicutes	Rare	+	vr	+		neg		+	+				+	+	vr					neg
Staphylococcus schleiferi subsp. schleiferi	Firmicutes	Rare	+	vr	+		neg		neg	neg				neg	neg	neg					neg
Staphylococcus simiae	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg		+	+	+	neg	neg	+	+	+
Staphylococcus simulans	Firmicutes	Rare	+	vr	+	neg	neg		+	vr	neg		neg	+	+	neg					neg
Staphylococcus succinus subsp. succinus	Firmicutes	Unlikely	+													neg
Staphylococcus warneri	Firmicutes	Minor	+	vr	+	d(+)	neg		d	+	d(+)		neg	+	+	neg					neg
Staphylococcus xylosus	Firmicutes	Rare	+	vr	+	d(+)	neg		+	+	neg		neg	+	+	neg					neg
Starkeya novella	Proteobacteria	Unlikely	neg
Stenotrophomonas acidaminiphila	Proteobacteria	Unlikely	neg
Stenotrophomonas bentonitica	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		neg	neg		neg	+		neg	neg
Stenotrophomonas maltophilia	Proteobacteria	Minor	neg	d			neg			+				neg	neg		neg
Stenotrophomonas rhizophila	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Stomatobaculum longum	Firmicutes	Minor	vr	+			neg		neg	+	neg		neg	+	neg
Streptobacillus hongkongensis	Fusobacteria	Rare	neg
Streptobacillus moniliformis	Fusobacteria	Unlikely	neg	+
Streptococcus acidominimus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+				+		w		+	+	neg	neg					neg	+		neg	neg
Streptococcus agalactiae	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	d	neg	vr	+	neg	neg	neg	+	+	neg	d(neg)		neg	neg	neg	neg		+	neg
Streptococcus alactolyticus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d	d	neg	+	d	d(+)	+	+	d	+	d		neg		neg	neg		neg	d(neg)
Streptococcus anginosus	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	d(+)	neg	+	+	neg	+		neg		neg	neg			neg
Streptococcus anginosus subsp. whileyi	Firmicutes	Rare	+	+			d		+	+		d	neg	+	+		d				neg	neg
Streptococcus australis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	neg	neg	+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg		neg		neg	neg		+	neg
Streptococcus caballi	Firmicutes	Rare	+						neg	+	neg	+	+	+	+						+	+		+	+
Streptococcus canis	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	neg	neg	+	d(neg)	neg	neg				d(neg)	neg			+
Streptococcus castoreus	Firmicutes	Rare	+	+					neg	+	neg	neg	neg	+	neg						neg	neg		+	+
Streptococcus constellatus subsp. constellatus	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	w		neg	+	neg	neg	neg	+	w(+)		d(neg)			d(neg)	neg	neg			w(+)
Streptococcus cristatus	Firmicutes	Minor	+	+		d(+)	neg		d(+)	+	neg	neg	vr	+	vr	neg	neg		neg		neg	neg		+	neg
Streptococcus danieliae	Firmicutes	Rare	+	+					neg				d		+						neg	neg			+
Streptococcus didelphis	Firmicutes	Rare	+	+					neg				neg		+						neg	neg		+	d
Streptococcus downei	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	neg		+	+	neg	neg	neg	+	+						neg	+			neg
Streptococcus dysgalactiae	Firmicutes	Rare	+	+					vr	+	neg		neg	+	+				vr		vr	neg			+
Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis	Firmicutes	Unlikely	+	+					d	+			neg	+	+						d	neg			+
Streptococcus equi subsp. equi	Firmicutes	Rare	+	+					neg	+	neg		neg	+	neg				+		+	neg		+	+
Streptococcus equinus	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	d(+)	+	neg	d(+)	d(+)	+	d	neg	+		neg	+	d(+)	+			+
Streptococcus ferus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	d	d	+	+	neg	+			+	+	d			+
Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	neg	+		vr		+	+			+
Streptococcus gordonii	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	d(neg)	d(neg)	+	+	neg	+		neg	+	neg	d(+)		neg	vr
Streptococcus gwangjuense	Firmicutes	Unlikely	+	+					+				neg		neg
Streptococcus henryi	Firmicutes	Rare	+						+		neg	+	neg	+	+						+	+		+	+
Streptococcus hyovaginalis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg				neg	neg			neg
Streptococcus ilei	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	d	neg	neg	+	+	+	d	+	+	neg	+	neg			+	+	neg			+
Streptococcus infantarius	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	d(+)	+	+	neg	neg	neg		neg		+	neg		+	+
Streptococcus infantarius subsp. infantarius	Firmicutes	Minor	+	+					+	+	neg		d(+)	+	neg						+	neg		+	+
Streptococcus infantis	Firmicutes	Minor	+	+					+	+	neg	neg	neg	+	neg		neg		neg		neg	neg		+	vr
Streptococcus intermedius	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	d(+)		+	+	neg	vr	vr	+	d(+)		d(neg)			d(neg)	neg	neg			vr
Streptococcus koreensis	Firmicutes	Unlikely	+	+					+				+		neg						neg	neg			neg
Streptococcus lactarius	Firmicutes	Rare	+						+	+	neg	neg	neg	+	neg						neg			neg
Streptococcus lutetiensis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+	vr	neg	+		neg		neg	neg		neg	d(+)
Streptococcus macedonicus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	d	+	+	neg	neg	neg				neg	neg		neg	neg
Streptococcus merionis	Firmicutes	Rare	+	+					+	+		neg	+		+		neg				neg	+		+	+
Streptococcus mitis	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	d	neg	+	+	neg	d(+)	d(+)	+	d(neg)	neg	neg		neg	neg	neg	neg		neg	neg
Streptococcus mutans	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	d(+)	+	+	+	neg	vr		neg	+	neg	+			neg
Streptococcus oralis	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	neg	vr	+	+	neg	+	d(+)	+	d(neg)	neg	vr		neg	neg	neg	neg		d	neg
Streptococcus oralis subsp. tigurinus	Firmicutes	Rare	+	+	+	+			+	+	neg	neg	+	+	d(+)						neg	neg			+
Streptococcus orisratti	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		+	+	neg	+	+	+	+		+				+	+			+
Streptococcus ovis	Firmicutes	Rare	+	+					+	+	neg	neg	+	+	+						+			neg
Streptococcus pantholopis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg		neg	+	+	neg	+				neg	neg			neg
Streptococcus parasanguinis	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	d(+)	vr	+	+	neg	d(+)	d(+)	+	d(+)	neg	vr		neg		neg	neg			vr
Streptococcus parasuis	Firmicutes	Rare	+	+						+	neg	neg		+	+						+			+
Streptococcus parauberis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d(+)	d(+)	+	+	vr	neg	+	+	+		d(+)		neg		neg	d(+)			d(+)
Streptococcus pasteurianus	Firmicutes	Minor	+	+					+	+	d	d(neg)	d	+	+						neg	neg		neg	neg
Streptococcus periodonticum	Firmicutes	Unlikely	+	+					neg				neg		+						neg	neg			neg
Streptococcus peroris	Firmicutes	Rare	+	+					+	+	neg	neg	neg	+	neg		neg		neg		neg	neg		neg
Streptococcus pluranimalium	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	d	d	d	d	d(+)	d	d(neg)	d	d(+)	+	neg	d				neg	neg		neg	neg
Streptococcus plurextorum	Firmicutes	Rare	+	+	+	d	neg	neg	+	+	neg	neg	+	+		neg	neg			neg	neg	neg		neg	neg
Streptococcus pneumoniae	Firmicutes	Minor	+	+	+	+			+	+	neg	w(+)	+	+	+		neg		neg		vr	+			d(+)
Streptococcus porci	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	+	+	+	+	neg	neg			neg	+	neg		+	+
Streptococcus pseudopneumoniae	Firmicutes	Minor	+	+					vr	+	neg		neg	+	neg				neg		neg	neg			vr
Streptococcus pseudoporcinus	Firmicutes	Rare	+	+					neg	+		neg		+	+
Streptococcus pyogenes	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	vr	neg	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg		vr		d(+)	neg		+	neg
Streptococcus rubneri	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	neg	+	+	neg	d	+	+	neg		neg			neg	neg	neg			neg
Streptococcus salivarius	Firmicutes	Widespread	+	+	+	+	+	vr	+	+	neg	neg	+	+	d(+)	neg	+		neg	+	neg	d			neg
Streptococcus sanguinis	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	d(+)	+	+	+	neg	d(+)	d(+)	+	+	neg	d		neg	d(+)	neg	d(+)		+	d
Streptococcus sinensis	Firmicutes	Rare	+	+			+		+	+	neg	neg	neg	+	+						neg	neg		+	+
Streptococcus sobrinus	Firmicutes	Minor	+	+		d	w		d	+	neg	neg	neg	+	+		neg			neg	neg				neg
Streptococcus suis	Firmicutes	Rare	+	+	+	vr	neg	neg	+	+	neg	d(+)	d(+)	+	+	neg	neg		neg		+	+		+
Streptococcus thermophilus	Firmicutes	Widespread	+	+	+	d(+)	neg		+	neg	d(+)	d(+)	d	+	neg		neg				neg	neg
Streptococcus thoraltensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	d(+)	d(+)	d(+)	+	+		d(+)		neg		neg	+		+	+
Streptococcus timonensis	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg			neg	neg	neg			w
Streptococcus uberis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+		neg		d(neg)	+			vr
Streptococcus vestibularis	Firmicutes	Moderate	+	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	d(+)	neg	+		neg		neg	neg			neg
Streptococcus viridans	Firmicutes	Rare	+	+																		neg
Streptomyces albus	Actinobacteria	Unlikely	+	w
Streptomyces flavogriseus	Actinobacteria	Unlikely	+
Streptomyces hygroscopicus	Actinobacteria	Unlikely	+
Streptomyces koyangensis	Actinobacteria	Rare	+
Streptomyces lividans	Actinobacteria	Unlikely	+
Streptomyces massiliensis	Actinobacteria	Unlikely	+
Streptomyces misionensis	Actinobacteria	Rare	+
Streptomyces specialis	Actinobacteria	Unlikely	+
Streptomyces thermoviolaceus	Actinobacteria	Rare	+	neg					neg	neg											neg
Streptomyces thermovulgaris	Actinobacteria	Unlikely	+
Streptomyces violaceusniger	Actinobacteria	Unlikely	+
Streptosporangium roseum	Actinobacteria	Unlikely	+
Subdoligranulum formicile	Firmicutes	Rare	neg
Subdoligranulum variabile	Firmicutes	Moderate	neg										neg
Succinatimonas hippei	Proteobacteria	Minor	neg	+			neg		neg	+	neg		neg	neg	neg
Succinivibrio dextrinosolvens	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	neg		neg	+			neg	+	neg			neg		neg		neg	+		w	neg
Sulfurospirillum deleyianum	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Sutcliffiella cohnii	Firmicutes	Unlikely	+	neg																	neg			+	neg
Sutterella faecalis	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Sutterella massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg
Sutterella megalosphaeroides	Proteobacteria	Rare	neg	neg									neg
Sutterella parvirubra	Proteobacteria	Minor	neg
Sutterella seckii	Proteobacteria	Rare	neg
Sutterella stercoricanis	Proteobacteria	Rare	neg	neg	neg					neg				neg
Sutterella timonensis	Proteobacteria	Rare	neg
Sutterella wadsworthensis	Proteobacteria	Widespread	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Symbiobacterium thermophilum	Firmicutes	Unlikely	neg
Symbiobacterium toebii	Firmicutes	Unlikely	neg
Syntrophobotulus glycolicus	Firmicutes	Unlikely	neg
Syntrophococcus sucromutans	Firmicutes	Rare	neg	neg
Syntrophomonas zehnderi	Firmicutes	Rare	vr
Tannerella forsythia	Bacteroidetes	Minor	neg	+	+	+	+		neg	+	+		neg	+	+		+					neg
Tannerella serpentiformis	Bacteroidetes	Unlikely	neg										neg
Taonella mepensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	w
Tatumella ptyseos	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	neg		neg	neg	neg	w	neg	+	+						neg	neg			neg
Tepidanaerobacter acetatoxydans	Firmicutes	Rare	vr
Tepiditoga spiralis	Thermotogae	Unlikely	neg
Terrahaemophilus aromaticivorans	Proteobacteria	Rare	neg
Terribacillus aidingensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	+	+	+	+	neg	+			+	neg	neg			neg
Terribacillus halophilus	Firmicutes	Unlikely	+	neg								neg		neg			neg
Terrisporobacter glycolicus	Firmicutes	Minor	+	+	+					+
Terrisporobacter mayombei	Firmicutes	Rare	+	+	+		+			+									+	+					+
Terrisporobacter othiniensis	Firmicutes	Rare	+
Terrisporobacter petrolearius	Firmicutes	Rare	+	+			+			+
Tessaracoccus massiliensis	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+			neg	neg				+
Tetragenococcus halophilus	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+	+		neg	+	neg	neg	neg	+		+	+					neg			neg
Tetragenococcus koreensis	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+		neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+				neg	neg			neg
Tetragenococcus solitarius	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	+	+				neg				neg
Thalassobacillus devorans	Firmicutes	Non	+	+	+										+
Thauera terpenica	Proteobacteria	Rare	neg
Thermaerobacter marianensis	Firmicutes	Non	vr
Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum	Firmicutes	Rare	neg	+	+	+	+		+	+				+	+				+		+	neg	+		+	+
Thermobacillus composti	Firmicutes	Unlikely	neg	neg
Thermobispora bispora	Actinobacteria	Unlikely	+
Thermoclostridium stercorarium	Firmicutes	Unlikely	neg	+	neg	+	+		+	+	neg	+	neg	neg	neg		neg	+		+	+	neg			+
Thermolithobacter ferrireducens	Firmicutes	Non	+
Thermomonas carbonis	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Thermomonospora curvata	Actinobacteria	Unlikely	+
Thermophilibacter immobilis	Actinobacteria	Unlikely	+
Thermophilibacter mediterraneus	Actinobacteria	Rare	+
Thermophilibacter provencensis	Actinobacteria	Minor	+
Thermus scotoductus	Deinococcus-Thermus	Unlikely	neg
Thiomonas islandica	Proteobacteria	Unlikely	neg
Thomasclavelia saccharogumia	Firmicutes	Rare	+
Thomasclavelia spiroformis	Firmicutes	Moderate	+		+	neg	d		+	neg		neg	neg	+	neg		d			w(neg)	neg	+			neg
Tidjanibacter inops	Bacteroidetes	Moderate
Tidjanibacter massiliensis	Bacteroidetes	Rare	neg
Timonella senegalensis	Actinobacteria	Rare	+	+		+		+		+		neg	neg	+						+
Tissierella praeacuta	Firmicutes	Rare	+	+
Trabulsiella guamensis	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		neg	+		neg	neg	neg	+					+
Tractidigestivibacter scatoligenes	Actinobacteria	Rare	+	+			+		+	+	neg		neg	+	neg
Traorella massiliensis	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg		neg			neg
Treponema berlinense	Spirochaetes	Rare	neg										neg
Treponema brennaborense	Spirochaetes	Unlikely	neg										+
Treponema denticola	Spirochaetes	Rare	neg
Treponema medium	Spirochaetes	Unlikely	neg	+	+	+				+			+	+	+							+
Treponema parvum	Spirochaetes	Unlikely	neg
Treponema pectinovorum	Spirochaetes	Rare	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg	neg	neg	neg		neg			neg	neg		+		neg
Treponema pedis	Spirochaetes	Unlikely	neg
Treponema peruense	Spirochaetes	Rare	neg	+					+	+			+	+
Treponema phagedenis	Spirochaetes	Unlikely	neg
Treponema primitia	Spirochaetes	Unlikely	neg
Treponema ruminis	Spirochaetes	Unlikely	neg
Treponema socranskii	Spirochaetes	Unlikely	neg	+	+	+	neg		neg	+	neg	neg	d	+	+		neg		+		+	neg	d		+
Treponema succinifaciens	Spirochaetes	Rare	neg	+		+	+		+	+								neg				neg			+
Treponema vincentii	Spirochaetes	Rare	neg
Tropheryma whipplei	Actinobacteria	Unlikely	neg
Trueperella bernardiae	Actinobacteria	Rare	+	+	+				neg	+	neg		neg	neg	neg		neg		neg		d(+)				+
Trueperella pyogenes	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+		+	+	+	neg	neg	d	+		neg		+	neg	+				+
Tsukamurella pulmonis	Actinobacteria	Unlikely	+	+	+	+	neg		neg	neg	neg		neg	+	+							neg
Tumebacillus avium	Firmicutes	Unlikely	+	neg																+
Tumebacillus permanentifrigoris	Firmicutes	Unlikely	+
Turicibacter sanguinis	Firmicutes	Moderate	+							+			neg
Turicimonas muris	Proteobacteria	Rare	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Tyzzerella nexilis	Firmicutes	Widespread	+							neg
Ureaplasma parvum	Tenericutes	Rare	unk	neg
Ureaplasma urealyticum	Tenericutes	Rare	unk
Ureibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	neg	neg								neg		neg			neg
Ureibacillus suwonensis	Firmicutes	Unlikely	neg	neg
Ureibacillus thermosphaericus	Firmicutes	Non	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg				neg	neg			neg
Urinicoccus timonensis	Firmicutes	Rare	+	+	neg	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Urmitella timonensis	Firmicutes	Rare	+
Uruburuella suis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+					neg				neg
Vaginimicrobium propionicum	Actinobacteria	Unlikely	+	+			neg		neg	+	+		neg	+	+
Vagococcus carniphilus	Firmicutes	Rare	+	+					neg	+	neg	neg	neg	d	+						neg	neg		neg
Vagococcus fluvialis	Firmicutes	Rare	+	+	+	neg	+	+	neg	+		neg		d	+	d	+				neg	neg			neg
Vagococcus lutrae	Firmicutes	Rare	+	+						+	neg	neg	neg	+	+						neg			neg
Vagococcus penaei	Firmicutes	Rare	+	+					neg	+	+	neg	+	+	+						neg			neg
Vagococcus teuberi	Firmicutes	Rare	+	+					neg	+	neg	neg	neg	+	+						neg			neg
Vampirovibrio chlorellavorus	Cyanobacteria	Unlikely	neg
Varibaculum cambriense	Actinobacteria	Rare	+	+	d		neg		neg	vr	neg	neg	neg	d(+)	vr		neg		neg		neg			neg
Varibaculum timonense	Actinobacteria	Rare	+	neg			+		+	+	+		neg	+	neg
Variovorax boronicumulans	Proteobacteria	Rare	neg	neg
Variovorax ginsengisoli	Proteobacteria	Unlikely	neg	neg
Variovorax paradoxus	Proteobacteria	Unlikely	neg
Veillonella atypica	Firmicutes	Widespread	neg						neg	neg	neg		neg		neg				neg		neg
Veillonella denticariosi	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg				neg	neg				neg
Veillonella dispar	Firmicutes	Moderate	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg
Veillonella infantium	Firmicutes	Rare	neg
Veillonella magna	Firmicutes	Rare	neg		neg
Veillonella montpellierensis	Firmicutes	Rare	neg	neg		neg	neg		neg	neg	neg	neg	neg		neg					neg		neg
Veillonella nakazawae	Firmicutes	Rare	neg
Veillonella parvula	Firmicutes	Widespread	neg	neg			neg		neg	neg	neg		neg	neg	neg				neg		neg
Veillonella ratti	Firmicutes	Rare	neg										neg
Veillonella rodentium	Firmicutes	Unlikely	neg
Veillonella rogosae	Firmicutes	Minor	neg										neg
Veillonella tobetsuensis	Firmicutes	Minor	neg
Vescimonas coprocola	Firmicutes	Rare	neg
Vescimonas fastidiosa	Firmicutes	Rare	neg
Vibrio alginolyticus	Proteobacteria	Rare	neg	+		d(neg)	+		neg	+		neg	neg	+	+
Vibrio cholerae	Proteobacteria	Unlikely	neg	+		d	neg		neg	+		neg	neg	+	+
Vibrio cincinnatiensis	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		neg	+		neg	neg	+	+
Vibrio fluvialis	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	d(neg)		neg	+		neg	neg	+	+		+
Vibrio furnissii	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	neg		neg	+		neg	neg	+	+		neg
Vibrio metoecus	Proteobacteria	Rare	neg	+
Vibrio metschnikovii	Proteobacteria	Rare	neg	+		d	neg		d(neg)	+		neg	neg	+	+
Vibrio mimicus	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	neg		d(w)	+		neg	neg	neg	+		neg
Vibrio natriegens	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	d	d(+)		neg	+		d	d	+	+
Vibrio neptunius	Proteobacteria	Unlikely	neg	+								neg		+			neg
Vibrio parahaemolyticus	Proteobacteria	Rare	neg	+		d(+)	d		neg	+		neg	neg	neg	+
Vibrio proteolyticus	Proteobacteria	Rare	neg	+		neg	+		neg	+		neg	neg	neg	+
Vibrio rumoiensis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+					+
Vibrio vulnificus	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	d		d	+		neg	neg	d(neg)	+
Victivallis vadensis	Lentisphaerae	Minor	neg	+			+
Virgibacillus dakarensis	Firmicutes	Rare	+
Virgibacillus dokdonensis	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	+		+	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	neg				neg
Virgibacillus doumboii	Firmicutes	Rare	+	+	neg	neg	neg		neg	neg						+									neg
Virgibacillus halodenitrificans	Firmicutes	Rare	vr	+	+	+	neg		d	+	neg	neg	neg	+	+	neg	+				neg
Virgibacillus ihumii	Firmicutes	Rare	+	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	+	neg			+	neg	neg			neg
Virgibacillus massiliensis	Firmicutes	Rare	+
Virgibacillus ndiopensis	Firmicutes	Rare	+	neg	+	neg		neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg	neg			+		neg			neg
Virgibacillus pantothenticus	Firmicutes	Rare	+	+	+		d	d	d	+	neg		neg	+	+	+	+					neg
Virgibacillus profundi	Firmicutes	Unlikely	vr	w	+	w			neg	neg		neg		w	neg						neg
Virgibacillus proomii	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d	neg	neg	+	neg	neg	neg	d	+	neg	d				d	neg			d
Virgibacillus salexigens	Firmicutes	Unlikely	+	+	+	+			neg	d		neg			neg							neg
Virgibacillus senegalensis	Firmicutes	Non	+	neg	neg				neg	neg				neg
Virgibacillus siamensis	Firmicutes	Unlikely	+	+	neg	neg	+		neg	+	neg	neg		neg	neg
Vitreoscilla massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg
Vitreoscilla stercoraria	Proteobacteria	Rare	neg
Weeksella virosa	Firmicutes	Rare	neg	neg	neg		neg		neg	neg			neg	neg	neg
Weissella cibaria	Firmicutes	Minor	+	+	+	neg	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	+		neg	+	neg	neg			neg
Weissella confusa	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	+	neg	neg	+	neg	neg	neg	+	neg	neg	+		neg		neg	neg			neg
Weissella paramesenteroides	Firmicutes	Minor	+	+	+	+	vr	neg	neg	+	neg	+	d	+	+	+	neg				neg	neg			neg
Weissella viridescens	Firmicutes	Minor	+			neg	neg			+		neg	neg	d	d
Weizmannia coagulans	Firmicutes	Rare	+	+	+	+	d	d	d	+	neg	+	d	d	+	d	d				neg	neg			+
Winkia neuii	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	d	d	+	+	+	+	+	+	+						d	d
Wolinella succinogenes	Proteobacteria	Rare	neg
Xanthomonas massiliensis	Proteobacteria	Unlikely	neg
Xylanimonas cellulosilytica	Actinobacteria	Rare	+	+	+	+	+	+	+	+	+			+	+	+	+
Yangia pacifica	Proteobacteria	Non	neg
Yersinia aldovae	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	d		neg	neg	neg	neg	neg	neg	+		neg			+
Yersinia aleksiciae	Proteobacteria	Rare	neg	+			+			vr				neg	+		+
Yersinia alsatica	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	neg	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Yersinia artesiana	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Yersinia bercovieri	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		neg	+		neg	neg	+	+		+
Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	+		neg	+	neg	neg	neg	+	+		d(w)				neg	neg			w
Yersinia frederiksenii	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		neg	+	neg	neg	neg	+	+		+			+	neg	neg			w
Yersinia intermedia	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		neg	+	neg	+	+	+	+		+			+	neg	neg			neg
Yersinia kristensenii subsp. kristensenii	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+		d(w)	+	neg	neg	neg	neg	+		neg			neg	neg	neg			w
Yersinia kristensenii subsp. rochesterensis	Proteobacteria	Rare	neg	+			+		neg	+		neg	neg	neg	+		+
Yersinia massiliensis	Proteobacteria	Rare	neg				+		d	+		neg	d(neg)	+	+
Yersinia mollaretii	Proteobacteria	Rare	neg	+		+	+		d	+		neg	neg	+	+
Yersinia occitanica	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	d	+	neg	neg	neg	neg	+	neg	neg			neg	neg	neg			neg
Yersinia pestis	Proteobacteria	Non	neg	+			neg		neg	d		d	neg	neg	+
Yersinia proxima	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Yersinia pseudotuberculosis	Proteobacteria	Unlikely	neg	+	+	+	neg		neg	d	neg	+	neg	d	+				neg		neg
Yersinia rohdei	Proteobacteria	Rare	neg	+			neg		neg	neg		d	d	+	+		neg
Yersinia vastinensis	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	+	+	neg	neg	neg	+	+	neg	neg			+	neg	neg			neg
Yokenella regensburgei	Proteobacteria	Rare	neg	+	+	+	+	+	neg	+	neg	+	neg	neg	+	neg	neg
Yonghaparkia alkaliphila	Actinobacteria	Non	+
Zunongwangia profunda	Bacteroidetes	Non	neg	+								neg		+			neg

Click on table headings to sort. Table abbreviations: Glc - glucose; Fru - fructose; Gal - galactose; Celb - cellubiose; Gent - gentiobiose; Lact - lactose; Malt - maltose; Melz - melezitose; Melb - melibiose; Raff - raffinose; Sucr - sucrose; Treh - trehalose; Tura - D-turanose; Amyg - amygdalin; Cell - cellulose; Dext - dextrin; Aesc - aesculin; Glyg - glycogen; Inul - inulin; Pect - pectin; Pull - pullulan; Star - starch; Xyln - xylan;

BACTERIA TABLES

INFORMATION